ДНКJB6 - DNAJB6

ДНКJB6
Идентификаторы
Псевдонимы	ДНКJB6, Dnajb6, Mrj, mDj4, DJ4, DnaJ, HHDJ1, HSJ-2, HSJ2, LGMD1D, LGMD1E, MSJ-1, DnaJ, член семейства белков теплового шока (Hsp40) B6, LGMDD1
Внешние идентификаторы	OMIM: 611332 MGI: 1344381 ГомолоГен: 38058 Генные карты: ДНКJB6
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	157,417,439 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	29,818,134 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• привязка шаперона; • связывание с белками теплового шока; • развернутое связывание с белками; • GO: 0001948 связывание с белками; • Активность активатора АТФазы; • идентичное связывание с белками; • Связывание ДНК;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • цитозоль; • мембрана; • нуклеоплазма; • Z диск; • перинуклеарная область цитоплазмы; • ядро клетки;
Биологический процесс	• организация промежуточной нити; • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе; • отрицательное регулирование сборки тела включения; • регулирование локализации белка; • сворачивание белка; • регуляция клеточного ответа на тепло; • положительная регуляция активности АТФазы; • организация актинового цитоскелета; • организация внеклеточного матрикса; • локализация белка в ядре; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • хорио-аллантоисный синтез; • дифференцировка клеток синцитиотрофобластов, участвующих в развитии лабиринтного слоя; • развитие хориона;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10049
	23950
	ENSG00000105993
	ENSMUSG00000029131
	O75190
	O54946
	NM_005494; NM_058246; NM_001363676
NM_001037940; NM_001037941; NM_001127367; NM_011847; NM_001359198;
	NM_001378835
	NP_005485; NP_490647; NP_001350605
NP_001033029; NP_001033030; NP_001120839; NP_035977; NP_001346127;
	NP_001365764
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

DnaJ гомолог подсемейства B член 6 это белок что у людей кодируется ДНКJB6 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков DNAJ. Члены семейства DNAJ характеризуются высококонсервативным аминокислотным участком, называемым «J-доменом», и функционируют как один из двух основных классов молекулярных шаперонов, участвующих в широком диапазоне клеточных событий, таких как сворачивание белка и сборка олигомерного белкового комплекса. Этот член семейства может также играть роль в агрегации полиглутамина в определенных нейронах. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскрипта; однако не все варианты описаны полностью.^[7]

Взаимодействия

Было показано, что DNAJB6 взаимодействовать с участием Кератин 18.^[8] Также было показано, что агрегация Aβ42 (процесс, связанный, например, с болезнью Альцгеймера) замедляется DNAJB6 в зависимости от концентрации, что распространяется до очень низких субстехиометрических молярных соотношений шаперона к пептиду.^[9]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105993 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000029131 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Секи Н., Хаттори А., Хаяси А., Кодзума С., Миядзима Н., Сайто Т. (июнь 1999 г.). «Клонирование, тканевая экспрессия и хромосомная принадлежность гена MRJ человека для члена семейства белков DNAJ». J Hum Genet. 44 (3): 185–9. Дои:10.1007 / с100380050139. PMID 10319584.
^ Пей Л. (март 1999 г.). «Ген-белок, трансформирующий опухоль гипофиза, ассоциируется с рибосомным белком S10 и новым человеческим гомологом DnaJ в клетках яичек». J Biol Chem. 274 (5): 3151–8. Дои:10.1074 / jbc.274.5.3151. PMID 9915854.
^ ^а ^б «Ген Entrez: ДНКJB6, гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство B, член 6».
^ Идзава I, Нисидзава М., Отакара К., Оцука К., Инада Х, Инагаки М. (2000). «Идентификация Mrj, белка семейства DnaJ / Hsp40, в качестве регуляторного белка кератина 8/18 филаментов». J. Biol. Chem. 275 (44): 34521–7. Дои:10.1074 / jbc.M003492200. PMID 10954706.
^ Månsson, C; Arosio, P; Hussein, R; Кампинга, H H; Хашем, R M; Boelens, W C; Эмануэльссон, К. (2014). «Взаимодействие молекулярного шаперона DNAJB6 с растущими агрегатами бета-амилоида 42 (Aβ42) приводит к субстехиометрическому ингибированию образования амилоида». J. Biol. Chem. 289 (45): 31066–76. Дои:10.1074 / jbc.M114.595124. ЧВК 4223311. PMID 25217638.

дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Идзава И., Нисидзава М., Отакара К. и др. (2000). «Идентификация Mrj, белка семейства DnaJ / Hsp40, в качестве регуляторного белка кератина 8/18 филаментов». J. Biol. Chem. 275 (44): 34521–7. Дои:10.1074 / jbc.M003492200. PMID 10954706.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Оцука К., Хата М. (2001). «Гомологи HSP40 / DNAJ млекопитающих: клонирование новых кДНК и предложение по их классификации и номенклатуре». Шапероны клеточного стресса. 5 (2): 98–112. Дои:10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0098: MHDHCO> 2.0.CO; 2. ISSN 1466-1268. ЧВК 312896. PMID 11147971.
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
Чуанг Дж. З., Чжоу Х., Чжу М. и др. (2002). «Характеристика обогащенного головным мозгом шаперона MRJ, который независимо ингибирует агрегацию и токсичность Хантингтина». J. Biol. Chem. 277 (22): 19831–8. Дои:10.1074 / jbc.M109613200. PMID 11896048.
Фаринья С.М., Ногейра П., Мендес Ф. и др. (2002). «Гомолог DnaJ человека (Hdj) -1 / белок теплового шока (Hsp) 40 ко-шаперон необходим для стабилизации in vivo регулятора трансмембранной проводимости муковисцидоза с помощью Hsp70». Biochem. J. 366 (Pt 3): 797–806. Дои:10.1042 / BJ20011717. ЧВК 1222832. PMID 12069690.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома 7 человека: последовательность ДНК и биология». Наука. 300 (5620): 767–72. Дои:10.1126 / science.1083423. ЧВК 2882961. PMID 12690205.
Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Дои:10.1038 / природа01782. PMID 12853948.
Ханай Р., Машима К. (2004). «Характеристика двух изоформ гомолога DnaJ человека, HSJ2». Мол. Биол. Представитель. 30 (3): 149–53. Дои:10.1023 / А: 1024916223616. PMID 12974469. S2CID 24105834.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Лю Ю., Чжу М.С., Ван Ю.Дж. и др. (2004). «[Клонирование шаперона PBP гомолога DnaJ и его субклеточная локализация]». Си Бао Ю Фен Цзы Миан И Сюэ За Чжи. 19 (6): 531–4. PMID 15182641.
Беррути Дж., Мартегани Э. (2005). «Деубиквитинирующий фермент mUBPy взаимодействует со специфическим для сперматозоидов молекулярным шапероном MSJ-1: связь с протеасомой, акросомой и центросомой в мужских половых клетках мыши». Биол. Репрод. 72 (1): 14–21. Дои:10.1095 / биолрепрод.104.030866. PMID 15342353.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Дай Ю.С., Сюй Дж., Молькентин Д.Д. (2005). «Связанный с DnaJ фактор Mrj взаимодействует с ядерным фактором активированных Т-клеток c3 и опосредует репрессию транскрипции посредством привлечения гистон-деацетилазы класса II». Мол. Cell. Биол. 25 (22): 9936–48. Дои:10.1128 / MCB.25.22.9936-9948.2005. ЧВК 1280278. PMID 16260608.

внешние ссылки

ДНКJB6 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
ДНКJB6 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105993 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000029131 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10319584-5] Секи Н., Хаттори А., Хаяси А., Кодзума С., Миядзима Н., Сайто Т. (июнь 1999 г.). «Клонирование, тканевая экспрессия и хромосомная принадлежность гена MRJ человека для члена семейства белков DNAJ». J Hum Genet. 44 (3): 185–9. Дои:10.1007 / с100380050139. PMID 10319584.

[pmid9915854-6] Пей Л. (март 1999 г.). «Ген-белок, трансформирующий опухоль гипофиза, ассоциируется с рибосомным белком S10 и новым человеческим гомологом DnaJ в клетках яичек». J Biol Chem. 274 (5): 3151–8. Дои:10.1074 / jbc.274.5.3151. PMID 9915854.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: ДНКJB6, гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство B, член 6».

[pmid10954706-8] Идзава I, Нисидзава М., Отакара К., Оцука К., Инада Х, Инагаки М. (2000). «Идентификация Mrj, белка семейства DnaJ / Hsp40, в качестве регуляторного белка кератина 8/18 филаментов». J. Biol. Chem. 275 (44): 34521–7. Дои:10.1074 / jbc.M003492200. PMID 10954706.

[pmid25217638-9] Månsson, C; Arosio, P; Hussein, R; Кампинга, H H; Хашем, R M; Boelens, W C; Эмануэльссон, К. (2014). «Взаимодействие молекулярного шаперона DNAJB6 с растущими агрегатами бета-амилоида 42 (Aβ42) приводит к субстехиометрическому ингибированию образования амилоида». J. Biol. Chem. 289 (45): 31066–76. Дои:10.1074 / jbc.M114.595124. ЧВК 4223311. PMID 25217638.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]