Атаксин 3 - Ataxin 3
Атаксин-3 это белок что у людей кодируется ATXN3 ген.[5][6]
Клиническое значение
Болезнь Мачадо-Джозефа, также известная как спиноцеребеллярная атаксия-3, является аутосомно-доминантный неврологическое расстройство. Белок, кодируемый геном ATXN3, содержит (CAG) n повторы в кодирующей области, и увеличение этих повторов с нормальных 13-36 до 68-79 является причиной Болезнь Мачадо-Джозефа. Существует обратная корреляция между возрастом начала и количеством повторов CAG. Для этого гена были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.[6]
Взаимодействия
Было показано, что атаксин 3 взаимодействовать с:
Модельные организмы
Модельные организмы были использованы при изучении функции ATXN3. Условный нокаутирующая мышь линия называется Atxn3tm1a (КОМП) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[10] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[11] для определения последствий удаления.[12][13][14][15] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[16] - углубленное фенотипирование костей и хрящей[17]
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Все данные доступны на сайте.[11][16][17] | |
| Лейкоциты периферической крови 6 недель | Нормальный |
| Инсулин | Нормальный |
| Гематология 6 недель | Нормальный |
| Гомозиготная жизнеспособность на P14 | Нормальный |
| Гомозиготная фертильность | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология 16 недель | Нормальный |
| Лейкоциты периферической крови 16 недель | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный |
| Функция цитотоксических Т-клеток | Нормальный |
| Иммунофенотипирование селезенки | Нормальный |
| Иммунофенотипирование мезентериальных лимфатических узлов | Нормальный |
| Иммунофенотипирование костного мозга | Нормальный |
| Состав эпидермального иммунитета | Нормальный |
| Проблема гриппа | Нормальный |
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000066427 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021189 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Takiyama Y, Nishizawa M, Tanaka H, Kawashima S, Sakamoto H, Karube Y, Shimazaki H, Soutome M, Endo K, Ohta S (июль 1993 г.). «Ген болезни Мачадо-Джозефа отображается на хромосоме 14q человека». Природа Генетика. 4 (3): 300–4. Дои:10.1038 / ng0793-300. PMID 8358439. S2CID 27424416.
- ^ а б «Энтрез Ген: атаксин 3 ATXN3».
- ^ а б Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B». Молекулярная генетика человека. 9 (12): 1795–803. Дои:10.1093 / hmg / 9.12.1795. PMID 10915768.
- ^ Doss-Pepe EW, Stenroos ES, Johnson WG, Madura K (сентябрь 2003 г.). «Взаимодействие атаксина-3 с rad23 и валозин-содержащим белком и его ассоциации с цепями убиквитина и протеасомой согласуются с ролью в протеолизе, опосредованном убиквитином». Молекулярная и клеточная биология. 23 (18): 6469–83. Дои:10.1128 / MCB.23.18.6469-6483.2003. ЧВК 193705. PMID 12944474.
- ^ Ван Кью, Ли Л., Йе Й (март 2008 г.). «Ингибирование p97-зависимой деградации белка под действием Иарестатина I». Журнал биологической химии. 283 (12): 7445–54. Дои:10.1074 / jbc.M708347200. ЧВК 2276333. PMID 18199748.
- ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
- ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Проект генетики мышей, Таннахилл Д., Логан Д.В., Макартур Д.Г., Флинт Дж., Махаджан В.Б., Цанг С.Х., Смит I, Ватт FM, Скарнес В.К., Дуган Джи, Адамс DJ, Рамирес-Солис Р., Брэдли А., Сталь КП (2013) . «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК 3717207. PMID 23870131.
- ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».
- ^ а б «Консорциум OBCD».
дальнейшее чтение
- Гото Дж., Ватанабе М., Итикава Й., Йи С.Б., Ихара Н., Эндо К., Игараси С., Такияма Й., Гаспар С., Масиэл П., Цудзи С., Роуло Г.А., Канадзава И. (август 1997 г.). «Продукты гена болезни Мачадо-Джозефа, несущие различные карбоксильные окончания». Нейробиологические исследования. 28 (4): 373–7. Дои:10.1016 / S0168-0102 (97) 00056-4. PMID 9274833. S2CID 27241785.
- Schöls L, Vieira-Saecker AM, Schöls S, Przuntek H, Epplen JT, Riess O (июнь 1995 г.). «Экспансия тринуклеотидов в гене MJD1 клинически проявляется как спиноцеребеллярная атаксия и чаще всего встречается у немецких пациентов с SCA». Молекулярная генетика человека. 4 (6): 1001–5. Дои:10.1093 / hmg / 4.6.1001. PMID 7655453.
- Стеванин Г., Кансел Дж., Дюрр А., Чнейвейс Х., Дубург О., Вайссенбах Дж., Канн Х. М., Аджид Й, Брайс А. (январь 1995 г.). «Ген спинномозговой атаксии 3 (SCA3) расположен в области примерно 3 сМ на хромосоме 14q24.3-q32.2». Американский журнал генетики человека. 56 (1): 193–201. ЧВК 1801316. PMID 7825578.
- Кавагути Ю., Окамото Т., Таниваки М., Айзава М., Иноуэ М., Катаяма С., Каваками Х., Накамура С., Нисимура М., Акигучи И. (ноябрь 1994 г.). «Расширения CAG в новом гене болезни Мачадо-Джозефа на хромосоме 14q32.1». Природа Генетика. 8 (3): 221–8. Дои:10.1038 / ng1194-221. PMID 7874163. S2CID 29188685.
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Икеда Х., Ямагути М., Сугай С., Азе Й., Нарумия С., Какидзука А. (июнь 1996 г.). «Расширенный полиглутамин в белке болезни Мачадо-Джозефа вызывает гибель клеток in vitro и in vivo». Природа Генетика. 13 (2): 196–202. Дои:10.1038 / ng0696-196. PMID 8640226. S2CID 21966287.
- Paulson HL, Das SS, Crino PB, Perez MK, Patel SC, Gotsdiner D, Fischbeck KH, Pittman RN (апрель 1997 г.). «Продукт гена болезни Мачадо-Джозефа представляет собой цитоплазматический белок, широко экспрессирующийся в головном мозге». Анналы неврологии. 41 (4): 453–62. Дои:10.1002 / ana.410410408. PMID 9124802. S2CID 43460483.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Wellington CL, Ellerby LM, Hackam AS, Margolis RL, Trifiro MA, Singaraja R, McCutcheon K, Salvesen GS, Propp SS, Bromm M, Rowland KJ, Zhang T, Rasper D, Roy S, Thornberry N, Pinsky L, Kakizuka A , Росс CA, Николсон Д.В., Бредесен Д.Е., Хайден М.Р. (апрель 1998 г.). «Расщепление каспазой генных продуктов, связанных с нарушениями триплетной экспансии, приводит к образованию усеченных фрагментов, содержащих полиглутаминовый тракт». Журнал биологической химии. 273 (15): 9158–67. Дои:10.1074 / jbc.273.15.9158. PMID 9535906.
- Таит Д., Риччио М., Ситтлер А., Шерзингер Е., Санти С., Огнибене А., Маральди Н. М., Лехрах Н., Ванкер Е. Е. (июнь 1998 г.). «Атаксин-3 транспортируется в ядро и связывается с ядерным матриксом». Молекулярная генетика человека. 7 (6): 991–7. Дои:10,1093 / чмг / 7,6,991. PMID 9580663.
- Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B». Молекулярная генетика человека. 9 (12): 1795–803. Дои:10.1093 / hmg / 9.12.1795. PMID 10915768.
- Итикава Ю., Гото Дж., Хаттори М., Тойода А., Исии К., Чон С.Ю., Хашида Н., Масуда Н., Огата К., Касаи Ф., Хираи М., Масиэль П., Роуло Г.А., Сакаки И., Канадзава И. (2001). «Геномная структура и экспрессия MJD, гена болезни Мачадо-Джозефа». Журнал генетики человека. 46 (7): 413–22. Дои:10.1007 / с100380170060. PMID 11450850.
- Чай И, Шао Дж, Миллер В.М., Уильямс А., Полсон Х.Л. (июль 2002 г.). «Визуализация живых клеток показывает дивергентную внутриклеточную динамику белков полиглютаминовой болезни и поддерживает модель патогенеза секвестрации». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (14): 9310–5. Bibcode:2002PNAS ... 99.9310C. Дои:10.1073 / pnas.152101299. ЧВК 123137. PMID 12084819.
- Йошида Х, Йошизава Т., Сибасаки Ф., Сёдзи С., Канадзава И. (июль 2002 г.). «Химические шапероны уменьшают образование агрегатов и гибель клеток, вызванные усеченным продуктом гена болезни Мачадо-Джозефа с расширенным полиглутаминовым участком». Нейробиология болезней. 10 (2): 88–99. Дои:10.1006 / nbdi.2002.0502. PMID 12127147. S2CID 25183307.
- Ли Ф, Макфарлан Т., Питтман Р.Н., Чакраварти Д. (ноябрь 2002 г.). «Атаксин-3 - это гистон-связывающий белок с двумя независимыми транскрипционными корепрессорами». Журнал биологической химии. 277 (47): 45004–12. Дои:10.1074 / jbc.M205259200. PMID 12297501.
- Альбрехт М., Хоффманн Д., Эверт Б.О., Шмитт И., Вюлльнер Ю., Ленгауэр Т. (февраль 2003 г.). «Структурное моделирование атаксина-3 показывает отдаленную гомологию с адаптинами». Белки. 50 (2): 355–70. Дои:10.1002 / prot.10280. PMID 12486728.
- Маршал С., Шехи Е., Харрикейн М.К., Фузи П., Хейтц Ф., Тортора П., Ланге Р. (август 2003 г.). «Структурная нестабильность и фибриллярная агрегация нерасширенного человеческого атаксина-3, выявленная под высоким давлением и температурой». Журнал биологической химии. 278 (34): 31554–63. Дои:10.1074 / jbc.M304205200. PMID 12766160.
внешняя ссылка
- GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о спиноцеребеллярной атаксии 3 типа
- Человек ATXN3 расположение генома и ATXN3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
PDB галерея | |
|---|---|
|
