URM1 - URM1

Urm1 (модификатор, связанный с убиквитином)
2qjl animated.gif
Модификатор-1, связанный с убиквитином (2qjl). В центре белка расположена β-захватная складка. Кроме того, карбоксиконцевой глицин в мотиве диглицина отмечен синим цветом, а ионы Mg представлены черными сферами.
Идентификаторы
СимволURM1
PfamPF09138
ИнтерПроIPR015221
SCOP2d.15.3.3 / Объем / СУПФАМ

Убиквитин-связанный модификатор-1 (URM1) - это убиквитиноподобный белок который модифицирует белки в дрожжевых убиквитиноподобных урмилирование путь.[1] Структурные сравнения и филогенетический анализ суперсемейства ubiquitin показали, что Urm1 имеет наиболее консервативные структурные и последовательные особенности общего предка всего суперсемейства.[2][3]

Urm1 характеризуется основной β-захватной складкой и важным карбоксиконцевым глицином в мотиве диглицина. Известно, что Urm1 конъюгирован с пероксиредоксином. Ahp1, ATPBD3, и CTU2 и человек MOCS3, через механизм, включающий E1-подобный белок Uba4 через остатки лизина.[4] Подобно убиквитинированию, урмилирование требует промежуточного тиоэфира и формирует изопептидные связи между Urm1 и его субстратами. Более того, окислительный стресс может значительно усилить процесс урмилирования.[5] Функционирует как белковая метка, играющая роль в восприятии питательных веществ и реакции на окислительный стресс.

Недавно было продемонстрировано, что Urm1 может действовать как переносчик серы в тиолировании эукариотических клеток. тРНК посредством механизма, который требует образования тиокарбоксилированного Urm1.[6] URM1 участвует в тиолировании цитоплазматических тРНК; получает серу от E1-подобного фермента Uba4 и переносит ее на тРНК. Исследования последовательности и структурной гомологии показывают, что Urm1 может быть более тесно связан с прокариотическими белками-переносчиками серы, ThiS и MoaD, которые можно рассматривать как прокариотические аналоги эукариотических UBls. .[7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Goehring AS, Rivers DM, Sprague GF (ноябрь 2003 г.). «Урмилирование: убиквитиноподобный путь, который функционирует во время инвазивного роста и почкования у дрожжей». Молекулярная биология клетки. 14 (11): 4329–41. Дои:10.1091 / mbc.E03-02-0079. ЧВК  266754. PMID  14551258.
  2. ^ Сюй Дж., Чжан Дж., Ван Л., Чжоу Дж., Хуан Х, Ву Дж, Чжун Й, Ши И (август 2006 г.). «Структура раствора Urm1 и ее значение для происхождения модификаторов белка». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (31): 11625–30. Bibcode:2006PNAS..10311625X. Дои:10.1073 / pnas.0604876103. ЧВК  1518799. PMID  16864801.
  3. ^ Goehring AS, Rivers DM, Sprague GF (ноябрь 2003 г.). «Урмилирование: убиквитин-подобный путь, который функционирует во время инвазивного роста и почкования у дрожжей». Молекулярная биология клетки. 14 (11): 4329–41. Дои:10.1091 / mbc.E03-02-0079. ЧВК  266754. PMID  14551258.
  4. ^ Van der Veen AG, Schorpp K, Schlieker C, Buti L, Damon JR, Spooner E, Ploegh HL, Jentsch S (февраль 2011 г.). «Роль убиквитиноподобного белка Urm1 как неканонического модификатора белка, направленного на лизин». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (5): 1763–70. Дои:10.1073 / pnas.1014402108. ЧВК  3033243. PMID  21209336.
  5. ^ Ван Ф, Лю М., Цю Р., Цзи С. (август 2011 г.). «Двойная роль убиквитиноподобного белка Urm1 как модификатора белка и носителя серы». Белки и клетки. 2 (8): 612–9. Дои:10.1007 / s13238-011-1074-6. ЧВК  4875326. PMID  21904977.
  6. ^ Петроски М.Д., Салвесен Г.С., Вольф Д.А. (февраль 2011 г.). «Urm1 связывает перенос серы с убиквитин-подобной функцией белка при окислительном стрессе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (5): 1749–50. Bibcode:2011PNAS..108.1749P. Дои:10.1073 / pnas.1019043108. ЧВК  3033263. PMID  21245332.
  7. ^ Pedrioli PG, Leidel S, Hofmann K (декабрь 2008 г.). «Urm1 на перекрестке модификаций.« Модификации белков: серия обзоров, выходящих за рамки обычных подозреваемых »». EMBO отчеты. 9 (12): 1196–202. Дои:10.1038 / embor.2008.209. ЧВК  2603462. PMID  19047990.