UBE2G2 - UBE2G2

UBE2G2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2CYX, 2KLY, 2LXP, 3H8K, 4LAD
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2G2, UBC7, убиквитин-конъюгированный фермент E2 G2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603124 MGI: 1343188 ГомолоГен: 6599 Генные карты: UBE2G2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 21 (человека)
Конец	44,801,826 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 10 (мышь)
Конец	77,645,993 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• трансферазная активность; • связывание нуклеотидов; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание АТФ; • активность фермента, конъюгированного с убиквитином; • связывание убиквитин-протеин-лигазы; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы; • идентичное связывание с белками; • активность убиквитин-протеинтрансферазы;
Сотовый компонент	• эндоплазматический ретикулум; • цитозоль;
Биологический процесс	• убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • убиквитинирование, связанное с белком K48; • катаболический процесс клеточного белка; • N-связанное гликозилирование белка через аспарагин; • убиквитин-зависимый путь ERAD; • клеточный ответ на интерферон-бета; • отрицательная регуляция ретроградного транспорта белков, ER в цитозоль; • убиквитинирование белков; • полиубиквитинирование белков;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7327
	22213
	ENSG00000184787
	ENSMUSG00000009293
	P60604
	P60605
	NM_182688; NM_001202489; NM_003343
	NM_019803
	NP_001189418; NP_003334; NP_872630
	NP_062777
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-конъюгированный фермент E2 G2 это белок что у людей кодируется UBE2G2 ген.^[5]^[6]^[7]

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом нацеливания на аномальные или короткоживущие белки для деградации. Убиквитинирование включает как минимум три класса ферментов: убиквитин-активирующие ферменты, или E1s, убихин-конъюгирующие ферменты, или E2s, и убиквитин-протеиновые лигазы, или E3s. Этот ген кодирует член семейства E2-убиквитин-конъюгированных ферментов. Кодируемый белок имеет 100% идентичность последовательности с аналогом мыши. Этот ген экспрессируется повсеместно, с высоким выражение наблюдается во взрослых мышцах. Два альтернативно сращенный варианты транскрипции, кодирующие различные изоформы были обнаружены для этого гена.^[7] Известно, что Ube2g2 взаимодействует с множеством других белков, включая убиквитин, E3 gp78 и Hrd1 RING.

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184787 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000009293 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Кацанис Н., Фишер Э.М. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация, экспрессия и хромосомная локализация убиквитин-конъюгированного фермента 7 (UBE2G2), человеческого гомолога гена Saccharomyces cerevisiae ubc7». Геномика. 51 (1): 128–31. Дои:10.1006 / geno.1998.5263. PMID 9693041.
^ Rose SA, Leek JP, Moynihan TP, Ardley HC, Markham AF, Robinson PA (март 1999 г.). «Отнесение1 гена убиквитин-конъюгированного фермента, UBE2G2, к полосе хромосомы человека 21q22.3 путем гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 83 (1–2): 98–9. Дои:10.1159/000015141. PMID 9925943. S2CID 13129608.
^ ^а ^б «Ген Entrez: UBE2G2 убиквитин-конъюгированный фермент E2G 2 (гомолог UBC7, дрожжи)».

дальнейшее чтение

Чен П., Джонсон П., Соммер Т. и др. (1993). «Множественные убиквитин-конъюгированные ферменты участвуют в деградации in vivo репрессора альфа-2 MAT дрожжей». Ячейка. 74 (2): 357–69. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90426-Q. PMID 8393731. S2CID 205020910.
Мойнихан Т.П., Ардли Х.С., Нубер У. и др. (1999). «Убиквитин-конъюгирующие ферменты UbcH7 и UbcH8 взаимодействуют с доменами HHARI и H7-AP1, содержащими RING finger / IBR». J. Biol. Chem. 274 (43): 30963–8. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30963. PMID 10521492.
Хуанг Л., Киннукан Э, Ван Г. и др. (1999). «Структура комплекса E6AP-UbcH7: понимание убиквитинирования ферментным каскадом E2-E3». Наука. 286 (5443): 1321–6. Дои:10.1126 / science.286.5443.1321. PMID 10558980.
Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека». Природа. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Натура.405..311H. Дои:10.1038/35012518. PMID 10830953.
Ленк У, Соммер Т (2001). «Убиквитин-опосредованный протеолиз короткоживущего регуляторного белка зависит от его клеточной локализации». J. Biol. Chem. 275 (50): 39403–10. Дои:10.1074 / jbc.M006949200. PMID 10991948.
Жоазейро, Калифорния, Хантер Т. (2000). «Биохимия. Убиквитинирование - больше двух танго». Наука. 289 (5487): 2061–2. Дои:10.1126 / science.289.5487.2061. PMID 11032556. S2CID 83324199.
Тивари С., Вайсман А.М. (2001). «Эндоплазматический ретикулум (ER) -ассоциированная деградация субъединиц Т-клеточного рецептора. Вовлечение ER-ассоциированных убиквитин-конъюгированных ферментов (E2s)». J. Biol. Chem. 276 (19): 16193–200. Дои:10.1074 / jbc.M007640200. PMID 11278356.
Фанг С., Феррон М., Ян С. и др. (2002). «Рецептор аутокринного фактора подвижности опухоли, gp78, представляет собой убиквитиновую протеинлигазу, участвующую в деградации эндоплазматического ретикулума». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (25): 14422–7. Дои:10.1073 / pnas.251401598. ЧВК 64697. PMID 11724934.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Вебстер JM, Tiwari S, Weissman AM, Wojcikiewicz RJ (2003). «Убиквитинирование инозитол-1,4,5-трифосфатного рецептора опосредуется Ubc7 млекопитающих, компонентом связанного с эндоплазматическим ретикулумом пути деградации, и ингибируется хелатированием внутриклеточного Zn2 +». J. Biol. Chem. 278 (40): 38238–46. Дои:10.1074 / jbc.M305600200. PMID 12869571.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Чен Б., Мариано Дж., Цай Ю.С. и др. (2006). «Активность деградации E3, связанной с эндоплазматическим ретикулумом человека, gp78, требует его Cue-домена, RING-пальца и сайта связывания E2». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (2): 341–6. Bibcode:2006ПНАС..103..341С. Дои:10.1073 / pnas.0506618103. ЧВК 1326157. PMID 16407162.
Араи Р., Йошикава С., Мураяма К. и др. (2006). «Структура человеческого убиквитин-конъюгированного фермента E2 G2 (UBE2G2 / UBC7)». Acta Crystallographica Раздел F. 62 (Pt 4): 330–4. Дои:10.1107 / S1744309106009006. ЧВК 2222581. PMID 16582478.
Ху YH, Warnatz HJ, Vanhecke D, et al. (2006). «Скрининг внутриклеточной локализации на основе массива клеток выявляет новые функциональные особенности белков хромосомы 21 человека». BMC Genomics. 7: 155. Дои:10.1186/1471-2164-7-155. ЧВК 1526728. PMID 16780588.
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.

внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P60604 (Убиквитин-конъюгированный фермент E2 G2) на PDBe-KB.

Эта статья о ген на хромосома человека 21 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184787 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000009293 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9693041-5] Кацанис Н., Фишер Э.М. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация, экспрессия и хромосомная локализация убиквитин-конъюгированного фермента 7 (UBE2G2), человеческого гомолога гена Saccharomyces cerevisiae ubc7». Геномика. 51 (1): 128–31. Дои:10.1006 / geno.1998.5263. PMID 9693041.

[pmid9925943-6] Rose SA, Leek JP, Moynihan TP, Ardley HC, Markham AF, Robinson PA (март 1999 г.). «Отнесение1 гена убиквитин-конъюгированного фермента, UBE2G2, к полосе хромосомы человека 21q22.3 путем гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 83 (1–2): 98–9. Дои:10.1159/000015141. PMID 9925943. S2CID 13129608.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: UBE2G2 убиквитин-конъюгированный фермент E2G 2 (гомолог UBC7, дрожжи)».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]