UFM1 - UFM1
Модификатор убиквитин-фолда 1, также известный как UFM1, это белок который у человека кодируется UFM1 ген.[5][6]
UFM1 - это убиквитин -подобный белок, который конъюгирован с белками-мишенями с помощью E1-подобного активирующего фермента UBA5 и E2-подобный конъюгирующий фермент UFC1.[6] Этот процесс часто называют УФМилированием.[7]
Функция
UFM1 имеет несколько общих свойств с убиквитин (Уб) и другие убиквитиноподобные белки (UBLs). Ufm1 имеет похожие третичная структура в Ub, но не хватает очевидных сходство последовательностей. Он синтезируется как неактивная форма-предшественник (про-Ufm1), которая имеет 2 дополнительные аминокислоты помимо консервативного глицина. Механизм Ufm1 спряжение аналогичен убиквитину. Зрелые ufm1 имеет открытый C-терминал глицин который необходим для последующей активации родственным ему белком E1 (Uba5). Эта стадия активации приводит к образованию высокоэнергетической тиолэфирной связи в присутствии АТФ. Впоследствии Ufm1 передается своему родственному E2-подобному ферменту (Ufc1) через аналогичный тиоэфир связь с цистеин на активном сайте E2. Ufm1 конъюгирован с множеством целевых белков и образует комплексы с еще не идентифицированными белками. Таким образом, предположительно существуют лигазы E3 (на сегодняшний день ни одна из них не идентифицирована) для выполнения заключительного этапа конъюгации Ufm1 с соответствующими мишенями. Модификация белков с помощью Ufm1 также обратима. Два романа цистеиновые протеазы были идентифицированы на сегодняшний день (UFSP1 и UFSP2 ), которые расщепляют С-концевые слияния Ufm1-пептид, а также удаляют Ufm1 из нативных внутриклеточных конъюгатов. Эти протеазы не имеют очевидной гомологии с ферментами, деконъюгировавшими убиквитин. Все белки для конъюгации Ufm1 (Uba5, Ufc1 и Ufm1) законсервированы у животных и растений (но не у дрожжей), что указывает на их важную роль в многоклеточных организмах. Точная роль модификации Ufm1 in vivo еще не известно[8], но основная цель оказывается uL24 / RPL26 в клетках человека.[7]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120686 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027746 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ген Entrez: UFM1 убиквитиновый модификатор 1».
- ^ а б Комацу М., Чиба Т., Тацуми К., Иемура С., Танида И., Окадзаки Н., Уэно Т., Коминами Э., Нацуме Т., Танака К. (май 2004 г.). «Новая система конъюгирования с белком для Ufm1, модификатора убиквитинового сворачивания». EMBO J. 23 (9): 1977–86. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600205. ЧВК 404325. PMID 15071506.
- ^ а б Walczak, Christopher P .; Лето, Дара Э .; Чжан, Личао; Риепе, Селеста; Muller, Ryan Y .; DaRosa, Paul A .; Инголия, Николай Т .; Элиас, Джошуа Э .; Копито, Рон Р. (9 января 2019 г.). «Рибосомный белок RPL26 является основной мишенью UFMylation». Труды Национальной академии наук. Труды Национальной академии наук. 116 (4): 1299–1308. Дои:10.1073 / pnas.1816202116. ISSN 0027-8424.
- ^ "Обзор Boston Biochem UFM1". Архивировано из оригинал 15 октября 2007 г.. Получено 2008-05-21.
дальнейшее чтение
- Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК 310934. PMID 11042152.
- Ю Й, Чжан Ц., Чжоу Г. и др. (2001). «Профили экспрессии генов в печени плода человека и идентификация генов, специфичных для тканей и стадии развития, посредством составленных профилей экспрессии и эффективного клонирования полноразмерных кДНК». Genome Res. 11 (8): 1392–403. Дои:10.1101 / гр.175501. ЧВК 311073. PMID 11483580.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Данэм А., Мэтьюз Л.Х., Бертон Дж. И др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 13 человека». Природа. 428 (6982): 522–8. Дои:10.1038 / природа02379. ЧВК 2665288. PMID 15057823.
- Комацу М., Чиба Т., Тацуми К. и др. (2005). «Новая система конъюгирования с белком для Ufm1, модификатора убиквитинового сворачивания». EMBO J. 23 (9): 1977–86. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600205. ЧВК 404325. PMID 15071506.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Сасакава Х., Саката Э., Ямагути Ю. и др. (2006). «Структура раствора и динамика Ufm1, убиквитиновый модификатор 1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 343 (1): 21–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.02.107. PMID 16527251.
- Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
внешняя ссылка
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P61960 (Модификатор укладки убиквитина человека 1) на PDBe-KB.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
 | Эта статья о ген на хромосома человека 13 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |