РАНБП2 - RANBP2
RAN-связывающий белок 2 (РАНБП2) является белок который у человека кодируется РАНБП2 ген.[3] Он также известен как нуклеопорин 358 (Nup358), поскольку он является членом семейства нуклеопоринов, составляющих комплекс ядерных пор. RanBP2 имеет массу 358 кДа.
Функция
РАН это маленький GTP-связывающий белок из Надсемейство RAS. Ран GTPase является главным регуляторным переключателем, который, помимо других функций, контролирует перемещение белков между ядерным и цитоплазматическим компартментами клетки. Ran GTPase контролирует множество клеточных функций посредством взаимодействия с другими белками. В RanBP2 ген кодирует очень большой RAN-связывающий белок, который локализуется в цитоплазматических филаментах, исходящих из ядерная пора сложный. RanBP2 / Nup358 - гигантские подмости и мозаика циклофилин -зависимый нуклеопорин, участвующий в контроле селективных процессов Цикл Ran-GTPase. RanBP2 состоит из нескольких доменов. Каждый домен RanBP2 избирательно и напрямую взаимодействует с отдельными белками, такими как Ran GTPase, импортин -бета, экспорт -1/CRM1, красный опсин, подразделения протеасома, cox11 и кинезин-1 изоформы, KIF5B и KIF5C. Еще одним партнером RanBP2 является Фермент E2 UBC9. RanBP2 сильно усиливает SUMO1 перевод из UBC9 в цель SUMO1 SP100. Другой целью для SUMOylation является RanGAP который является белком, активирующим ГТФазу для Ran. SUMO-RanGAP взаимодействует с доменом около карбоксильного конца RanBP2. Эти результаты помещают сумоилирование в цитоплазматических филаментах комплекса ядерных пор и предполагают, что для некоторых субстратов модификация и ядерный импорт являются связанными событиями. Плейотропная (многофункциональная) роль RanBP2 отражает его взаимодействие с множеством партнеров, каждый из которых выполняет свои клеточные или молекулярные функции. Этот ген частично продублирован в кластере генов, который находится в горячей точке для рекомбинации на хромосоме 2q человека.
Клиническое значение
Недостаточность RanBP2 напрямую связан с канцерогенез, анеуплоидия, и нейрозащита из фоторецепторные нейроны к легким стрессам и старению. Миссенс-мутации человека в RanBP2 были идентифицированы в его богатой лейцином области, и они вызывают аутосомно-доминантную некротизирующую энцефалопатию (ADNE).[4]
Взаимодействия
RANBP2 был показан взаимодействовать с КПНБ1[5][6][7] и UBE2I.[8][9]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000153201 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Беддов А.Л., Ричардс С.А., Орем Н.Р., Макара И.Г. (апрель 1995 г.). «Ran / TC4 GTPase-связывающий домен: идентификация путем клонирования экспрессии и характеристики консервативного мотива последовательности». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (8): 3328–32. Дои:10.1073 / пнас.92.8.3328. ЧВК 42159. PMID 7724562.
- ^ «Ген Entrez: RANBP2 RAN-связывающий белок 2».
- ^ Ясин Н.Р., Блобель Г. (сентябрь 1999 г.). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение ядерного импорта на нуклеопорине nup358». Журнал биологической химии. 274 (37): 26493–502. Дои:10.1074 / jbc.274.37.26493. PMID 10473610.
- ^ Дельфин С., Гуан Т., Мельхиор Ф, Джерас Л. (декабрь 1997 г.). «RanGTP нацелен на p97 на RanBP2, нитчатый белок, локализованный на цитоплазматической периферии комплекса ядерных пор». Молекулярная биология клетки. 8 (12): 2379–90. Дои:10.1091 / mbc.8.12.2379. ЧВК 25714. PMID 9398662.
- ^ Бен-Эфраим I, Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта». Журнал клеточной биологии. 152 (2): 411–7. Дои:10.1083 / jcb.152.2.411. ЧВК 2199621. PMID 11266456.
- ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
- ^ Чжан Х., Сайто Х., Матунис MJ (сентябрь 2002 г.). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в филаментах комплекса ядерных пор». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6498–508. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6498-6508.2002. ЧВК 135644. PMID 12192048.
дальнейшее чтение
- Муравала П., Трипати М.М., Вьяс П., Салунке А., Джозеф Дж. (Сентябрь 2009 г.). «Nup358 взаимодействует с APC и играет роль в поляризации клеток». Журнал клеточной науки. 122 (Пт 17): 3113–22. Дои:10.1242 / jcs.037523. PMID 19654215.
- Феррейра PA, Hom JT, Pak WL (сентябрь 1995 г.). «Новые подтипы бычьего циклофилина, экспрессируемые в сетчатке». Журнал биологической химии. 270 (39): 23179–88. Дои:10.1074 / jbc.270.39.23179. PMID 7559465.
- Yokoyama N, Hayashi N, Seki T, Panté N, Ohba T, Nishii K, Kuma K, Hayashida T, Miyata T., Aebi U (июль 1995 г.). «Гигантский белок нуклеопор, который связывает Ran / TC4». Природа. 376 (6536): 184–8. Дои:10.1038 / 376184a0. PMID 7603572. S2CID 4304659.
- Беддов А.Л., Ричардс С.А., Орем Н.Р., Макара И.Г. (апрель 1995 г.). «Домен, связывающий GTPase Ran / TC4: идентификация путем клонирования экспрессии и характеристики консервативного мотива последовательности». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (8): 3328–32. Дои:10.1073 / пнас.92.8.3328. ЧВК 42159. PMID 7724562.
- Wu J, Matunis MJ, Kraemer D, Blobel G, Coutavas E (июнь 1995 г.). «Nup358, цитоплазматический нуклеопорин с пептидными повторами, сайтами связывания Ran-GTP, цинковыми пальцами, гомологичным доменом циклофилина А и богатой лейцином областью». Журнал биологической химии. 270 (23): 14209–13. Дои:10.1074 / jbc.270.23.14209. PMID 7775481.
- Bischoff FR, Krebber H, Smirnova E, Dong W., Ponstingl H (февраль 1995 г.). «Совместная активация RanGTPase и ингибирование диссоциации GTP с помощью Ran-GTP-связывающего белка RanBP1». Журнал EMBO. 14 (4): 705–15. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07049.x. ЧВК 398135. PMID 7882974.
- Феррейра ПА, Накаяма Т.А., Пак В.Л., Трэвис Г.Х. (октябрь 1996 г.). «Родственный циклофилину белок RanBP2 действует как шаперон для красного / зеленого опсина». Природа. 383 (6601): 637–40. Дои:10.1038 / 383637a0. PMID 8857542. S2CID 4304490.
- Махаджан Р., Дельфин С., Гуан Т., Джерас Л., Мельхиор Ф. (январь 1997 г.). «Небольшой убиквитин-родственный полипептид, участвующий в нацеливании RanGAP1 на комплексный белок RanBP2 ядерных пор». Клетка. 88 (1): 97–107. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81862-0. PMID 9019411. S2CID 17819277.
- Феррейра ПА, Накаяма Т.А., Трэвис Г.Х. (февраль 1997 г.). «Взаимное превращение изоформ красного опсина с помощью циклофилин-родственного шаперонного белка Ran-связывающего белка 2». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (4): 1556–61. Дои:10.1073 / pnas.94.4.1556. ЧВК 19830. PMID 9037092.
- Ясин Н.Р., Блобель Г. (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (9): 4451–6. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4451. ЧВК 20743. PMID 9114010.
- Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (10): 5055–60. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5055. ЧВК 24630. PMID 9144189.
- Krebber H, Bastians H, Hoheisel J, Lichter P, Ponstingl H, Joos S (июль 1997 г.). «Локализация гена, кодирующего Ran-связывающий белок RanBP2, в хромосоме человека 2q11-q13 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 43 (2): 247–8. Дои:10.1006 / geno.1997.4777. PMID 9244446.
- Дельфин С., Гуан Т., Мельхиор Ф, Джерас Л. (декабрь 1997 г.). «RanGTP нацелен на p97 на RanBP2, нитчатый белок, локализованный на цитоплазматической периферии комплекса ядерных пор». Молекулярная биология клетки. 8 (12): 2379–90. Дои:10.1091 / mbc.8.12.2379. ЧВК 25714. PMID 9398662.
- Нотванг Х.Г., Ренсинг С., Кюблер М., Денич Д., Брандл Б., Стубанус М., Хааф Т., Курнит Д., Хильдебрандт Ф. (февраль 1998 г.). «Идентификация нового гена, родственного Ran-связывающему белку 2 (RANBP2L1), и обнаружение кластера генов на хромосоме 2q11-q12 человека». Геномика. 47 (3): 383–92. Дои:10.1006 / geno.1997.5119. PMID 9480752.
- Феррейра П.А., Юнфей С., Шик Д., Роепман Р. (сентябрь 1998 г.). «Циклофилин-подобный домен опосредует ассоциацию Ran-связывающего белка 2 с субъединицами 19 S регуляторного комплекса протеасомы». Журнал биологической химии. 273 (38): 24676–82. Дои:10.1074 / jbc.273.38.24676. PMID 9733766.
- Веттер И.Р., Новак С., Нисимото Т., Кульман Дж., Виттингхофер А. (март 1999 г.). «Структура Ran-связывающего домена в комплексе с Ran, связанным с аналогом GTP: последствия для ядерного транспорта». Природа. 398 (6722): 39–46. Дои:10.1038/17969. PMID 10078529. S2CID 4319742.
- Ясин Н.Р., Блобель Г. (май 1999 г.). «Два различных класса сайтов связывания Ran на нуклеопорине Nup-358». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (10): 5516–21. Дои:10.1073 / пнас.96.10.5516. ЧВК 21891. PMID 10318915.
- Ясин Н.Р., Блобель Г. (сентябрь 1999 г.). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение ядерного импорта на нуклеопорине nup358». Журнал биологической химии. 274 (37): 26493–502. Дои:10.1074 / jbc.274.37.26493. PMID 10473610.
- Сингх BB, Патель Х. Х., Роепман Р., Шик Д., Феррейра, Пенсильвания (декабрь 1999 г.). «Кластерный домен цинкового пальца RanBP2 является специфическим местом стыковки ядерного фактора экспорта, экспортина-1». Журнал биологической химии. 274 (52): 37370–8. Дои:10.1074 / jbc.274.52.37370. PMID 10601307.
- Бен-Эфраим I, Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта». Журнал клеточной биологии. 152 (2): 411–7. Дои:10.1083 / jcb.152.2.411. ЧВК 2199621. PMID 11266456.
- Фаузер С., Аслануков А., Рёпман Р., Феррейра П.А. (июнь 2001 г.). «Геномная организация, экспрессия и локализация гена мышиного Ran-связывающего белка 2 (RanBP2)». Геном млекопитающих. 12 (6): 406–15. Дои:10.1007 / s003350010291. PMID 11353387. S2CID 9263393.
- Мавлютов Т.А., Цай Й, Феррейра П.А. (сентябрь 2002 г.). «Идентификация RanBP2- и кинезин-опосредованных транспортных путей с ограниченной нейрональной и субклеточной локализацией». Трафик. 3 (9): 630–40. Дои:10.1034 / j.1600-0854.2002.30905.x. PMID 12191015. S2CID 26111676.
- Аслануков А., Бховмик Р., Гуруджу М., Освальд Дж., Раз Д., Буш Р.А., Сивинг П.А., Лу Х, Бок С.Б., Феррейра П.А. (октябрь 2006 г.). «RanBP2 модулирует активность Cox11 и гексокиназы I, а гаплонедостаточность RanBP2 вызывает дефицит метаболизма глюкозы». PLOS Genetics. 2 (10): e177. Дои:10.1371 / journal.pgen.0020177. ЧВК 1626108. PMID 17069463.
- Чо К.И., Цай Й, Йи Х, Йе А., Аслануков А., Феррейра П.А. (декабрь 2007 г.). «Ассоциация кинезин-связывающего домена RanBP2 с KIF5B и KIF5C определяет локализацию и функцию митохондрий». Трафик. 8 (12): 1722–35. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2007.00647.x. PMID 17887960. S2CID 25829308.
- Йи Х, Фридман Дж. Л., Феррейра ПА (ноябрь 2007 г.). «Циклофилин-подобный домен Ran-связывающего белка-2 избирательно модулирует активность убиквитин-протеасомной системы и биогенез белка». Журнал биологической химии. 282 (48): 34770–8. Дои:10.1074 / jbc.M706903200. PMID 17911097.
- Dawlaty MM, Malureanu L, Jeganathan KB, Kao E, Sustmann C, Tahk S, Shuai K, Grosschedl R, van Deursen JM (апрель 2008 г.). «Разрешение сестринских центромер требует RanBP2-опосредованного SUMOилирования топоизомеразы IIальфа». Клетка. 133 (1): 103–15. Дои:10.1016 / j.cell.2008.01.045. ЧВК 2693193. PMID 18394993.
- Чо КИ, Йи Х, Йе А., Церенцудол Н., Куадрадо Л., Сирл К., Хао И, Феррейра, Пенсильвания (февраль 2009 г.). «Гаплонедостаточность RanBP2 является нейропротектором против вызванной светом и возрастной дегенерации фоторецепторных нейронов». Гибель клеток и дифференциация. 16 (2): 287–97. Дои:10.1038 / cdd.2008.153. ЧВК 2626153. PMID 18949001.
- Чо КИ, Йи Х, Десаи Р., Хэнд А.Р., Хаас А.Л., Феррейра ПА (май 2009 г.). «RANBP2 представляет собой аллостерический активатор обычного моторного белка кинезина-1, KIF5B, в минимальной бесклеточной системе». EMBO отчеты. 10 (5): 480–6. Дои:10.1038 / embor.2009.29. ЧВК 2680871. PMID 19305391.
PDB галерея | |
|---|---|
|
