Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок - N-ethylmaleimide sensitive fusion protein

NSF
Идентификаторы
Псевдонимы	NSF, SKD2, фактор, чувствительный к N-этилмалеимиду, фактор, чувствительный к N-этилмалеимиду, слияние везикул с АТФазой, SEC18
Внешние идентификаторы	OMIM: 601633 MGI: 104560 ГомолоГен: 4502 Генные карты: NSF
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	46,757,464 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	103,954,056 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание нуклеотидов; • Связывание домена PDZ; • привязка синтаксина-1; • связывание ионов металлов; • Связывание Rab GTPase; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание синтаксина; • гидролазная активность; • Связывание АТФ; • связывание протеинкиназы; • Привязка SNARE; • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса; • связывание ионотропного рецептора глутамата; • АТФазная активность;
Сотовый компонент	• GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность; • миелин; • клеточная мембрана; • дендритный вал; • лизосомальная мембрана; • внеклеточная экзосома; • Мембрана Гольджи; • цитоплазма; • цитозоль; • Стек Гольджи;
Биологический процесс	• слияние плазматической мембраны; • положительная регуляция белкового катаболического процесса; • регуляция экзоцитоза; • транспорт ионов калия; • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт; • Покрытие везикул COPII; • транспорт белка; • внутриклеточный транспорт белка; • везикулярный транспорт; • положительное регулирование рециклинга рецепторов; • экзоцитоз; • ретроградный везикулярный транспорт, Гольджи в ER; • Разборка комплекса SNARE; • транспорт; • Гольджи к транспорту белков плазматической мембраны; • Стыковка пузырьков Гольджи;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4905
	18195
	ENSG00000073969; ENSG00000278174; ENSG00000276262
	ENSMUSG00000034187
	P46459
	P46460
	NM_006178
	NM_008740
	NP_006169
	NP_032766
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

N-этилмалеимид-чувствительный фактор, также известен как NSF или N-этилмалеимид-чувствительные гибридные белки, является фермент который у человека кодируется NSF ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

NSF - гомогексамерный AAA АТФаза участвует в слиянии мембран.^[8] NSF повсеместно обнаруживается в мембранах эукариотических клеток. Это центральный компонент клеточного аппарата в переносе мембраны. пузырьки из одного мембранного отсека в другой. Во время этого процесса SNARE белки на двух соединяющихся мембранах (обычно пузырьке и целевой мембране, такой как плазматическая мембрана ) образуют комплекс, в котором α-спиральные домены SNARE наматываются друг на друга и образуют очень стабильный четырехспиральный пучок. Поскольку SNAREs переплетаются, они тянут везикулу к мембране-мишени, исключая воду и способствуя слиянию везикулы с мембраной-мишенью. NSF распутывает комплексы SNARE после слияния мембран, используя гидролиз АТФ в качестве источника энергии, позволяя повторно использовать диссоциированные SNARE для повторного использования в дальнейших циклах слияния мембран.^[9] Однако это предложение остается спорным. Недавняя работа показывает, что функция АТФазы NSF не участвует в рециклировании пузырьков, а скорее действует в акте слияния пузырьков с плазматической мембраной.^[10]

Гипотеза SNARE

Поскольку функция нейронов зависит от высвобождения нейротрансмиттеры в синапс - процесс, в котором синаптические везикулы слиться с пресинаптической мембраной - NSF является ключевым синаптическим компонентом. Таким образом, условные термочувствительные мутации в Drosophila melanogaster ген NSF приводит к коматозному поведению при ограничительной температуре (и, следовательно, ген называется коматозным), предположительно из-за того, что функции нейронов заблокированы. В Dictyostelium discoideum amoebae подобные мутации приводят к прекращению движения клеток при рестриктивной температуре, что указывает на роль внутриклеточного мембранного транспорта в миграции. На другую нейронную роль NSF указывает его прямое связывание с субъединицей GluR2 AMPA тип рецепторы глутамата (которые обнаруживают нейротрансмиттер глутамат ). Это дает NSF предполагаемую роль в доставке и выражение рецепторов AMPA на синапс.^[11]

NSF был обнаружен Джеймс Ротман и его коллеги в 1987 г. Стэндфордский Университет; они идентифицировали NSF после наблюдения, что цитоплазматический фактор, необходимый для слияния мембран, был инактивирован обработкой N-этилмалеимид. Этот анализ позволил им очистить NSF.^[12]

Взаимодействия

N-этилмалеимид-чувствительный гибридный белок взаимодействовать с участием НАПА.^[13]^[14]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ENSG00000278174, ENSG00000276262 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000073969, ENSG00000278174, ENSG00000276262 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034187 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ «Энтрез Ген: фактор, чувствительный к N-этилмалеимиду NSF».
^ Wilson DW, Whiteheart SW, Wiedmann M, Brunner M, Rothman JE (май 1992 г.). «Мультисубъединичная частица, участвующая в слиянии мембран». Журнал клеточной биологии. 117 (3): 531–8. Дои:10.1083 / jcb.117.3.531. ЧВК 2289450. PMID 1315316.
^ Хойл Дж., Фелан Дж. П., Бермингем Н., Фишер Э.М. (ноябрь 1996 г.). «Локализация гена N-этилмалеимид-чувствительного фактора (NSF) человека и мыши: двухдоменный член семейства AAA, который участвует в слиянии мембран». Геном млекопитающих. 7 (11): 850–2. Дои:10.1007 / s003359900249. PMID 8875895. S2CID 21435412.
^ Фурст Дж., Саттон Р. Б., Чен Дж., Брюнгер А. Т., Григорьев Н. (сентябрь 2003 г.). «Электронная криомикроскопия структуры чувствительного фактора N-этилмалеимида при разрешении 11 A». Журнал EMBO. 22 (17): 4365–74. Дои:10.1093 / emboj / cdg420. ЧВК 202363. PMID 12941689.
^ Альбертс, Брюс (2008). Молекулярная биология клетки. Наука о гирляндах. ISBN 978-0-8153-4105-5.
^ Кунер Т., Ли И, Джи К.Р., Боневальд Л.Ф., Августин Г.Дж. (январь 2008 г.). «Фотолиз клеточного пептида показывает быстрое действие фактора, чувствительного к N-этилмалеимиду, до высвобождения нейромедиатора». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (1): 347–52. Bibcode:2008ПНАС..105..347К. Дои:10.1073 / pnas.0707197105. ЧВК 2224215. PMID 18172208.
^ Ноэль Дж., Ральф Г.С., Пикард Л., Уильямс Дж., Молнар Э., Уни Дж. Б., Коллингридж Г.Л., Хенли Дж. М. (июнь 1999 г.). «Поверхностная экспрессия рецепторов AMPA в нейронах гиппокампа регулируется NSF-зависимым механизмом». Нейрон. 23 (2): 365–76. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80786-2. PMID 10399941.
^ Глик Б.С., Ротман Дж. Э. (1987). «Возможная роль жирного ацил-кофермента А во внутриклеточном транспорте белка». Природа. 326 (6110): 309–12. Bibcode:1987Натура.326..309Г. Дои:10.1038 / 326309a0. PMID 3821906. S2CID 4306469.
^ Барнард Р.Дж., Морган А., Бургойн Р.Д. (ноябрь 1997 г.). «Стимуляция активности АТФазы NSF с помощью альфа-SNAP необходима для разборки комплекса SNARE и экзоцитоза». Журнал клеточной биологии. 139 (4): 875–83. Дои:10.1083 / jcb.139.4.875. ЧВК 2139964. PMID 9362506.
^ Хэнсон П.И., Отто Х., Бартон Н., Ян Р. (июль 1995 г.). «Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок и альфа-SNAP вызывают конформационные изменения синтаксина». Журнал биологической химии. 270 (28): 16955–61. Дои:10.1074 / jbc.270.28.16955. PMID 7622514.

дальнейшее чтение

Wilson DW, Whiteheart SW, Wiedmann M, Brunner M, Rothman JE (май 1992 г.). «Мультисубъединичная частица, участвующая в слиянии мембран». Журнал клеточной биологии. 117 (3): 531–8. Дои:10.1083 / jcb.117.3.531. ЧВК 2289450. PMID 1315316.
Хэнсон П.И., Отто Х., Бартон Н., Ян Р. (июль 1995 г.). «Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок и альфа-SNAP вызывают конформационные изменения синтаксина». Журнал биологической химии. 270 (28): 16955–61. Дои:10.1074 / jbc.270.28.16955. PMID 7622514.
Пушель А.В., О'Коннор В., Бец Х. (июнь 1994 г.). «Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок (NSF) предпочтительно экспрессируется в нервной системе». Письма FEBS. 347 (1): 55–8. Дои:10.1016/0014-5793(94)00505-2. PMID 8013662. S2CID 8148431.
Whiteheart SW, Rossnagel K, Buhrow SA, Brunner M, Jaenicke R, Rothman JE (август 1994). «Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок: тримерная АТФаза, гидролиз которой АТФ необходим для слияния мембран». Журнал клеточной биологии. 126 (4): 945–54. Дои:10.1083 / jcb.126.4.945. ЧВК 2120109. PMID 8051214.
Nagahama M, Orci L, Ravazzola M, Amherdt M, Lacomis L, Tempst P, Rothman JE, Söllner TH (май 1996). «V-SNARE участвует во внутри-Гольджи-транспорте». Журнал клеточной биологии. 133 (3): 507–16. Дои:10.1083 / jcb.133.3.507. ЧВК 2120813. PMID 8636227.
Хойл Дж., Фелан Дж. П., Бермингем Н., Фишер Э.М. (ноябрь 1996 г.). «Локализация гена N-этилмалеимид-чувствительного фактора (NSF) человека и мыши: двухдоменный член семейства AAA, который участвует в слиянии мембран». Геном млекопитающих. 7 (11): 850–2. Дои:10.1007 / s003359900249. PMID 8875895. S2CID 21435412.
Якобссон Г., Мейстер Б. (декабрь 1996 г.). «Молекулярные компоненты экзоцитотического аппарата гипофиза крысы». Эндокринология. 137 (12): 5344–56. Дои:10.1210 / en.137.12.5344. PMID 8940356.
Тиммерс К.И., Кларк А.Э., Омацу-Канбе М., Уайтхарт С.В., Беннетт М.К., Холман Г.Д., Кушман С.З. (декабрь 1996 г.). «Идентификация рецепторов SNAP во фракциях мембран жировых клеток крыс и в комплексах SNARE, коиммунопреципитированных с меченным эпитопом N-этилмалеимид-чувствительным гибридным белком». Биохимический журнал. 320 (2): 429–36. Дои:10.1042 / bj3200429. ЧВК 1217948. PMID 8973549.
Germain-Lee EL, Obie C, Valle D (август 1997 г.). «NVL: новый член семейства АТФаз AAA, локализованный в ядре». Геномика. 44 (1): 22–34. Дои:10.1006 / geno.1997.4856. PMID 9286697.
Субраманиам В.Н., Ло Э., Хонг В. (октябрь 1997 г.). «Чувствительный к N-этилмалеимиду фактор (NSF) и альфа-растворимые белки прикрепления NSF (SNAP) опосредуют диссоциацию комплекса GS28-синтаксин 5 рецепторов Гольджи SNAP (SNARE)». Журнал биологической химии. 272 (41): 25441–4. Дои:10.1074 / jbc.272.41.25441. PMID 9325254.
Лоу С.Л., Питер Ф., Субраманиам В.Н., Вонг С.Х., Хонг В. (октябрь 1997 г.). «SNARE, участвующий в транспорте белка через аппарат Гольджи». Природа. 389 (6653): 881–4. Bibcode:1997Натура.389..881Л. Дои:10.1038/39923. PMID 9349823. S2CID 4421051.
Барнард Р.Дж., Морган А., Бургойн Р.Д. (ноябрь 1997 г.). «Стимуляция активности АТФазы NSF с помощью альфа-SNAP необходима для разборки комплекса SNARE и экзоцитоза». Журнал клеточной биологии. 139 (4): 875–83. Дои:10.1083 / jcb.139.4.875. ЧВК 2139964. PMID 9362506.
Остен П., Шривастава С., Инман Дж. Дж., Вилим Ф. С., Хатри Л., Ли Л. М., Стейтс Б.А., Эйнхебер С., Милнер Т.А., Хэнсон П.И., Зифф Э.Б. (июль 1998 г.). «С-конец GluR2 рецептора AMPA может опосредовать обратимое, АТФ-зависимое взаимодействие с NSF и альфа- и бета-SNAP». Нейрон. 21 (1): 99–110. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80518-8. PMID 9697855.
McDonald PH, Cote NL, Lin FT, Premont RT, Pitcher JA, Lefkowitz RJ (апрель 1999 г.). «Идентификация NSF как белка, связывающего бета-аррестин-1. Значение для регуляции бета2-адренорецепторов». Журнал биологической химии. 274 (16): 10677–80. Дои:10.1074 / jbc.274.16.10677. PMID 10196135.
Субраманиам В.Н., Ло Э., Хорстманн Х., Хаберманн А., Сюй Ю., Коу Дж., Гриффитс Г., Хонг В. (март 2000 г.). «Предпочтительная ассоциация синтаксина 8 с ранней эндосомой». Журнал клеточной науки. 113 (6): 997–1008. PMID 10683148.
Сагив Ю., Легесс-Миллер А., Порат А., Элазар З. (апрель 2000 г.). «GATE-16, модулятор мембранного транспорта, взаимодействует с NSF и Golgi v-SNARE GOS-28». Журнал EMBO. 19 (7): 1494–504. Дои:10.1093 / emboj / 19.7.1494. ЧВК 310219. PMID 10747018.
Аллан BB, Мойер Б.Д., Balch WE (июль 2000 г.). «Рекрутирование Rab1 p115 в комплекс cis-SNARE: программирование отпочковывающихся везикул COPII для слияния». Наука. 289 (5478): 444–8. Bibcode:2000Sci ... 289..444A. Дои:10.1126 / science.289.5478.444. PMID 10903204.
Мишо М., Томес С.Н., Де Блас Дж., Юнес Р., Майорга Л.С. (август 2000 г.). «Акросомный экзоцитоз, вызываемый кальцием, в сперматозоидах человека требует скоординированной активации Rab3A и фактора, чувствительного к N-этилмалеимиду». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (18): 9996–10001. Bibcode:2000PNAS ... 97.9996M. Дои:10.1073 / pnas.180206197. ЧВК 27650. PMID 10954749.
Имаи К., Сугай Т., Иритани С., Нидзато К., Накамура Р., Макифути Т., Какита А., Такахаши Н., Нава Х. (июнь 2001 г.). «Количественное исследование экспрессии синапсина II и N-этилмалеимид-чувствительного гибридного белка у больных шизофренией». Письма о неврологии. 305 (3): 185–8. Дои:10.1016 / S0304-3940 (01) 01844-4. PMID 11403936. S2CID 20542930.
Киттлер Дж. Т., Ростаинг П., Скьяво Дж., Фритчи Дж. М., Олсен Р., Триллер А., Мосс С. Дж. (Июль 2001 г.). «Субклеточное распределение GABARAP и его способность взаимодействовать с NSF предполагают роль этого белка во внутриклеточном транспорте рецепторов GABA (A)». Молекулярная и клеточная нейронауки. 18 (1): 13–25. Дои:10.1006 / mcne.2001.1005. PMID 11461150. S2CID 43244403.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000278174, ENSG00000276262 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000073969, ENSG00000278174, ENSG00000276262 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034187 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] «Энтрез Ген: фактор, чувствительный к N-этилмалеимиду NSF».

[pmid1315316-6] Wilson DW, Whiteheart SW, Wiedmann M, Brunner M, Rothman JE (май 1992 г.). «Мультисубъединичная частица, участвующая в слиянии мембран». Журнал клеточной биологии. 117 (3): 531–8. Дои:10.1083 / jcb.117.3.531. ЧВК 2289450. PMID 1315316.

[pmid8875895-7] Хойл Дж., Фелан Дж. П., Бермингем Н., Фишер Э.М. (ноябрь 1996 г.). «Локализация гена N-этилмалеимид-чувствительного фактора (NSF) человека и мыши: двухдоменный член семейства AAA, который участвует в слиянии мембран». Геном млекопитающих. 7 (11): 850–2. Дои:10.1007 / s003359900249. PMID 8875895. S2CID 21435412.

[pmid12941689-8] Фурст Дж., Саттон Р. Б., Чен Дж., Брюнгер А. Т., Григорьев Н. (сентябрь 2003 г.). «Электронная криомикроскопия структуры чувствительного фактора N-этилмалеимида при разрешении 11 A». Журнал EMBO. 22 (17): 4365–74. Дои:10.1093 / emboj / cdg420. ЧВК 202363. PMID 12941689.

[Alberts_2008-9] Альбертс, Брюс (2008). Молекулярная биология клетки. Наука о гирляндах. ISBN 978-0-8153-4105-5.

[pmid18172208-10] Кунер Т., Ли И, Джи К.Р., Боневальд Л.Ф., Августин Г.Дж. (январь 2008 г.). «Фотолиз клеточного пептида показывает быстрое действие фактора, чувствительного к N-этилмалеимиду, до высвобождения нейромедиатора». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (1): 347–52. Bibcode:2008ПНАС..105..347К. Дои:10.1073 / pnas.0707197105. ЧВК 2224215. PMID 18172208.

[pmid10399941-11] Ноэль Дж., Ральф Г.С., Пикард Л., Уильямс Дж., Молнар Э., Уни Дж. Б., Коллингридж Г.Л., Хенли Дж. М. (июнь 1999 г.). «Поверхностная экспрессия рецепторов AMPA в нейронах гиппокампа регулируется NSF-зависимым механизмом». Нейрон. 23 (2): 365–76. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80786-2. PMID 10399941.

[pmid3821906-12] Глик Б.С., Ротман Дж. Э. (1987). «Возможная роль жирного ацил-кофермента А во внутриклеточном транспорте белка». Природа. 326 (6110): 309–12. Bibcode:1987Натура.326..309Г. Дои:10.1038 / 326309a0. PMID 3821906. S2CID 4306469.

[pmid9362506-13] Барнард Р.Дж., Морган А., Бургойн Р.Д. (ноябрь 1997 г.). «Стимуляция активности АТФазы NSF с помощью альфа-SNAP необходима для разборки комплекса SNARE и экзоцитоза». Журнал клеточной биологии. 139 (4): 875–83. Дои:10.1083 / jcb.139.4.875. ЧВК 2139964. PMID 9362506.

[pmid7622514-14] Хэнсон П.И., Отто Х., Бартон Н., Ян Р. (июль 1995 г.). «Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок и альфа-SNAP вызывают конформационные изменения синтаксина». Журнал биологической химии. 270 (28): 16955–61. Дои:10.1074 / jbc.270.28.16955. PMID 7622514.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]