UBE2I - Википедия - UBE2I

UBE2I
Protein UBE2I PDB 1a3s.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыUBE2I, C358B7.1, P18, UBC9, убиквитин-конъюгированный фермент E2 I
Внешние идентификаторыOMIM: 601661 MGI: 107365 ГомолоГен: 5574 Генные карты: UBE2I
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Genomic location for UBE2I
Genomic location for UBE2I
Группа16p13.3Начинать1,308,880 бп[1]
Конец1,327,018 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE UBE2I 208760 at fs.png

PBB GE UBE2I 213535 s at fs.png

PBB GE UBE2I 211008 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7329

22196

Ансамбль

ENSG00000103275

ENSMUSG00000015120

UniProt

P63279

P63280

RefSeq (мРНК)

NM_003345
NM_194259
NM_194260
NM_194261

NM_001177609
NM_001177610
NM_011665
NM_001357694

RefSeq (белок)

NP_003336
NP_919235
NP_919236
NP_919237

NP_001171080
NP_001171081
NP_035795
NP_001344623

Расположение (UCSC)Chr 16: 1.31 - 1.33 МбChr 17: 25.26 - 25.27 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

SUMO-конъюгированный фермент UBC9 является фермент что у людей кодируется UBE2I ген.[5] Его также иногда называют «убиквитин-конъюгированным ферментом E2I» или «белком-носителем убиквитина 9», хотя эти названия не совсем точно описывают его функцию.

Выражение

Четыре попеременно соединенных стенограмма варианты, кодирующие то же самое белок были обнаружены для этого гена.[6]

Функция

UBC9 белок кодируемый геном UBE2I составляет ядро ​​в пути сумоилирования клетки. Сумоилирование - это процесс, в котором Малый убиквитин-подобный модификатор (SUMO) ковалентно присоединяется к другим белкам, чтобы изменить их поведение. Например, сумоилирование может повлиять на локализацию белка в клетке, его способность взаимодействовать с другими белками или ДНК.

UBC9 выполняет третий этап жизненного цикла сумоилирования: этап конъюгации. Когда предшественники белка SUMO впервые экспрессируются, они сначала проходят стадию созревания, на которой четыре C-концевые аминокислоты удаляются, выявляя ди-глицин мотив. На втором этапе Активирующий комплекс Е1 связывается с SUMO в своем диглицине и передает его белку E2 Ubc9, где он образует тиоэфир связь с цистеин остаток в каталитическом кармане Ubc9. Загруженный Ubc9 теперь готов к сумоилированию своих различных белков-мишеней (также называемых субстраты ). Он распознает определенный мотив аминокислота остатки на этих субстратах: большой гидрофобный остаток, за которым следует лизин, за которым следует спейсер, за которым следует кислотный остаток. Этот мотив обычно сокращенно описывают как ΨKxD / E. Центральный лизин в мотиве распознавания субстрата вставляется в каталитический карман. Здесь карболксильный конец диглицина SUMO образует пептидная связь с ε-аминогруппа лизина. Этому процессу может способствовать белок лигаза E3.

Процесс сумоилирования обратим. SENP протеазы могут удалять SUMO из сумоилированных белков, освобождая его для использования в дальнейших реакциях сумоилирования.

Клиническая значимость Актуальность

Было показано, что белок UBC9, кодируемый геном UBE2I, является мишенью для множества вирусов, включая ВИЧ и ВПЧ. Была выдвинута гипотеза, что эти вирусы захватывают UBC9 для своих собственных целей.[7]

Взаимодействия

UBE2I был показан взаимодействовать с:

Примечания

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103275 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015120 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ватанабэ Т.К., Фудзивара Т., Кавай А., Симидзу Ф., Таками С., Хирано Х., Окуно С., Одзаки К., Такеда С., Шимада Ю., Нагата М., Такаичи А., Такахаши Е., Накамура Ю., Шин С. (март 1996 г.). «Клонирование, экспрессия и картирование UBE2I, нового гена, кодирующего человеческий гомолог дрожжевых убиквитин-конъюгированных ферментов, которые имеют решающее значение для регуляции клеточного цикла». Cytogenet Cell Genet. 72 (1): 86–9. Дои:10.1159/000134169. PMID  8565643.
  6. ^ «Ген Entrez: UBE2I убиквитин-конъюгированный фермент E2I (гомолог UBC9, дрожжи)».
  7. ^ Варадарадж А., Маттошио Д., Чиокка С. (январь 2014 г.). «Фермент SUMO Ubc9 как вирусная мишень». IUBMB Life. 66 (1): 27–33. Дои:10.1002 / iub.1240. PMID  24395713. S2CID  42047371.
  8. ^ Файрштейн Р., Фейерштейн Н. (март 1998 г.). «Ассоциация активирующего фактора транскрипции 2 (ATF2) с убиквитин-конъюгированным ферментом hUBC9. Влияние пути убиквитин / протеасома в регуляцию ATF2 в Т-клетках». J. Biol. Chem. 273 (10): 5892–902. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5892. PMID  9488727.
  9. ^ Поукка Х., Аарнисало П., Карвонен Ю., Палвимо Дж. Дж., Янне О. А. (июль 1999 г.). «Ubc9 взаимодействует с рецептором андрогенов и активирует рецептор-зависимую транскрипцию». J. Biol. Chem. 274 (27): 19441–6. Дои:10.1074 / jbc.274.27.19441. PMID  10383460.
  10. ^ Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Лазо Дж.С. (декабрь 1998 г.). «Эволюционно консервативная цистеиновая протеаза, блеомицин гидролаза человека, связывается с человеческим гомологом убиквитин-конъюгированного фермента 9». Мол. Pharmacol. 54 (6): 954–61. Дои:10,1124 / моль 54.6.954. PMID  9855622.
  11. ^ а б Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  12. ^ Махон О., Бэкман М., Юлин К., Краусс С. (октябрь 2000 г.). «Дрожжевая двугибридная система идентифицирует убиквитин-конъюгированный фермент mUbc9 как потенциального партнера мышиного Dac». Мех. Dev. 97 (1–2): 3–12. Дои:10.1016 / s0925-4773 (00) 00402-0. PMID  11025202. S2CID  14154139.
  13. ^ Ling Y, Sankpal UT, Робертсон AK, McNally JG, Karpova T, Robertson KD (2004). «Модификация de novo ДНК-метилтрансферазы 3a (Dnmt3a) с помощью SUMO-1 модулирует ее взаимодействие с гистондеацетилазами (HDAC) и ее способность подавлять транскрипцию». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (2): 598–610. Дои:10.1093 / нар / гх195. ЧВК  373322. PMID  14752048.
  14. ^ Канг Э.С., Пак CW, Чанг Дж.Х. (декабрь 2001 г.). «Dnmt3b, de novo ДНК-метилтрансфераза, взаимодействует с SUMO-1 и Ubc9 через свою N-концевую область и может быть модифицирована SUMO-1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 289 (4): 862–8. Дои:10.1006 / bbrc.2001.6057. PMID  11735126.
  15. ^ а б c Книпшер П., Флото А., Клуг Х., Олсен Дж. В., ван Дейк В. Дж., Фиш А., Джонсон Э. С., Манн М., Сикма Т.К., Пихлер А. (август 2008 г.). «Сумоилирование Ubc9 регулирует дискриминацию мишеней SUMO». Мол. Клетка. 31 (3): 371–82. Дои:10.1016 / j.molcel.2008.05.022. PMID  18691969.
  16. ^ Ryu SW, Chae SK, Kim E (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Daxx, белка, связывающего Fas, с сентрином и Ubc9». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 279 (1): 6–10. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3882. PMID  11112409.
  17. ^ Hahn SL, Wasylyk B, Criqui-Filipe P, Criqui P (сентябрь 1997 г.). «Модуляция транскрипционной активности ETS-1 с помощью huUBC9, убиквитин-конъюгированного фермента». Онкоген. 15 (12): 1489–95. Дои:10.1038 / sj.onc.1201301. PMID  9333025. S2CID  26170389.
  18. ^ Ши И, Зоу М., Фарид Н.Р., Патерсон М.С. (декабрь 2000 г.). «Ассоциация FHIT (хрупкая гистидиновая триада), кандидата гена-супрессора опухоли, с убиквитин-конъюгированным ферментом hUBC9». Biochem. J. 352 (2): 443–8. Дои:10.1042/0264-6021:3520443. ЧВК  1221476. PMID  11085938.
  19. ^ Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта». EMBO J. 20 (14): 3685–94. Дои:10.1093 / emboj / 20.14.3685. ЧВК  125545. PMID  11447110.
  20. ^ а б Зальцман А., Сирфосс Дж., Марсиро С., Стоун М., Ресснер Р., Манро Р., Фрэнкс К., Д'Алонсо Дж., Токке Б., Джей М., Иващенко Ю. (апрель 1998 г.). «hUBC9 связывается с MEKK1 и рецептором TNF-альфа типа I и стимулирует активность NFkappaB». FEBS Lett. 425 (3): 431–5. Дои:10.1016 / s0014-5793 (98) 00287-7. PMID  9563508. S2CID  84816080.
  21. ^ Сюй В., Гонг Л., Хаддад М.М., Бишоф О., Кампизи Дж., Йе Е.Т., Медрано Е.Е. (март 2000 г.). «Регулирование уровней белка фактора транскрипции MITF, связанного с микрофтальмией, путем ассоциации с убиквитин-конъюгированным ферментом hUBC9». Exp. Cell Res. 255 (2): 135–43. Дои:10.1006 / exc.2000.4803. PMID  10694430.
  22. ^ а б c Шен З, Пардингтон-Пуртимун ЧП, Комо Дж. К., Мойзис Р. К., Чен Д. Д. (октябрь 1996 г.). «Ассоциации UBE2I с белками RAD52, UBL1, p53 и RAD51 в дрожжевой двугибридной системе». Геномика. 37 (2): 183–186. Дои:10.1006 / geno.1996.0540. PMID  8921390.
  23. ^ а б Minty A, Dumont X, Kaghad M, Caput D (ноябрь 2000 г.). «Ковалентная модификация p73alpha с помощью SUMO-1. Двухгибридный скрининг с p73 идентифицирует новые взаимодействующие с SUMO-1 белки и мотив взаимодействия SUMO-1». J. Biol. Chem. 275 (46): 36316–23. Дои:10.1074 / jbc.M004293200. PMID  10961991.
  24. ^ Галлахер В.М., Аргентини М., Сьерра V, Бракко Л., Дебюше Л., Консейлер Е. (июнь 1999 г.). «MBP1: новый мутантный p53-специфический белок-партнер с онкогенными свойствами». Онкоген. 18 (24): 3608–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1202937. PMID  10380882.
  25. ^ Bernier-Villamor V, Sampson DA, Matunis MJ, Lima CD (февраль 2002 г.). «Структурная основа E2-опосредованной конъюгации SUMO, выявленная комплексом между убиквитин-конъюгированным ферментом Ubc9 и RanGAP1». Клетка. 108 (3): 345–56. Дои:10.1016 / с0092-8674 (02) 00630-х. PMID  11853669. S2CID  15512250.
  26. ^ а б Ли Б.Х., Ёсимацу К., Маэда А., Очиай К., Моримацу М., Араки К., Огино М., Морикава С., Арикава Дж. (Декабрь 2003 г.). «Ассоциация нуклеокапсидного белка хантавирусов Сеула и Хантаана с небольшими молекулами, родственными убиквитин-подобному модификатору-1». Вирус Res. 98 (1): 83–91. Дои:10.1016 / j.virusres.2003.09.001. PMID  14609633.
  27. ^ Sapetschnig A, Rischitor G, Braun H, Doll A, Schergaut M, Melchior F, Suske G (октябрь 2002 г.). «Фактор транскрипции Sp3 подавляется посредством модификации SUMO с помощью PIAS1». EMBO J. 21 (19): 5206–15. Дои:10.1093 / emboj / cdf510. ЧВК  129032. PMID  12356736.
  28. ^ Кахио Т., Нисида Т., Ясуда Х. (сентябрь 2001 г.). «Участие PIAS1 в сумоилировании супрессора опухолей р53». Мол. Клетка. 8 (3): 713–8. Дои:10.1016 / с1097-2765 (01) 00349-5. PMID  11583632.
  29. ^ Коваленко О.В., Plug AW, Haaf T, Gonda DK, Ashley T, Ward DC, Radding CM, Golub EI (апрель 1996 г.). «Убиквитин-конъюгирующий фермент млекопитающих Ubc9 взаимодействует с рекомбинационным белком Rad51 и локализуется в синаптонемных комплексах». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (7): 2958–63. Дои:10.1073 / пнас.93.7.2958. ЧВК  39742. PMID  8610150.
  30. ^ а б c d Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3: 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
  31. ^ Чжан Х., Сайто Х., Матунис М.Дж. (сентябрь 2002 г.). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в филаментах комплекса ядерных пор». Мол. Клетка. Биол. 22 (18): 6498–508. Дои:10.1128 / mcb.22.18.6498-6508.2002. ЧВК  135644. PMID  12192048.
  32. ^ а б Татхам М.Х., Ким С., Ю Би, Джафрей Э, Сонг Дж, Чжэн Дж, Родригес М.С., Хэй РТ, Чен Й (август 2003 г.) «Роль N-концевого сайта Ubc9 в связывании и конъюгации SUMO-1, -2 и -3». Биохимия. 42 (33): 9959–69. Дои:10.1021 / bi0345283. PMID  12924945.
  33. ^ Нетцер С., Боландер С.К., Ригер Л., Мюллер С., Кольхасе Дж. (Август 2002 г.). «Взаимодействие развивающего регулятора SALL1 с UBE2I и SUMO-1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 296 (4): 870–6. Дои:10.1016 / с0006-291х (02) 02003-х. PMID  12200128.
  34. ^ Хаггинс Г.С., Чин М.Т., Сибинга Н.Э., Ли С.Л., Хабер Э., Ли М.Э. (октябрь 1999 г.). «Характеристика сайтов связывания mUBC9, необходимых для деградации белка E2A». J. Biol. Chem. 274 (40): 28690–6. Дои:10.1074 / jbc.274.40.28690. PMID  10497239.
  35. ^ Мао Ю., Сунь М., Десаи С.Д., Лю Л.Ф. (апрель 2000 г.). «Конъюгация SUMO-1 с топоизомеразой I: возможный ответ репарации на опосредованное топоизомеразой повреждение ДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (8): 4046–51. Дои:10.1073 / pnas.080536597. ЧВК  18143. PMID  10759568.
  36. ^ Wang ZY, Qiu QQ, Seufert W., Taguchi T., Testa JR, Whitmore SA, Callen DF, Welsh D, Shenk T., Deuel TF (октябрь 1996 г.). «Молекулярное клонирование кДНК и хромосомная локализация гена человеческого убиквитин-конъюгированного фермента 9». J. Biol. Chem. 271 (40): 24811–6. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24811. PMID  8798754.

Рекомендации