VAMP2 - Википедия - VAMP2

ВАМП2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3FIE, 3FII, 3РК2, 3RK3, 3RL0
Идентификаторы
Псевдонимы	ВАМП2, SYB2, VAMP-2, мембранный белок 2, связанный с везикулами, NEDHAHM
Внешние идентификаторы	OMIM: 185881 MGI: 1313277 ГомолоГен: 7591 Генные карты: ВАМП2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	8,163,546 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	69,092,384 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Активность рецептора SNAP; • самоассоциация белков; • GO: 0001948 связывание с белками; • привязка синтаксина-1; • Привязка SNARE; • связывание кальмодулина; • связывание синтаксина; • связывание фосфолипидов; • кальций-зависимое связывание с белками;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны; • цитозоль; • клатриновая мембрана транспортной везикулы моноаминов; • мембрана; • секреторная мембрана гранул; • клеточная мембрана; • клатриновая мембрана транспортных везикул гамма-аминомасляной кислоты; • синапс; • неотъемлемый компонент плазматической мембраны; • мембрана синаптических везикул; • мембрана из гранул зимогена; • соединение клеток; • проекция нейрона; • цитоплазматический пузырек; • везикула, покрытая клатрином; • клатрин-скульптурная мембрана везикулы транспорта глутамата; • секреторная гранула; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • комплекс синаптобревин 2-SNAP-25-синтаксин-1a-комплексин I; • комплекс синаптобревин 2-SNAP-25-синтаксин-1а; • Комплекс SNARE; • комплекс синаптобревин 2-SNAP-25-синтаксин-1a-комплексин II; • комплекс потенциалозависимых калиевых каналов; • сеть транс-Гольджи; • синаптический пузырек; • везикул; • перинуклеарная область цитоплазмы; • конец проекции нейрона; • мембрана везикул, покрытая клатрином;
Биологический процесс	• естественная дегрануляция клеток-киллеров; • секреция слизи; • регуляция секреции гистамина тучными клетками; • дегрануляция нейтрофилов; • секреция глутамата; • слияние пузырьков; • дегрануляция эозинофилов; • везикулярный транспорт; • экзоцитоз; • ответ на глюкозу; • Слияние липидного бислоя; • регулирование активности калиевых каналов задержанного выпрямителя; • экзоцитоз, регулируемый ионами кальция; • регуляция экзоцитоза; • положительная регуляция внутриклеточного транспорта белков; • транспорт белка; • Гольджи к транспорту белков плазматической мембраны; • экзоцитоз синаптических пузырьков; • клеточный ответ на стимул инсулина; • длительная синаптическая потенциация; • регуляция опосредованного пузырьками транспорта; • мембранная организация; • сборка макромолекулярного комплекса; • пост-Гольджи-опосредованный везикулами транспорт; • GO: 0010554 секреция нейротрансмиттера;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6844
	22318
	ENSG00000220205
	ENSMUSG00000020894
	P63027
	P63044
	NM_014232; NM_001330125
	NM_009497
	NP_001317054; NP_055047
	NP_033523
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Гипотетические модели конформаций VAMP2 и участие в сборке комплекса SNARE для высвобождения нейромедиатора

Связанный с пузырьками мембранный белок 2 (ВАМП2) это белок что у людей кодируется ВАМП2 ген.^[5]^[6]

Функция

Синаптобревины / ВАМП, синтаксины, и белок, связанный с синаптосомами массой 25 кДа SNAP25 являются основными компонентами белкового комплекса, участвующего в стыковке и / или слиянии синаптические везикулы с пресинаптической мембраной. VAMP2 является членом мембранный белок, связанный с пузырьками (ВАМП) / семейство синаптобревинов. Предполагается, что VAMP2 участвует в нейротрансмиттер выпуск на этапе между стыковкой и слияние. Мыши, лишенные функционального гена synaptobrevin2 / VAMP2, не могут выжить после рождения и имеют резко сниженную синаптическую передачу, около 10% от контроля.^[7] Белок образует стабильный комплекс с синтаксином, белком, связанным с синаптосомами, 25 кДа и комплексин. Он также образует особый комплекс с синаптофизин.^[6]

Клиническое значение

Гетерозиготный мутации в VAMP2 вызывают расстройство нервного развития с гипотония и аутичный особенности (с или без гиперкинетические движения ).^[8]^[9]^[10]

Взаимодействия

VAMP2 был показан взаимодействовать с:

RABAC1,^[11]
SNAP-25,^[12]^[13]^[14]
SNAP23,^[15]^[16]^[17]
STX1A,^[13]^[14]^[18]^[19]^[20]^[21] и
STX4.^[15]^[22]^[23]^[24]

дальнейшее чтение

Брумелл Дж. Х., Волчук А., Сенгелов Х., Боррегаард Н., Сьютат А. М., Бейнтон Д. Ф., Гринштейн С., Клип А. (декабрь 1995 г.). «Субклеточное распределение стыковочных / гибридных белков в нейтрофилах, секреторных клетках с множественными экзоцитарными компартментами». Журнал иммунологии. 155 (12): 5750–9. PMID 7499863.
Кутай У., Анерт-Хильгер Г., Хартманн Э., Виденманн Б., Рапопорт Т.А. (январь 1995 г.). «Транспортный путь синаптобревина через новый путь встраивания в мембрану эндоплазматического ретикулума». Журнал EMBO. 14 (2): 217–23. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb06994.x. ЧВК 398073. PMID 7835332.
Чапман Э. Р., Ан С., Бартон Н., Ян Р. (ноябрь 1994 г.). «SNAP-25, t-SNARE, который связывается как с синтаксином, так и с синаптобревином через домены, которые могут образовывать спиральные спирали». Журнал биологической химии. 269 (44): 27427–32. PMID 7961655.
Hunt JM, Bommert K, Charlton MP, Kistner A, Habermann E, Augustine GJ, Betz H (июнь 1994 г.). «Пост-докинг роль синаптобревина в слиянии синаптических пузырьков». Нейрон. 12 (6): 1269–79. Дои:10.1016 / 0896-6273 (94) 90443-Х. PMID 8011337. S2CID 799315.
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Джагадиш М.Н., Фернандес С.С., Хьюиш Д.Р., Маколей С.Л., Гоф К.Х., Грусовин Дж., Веркейлен А., Косгроув Л., Алафачи А., Френкель М.Дж., Уорд К.В. (август 1996 г.). «Чувствительные к инсулину ткани содержат изоформы А и В основного комплексного белка SNAP-25 (синаптосомно-связанный белок 25) в дополнение к синтаксину 4 и синаптобревинам 1 и 2». Биохимический журнал. 317. 317 (3): 945–54. Дои:10.1042 / bj3170945. ЧВК 1217577. PMID 8760387.
Мандон Б., Чжоу С.Л., Нильсен С., Неппер М.А. (август 1996 г.). «Синтаксин-4 локализован на апикальной плазматической мембране клеток собирательного канала почек крыс: возможная роль в транспортировке аквапорина-2». Журнал клинических исследований. 98 (4): 906–13. Дои:10.1172 / JCI118873. ЧВК 507504. PMID 8770861.
Тиммерс К.И., Кларк А.Э., Омацу-Канбе М., Уайтхарт С.В., Беннетт М.К., Холман Г.Д., Кушман С.З. (декабрь 1996 г.). «Идентификация рецепторов SNAP во фракциях мембран жировых клеток крыс и в комплексах SNARE, коиммунопреципитированных с меченным эпитопом N-этилмалеимид-чувствительным гибридным белком». Биохимический журнал. 320. 320 (2): 429–36. Дои:10.1042 / bj3200429. ЧВК 1217948. PMID 8973549.
Бец А., Окамото М., Бенселер Ф., Брозе Н. (январь 1997 г.). «Прямое взаимодействие крысиного гомолога unc-13 Munc13-1 с N-концом синтаксина». Журнал биологической химии. 272 (4): 2520–6. Дои:10.1074 / jbc.272.4.2520. PMID 8999968.
Хао Дж. К., Салем Н., Пэн XR, Келли Р. Б., Беннет М. К. (март 1997 г.). «Влияние мутаций в везикулярно-ассоциированном мембранном белке (VAMP) на сборку мультимерных белковых комплексов». Журнал неврологии. 17 (5): 1596–603. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.17-05-01596.1997. ЧВК 6573372. PMID 9030619.
Мартинчич И., Перальта, ME, Нгзее, Дж. К. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика двойного пренилированного рецептора Rab и VAMP2». Журнал биологической химии. 272 (43): 26991–8. Дои:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID 9341137.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Weir ML, Klip A, Trimble WS (июль 1998 г.). «Идентификация человеческого гомолога ассоциированного с везикулярным мембранным белком (VAMP) белка 33 кДа (VAP-33): широко экспрессируемого белка, который связывается с VAMP». Биохимический журнал. 333. 333 (2): 247–51. Дои:10.1042 / bj3330247. ЧВК 1219579. PMID 9657962.
Изенманн С., Хью-Гудолл Ю., Гэмбл Дж., Вадас М., Ваттенберг Б.В. (июль 1998 г.). «Изоформа сплайсинга мембранного протеина-1, ассоциированного с везикулами (VAMP-1), содержит сигнал нацеливания на митохондрии». Молекулярная биология клетки. 9 (7): 1649–60. Дои:10.1091 / mbc.9.7.1649. ЧВК 25402. PMID 9658161.
Прекерис Р., Клумперман Дж., Чен Ю.А., Шеллер Р.Х. (ноябрь 1998 г.). «Синтаксин 13 опосредует цикл белков плазматической мембраны через эндосомы, реализующие тубуловезикулярную систему». Журнал клеточной биологии. 143 (4): 957–71. Дои:10.1083 / jcb.143.4.957. ЧВК 2132958. PMID 9817754.
Нисимура Й., Хаяси М., Инада Х., Танака Т. (январь 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика гомологов млекопитающих ассоциированных с везикулами мембранных белков-ассоциированных (VAMP-ассоциированных) белков». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 254 (1): 21–6. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9876. PMID 9920726.
Valdez AC, Cabaniols JP, Brown MJ, Roche PA (март 1999 г.). «Синтаксин 11 связан с SNAP-23 на поздних эндосомах и в сети транс-Гольджи». Журнал клеточной науки. 112. 112 (6): 845–54. PMID 10036234.
Маргиттай М., Отто Х., Ян Р. (март 1999 г.). «Стабильное взаимодействие между синтаксином 1a и синаптобревином 2, опосредованное их трансмембранными доменами». Письма FEBS. 446 (1): 40–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00028-9. PMID 10100611. S2CID 9115709.
Фасшауэр Д., Антонин В., Маргиттай М., Пабст С., Ян Р. (май 1999 г.). «Смешанные и неродственные комплексы SNARE. Характеристика сборки и биофизических свойств». Журнал биологической химии. 274 (22): 15440–6. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15440. PMID 10336434.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000220205 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020894 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1976629-5] Арчер Б.Т., Озчелик Т., Ян Р., Франк У., Зюдхоф ТЦ (октябрь 1990 г.). «Структуры и хромосомные локализации двух генов человека, кодирующих синаптобревины 1 и 2». Журнал биологической химии. 265 (28): 17267–73. PMID 1976629.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: мембранный белок 2, связанный с пузырьками VAMP2 (синаптобревин 2)».

[pmid11691998-7] Шох С., Деак Ф., Кенигсторфер А., Можаева М., Сара Й., Зюдхоф ТЦ, Кавалали Е.Т. (ноябрь 2001 г.). «Функция SNARE проанализирована у мышей с нокаутом по синаптобревину / VAMP». Наука. 294 (5544): 1117–22. Bibcode:2001Научный ... 294.1117С. Дои:10.1126 / science.1064335. PMID 11691998. S2CID 40321111.

[pmid30929742-8] Salpietro V, Malintan NT, Llano-Rivas I, et al. (Апрель 2019). «Мутации в нервном пузыре SNARE VAMP2 влияют на слияние синаптических мембран и нарушают нейроразвитие человека». Американский журнал генетики человека. 104 (4): 721‐730. Дои:10.1016 / j.ajhg.2019.02.016. ЧВК 6451933. PMID 30929742.

[pmid32336483-9] Сунага Ю., Мурамацу К., Косаки К. и др. (Апрель 2020 г.). «Вариант нейронального везикулярного SNARE VAMP2 (синаптобревин-2): первое сообщение в Японии». Мозг и развитие. 42 (7): 529–533. Дои:10.1016 / j.braindev.2020.04.001. PMID 32336483. S2CID 216095891.

[OMIM618760-10] «Запись OMIM: расстройство нервного развития с гипотонией и аутизмом с гиперкинетическими движениями или без них».

[pmid9341137-11] Мартинчич И., Перальта, ME, Нгзее, Дж. К. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика двойного пренилированного рецептора Rab и VAMP2». Журнал биологической химии. 272 (43): 26991–8. Дои:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID 9341137.

[pmid11524423-12] Ли Й, Чин Л.С., Вейгель К., Ли Л. (ноябрь 2001 г.). «Spring, новый белок пальца RING, регулирующий экзоцитоз синаптических везикул». Журнал биологической химии. 276 (44): 40824–33. Дои:10.1074 / jbc.M106141200. PMID 11524423.

[pmid9030619-13] а ^б Хао Дж. К., Салем Н., Пэн XR, Келли Р. Б., Беннет М. К. (март 1997 г.). «Влияние мутаций в везикулярно-ассоциированном мембранном белке (VAMP) на сборку мультимерных белковых комплексов». Журнал неврологии. 17 (5): 1596–603. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.17-05-01596.1997. ЧВК 6573372. PMID 9030619.

[pmid11832227-14] а ^б Чен X, Томчик Д.Р., Ковригин Э., Арак Д., Мачиус М., Зюдхоф ТК, Ризо Дж. (Январь 2002 г.). «Трехмерная структура комплекса комплексин / SNARE». Нейрон. 33 (3): 397–409. Дои:10.1016 / s0896-6273 (02) 00583-4. PMID 11832227. S2CID 17878965.

[pmid10820264-15] а ^б Paumet F, Le Mao J, Martin S, Galli T, David B, Blank U, Roa M (июнь 2000 г.). «Растворимые рецепторы белка прикрепления NSF (SNAREs) в тучных клетках RBL-2H3: функциональная роль синтаксина 4 в экзоцитозе и идентификация секреторного компартмента, содержащего мембранный белок 8, связанный с везикулами». Журнал иммунологии. 164 (11): 5850–7. Дои:10.4049 / jimmunol.164.11.5850. PMID 10820264.

[pmid12828989-16] Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Шимомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Архивы оральной биологии. 48 (8): 597–604. Дои:10.1016 / с0003-9969 (03) 00116-х. PMID 12828989.

[pmid10713150-17] Каваниси М., Тамори Ю., Окадзава Х., Араки С., Шинода Х., Касуга М. (март 2000 г.). «Роль SNAP23 в инсулино-индуцированной транслокации GLUT4 в адипоцитах 3T3-L1. Опосредование образования комплекса между синтаксином4 и VAMP2». Журнал биологической химии. 275 (11): 8240–7. Дои:10.1074 / jbc.275.11.8240. PMID 10713150.

[pmid10449403-18] Дулубова И., Сугита С., Хилл С., Хосака М., Фернандес И., Зюдхоф ТК, Ризо Дж. (Август 1999 г.). «Конформационный переключатель синтаксина во время экзоцитоза: роль munc18». Журнал EMBO. 18 (16): 4372–82. Дои:10.1093 / emboj / 18.16.4372. ЧВК 1171512. PMID 10449403.

[pmid7553862-19] McMahon HT, Missler M, Li C, Südhof TC (октябрь 1995 г.). «Комплексины: цитозольные белки, регулирующие функцию рецептора SNAP». Клетка. 83 (1): 111–9. Дои:10.1016/0092-8674(95)90239-2. PMID 7553862. S2CID 675343.

[pmid12093152-20] Перес-Брангули Ф., Мухайсен А., Блази Дж. (Июнь 2002 г.). «Связывание Munc 18a с изоформами синтаксина 1A и 1B определяет его локализацию на плазматической мембране и блокирует сборку SNARE в трехгибридном системном анализе». Молекулярная и клеточная нейронауки. 20 (2): 169–80. Дои:10.1006 / mcne.2002.1122. PMID 12093152. S2CID 23927545.

[pmid10100611-21] Маргиттай М., Отто Х., Ян Р. (март 1999 г.). «Стабильное взаимодействие между синтаксином 1a и синаптобревином 2, опосредованное их трансмембранными доменами». Письма FEBS. 446 (1): 40–4. Дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 00028-9. PMID 10100611. S2CID 9115709.

[pmid12517971-22] Моллинедо Ф., Мартин-Мартин Б., Калафат Дж., Набокина С.М., Лазо, Пенсильвания (январь 2003 г.). "Роль связанного с везикулами мембранного белка-2 через Q-растворимый N-этилмалеимид-чувствительный фактор присоединения рецептора белка / R-растворимый N-этилмалеимид-чувствительный фактор взаимодействия рецептора белка прикрепления в экзоцитозе специфических и третичных гранул нейтрофилов человека ". Журнал иммунологии. 170 (2): 1034–42. Дои:10.4049 / jimmunol.170.2.1034. PMID 12517971.

[pmid8760387-23] Джагадиш М.Н., Фернандес С.С., Хьюиш Д.Р., Маколей С.Л., Гоф К.Х., Грусовин Дж., Веркейлен А., Косгроув Л., Алафачи А., Френкель М.Дж., Уорд К.В. (август 1996 г.). «Чувствительные к инсулину ткани содержат изоформы А и В основного комплексного белка SNAP-25 (синаптосомно-связанный белок 25) в дополнение к синтаксину 4 и синаптобревинам 1 и 2». Биохимический журнал. 317. 317 (3): 945–54. Дои:10.1042 / bj3170945. ЧВК 1217577. PMID 8760387.

[pmid10194441-24] Рид Г.Л., Хунг А.К., Фицджеральд М.Л. (апрель 1999 г.). «Человеческие тромбоциты содержат белки SNARE и гомолог Sec1p, который взаимодействует с синтаксином 4 и фосфорилируется после активации тромбина: последствия для секреции тромбоцитов». Кровь. 93 (8): 2617–26. Дои:10.1182 / кровь.V93.8.2617. PMID 10194441.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

VAMP2 - Википедия - VAMP2

Содержание

Функция

Клиническое значение

Взаимодействия

Рекомендации

дальнейшее чтение