UBE2V2 - UBE2V2
Убиквитин-конъюгированный фермент E2 вариант 2 это белок что у людей кодируется UBE2V2 ген.[5][6] Варианты белков E2, конъюгирующих с убиквитином, составляют отдельное подсемейство в семействе белков E2.
Структура
UBE2V2 имеет сходство последовательности с другими убиквитин-конъюгирующие ферменты но лишены консервативного остатка цистеина, который имеет решающее значение для каталитической активности E2s. Белок, кодируемый этим геном, также имеет гомологию с убиквитин-конъюгированным ферментом E2 вариант 1 и продуктом дрожжевого гена MMS2.[7]
Функция
UBE2V2 также используется в качестве внутриклеточного сенсора реактивных электрофильных видов, которые присутствуют в больших количествах в периоды патогенного и / или экологического стресса.[8] Остаток C69 UBE2V2 способен связываться с различными РЕС. Было показано, что связывание RES с UBE2V2 способствует UBE2V2-опосредованной активации Ube2N, другого белка E2, который образует комплекс с UBE2V2. Было показано, что активированный Ube2N играет важную роль в стимулировании реакций повреждения ДНК. Таким образом, UBE2V2 может способствовать целостности генома, непосредственно воспринимая RES и воздействуя на реакции на повреждение ДНК.[9] Он также может участвовать в дифференцировке моноцитов и энтероцитов.[7]
Взаимодействия
UBE2V2 был показан взаимодействовать с участием HLTF.[10] Хотя сам UBE2V2 не обладает убиквитин-конъюгирующей активностью, он может взаимодействовать с различными Убиквитин-конъюгирующие ферменты для облегчения их каталитической активности.[11] Например, UBE2V2 может образовывать комплекс с UBE2N с образованием гетеродимера, способного синтезировать связанные с Lys-63 полиубиквитиновые цепи.[12] UBE2V2 может способствовать активности UBE2N, координируя позиционирование UBE2N, чтобы способствовать формированию убиквитиновой цепи, особенно в Lys-63, поскольку молекула убиквитина имеет несколько потенциальных сайтов связывания лизина.[13] Точно так же было показано, что UBE2V2 взаимодействует с убиквитин-конъюгированным ферментом Ubc13, чтобы побудить Ubc13 принять активную конформацию, которая может создавать полиубитуитиновые цепи Lys-63 на различных субстратах.[14]
Добавление цепей полиубиквитина Lys-63 к внутриклеточным мишеням отличается от канонических цепей полиубиквитина Lys-48 тем, что цепи Lys-63 не опосредуют протеасомную деградацию его субстрата.[15] Хотя их функция остается плохо изученной, было показано, что цепи Lys-63 регулируют сигнальные пути путем активации или ингибирования функции целевого белка.[16] Например, TRIM5alpha Ограничение обратной транскрипции ретровирусов зависит от UBE2V2 / UBE2N-опосредованного полиубиквитинирования.[17] Было показано, что UBE2V2 регулирует TRIM21 противовирусная активность аналогичным образом.[18]
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169139 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022674 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Санчо Э., Вила М.Р., Санчес-Пулидо Л., Лозано Дж. Дж., Пачуччи Р., Надаль М., Фокс М., Харви С., Беркович Б., Лукили Н., Цехановер А., Лин С.Л., Санс Ф., Эстивилл Х, Валенсия А., Томсон TM ( Январь 1998 г.). «Роль UEV-1, неактивного варианта E2 убиквитин-конъюгированных ферментов, в дифференцировке in vitro и поведении клеточного цикла мукосекреторных клеток кишечника HT-29-M6». Молекулярная и клеточная биология. 18 (1): 576–89. Дои:10.1128 / mcb.18.1.576. ЧВК 121525. PMID 9418904.
- ^ Fritsche J, Rehli M, Krause SW, Andreesen R, Kreutz M (июнь 1997 г.). «Молекулярное клонирование 1альфа, 25-дигидроксивитамина D3-индуцируемого транскрипта (DDVit 1) в моноцитах крови человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 235 (2): 407–12. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6798. PMID 9199207.
- ^ а б "Ген Entrez: UBE2V2 убиквитин-конъюгированный фермент E2 вариант 2".
- ^ Фермер Е.Е., Давуан С. (август 2007 г.). «Реактивные электрофильные виды». Текущее мнение в области биологии растений. 10 (4): 380–6. Дои:10.1016 / j.pbi.2007.04.019. PMID 17646124.
- ^ Чжао Й, Лонг MJ, Ван И, Чжан С., Ай Й (февраль 2018 г.). «Ube2V2 - это розеттский камень, соединяющий редокс-коды и убиквитин-коды, координирующий реакцию на повреждение ДНК». ACS Central Science. 4 (2): 246–259. Дои:10.1021 / acscentsci.7b00556. ЧВК 5833000. PMID 29532025.
- ^ Унк И., Хайду И., Фатйол К., Гурвиц Дж., Юн Дж. Х., Пракаш Л., Пракаш С., Харачка Л. (март 2008 г.). «Человеческий HLTF функционирует как убиквитинлигаза для полиубиквитинирования ядерного антигена пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (10): 3768–73. Дои:10.1073 / pnas.0800563105. ЧВК 2268824. PMID 18316726.
- ^ Стюарт М.Д., Риттерхофф Т., Клевит Р.Э., Бржович П.С. (апрель 2016 г.). «Ферменты E2: больше, чем просто посредники». Клеточные исследования. 26 (4): 423–40. Дои:10.1038 / cr.2016.35. ЧВК 4822130. PMID 27002219.
- ^ Флетчер А.Дж., Кристенсен Д.Е., Нельсон К., Тан С.П., Шаллер Т., Ленер П.Дж., Сандквист В.И., Towers GJ (август 2015 г.). «TRIM5α требует, чтобы Ube2W закреплял Lys63-связанные цепи убиквитина и ограничивал обратную транскрипцию». Журнал EMBO. 34 (15): 2078–95. Дои:10.15252 / embj.201490361. ЧВК 4551353. PMID 26101372.
- ^ Эддинс MJ, Карлайл CM, Гомес KM, Pickart CM, Wolberger C (октябрь 2006 г.). «Mms2-Ubc13, ковалентно связанный с убиквитином, раскрывает структурную основу образования полиубиквитиновой цепи, специфичной для связывания». Структурная и молекулярная биология природы. 13 (10): 915–20. Дои:10.1038 / nsmb1148. PMID 16980971. S2CID 6757737.
- ^ Браниган Э., Плеханова А., Джафрей Э.Г., Нейсмит Дж. Х., Hay RT (август 2015 г.). «Структурная основа для RING-катализируемого синтеза K63-связанных цепей убиквитина». Структурная и молекулярная биология природы. 22 (8): 597–602. Дои:10.1038 / nsmb.3052. ЧВК 4529489. PMID 26148049.
- ^ Флетчер А.Дж., Кристенсен Д.Е., Нельсон С., Тан С.П., Шаллер Т., Ленер П.Дж., Сандквист В.И., Towers GJ (август 2015 г.). «TRIM5α требует, чтобы Ube2W закреплял Lys63-связанные цепи убиквитина и ограничивал обратную транскрипцию». Журнал EMBO. 34 (15): 2078–95. Дои:10.15252 / embj.201490361. ЧВК 4551353. PMID 26101372.
- ^ «UBE2N - убиквитин-конъюгированный фермент E2 N - Homo sapiens (человек) - ген и белок UBE2N». www.uniprot.org. Получено 2018-04-06.
- ^ Флетчер А.Дж., Кристенсен Д.Е., Нельсон К., Тан С.П., Шаллер Т., Ленер П.Дж., Сандквист В.И., Towers GJ (август 2015 г.). «TRIM5α требует, чтобы Ube2W закреплял Lys63-связанные цепи убиквитина и ограничивал обратную транскрипцию». Журнал EMBO. 34 (15): 2078–95. Дои:10.15252 / embj.201490361. ЧВК 4551353. PMID 26101372.
- ^ Флетчер А.Дж., Маллери Д.Л., Уоткинсон Р.Э., Диксон К.Ф., Джеймс Л.К. (август 2015 г.). «Ферменты последовательного убиквитинирования и деубиквитинирования синхронизируют двойную сенсорную и эффекторную функции TRIM21». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (32): 10014–9. Дои:10.1073 / pnas.1507534112. ЧВК 4538650. PMID 26150489.
дальнейшее чтение
- Сяо В., Линь С.Л., Брумфилд С., Чоу Б.Л., Вэй Ю.Ф. (сентябрь 1998 г.). «Продукты дрожжевого MMS2 и двух человеческих гомологов (hMMS2 и CROC-1) определяют структурно и функционально консервативное семейство Ubc-подобных белков». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (17): 3908–14. Дои:10.1093 / nar / 26.17.3908. ЧВК 147796. PMID 9705497.
- Хофманн Р.М., Пикарт С.М. (март 1999 г.). «Неканонический MMS2-кодируемый убиквитин-конъюгированный фермент выполняет функции сборки новых полиубиквитиновых цепей для репарации ДНК». Ячейка. 96 (5): 645–53. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80575-9. PMID 10089880. S2CID 17117789.
- Чан Н.Л., Хилл КП (август 2001 г.). «Определение топологии цепи полиубиквитина». Структурная биология природы. 8 (8): 650–2. Дои:10.1038/90337. PMID 11473244. S2CID 16579945.
- Мораес Т.Ф., Эдвардс Р.А., МакКенна С., Пастушок Л., Сяо В., Гловер Дж. Н., Эллисон М.Дж. (август 2001 г.). «Кристаллическая структура человеческого комплекса ферментов, конъюгированных с убиквитином, hMms2-hUbc13». Структурная биология природы. 8 (8): 669–73. Дои:10.1038/90373. PMID 11473255. S2CID 23504541.
- Геваерт К., Гётальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (Май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природа Биотехнологии. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
- Bothos J, Summers MK, Venere M, Scolnick DM, Halazonetis TD (октябрь 2003 г.). «Белок митотической контрольной точки Chfr функционирует с Ubc13-Mms2 с образованием Lys63-связанных полиубиквитиновых цепей». Онкоген. 22 (46): 7101–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1206831. PMID 14562038.
- Чжоу Х., Вертц И., О'Рурк К., Ультч М., Сешагири С., Эби М., Сяо В., Диксит В.М. (январь 2004 г.). «Bcl10 активирует путь NF-kappaB посредством убиквитинирования NEMO». Природа. 427 (6970): 167–71. Дои:10.1038 / природа02273. PMID 14695475. S2CID 4429582.
- Симпсон LJ, Сейл JE (апрель 2005 г.). «UBE2V2 (MMS2) не требуется для эффективного преобразования гена иммуноглобулина или устойчивости к повреждению ДНК в DT40». Ремонт ДНК. 4 (4): 503–10. Дои:10.1016 / днареп.2004.12.002. PMID 15725630.
- Пастушок Л., Мораес Т.Ф., Эллисон М.Дж., Сяо В. (май 2005 г.). «Вставка одного ключевого остатка Mms2 в карман Ubc13 определяет интерфейсную специфичность комплекса конъюгации убиквитина Lys63 человека». Журнал биологической химии. 280 (18): 17891–900. Дои:10.1074 / jbc.M410469200. PMID 15749714.
- Spyracopoulos L, Льюис MJ, Saltibus LF (июнь 2005 г.). «Динамика основной и боковой цепи убиквитин-конъюгированного варианта фермента Mms2 человека в свободном и убиквитин-связанном состояниях». Биохимия. 44 (24): 8770–81. Дои:10.1021 / bi050065k. PMID 15952783.
- Андерсен П.Л., Чжоу Х., Пастушок Л., Мораес Т., МакКенна С., Зиола Б., Эллисон М.Дж., Диксит В.М., Сяо В. (август 2005 г.). «Четкая регуляция функций Ubc13 двумя вариантами убиквитин-конъюгированного фермента Mms2 и Uev1A». Журнал клеточной биологии. 170 (5): 745–55. Дои:10.1083 / jcb.200502113. ЧВК 2171356. PMID 16129784.
- Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
- Вен Р., Ньютон Л., Ли Г., Ван Х, Сяо В. (май 2006 г.). «Arabidopsis thaliana UBC13: значение безошибочной устойчивости к повреждению ДНК и полиубиквитилирование, связанное с Lys63, у растений». Молекулярная биология растений. 61 (1–2): 241–53. Дои:10.1007 / s11103-006-0007-x. PMID 16786304. S2CID 8437446.
- Zhao GY, Sonoda E, Barber LJ, Oka H, Murakawa Y, Yamada K, Ikura T, Wang X, Kobayashi M, Yamamoto K, Boulton SJ, Takeda S (март 2007 г.). «Решающая роль убиквитин-конъюгированного фермента Ubc13 в инициации гомологичной рекомбинации». Молекулярная клетка. 25 (5): 663–75. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.01.029. PMID 17349954.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
 | Эта статья о ген на хромосома человека 8 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |