UBE2Z - UBE2Z
Фермент, конъюгирующий убиквитин E2 Z (UBE2Z), также известный как UBA6-специфический фермент E2 1 (USE1), является фермент что у людей кодируется UBE2Z ген на хромосома 17.[5][6] Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток.[7] UBE2Z - это Фермент, конъюгированный с убиквитином E2 и участвует во втором этапе протеина убиквитинирование в течение протеолиз.[8] А исследование ассоциации всего генома (GWAS) выявил, что ген UBE2Z связан с хроническая болезнь почек.[9] В UBE2Z ген также содержит один из 27 SNP связано с повышенным риском ишемическая болезнь сердца.[10]
Структура
Ген
В UBE2Z ген находится на хромосоме 17 в полосе 17q21.32 и содержит 7 экзоны.[5] Этот ген производит 2 изоформы через альтернативное сращивание.[11] UBE2Z кДНК простирается в длину 3054 пар оснований.[12]
Протеин
Этот белок принадлежит к семейству ферментов, конъюгированных с убиквитином, и является одним из ферментов E2.[11] UBE2Z пролеты 246 аминокислоты, 150 из которых кодируют сохраненные 16–18 кДа домен E2 конъюгированного с убиквитином фермента (домен UBC), расположенный в области фермента N-концевой и отвечает за фермент каталитический функция. Этот домен UBC имеет относительно негибкую β-лист структура с фланкирующими спиралями и содержит высококонсервативный цистеин остаток, Cys80, который функционирует как активный сайт для сложный эфир тиола образование с убиквитином. UBE2Z также содержит C-терминал продление, предложено участвовать в субстрат связывание, которое характерно для конъюгированного с убиквитином фермента класса II E2.[12]
Функция
В UBE2Z ген повсеместно экспрессируется в тканях человека, и его экспрессия относительно высока в плацента, поджелудочная железа, селезенка и яичко. Примечательно, что его экспрессия в раковых тканях намного выше, чем в соответствующих нормальных тканях, особенно при раке почек, лимфатических узлов, толстой кишки и яичников.[12] Как член E2 убиквитин-конъюгированный фермент семейства UBE2Z в основном участвует во второй стадии белковой убиквитинирование, который является основным компонентом механизма деградации белка.[8] В частности, UBE2Z получает убиквитин (Ub) из убиквитин-активирующий фермент (E1) опосредует перенос Ub от E2 к субстрату, прямо или косвенно с помощью фермента лигазы (E3), который взаимодействует с субстратом и комплексом E2-Ub. UBE2Z мог заряжать только Ub или FAT10 от UBA6 вместо UBA1, что отличает его от других E2.[13][14]
Клиническое значение
Исследование генетических вариантов, которые регулируют липидный обмен и определяют предрасположенность к дислипидемии у японцев, показало, что UBE2Z вместе с ZPR1 и интерлейкином-6R могут быть важными локусами гипертриглицеридемии.[15] Более того, в GWAS среди 2247 японцев было исследовано 29 полиморфизмов, которые ранее были идентифицированы как локусы восприимчивости к заболеванию коронарной артерии, чтобы определить корреляцию этих локусов с хроническим заболеванием почек.[9] Этот мета-анализ GWAS показал с помощью теста хи-квадрат, что rs46522 в гене UBE2Z был значительно связан с хроническим заболеванием почек.[9]
Клинический маркер
Мультилокусное исследование генетической шкалы риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген UBE2Z, выявило лиц с повышенным риском как эпизодов, так и рецидивов ИБС, а также увеличения клинической пользы от терапии статинами. Исследование было основано на когортном исследовании сообщества (исследование Malmo Diet and Cancer) и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22).[10]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000159202 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014349 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б «UBE2Z-убиквитин-конъюгированный фермент E2 Z [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 10 октября 2016.
- ^ Бялас Дж., Гроеттруп М., Айхем А (1 января 2015 г.). «Конъюгация убиквитин-активирующего фермента UBE1 с убиквитин-подобным модификатором FAT10 нацелена на его протеасомную деградацию». PLOS ONE. 10 (3): e0120329. Дои:10.1371 / journal.pone.0120329. ЧВК 4359146. PMID 25768649.
- ^ «BioGPS - ваша система генного портала». biogps.org. Получено 10 октября 2016.
- ^ а б Baarends WM, Roest HP, Grootegoed JA (май 1999 г.). «Система убиквитина в гаметогенезе». Молекулярная и клеточная эндокринология. 151 (1–2): 5–16. Дои:10.1016 / с0303-7207 (99) 00060-х. PMID 10411315. S2CID 8632308.
- ^ а б c Хорибе Х, Фудзимаки Т., Огури М., Като К., Мацуока Р., Абэ С., Токоро Ф, Араи М., Нода Т., Ватанабе С., Ямада Ю. (апрель 2015 г.). «Связь полиморфизма гена рецептора интерлейкина 6 с хроническим заболеванием почек у японцев». Нефрология. 20 (4): 273–8. Дои:10.1111 / nep.12381. PMID 25524550. S2CID 11292241.
- ^ а б Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ, Nordio F, Hyde CL, Cannon CP, Sacks FM, Poulter NR, Sever PS, Ridker PM, Braunwald E, Melander O, Kathiresan S, Sabatine MS (Июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза от терапии статинами: анализ испытаний первичной и вторичной профилактики». Ланцет. 385 (9984): 2264–71. Дои:10.1016 / S0140-6736 (14) 61730-X. ЧВК 4608367. PMID 25748612.
- ^ а б «UBE2Z - убиквитин-конъюгированный фермент E2 Z - Homo sapiens (человек) - ген и белок UBE2Z». UniProt. Получено 10 октября 2016.
- ^ а б c Гу Х, Чжао Ф, Чжэн М, Фэй Х, Чен Х, Хуан С., Се И, Мао И (сентябрь 2007 г.). «Клонирование и характеристика гена, кодирующего человеческий предполагаемый убиквитин-конъюгированный фермент E2Z (UBE2Z)». Отчеты по молекулярной биологии. 34 (3): 183–8. Дои:10.1007 / s11033-006-9033-7. PMID 17160626. S2CID 27210618.
- ^ Джин Дж, Ли Х, Гайги С.П., Харпер Дж. У. (июнь 2007 г.). «Двойные системы активации E1 для убиквитина по-разному регулируют заряд фермента E2». Природа. 447 (7148): 1135–8. Дои:10.1038 / природа05902. PMID 17597759. S2CID 4337767.
- ^ Aichem A, Pelzer C, Lukasiak S, Kalveram B, Sheppard PW, Rani N, Schmidtke G, Groettrup M (4 мая 2010 г.). «USE1 представляет собой биспецифический фермент, конъюгирующий с убиквитином и FAT10, который FAT10илирует себя цис». Nature Communications. 1: 13. Дои:10.1038 / ncomms1012. PMID 20975683.
- ^ Абэ С., Токоро Ф, Мацуока Р., Араи М., Нода Т., Ватанабе С., Хорибе Х, Фудзимаки Т., Огури М., Като К., Минатогучи С., Ямада Ю. (октябрь 2015 г.). «Ассоциация генетических вариантов с дислипидемией». Отчеты по молекулярной медицине. 12 (4): 5429–36. Дои:10.3892 / mmr.2015.4081. PMID 26238946.