UBE2E1 - UBE2E1

UBE2E1
Белок UBE2E1 PDB 1y6l.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыUBE2E1, UBCH6, убиквитин-конъюгированный фермент E2 E1
Внешние идентификаторыOMIM: 602916 MGI: 107411 ГомолоГен: 84372 Генные карты: UBE2E1
Номер ЕС2.3.2.24
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение UBE2E1
Геномное расположение UBE2E1
Группа3п24.2Начинать23,805,955 бп[1]
Конец23,891,640 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE UBE2E1 212519 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001202476
NM_003341
NM_182666

NM_009455

RefSeq (белок)

NP_001189405
NP_003332
NP_872607
NP_003332.1

NP_033481

Расположение (UCSC)Chr 3: 23.81 - 23.89 МбChr 14: 18.28 - 18.33 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Убиквитин-конъюгированный фермент E2 E1 это белок что у людей кодируется UBE2E1 ген.[5][6]

Функция

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом для нацеливания на аномальные или короткоживущие белки для деградации. Убиквитинирование включает по крайней мере три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин, или E1, ферменты, конъюгирующие с убиквитином, или E2, и лигазы убиквитин-протеин, или E3. Этот ген кодирует член семейства E2-убиквитин-конъюгированных ферментов. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[6]

Взаимодействия

UBE2E1 был показан взаимодействовать с Атаксин 1[7] и NEDD4.[8][9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170142 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021774 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Nuber U, Schwarz S, Kaiser P, Schneider R, Scheffner M (март 1996 г.). «Клонирование человеческих убиквитин-конъюгированных ферментов UbcH6 и UbcH7 (E2-F1) и характеристика их взаимодействия с E6-AP и RSP5». J. Biol. Chem. 271 (5): 2795–800. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2795. PMID  8576257.
  6. ^ а б «Ген Entrez: UBE2E1 убиквитин-конъюгированный фермент E2E 1 (гомолог UBC4 / 5, дрожжи)».
  7. ^ Хун С., Ли С., Чо С., Кан С. (июнь 2008 г.). «UbcH6 взаимодействует и убиквитинирует продукт гена SCA1 - атаксин-1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 371 (2): 256–60. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.04.066. PMID  18439907.
  8. ^ Анан Т., Нагата Й, Кога Х, Хонда Й, Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф, Сая Х, Накао М. (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-протеинлигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и селективное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Гены Клетки. 3 (11): 751–63. Дои:10.1046 / j.1365-2443.1998.00227.x. PMID  9990509. S2CID  1653536.
  9. ^ Малахова О.А., Чжан Д.Е. (апрель 2008 г.). «ISG15 ингибирует активность убиквитина E3 Nedd4 и усиливает врожденный противовирусный ответ». J. Biol. Chem. 283 (14): 8783–7. Дои:10.1074 / jbc.C800030200. ЧВК  2276364. PMID  18287095.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого убиквитин-конъюгированного фермента E2 E1 (UBE2E1)