SMN2 - SMN2
Выживание мотонейрона 2 (SMN2) это ген который кодирует Белок SMN (полный и усеченный) у человека.[5][6]
Ген
В SMN2 Ген является частью инвертированной дупликации размером 500 т.п.н. на хромосоме 5q13. Этот дублированный регион содержит по крайней мере четыре гена и повторяющиеся элементы, которые делают его склонным к перестройкам и делециям. Повторяемость и сложность последовательности также вызвали трудности в определении организации этой геномной области. Теломерный (SMN1 ) и центромерный (SMN2) копии этого гена почти идентичны и кодируют один и тот же белок. Важнейшее различие последовательностей между двумя генами - это единственный нуклеотид в экзоне 7, который, как полагают, является усилителем сплайсинга экзона. Нуклеотидная замена в SMN2 приводит к тому, что около 80-90% его транскриптов представляют собой усеченный, нестабильный белок, не имеющий биологической функции (Δ7SMN), и только 10-20% его транскриптов представляют собой полноразмерный белок (fl-SMN).
Обратите внимание, что девять экзонов как теломерной, так и центромерной копий исторически обозначаются как экзоны 1, 2a, 2b и 3-8. Считается, что в событиях конверсии генов могут участвовать два гена, что приводит к разному количеству копий каждого гена.[6]
Клиническое значение
В то время как мутации в теломерной копии связаны с спинальная мышечная атрофия, мутации в этом гене, центромерной копии, не приводят к заболеванию. Этот ген может быть модификатором заболевания, вызванного мутацией в теломерной копии.
Рекомендации
- ^ а б c ENSG00000205571, ENSG00000273772 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000277773, ENSG00000205571, ENSG00000273772 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021645 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Lefebvre S, Bürglen L, Reboullet S, Clermont O, Burlet P, Viollet L, Benichou B, Cruaud C, Millasseau P, Zeviani M (январь 1995 г.). «Идентификация и характеристика гена, определяющего мышечную атрофию позвоночника». Клетка. 80 (1): 155–65. Дои:10.1016/0092-8674(95)90460-3. PMID 7813012. S2CID 14291056.
- ^ а б «Энтрез Ген: выживаемость SMN2 мотонейрона 2, центромерного».
дальнейшее чтение
- Watihayati MS, Fatemeh H, Marini M, Atif AB, Zahiruddin WM, Sasongko TH, Tang TH, Zabidi-Hussin ZA, Nishio H, Zilfalil BA (январь 2009 г.). «Комбинация количества копий SMN2 и делеции NAIP предсказывает тяжесть заболевания при спинальной мышечной атрофии». Мозг и развитие. 31 (1): 42–5. Дои:10.1016 / j.braindev.2008.08.012. PMID 18842367. S2CID 206312220.
- Prior TW, Krainer AR, Hua Y, Swoboda KJ, Snyder PC, Bridgeman SJ, Burghes AH, Kissel JT (сентябрь 2009 г.). «Позитивный модификатор спинальной мышечной атрофии в гене SMN2». Американский журнал генетики человека. 85 (3): 408–13. Дои:10.1016 / j.ajhg.2009.08.002. ЧВК 2771537. PMID 19716110.
- Коуди Т.Х., Бауган Т.Д., Шабаби М., Пассини М.А., Лорсон С.Л. (2008). Valcarcel J (ред.). «Разработка единой векторной системы, которая усиливает транс-сплайсинг транскриптов SMN2». PLOS ONE. 3 (10): e3468. Дои:10.1371 / journal.pone.0003468. ЧВК 2565107. PMID 18941511.
- Эльшейх Б., Приор Т., Чжан Х, Миллер Р., Колб С.Дж., Мур Д., Брэдли В., Барон Р., Брайан В., Гелинас Д., Ианнакконе С., Лешнер Р., Мендель Д. Р., Мендоза М., Рассман Б., Смит С., Кинг В. , Kissel JT (октябрь 2009 г.). «Анализ тяжести заболевания на основе количества копий SMN2 у взрослых со спинальной мышечной атрофией». Мышцы и нервы. 40 (4): 652–6. Дои:10.1002 / mus.21350. PMID 19760790. S2CID 44901599.
- Уоркман Э., Сайева Л., Каррел Т.Л., Кроуфорд Т.О., Лю Д., Лутц К., Битти К.Э., Пеллиццони Л., Бургес А.Х. (июнь 2009 г.). «Миссенс-мутация SMN дополняет SMN2, восстанавливая snRNP и спасая мышей с SMA». Молекулярная генетика человека. 18 (12): 2215–29. Дои:10.1093 / hmg / ddp157. ЧВК 2685758. PMID 19329542.
- Bose JK, Wang IF, Hung L, Tarn WY, Shen CK (октябрь 2008 г.). «Сверхэкспрессия TDP-43 увеличивает включение экзона 7 во время выживания сплайсинга пре-мРНК мотонейрона». Журнал биологической химии. 283 (43): 28852–9. Дои:10.1074 / jbc.M805376200. ЧВК 2661999. PMID 18703504.
- Hauke J, Riessland M, Lunke S, Eyüpoglu IY, Blümcke I, El-Osta A, Wirth B, Hahnen E (январь 2009 г.). «Выживание гена 2 мотонейрона за счет метилирования ДНК коррелирует с тяжестью спинальной мышечной атрофии, и его можно обойти с помощью ингибирования гистондеацетилазы». Молекулярная генетика человека. 18 (2): 304–17. Дои:10.1093 / hmg / ddn357. ЧВК 2638778. PMID 18971205.
- Корча П., Каму В., Пралине Дж., Гордон П.Х., Вурч П., Андрес С. (2009). «Важность генов SMN в генетике спорадического БАС». Боковой амиотрофический склероз. 10 (5–6): 436–40. Дои:10.3109/17482960902759162. PMID 19922137. S2CID 2326464.
- Тициано Ф. Д., Пинто А. М., Фиори С., Ломастро Р., Мессина С., Бруно С., Пини А., Пане М, Д'Амико А., Геццо А., Бертини Е., Меркури Е., Нери Г., Браге С. (январь 2010 г.). «Уровни транскрипта SMN в лейкоцитах пациентов с СМА, определенные с помощью абсолютной ПЦР в реальном времени». Европейский журнал генетики человека. 18 (1): 52–8. Дои:10.1038 / ejhg.2009.116. ЧВК 2987170. PMID 19603064.
- Jedrzejowska M, Milewski M, Zimowski J, Borkowska J, Kostera-Pruszczyk A, Sielska D, Jurek M, Хаусманова-Петрусевич I (2009). «Модификаторы фенотипа спинальной мышечной атрофии: количество копий гена SMN2, делеция в гене NAIP и, возможно, пол влияют на течение заболевания». Acta Biochimica Polonica. 56 (1): 103–8. Дои:10.18388 / abp.2009_2521. PMID 19287802.
- Аркблад Э, Тулиниус М., Кроксмарк А.К., Хенрикссон М., Дарин Н. (май 2009 г.). «Популяционное исследование генотипической и фенотипической изменчивости у детей со спинальной мышечной атрофией». Acta Paediatrica. 98 (5): 865–72. Дои:10.1111 / j.1651-2227.2008.01201.x. PMID 19154529. S2CID 3134264.
- Паушкин С., Губиц А.К., Массне С., Дрейфус Г. (июнь 2002 г.). «Комплекс SMN, ассемблосома рибонуклеопротеидов». Текущее мнение в области клеточной биологии. 14 (3): 305–12. Дои:10.1016 / S0955-0674 (02) 00332-0. PMID 12067652.
- Фарук Ф, Балабанян С., Лю Х, Холчик М., Маккензи А. (ноябрь 2009 г.). «p38 Митоген-активированная протеинкиназа стабилизирует мРНК SMN через РНК-связывающий белок HuR». Молекулярная генетика человека. 18 (21): 4035–45. Дои:10.1093 / hmg / ddp352. PMID 19648294.
- Хасанзад М., Голкар З., Кариминеджад Р., Хадави В., Алмадани Н., Афрозан Ф., Салахшурифар И., Шафегати Ю., Кахризи К., Наджмабади Х. (февраль 2009 г.). «Делеции в гене выживания мотонейрона у иранских пациентов со спинальной мышечной атрофией». Анналы Медицинской академии, Сингапур. 38 (2): 139–41. PMID 19271042.
- Мартинс де Араужо М., Боннал С., Гастингс М.Л., Крайнер А.Р., Валькарсель Дж. (Апрель 2009 г.). «Дифференциальное распознавание 3 'сайтов сплайсинга транскриптов SMN1 и SMN2 с помощью U2AF и U2 snRNP». РНК. 15 (4): 515–23. Дои:10.1261 / rna.1273209. ЧВК 2661831. PMID 19244360.
- Song F, Qu YJ, Zou LP, Wang LW, Long MJ, Wang X, Yang YL, Chen Q, Wang H, Jin YW (декабрь 2008 г.). «[Молекулярный анализ гена выживания мотонейрона у 338 подозрительных детей, больных спинальной мышечной атрофией]». Чжунхуа Эр Кэ За Чжи = Китайский журнал педиатрии. 46 (12): 919–23. PMID 19134255.
- Иримура С., Китамура К., Като Н., Сайки К., Такеучи А., Мацуо М., Нишио Х., Ли MJ (2009). «HnRNP C1 / C2 может регулировать сплайсинг экзона 7 в гене спинномозговой мышечной атрофии SMN1». Журнал медицинских наук Кобе. 54 (5): E227-36. PMID 19628962.
- Йонг Дж, Ван Л., Дрейфус Дж. (Май 2004 г.). «Зачем клеткам машина для сборки РНК-белковых комплексов?». Тенденции в клеточной биологии. 14 (5): 226–32. Дои:10.1016 / j.tcb.2004.03.010. PMID 15130578.
- Чен ХХ, Чанг Дж.Г., Лу Р.М., Пэн Т.Ю., Тарн Вайоминг (ноябрь 2008 г.). «РНК-связывающий белок hnRNP Q модулирует использование экзона 7 в гене выживания моторного нейрона 2 (SMN2)». Молекулярная и клеточная биология. 28 (22): 6929–38. Дои:10.1128 / MCB.01332-08. ЧВК 2573304. PMID 18794368.
- Когулу О., Дурмаз Б., Пехливан С., Альпман А., Озкинай Ф. (июнь 2009 г.). «Оценка генов SMN и NAIP в семье: гомозиготная делеция гена SMN2 у плода и исход беременности». Генетическое тестирование и молекулярные биомаркеры. 13 (3): 287–8. Дои:10.1089 / gtmb.2008.0139. PMID 19397406.
PDB галерея | |
|---|---|
|
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.