Ли Альтенберг - Lee Altenberg

Ли Альтенберг
Родившийся
Ли Альтенберг
ГражданствоСоединенные Штаты Америки
Альма-матерКалифорнийский университет в Беркли
ИзвестенЭволюция эволюционируемости
Принцип редукции
НаградыПремия Onipa`a (2011)
Научная карьера
ПоляЭволюционная теория
Популяционная генетика
Линейная алгебра
УчрежденияГавайский университет в Маноа
Институт Конрада Лоренца
Университет Дьюка
ТезисОбобщение теории эволюции генов-модификаторов  (1984)
ДокторантМаркус В. Фельдман[1]
Другие научные консультантыГленис Томсон
ВлиянияМаркус Фельдман, Сэм Карлин, Майкл Конрад, Руперт Ридл, Лоуренс Гудвин, Дэвид М. Джозефсон
Интернет сайтдинамика.org/ Альтенберг/

Ли Альтенберг это биолог-теоретик. Он является доцентом кафедры информации и компьютерных наук в Гавайский университет в Маноа. Он наиболее известен своей работой, которая помогла установить эволюция эволюционируемости и модульность в генотип-фенотип карта как области исследований в эволюционной биологии,[2][3] для перемещения теоретических концепций между областями эволюционная биология и эволюционные вычисления,[4][5][6] и за его математическое объединение и обобщение модификатор генных моделей для эволюции передачи биологической информации, поместив в единую математическую структуру эволюцию скоростей мутаций, скоростей рекомбинации, скорости полового размножения и скорости распространения.[7][8]

Альтенберг - младший редактор журнала Биосистемы, и входит в редколлегии журналов Генетическое программирование и эволюционирующие машины и Искусственная жизнь, и на Общество вычислительного интеллекта IEEE Целевая группа по искусственной жизни и сложным адаптивным системам.[9]

Образование

Альтенберг получил степень бакалавра искусств. в области генетики в 1980 г. Калифорнийский университет в Беркли защитил диссертацию с отличием Гленис Томсон по теории частотно-зависимый выбор.[10] Он получил докторскую степень. кандидат биологических наук в 1985 г. Стэндфордский Университет с советником Маркус В. Фельдман с диссертацией по унифицированным моделям эволюции гена-модификатора.[11]

Карьера

Альтенберг получил докторскую степень в Стэнфордском университете, Государственном университете Северной Каролины и Университете Дьюка. В то время как постдокторант в Университет Дьюка, Альтенберг предложил первый курс по эволюционные вычисления быть отданным там. Когда его отец заболел криоглобулинемия, он переехал с ним в Гавайи для теплых температур.[12] В 2002 году Альтенберг был назначен адъюнкт-профессором информационных и компьютерных наук в Гавайский университет в Маноа. Он снова предложил там читать первые курсы по эволюционным вычислениям. В 2013 году Альтенберг был постоянным посетителем в Институт математических биологических наук в Государственный университет Огайо а в 2014-2016 гг. был старшим научным сотрудником Институт эволюции и когнитивных исследований имени Конрада Лоренца. В Попечительский совет Гавайского университета одобрил его повышение до профессора в 2020 году.[13]

Исследование

Исследования Альтенберга направлены на раскрытие математических взаимосвязей в динамике биологической эволюции, а также эволюционные алгоритмы. Его особенно интересуют явления более высокого порядка, такие как эволюция эволюционируемость, эволюция генетическая информация передачи, и эволюция генотип-фенотип карта. Его главными достижениями были (1) объединение теории эволюции генетических систем (скорости рекомбинации и мутаций) путем включения их в пространство инклюзивного наследования, которое включает как пространственную, так и культурную информацию, и (2) развитие концепция вариационные свойства организмов как явлений, подверженных эволюционной динамике. Это включает открытие механизмов, которые приводят к эволюции эволюционируемость, и модульность на карте генотип-фенотип.[14][7]

Математическая инклюзивность его теоретической работы сделала ее применимой к задачам эволюционных вычислений.[8] Его работа по эволюции передачи биологической информации потребовала разработки новых спектральные теоремы за линейные операторы, включая объединение теории реакции-диффузии, предсказывающей эволюцию медленного распространения, с предсказаниями принципа редукции для моделей эволюции мутации, рекомбинации и миграции.[15] Он применил спектральную теорию, чтобы понять эволюцию мутационная устойчивость.[16]

Альтенберг представил ряд концепций, которые были приняты в нескольких областях:

  • введение Ценовое уравнение в эволюционную теорию вычислений[14][17]
  • механизмы эволюции эволюционируемости и модульности[14][18][19][20][21]
  • концептуальное различие генеративного и вариационные свойства карты генотип-фенотип[20][22]
  • селекция выводка в эволюционных алгоритмах[14][23]
  • обобщение Стюарт Кауфман с NK Пейзажи,[18] применительно к технологической эволюции[24]
  • обобщение принципа редукции на бесконечномерные пространства, объединяющее модели реакции-диффузии для эволюции рассеивания,[15] и был применен к моделям эпидемии.[25]

Экологическая и социальная работа

Награды и отличия

Профессиональные общества

Альтенберг - пожизненный член:

внешняя ссылка

Рекомендации

  1. ^ Ли Альтенберг на Проект "Математическая генеалогия" Отредактируйте это в Викиданных
  2. ^ Баранюк, Крис (2 марта 2017 г.). «Жизнь может на самом деле улучшаться по мере развития». BBC Earth. Получено 14 сентября 2019.
  3. ^ Нуньо де ла Роса, Лаура (2017). «Вычисление расширенного синтеза: отображение динамики и концептуальной структуры фронта исследований эволюционируемости». Журнал экспериментальной зоологии, часть B: Молекулярная эволюция и эволюция развития. 328 (5): 395–411. Дои:10.1002 / jez.b.22741. PMID  28488750.
  4. ^ Чарльз В. Пети (27 июля 1998 г.). «Тронутые природой: заставить эволюцию работать на конвейере». Генетическое программирование. U.S. News & World Report. Получено 19 сентября 2019.
  5. ^ Ли Альтенберг (2016). Климан, Ричард М. (ред.). Энциклопедия эволюционной биологии. Эльзевир. С. 40–47. ISBN  9780128000496.
  6. ^ а б Рудольф Зайзинг; Ли Альтенберг. «Интервью с Ли Альтенбергом, 2017: Проект устной истории СНГ» (Видео). Общество вычислительного интеллекта IEEE. Гонолулу, Гавайи: IEEE. Получено 16 сентября 2019. Интервью с членом СНГ Ли Альтенбергом, записанное на серии симпозиумов IEEE 2017 по вычислительному интеллекту (IEEE SSCI 2017). Интервью Рудольфа Зайзинга.
  7. ^ а б c «Товарищи Ли Альтенберг». Институт Конрада Лоренца. KLI. Получено 16 сентября 2019.
  8. ^ а б "Биография Ли Альтенберга". 2017: Проект устной истории СНГ. IEEE.TV. Получено 15 сентября 2019.
  9. ^ «Целевая группа по искусственной жизни и сложным адаптивным системам». binghamton.edu. Получено 18 сентября 2019.
  10. ^ Альтенберг, Ли (1991). «Хаос из линейного частотно-зависимого отбора». Американский натуралист. 138 (1): 51–68. Дои:10.1086/285204.
  11. ^ Альтенберг, Ли (1984). Обобщение теории эволюции генов-модификаторов. Стэнфордский университет: Университетские микрофильмы. п. 237. CiteSeerX  10.1.1.187.5507.
  12. ^ Дайк, доктор Дайан (22 февраля 2013 г.). "Путешествие отца с криоглобулинемией, доктор Ли Альтенберг" (Видео). Блог Talk Radio. Eagle, CO 81631: Blog Talk Radio. Получено 19 сентября 2019.CS1 maint: location (связь)
  13. ^ «Список владения и продвижения UH 2020». Новости Гавайского университета. Гавайский университет. 22 июня 2020 г.. Получено 28 июля 2020.
  14. ^ а б c d Ли Альтенберг (1994). Киннер, Кеннет (ред.). Эволюция эволюционируемости в генетическом программировании. Кембридж, Массачусетс: MIT Press. С. 47–74. ISBN  9780262515535.
  15. ^ а б Альтенберг, Ли (2012). «Резольвентные положительные линейные операторы демонстрируют феномен редукции». Труды Национальной академии наук. 109 (10): 3705–3710. arXiv:1108.4546. Bibcode:2012PNAS..109.3705A. Дои:10.1073 / pnas.1113833109. ЧВК  3309728. PMID  22357763.
  16. ^ Альтенберг, Ли (2015). «Фундаментальные свойства эволюции мутационной устойчивости». п. 1508.07866. arXiv:1508.07866 [q-bio.PE ].
  17. ^ Альтенберг, Ли (1995). Whitley, Darrell L .; Восе, Майкл Д. (ред.). Теорема о схеме и теорема Прайса. Сан-Матео, Калифорния: Морган Кауфманн. С. 23–49. ISBN  978-1-55860-356-1. Получено 24 ноября 2019.
  18. ^ а б Альтенберг, Ли (1994). «Улучшение представлений за счет избирательного роста генома». Труды 1-й конференции IEEE по эволюционным вычислениям. 1: 182–187. Дои:10.1109 / ICEC.1994.350019. ISBN  0-7803-1899-4.
  19. ^ Альтенберг, Ли (1994). Себальд, А. (ред.). Новые явления в генетическом программировании. Мировое научное издательство. С. 233–241. ISBN  9810218109.
  20. ^ а б Альтенберг, Ли (1995). «Рост генома и эволюция карты генотип-фенотип». В Банцафе, Вольфганг; Экман, Фрэнк Х. (ред.). Эволюция и биокомпьютинг: вычислительные модели эволюции. Конспект лекций по информатике. 899. Берлин; Нью-Йорк: Springer-Verlag Berlin Heidelberg. С. 205–259. Дои:10.1007/3-540-59046-3_11. ISBN  978-3-540-59046-0.
  21. ^ Wagner, Günter P .; Альтенберг, Ли (июнь 1996 г.). «Сложные адаптации и эволюция эволюционируемости». Эволюция. 50 (3): 967–976. Дои:10.1111 / j.1558-5646.1996.tb02339.x. ISSN  0014-3820. PMID  28565291.
  22. ^ Армбрустер, В. Скотт (2014). «Интегрированные фенотипы: понимание ковариации признаков у растений и животных». Философские труды Королевского общества B: биологические науки. 369 (1649): 20130245. Дои:10.1098 / rstb.2013.0245. ЧВК  4084533. PMID  25002693.
  23. ^ Уй, Нгуен Куанг (2011). «Семантический кроссовер в генетическом программировании: приложение к действительной символьной регрессии» (PDF). Генетическое программирование и эволюционирующие машины. Springer. 12 (2): 91–119. Дои:10.1007 / s10710-010-9121-2. HDL:10197/3528.
  24. ^ Иоганн Петер Мурманн; Коэн Френкен (2006). «К систематической основе для исследования доминирующих дизайнов, технологических инноваций и промышленных изменений» (PDF). Политика исследования. Эльзевир. 35 (7): 925–952. Дои:10.1016 / j.respol.2006.04.011.
  25. ^ Гао, Даочжоу; Донг, Чао-Пин (2020). «Быстрая диффузия подавляет вспышки болезней». Труды Американского математического общества. 148 (4): 1709–1722. arXiv:1907.12229. Дои:10.1090 / proc / 14868.
  26. ^ Альтенберг, Ли (1990). «За гранью капитализма: забытое видение Лиланда Стэнфорда». Песчаник и плитка. Стэнфорд, Калифорния: Стэнфордское историческое общество. 14 (1): 8–20. Получено 16 сентября 2019.
  27. ^ Шотт-Розенфилд, Эбигейл (23 декабря 2014 г.). "Исторический уголок: видение Стэнфорда Лиландом Стэнфордом". Stanford Daily. Получено 14 сентября 2019.
  28. ^ а б Херли, Тимоти (24 января 2002 г.). «Любители звезд на Мауи хотят темных небес». Рекламодатель Гонолулу. Получено 14 сентября 2019.
  29. ^ а б Сан-Николас, Клодин (16 мая 2007 г.). «Проект Мауи на 1400 единиц подвергся атаке». Новости Мауи. Получено 16 сентября 2019.
  30. ^ а б c d Альтенберг, Ли. "Биография Резюме". Dynamics.org. Получено 16 сентября 2019.
  31. ^ «Глава ЛЯР выступит на ежегодном собрании Sierra Club». Новости Лахайны. Получено 14 сентября 2019.
  32. ^ «Членство в FQXi». Институт фундаментальных вопросов. Получено 21 апреля 2020.