STX8 - STX8
Синтаксин-8 это белок что у людей кодируется STX8 ген.[5][6][7]Синтаксин 8 напрямую взаимодействует с HECTd3 и имеет аналогичную субклеточную локализацию.[8] В белок было показано, чтобы сформировать SNARE комплекс с синтаксин 7, vti1b и эндобревин. Они функционируют как механизм для гомотипный слияние в последнее время эндосомы.[9]
Модельные организмы
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Гомозигота жизнеспособность | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Беспокойство | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Горячая тарелка | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Температура тела | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология | Нормальный |
| Лимфоциты периферической крови | Нормальный |
| Микроядерный тест | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Гистопатология кожи | Нормальный |
| Гистопатология головного мозга | Нормальный |
| Гистопатология глаз | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный[10] |
| Citrobacter инфекционное заболевание | Нормальный[11] |
| Все тесты и анализы от[12][13] |
Модельные организмы были использованы при изучении функции STX8. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Stx8tm2a (EUCOMM) Wtsi[14][15] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[16][17][18] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[12][19] Было проведено 24 испытания на гомозиготный мутант взрослых мышей, однако значительных отклонений не наблюдалось.[12]
Взаимодействия
STX8 был показан взаимодействовать с Связанный с пузырьками мембранный белок 8,[20] VTI1B[21][22] и STX7.[20]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170310 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020903 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж. С., Хуанг Б., Шен М., Ю С., Ло И., Шеллер Р. Х. (декабрь 1998 г.). «Три новых белка семейства синтаксин / SNAP-25». Журнал биологической химии. 273 (51): 34171–9. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34171. PMID 9852078.
- ^ Торо В., Бержес Т., Каллебаут I, Гийе-Генчик З., Грессен Л., Бернхейм А., Карст Ф., Морнон Дж. П., Китцис А., Чомель Дж. К. (апрель 1999 г.). «Молекулярное клонирование, анализ экспрессии и хромосомная локализация синтаксина человека 8 (STX8)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 257 (2): 577–83. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0503. PMID 10198254.
- ^ «Энтрез Ген: синтаксин 8 STX8».
- ^ Чжан Л., Кан Л., Бонд В., Чжан Н. (февраль 2009 г.). «Взаимодействие между синтаксином 8 и HECTd3, лигазой домена HECT». Клеточная и молекулярная нейробиология. 29 (1): 115–21. Дои:10.1007 / s10571-008-9303-0. PMID 18821010. S2CID 23216243.
- ^ Касай К., Суга К., Изуми Т., Акагава К. (октябрь 2008 г.). «Синтаксин 8 имеет два функционально различных мотива на основе дилейцина». Письма о клеточной и молекулярной биологии. 13 (1): 144–54. Дои:10.2478 / s11658-007-0043-9. ЧВК 6275627. PMID 17965969.
- ^ "Сальмонелла данные о заражении Stx8 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Citrobacter данные о заражении Stx8 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
- ^ а б Антонин В., Холройд С., Фасшауэр Д., Пабст С., фон Моллард Г.Ф., Ян Р. (декабрь 2000 г.). «Комплекс SNARE, опосредующий слияние поздних эндосом, определяет консервативные свойства структуры и функции SNARE». Журнал EMBO. 19 (23): 6453–64. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6453. ЧВК 305878. PMID 11101518.
- ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Субраманиам В.Н., Ло Э., Хорстманн Х., Хаберманн А., Сюй Ю., Коу Дж., Гриффитс Г., Хонг В. (март 2000 г.). «Предпочтительная ассоциация синтаксина 8 с ранней эндосомой». Журнал клеточной науки. 113 (Pt 6) (6): 997–1008. PMID 10683148.
дальнейшее чтение
- Прекерис Р., Ян Б., Оршот В., Клумперман Дж., Шеллер Р. Х. (ноябрь 1999 г.). «Различная роль синтаксина 7 и синтаксина 8 в эндосомном трафике». Молекулярная биология клетки. 10 (11): 3891–908. Дои:10.1091 / mbc.10.11.3891. ЧВК 25687. PMID 10564279.
- Субраманиам В.Н., Ло Э., Хорстманн Х., Хаберманн А., Сюй Ю., Коу Дж., Гриффитс Г., Хонг В. (март 2000 г.). «Предпочтительная ассоциация синтаксина 8 с ранней эндосомой». Журнал клеточной науки. 113 (Pt 6) (6): 997–1008. PMID 10683148.
- МакШи А., Сэмюэл Т., Эппель Дж. Т., Галлоуэй Д. А., Фанк Дж. О. (июль 2000 г.). «Идентификация CIP-1-связанного регулятора циклина B (CARB), нового p21-связывающего белка, действующего в фазе G2 клеточного цикла». Журнал биологической химии. 275 (30): 23181–6. Дои:10.1074 / jbc.M001772200. PMID 10781590.
- Scales SJ, Chen YA, Yoo BY, Patel SM, Doung YC, Scheller RH (май 2000 г.). «SNAREs вносят свой вклад в специфичность слияния мембран». Нейрон. 26 (2): 457–64. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81177-0. PMID 10839363.
- Антонин В., Холройд С., Фасшауэр Д., Пабст С., фон Моллард Г.Ф., Ян Р. (декабрь 2000 г.). «Комплекс SNARE, опосредующий слияние поздних эндосом, определяет консервативные свойства структуры и функции SNARE». Журнал EMBO. 19 (23): 6453–64. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6453. ЧВК 305878. PMID 11101518.
- Уэйд Н., Брайант Нью-Джерси, Коннолли Л.М., Симпсон Р.Дж., Лузио Дж. П., Пайпер Р.С., Джеймс Д.Е. (июнь 2001 г.). «Комплексы синтаксина 7 с взаимодействующим с хвостом Vps10p мыши 1b, синтаксином 6, ассоциированным с пузырьками мембранным белком (VAMP) 8 и VAMP7 в клетках меланомы b16». Журнал биологической химии. 276 (23): 19820–7. Дои:10.1074 / jbc.M010838200. PMID 11278762.
- Антонин В., Фасшауэр Д., Беккер С., Ян Р., Шнайдер Т.Р. (февраль 2002 г.). «Кристаллическая структура эндосомного комплекса SNARE раскрывает общие структурные принципы всех SNARE». Структурная биология природы. 9 (2): 107–11. Дои:10.1038 / nsb746. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-F459-F. PMID 11786915. S2CID 17724790.
- Bogdanovic A, Bennett N, Kieffer S, Louwagie M, Morio T, Garin J, Satre M, Bruckert F (ноябрь 2002 г.). «Синтаксин 7, синтаксин 8, Vti1 и VAMP7 (ассоциированный с везикулами мембранный белок 7) образуют активный комплекс SNARE для раннего слияния макропиноцитарных компартментов в Dictyostelium discoideum». Биохимический журнал. 368 (Pt 1): 29–39. Дои:10.1042 / BJ20020845. ЧВК 1222979. PMID 12175335.
- Сюй Ю., Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (октябрь 2002 г.). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи». Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3493–507. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. ЧВК 129961. PMID 12388752.
- Ким Б., Уэда М., Коминами Э., Акагава К., Косака С., Акадзава С. (ноябрь 2003 г.). «Идентификация мышиных Vps16 и биохимическая характеристика комплекса Vps класса C млекопитающих». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 311 (3): 577–82. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.10.030. PMID 14623309.
- Чжу X, МакШи А., Харрис П.Л., Райна А.К., Кастеллани Р.Дж., Фанк Дж.О., Шах С., Этвуд С., Боуэн Р., Баузер Р., Морелли Л., Перри Дж., Смит М.А. (март 2004 г.). «Повышенная экспрессия регулятора фазы G2 / M клеточного цикла, нейронального регулятора циклина B, связанного с CIP-1, при болезни Альцгеймера». Журнал неврологических исследований. 75 (5): 698–703. Дои:10.1002 / jnr.20028. PMID 14991845.
- Билан Ф., Торо В., Накфер М., Деран Р., Норез С., Кантеро А., Гарсия М., Бек Ф., Китцис А. (апрель 2004 г.). «Синтаксин 8 ухудшает передачу регулятора трансмембранной проводимости при муковисцидозе (CFTR) и ингибирует его канальную активность». Журнал клеточной науки. 117 (Pt 10): 1923–35. Дои:10.1242 / jcs.01070. PMID 15039462.
- Барриос-Родилес М., Браун К. Р., Оздамар Б., Бозе Р., Лю З., Донован Р. С., Синджо Ф., Лю Ю., Дембовы Дж., Тейлор И. В., Луга В., Прзулдж Н., Робинсон М., Сузуки Н., Хаяшизаки Ю., Юрисика И., Wrana JL (март 2005 г.). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
PDB галерея | |
|---|---|
|
