НАПА (ген) - NAPA (gene)

НАПА
Идентификаторы
Псевдонимы	НАПА, Белок прикрепления SNSF альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 603215 MGI: 104563 ГомолоГен: 2839 Генные карты: НАПА
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 19 (человек)
Конец	47,515,091 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	16,117,975 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность растворимого белка прикрепления NSF; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание синтаксина; • Привязка SNARE; • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса;
Сотовый компонент	• цитозоль; • мембрана; • вакуолярная мембрана; • миелин; • терминальный бутон; • Комплекс SNARE; • комплекс синаптобревин 2-SNAP-25-синтаксин-1а; • внеклеточная экзосома; • Мембрана Гольджи; • клеточная мембрана; • пресинапс; • постсинапс; • глутаматергический синапс;
Биологический процесс	• Разборка комплекса SNARE; • синаптическая передача, глутаматергическая; • Липидный бислой слияния; • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт; • развитие мозга; • Покрытие везикул COPII; • локализация апикального белка; • дифференциация нейронов; • транспорт белка; • внутриклеточный транспорт белка; • опосредованный пузырьками Гольджи транспорт; • везикулярный транспорт; • регуляция прайминга синаптических пузырьков; • ретроградный везикулярный транспорт, Гольджи в ER; • положительная регуляция активности АТФазы; • транспорт; • праймирование синаптических пузырьков; • разборка макромолекулярного комплекса;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8775
	108124
	ENSG00000105402
	ENSMUSG00000006024
	P54920
	Q9DB05
	NM_003827
	NM_025898
	NP_003818
	NP_080174
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

N-этилмалеимид-чувствительный фактор Апривязанность пRotein Аlpha, также известный как SNAP-α, представляет собой белок, который участвует во внутриклеточном движении и слиянии везикул с мембранами-мишенями в клетках.^[5]

Функция

'SNARE гипотеза »- модель, объясняющая процесс стыковки и слияния пузырьки к своей цели мембраны. Согласно этой модели, мембрана белки из везикулы (v-SNAREs) и белки из мембраны-мишени (t-SNAREs) регулируют специфичность нацеливания и стыковки везикул посредством взаимного распознавания. Как только два класса SNARE связываются друг с другом, они образуют комплекс, который задействует общие элементы термоядерного аппарата, а именно: NSF (N-этилмалеимид-чувствительный фактор) и SNAP (растворимые белки прикрепления к NSF) к месту слияния мембран, тем самым формируя комплекс слияния 20S. Альфа- и гамма-SNAP обнаруживаются в широком диапазоне тканей и действуют синергетически при транспортировке внутри Гольджи. Последовательность предсказанного 295-аминокислотного человеческого белка, кодируемого NAPA, имеет 37%, 60% и 67% идентичности с последовательностями дрожжи, Дрозофила, и альфа-SNAP кальмара соответственно. Тромбоциты содержат одни и те же белки, в том числе NSF, p115 / TAP, альфа-SNAP (этот белок), гамма-SNAP, а t-SNARE синтаксин-2 и синтаксин-4, которые используются во многих процессах везикулярного транспорта в других типах клеток. Экзоцитоз тромбоцитов использует молекулярный механизм, аналогичный тому, который используется другими секреторными клетками, такими как нейроны, хотя белки, используемые тромбоцитами, и способы их регуляции могут быть совершенно разными.^{[нужна цитата ]}

Клиническое значение

NAPA аномально экспрессируется у плодов обоих ЭКО и ИКСИ, что может способствовать увеличению риска врожденных дефектов при использовании этих методов вспомогательные репродуктивные технологии (ИСКУССТВО).^[6]

Взаимодействия

НАПА было показано взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105402 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006024 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Клэри Д.О., Грифф И.К., Ротман Дж. Э. (1990). «SNAPs, семейство белков прикрепления NSF, участвующих во внутриклеточном слиянии мембран у животных и дрожжей». Ячейка. 61 (4): 709–21. Дои:10.1016 / 0092-8674 (90) 90482-т. PMID 2111733. S2CID 11468679.
^ Чжан Ю., Чжан Ю.Л., Фэн Ц., Ву Ю.Т., Лю А.Х., Шэн Дж.З., Цай Дж., Хуанг Х.Ф. (сентябрь 2008 г.). «Сравнительный протеомный анализ плаценты человека, полученной с помощью вспомогательных репродуктивных технологий». Протеомика. 8 (20): 4344–56. Дои:10.1002 / pmic.200800294. PMID 18792929.
^ ^а ^б Хэнсон П.И., Отто Х., Бартон Н., Ян Р. (июль 1995 г.). «Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок и альфа-SNAP вызывают конформационные изменения синтаксина». J. Biol. Chem. 270 (28): 16955–61. Дои:10.1074 / jbc.270.28.16955. PMID 7622514.
^ Барнард Р.Дж., Морган А., Бургойн Р.Д. (ноябрь 1997 г.). «Стимуляция активности АТФазы NSF с помощью альфа-SNAP необходима для разборки комплекса SNARE и экзоцитоза». J. Cell Biol. 139 (4): 875–83. Дои:10.1083 / jcb.139.4.875. ЧВК 2139964. PMID 9362506.
^ ^а ^б ^c Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ McMahon HT, Missler M, Li C, Südhof TC (октябрь 1995 г.). «Комплексины: цитозольные белки, регулирующие функцию рецептора SNAP». Ячейка. 83 (1): 111–9. Дои:10.1016/0092-8674(95)90239-2. PMID 7553862. S2CID 675343.
^ Рабуй К., Кондо Х., Ньюман Р., Хуэй Н., Фримонт П., Уоррен Г. (март 1998 г.). «Синтаксин 5 является общим компонентом опосредованных NSF и p97 путей повторной сборки цистерн Гольджи из митотических фрагментов Гольджи in vitro». Ячейка. 92 (5): 603–10. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81128-9. PMID 9506515. S2CID 17285800.
^ Мяо Ю., Майнер К., Чжан Л., Хансон П.И., Дани А., Виг М. (июль 2013 г.). «Важная и независимая от NSF роль α-SNAP в поступлении кальция в магазин». eLife. 2: e00802. Дои:10.7554 / eLife.00802. ЧВК 3713520. PMID 23878724.

дальнейшее чтение

Уилсон DW, Уайтхарт SW, Видманн М., Бруннер М., Ротман Дж. Э. (1992). «Мультисубъединичная частица, участвующая в слиянии мембран». J. Cell Biol. 117 (3): 531–8. Дои:10.1083 / jcb.117.3.531. ЧВК 2289450. PMID 1315316.
Whiteheart SW, Brunner M, Wilson DW, Wiedmann M, Rothman JE (1992). «Растворимые N-этилмалеимид-чувствительные слитые белки присоединения (SNAP) связываются с комплексом мульти-SNAP рецепторов в мембранах Гольджи». J. Biol. Chem. 267 (17): 12239–43. PMID 1601890.
Хэнсон П.И., Отто Х., Бартон Н., Ян Р. (1995). «Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок и альфа-SNAP вызывают конформационные изменения синтаксина». J. Biol. Chem. 270 (28): 16955–61. Дои:10.1074 / jbc.270.28.16955. PMID 7622514.
Whiteheart SW, Griff IC, Brunner M, Clary DO, Mayer T., Buhrow SA, Rothman JE (1993). «Семейство SNAP белков прикрепления NSF включает в себя изоформу, специфичную для мозга». Природа. 362 (6418): 353–5. Bibcode:1993Натура 362..353Вт. Дои:10.1038 / 362353a0. PMID 8455721. S2CID 4341471.
Тиммерс К.И., Кларк А.Э., Омацу-Канбе М., Уайтхарт С.В., Беннетт М.К., Холман Г.Д., Кушман С.В. (1997). «Идентификация рецепторов SNAP во фракциях мембран жировых клеток крыс и в комплексах SNARE, коиммунопреципитированных с меченным эпитопом N-этилмалеимид-чувствительным гибридным белком». Biochem. J. 320 (Pt 2): 429–36. Дои:10.1042 / bj3200429. ЧВК 1217948. PMID 8973549.
Лимоны П.П., Чен Д., Бернштейн А.М., Беннетт М.К., Whiteheart SW (1997). «Регулируемая секреция тромбоцитов: идентификация элементов механизма экзоцитоза тромбоцитов». Кровь. 90 (4): 1490–500. Дои:10.1182 / кровь.V90.4.1490. PMID 9269766.
Субраманиам В.Н., Ло Э., Хонг В. (1997). «Чувствительный к N-этилмалеимиду фактор (NSF) и альфа-растворимые белки прикрепления NSF (SNAP) опосредуют диссоциацию комплекса GS28-синтаксин 5 рецепторов Гольджи SNAP (SNARE)». J. Biol. Chem. 272 (41): 25441–4. Дои:10.1074 / jbc.272.41.25441. PMID 9325254.
Лоу С.Л., Питер Ф., Субраманиам В.Н., Вонг С.Х., Хонг В. (1997). «SNARE, участвующий в транспорте белка через аппарат Гольджи». Природа. 389 (6653): 881–4. Bibcode:1997Натура.389..881Л. Дои:10.1038/39923. PMID 9349823. S2CID 4421051.
Барнард Р.Дж., Морган А., Бургойн Р.Д. (1997). «Стимуляция АТФазы NSF с помощью α-SNAP необходима для разборки комплекса SNARE и экзоцитоза». J. Cell Biol. 139 (4): 875–83. Дои:10.1083 / jcb.139.4.875. ЧВК 2139964. PMID 9362506.
Вонг Ш., Сюй И, Чжан Т., Хун В. (1998). «Синтаксин 7, новый член синтаксина, связанный с ранним эндосомным компартментом». J. Biol. Chem. 273 (1): 375–80. Дои:10.1074 / jbc.273.1.375. PMID 9417091.
Тан Б.Л., Тан А.Е., Лим Л.К., Ли С.С., Лоу Д.Й., Хонг В. (1998). «Синтаксин 12, член семейства синтаксинов, локализованный в эндосоме». J. Biol. Chem. 273 (12): 6944–50. Дои:10.1074 / jbc.273.12.6944. PMID 9507000.
Вонг Ш., Чжан Т., Сюй И, Субраманиам В.Н., Гриффитс Г., Хонг В. (1998). «Эндобревин, новый синаптобревин / VAMP-подобный белок, преимущественно связанный с ранней эндосомой». Мол. Биол. Ячейка. 9 (6): 1549–63. Дои:10.1091 / mbc.9.6.1549. ЧВК 25382. PMID 9614193.
Остен П., Сривастава С., Инман Г.Дж., Вилим Ф.С., Хатри Л., Ли Л.М., Стейтс Б.А., Эйнхебер С., Милнер Т.А., Хансон П.И., Зифф Э.Б. (1998). «С-конец GluR2 рецептора AMPA может опосредовать обратимое, АТФ-зависимое взаимодействие с NSF и альфа- и бета-SNAP». Нейрон. 21 (1): 99–110. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80518-8. PMID 9697855. S2CID 18569829.
Прекерис Р., Клумперман Дж., Чен Ю.А., Шеллер Р.Х. (1998). «Синтаксин 13 опосредует цикл белков плазматической мембраны через эндосомы с тубуловезикулярной рециклингом». J. Cell Biol. 143 (4): 957–71. Дои:10.1083 / jcb.143.4.957. ЧВК 2132958. PMID 9817754.
Нагамацу С., Ватанабэ Т., Накамичи Ю., Ямамура С., Цузуки К., Мацусима С. (1999). «Альфа-растворимый белок связывания фактора, чувствительного к N-этилмалеимиду, экспрессируется в бета-клетках поджелудочной железы и функционирует в инсулине, но не в секреции гамма-аминомасляной кислоты». J. Biol. Chem. 274 (12): 8053–60. Дои:10.1074 / jbc.274.12.8053. PMID 10075705.
Субраманиам В.Н., Ло Э., Хорстманн Х., Хаберманн А., Сюй Ю., Коу Дж., Гриффитс Г., Хонг В. (2000). «Предпочтительная ассоциация синтаксина 8 с ранней эндосомой». J. Cell Sci. 113 (6): 997–1008. PMID 10683148.
Хиросе Х, Арасаки К., Дохмаэ Н., Такио К., Хацудзава К., Нагахама М., Тани К., Ямамото А., Тохьяма М., Тагая М. (2005). «Влияние ZW10 на мембранный перенос между эндоплазматическим ретикулумом и Гольджи». EMBO J. 23 (6): 1267–78. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600135. ЧВК 381410. PMID 15029241.
Сингх Б.Б., Локвич Т.П., Бандйопадхьяй BC, Лю X, Боллимунта С., Бразер С.К., Комбс С., Дас С., Лендерс А.Г., Шенг Ж.Х., Неппер М.А., Амбудкар С.В., Амбудкар И.С. (2004). «VAMP2-зависимый экзоцитоз регулирует встраивание в плазматическую мембрану каналов TRPC3 и способствует притоку Ca2 +, стимулированному агонистами». Мол. Ячейка. 15 (4): 635–46. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.07.010. PMID 15327778.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105402 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006024 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[5] Клэри Д.О., Грифф И.К., Ротман Дж. Э. (1990). «SNAPs, семейство белков прикрепления NSF, участвующих во внутриклеточном слиянии мембран у животных и дрожжей». Ячейка. 61 (4): 709–21. Дои:10.1016 / 0092-8674 (90) 90482-т. PMID 2111733. S2CID 11468679.

[zhang-6] Чжан Ю., Чжан Ю.Л., Фэн Ц., Ву Ю.Т., Лю А.Х., Шэн Дж.З., Цай Дж., Хуанг Х.Ф. (сентябрь 2008 г.). «Сравнительный протеомный анализ плаценты человека, полученной с помощью вспомогательных репродуктивных технологий». Протеомика. 8 (20): 4344–56. Дои:10.1002 / pmic.200800294. PMID 18792929.

[pmid7622514-7] а ^б Хэнсон П.И., Отто Х., Бартон Н., Ян Р. (июль 1995 г.). «Чувствительный к N-этилмалеимиду гибридный белок и альфа-SNAP вызывают конформационные изменения синтаксина». J. Biol. Chem. 270 (28): 16955–61. Дои:10.1074 / jbc.270.28.16955. PMID 7622514.

[pmid9362506-8] Барнард Р.Дж., Морган А., Бургойн Р.Д. (ноябрь 1997 г.). «Стимуляция активности АТФазы NSF с помощью альфа-SNAP необходима для разборки комплекса SNARE и экзоцитоза». J. Cell Biol. 139 (4): 875–83. Дои:10.1083 / jcb.139.4.875. ЧВК 2139964. PMID 9362506.

[pmid16189514-9] а ^б ^c Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid7553862-10] McMahon HT, Missler M, Li C, Südhof TC (октябрь 1995 г.). «Комплексины: цитозольные белки, регулирующие функцию рецептора SNAP». Ячейка. 83 (1): 111–9. Дои:10.1016/0092-8674(95)90239-2. PMID 7553862. S2CID 675343.

[pmid9506515-11] Рабуй К., Кондо Х., Ньюман Р., Хуэй Н., Фримонт П., Уоррен Г. (март 1998 г.). «Синтаксин 5 является общим компонентом опосредованных NSF и p97 путей повторной сборки цистерн Гольджи из митотических фрагментов Гольджи in vitro». Ячейка. 92 (5): 603–10. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81128-9. PMID 9506515. S2CID 17285800.

[pmid23878724-12] Мяо Ю., Майнер К., Чжан Л., Хансон П.И., Дани А., Виг М. (июль 2013 г.). «Важная и независимая от NSF роль α-SNAP в поступлении кальция в магазин». eLife. 2: e00802. Дои:10.7554 / eLife.00802. ЧВК 3713520. PMID 23878724.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]