SNAP23 - SNAP23

SNAP23
Белок SNAP23 PDB 1nhl.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSNAP23, HsT17016, SNAP-23, SNAP23A, SNAP23B, белок, связанный с синаптосомами 23 кДа, белок, связанный с синаптосомами 23
Внешние идентификаторыOMIM: 602534 MGI: 109356 ГомолоГен: 37857 Генные карты: SNAP23
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное местоположение для SNAP23
Геномное местоположение для SNAP23
Группа15q15.1-q15.2Начинать42,491,233 бп[1]
Конец42,545,356 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SNAP23 209131 s на fs.png

PBB GE SNAP23 209130 в формате fs.png

PBB GE SNAP23 214544 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003825
NM_130798

NM_001177792
NM_001177793
NM_009222

RefSeq (белок)

NP_003816
NP_570710

NP_001171263
NP_001171264
NP_033248

Расположение (UCSC)Chr 15: 42.49 - 42.55 МбChr 2: 120,57 - 120,6 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Синаптосомно-связанный белок 23 это белок что у людей кодируется SNAP23 ген.[5][6] Для этого гена описаны два альтернативных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы белка.

Функция

Специфичность везикулярного транспорта частично регулируется взаимодействием мембранный белок, связанный с пузырьками названный синаптобревин / VAMP с белком мембраны целевого отсека, называемым синтаксин. Эти белки вместе с SNAP25 (белок, связанный с синаптосомами 25 кДа), образуют комплекс, который служит сайтом связывания для общего механизма слияния мембран. Синаптобревин / ВАМП и синтаксин, как полагают, участвуют в везикулярном транспорте в большинстве, если не во всех клетках, в то время как SNAP25 присутствует почти исключительно в головном мозге, что позволяет предположить, что существует повсеместно экспрессируемый гомолог SNAP25 для облегчения слияния транспортных пузырьков и мембран-мишеней в других клетках. ткани.

SNAP23 структурно и функционально подобен SNAP25 и прочно связывается с множеством синтаксинов и синаптобревинов / VAMP. Это важный компонент рецептора с высоким сродством для общего механизма слияния мембран и важный регулятор стыковки и слияния транспортных везикул.[7]

Клиническое значение

У лиц с резистентность к инсулину, SNAP23 перемещается с плазматической мембраны в цитозоль, где он становится связанным с липидными каплями и, следовательно, не может перемещаться GLUT-4 к мембране, препятствуя транспорту глюкозы.

Взаимодействия

SNAP23 был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000092531 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027287 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Mollinedo F, Lazo PA (февраль 1997 г.). «Идентификация двух изоформ слитого белка везикулярной мембраны SNAP-23 в нейтрофилах человека и клетках HL-60». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 231 (3): 808–12. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6196. PMID  9070898.
  6. ^ а б c d е Равичандран В., Чавла А., Рош, Пенсильвания (июнь 1996 г.). «Идентификация нового синтаксин- и синаптобревин / ВАМП-связывающего белка, SNAP-23, экспрессируемого в ненейрональных тканях». Журнал биологической химии. 271 (23): 13300–3. Дои:10.1074 / jbc.271.23.13300. PMID  8663154.
  7. ^ «Ген Entrez: белок, ассоциированный с синаптосомами SNAP23, 23 кДа».
  8. ^ Кормет-Бояка Е., Ди А., Чанг С.И., Нарен А.П., Туссон А., Нельсон Д.Д., Кирк К.Л. (сентябрь 2002 г.). «Каналы хлорида CFTR регулируются комплексом SNAP-23 / синтаксин 1A». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (19): 12477–82. Дои:10.1073 / пнас.192203899. ЧВК  129470. PMID  12209004.
  9. ^ Дифенбах Р.Дж., Дифенбах Э., Дуглас М.В., Каннингем А.Л. (декабрь 2002 г.). «Тяжелая цепь обычного кинезина взаимодействует с белками SNARE SNAP25 и SNAP23». Биохимия. 41 (50): 14906–15. Дои:10.1021 / bi026417u. PMID  12475239.
  10. ^ а б Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
  11. ^ Бакстон П., Чжан XM, Уолш Б., Шриратана А., Шенберг И., Маникам Э., Роу Т. (октябрь 2003 г.). «Идентификация и характеристика Snapin как повсеместно экспрессируемого SNARE-связывающего белка, который взаимодействует с SNAP23 в ненейрональных клетках». Биохимический журнал. 375 (Pt 2): 433–40. Дои:10.1042 / BJ20030427. ЧВК  1223698. PMID  12877659.
  12. ^ Valdez AC, Cabaniols JP, Brown MJ, Roche PA (март 1999 г.). «Синтаксин 11 связан с SNAP-23 на поздних эндосомах и в сети транс-Гольджи». Журнал клеточной науки. 112 (6): 845–54. PMID  10036234.
  13. ^ а б c d е ж грамм Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Шимомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Архивы оральной биологии. 48 (8): 597–604. Дои:10.1016 / S0003-9969 (03) 00116-X. PMID  12828989.
  14. ^ а б c Ли Г., Александр Е.А., Шварц Дж. Х. (май 2003 г.). «Специфичность изоформы синтаксина в регуляции экзоцитоза H + -АТФазы почек». Журнал биологической химии. 278 (22): 19791–7. Дои:10.1074 / jbc.M212250200. PMID  12651853.
  15. ^ а б c d Араки С., Тамори Й., Каваниси М., Шинода Х., Масуги Дж., Мори Х., Ники Т., Окадзава Х., Кубота Т., Касуга М. (май 1997 г.). «Ингибирование связывания SNAP-23 с синтаксином 4 с помощью Munc18c». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 234 (1): 257–62. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6560. PMID  9168999.
  16. ^ а б c Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж. С., Хуанг Б., Шен М., Ю С., Ло И., Шеллер Р. Х. (декабрь 1998 г.). «Три новых белка семейства синтаксин / SNAP-25». Журнал биологической химии. 273 (51): 34171–9. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34171. PMID  9852078.
  17. ^ а б c d Paumet F, Le Mao J, Martin S, Galli T, David B, Blank U, Roa M (июнь 2000 г.). «Растворимые рецепторы белка прикрепления NSF (SNAREs) в тучных клетках RBL-2H3: функциональная роль синтаксина 4 в экзоцитозе и идентификация секреторного компартмента, содержащего мембранный белок 8, связанный с везикулами». Журнал иммунологии. 164 (11): 5850–7. Дои:10.4049 / jimmunol.164.11.5850. PMID  10820264.
  18. ^ а б Каваниси М., Тамори Ю., Окадзава Х., Араки С., Шинода Х., Касуга М. (март 2000 г.). «Роль SNAP23 в индуцированной инсулином транслокации GLUT4 в адипоцитах 3T3-L1. Опосредование образования комплекса между синтаксином4 и VAMP2». Журнал биологической химии. 275 (11): 8240–7. Дои:10.1074 / jbc.275.11.8240. PMID  10713150.
  19. ^ а б Freedman SJ, Song HK, Xu Y, Sun ZY, Eck MJ (апрель 2003 г.). «Гомотетрамерная структура N-концевого домена спиральной спирали SNAP-23». Журнал биологической химии. 278 (15): 13462–7. Дои:10.1074 / jbc.M210483200. PMID  12556468.
  20. ^ Мартин-Мартин Б., Набокина С.М., Блази Дж., Лазо, Пенсильвания, Моллинедо Ф. (октябрь 2000 г.). «Участие SNAP-23 и синтаксина 6 в экзоцитозе нейтрофилов человека». Кровь. 96 (7): 2574–83. PMID  11001914.
  21. ^ Мартинес-Арка С., Радж Р., Вакка М., Рапосо Дж., Камонис Дж., Про-Жильярдо В., Давиет Л., Формстехер Е., Гамбург А., Филиппини Ф., Д'Эспозито М., Галли Т. (июль 2003 г.). «Двойной механизм, контролирующий локализацию и функцию экзоцитарных v-SNARE». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (15): 9011–6. Дои:10.1073 / pnas.1431910100. ЧВК  166429. PMID  12853575.
  22. ^ Галли Т., Захрауи А., Вайдьянатан В.В., Рапосо Дж., Тиан Дж. М., Карин М., Ниманн Х., Лувард Д. (июнь 1998 г.). «Новый мембранный белок, нечувствительный к столбняку, нечувствительный к везикулам, в комплексах SNARE апикальной плазматической мембраны эпителиальных клеток». Молекулярная биология клетки. 9 (6): 1437–48. Дои:10.1091 / mbc.9.6.1437. ЧВК  25366. PMID  9614185.

дальнейшее чтение