COPE (ген) - Википедия - COPE (gene)

СПРАВИТЬСЯ
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыСПРАВИТЬСЯ, эпсилон-COP, субъединица эпсилон-белкового комплекса-катомера, эпсилон-субъединица комплекса оболочки COPI
Внешние идентификаторыOMIM: 606942 MGI: 1891702 ГомолоГен: 5254 Генные карты: СПРАВИТЬСЯ
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное местоположение для COPE
Геномное местоположение для COPE
Группа19п13.11Начинать18,899,514 бп[1]
Конец18,919,387 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE COPE 201264 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_007263
NM_199442
NM_199444
NM_001330469

NM_021538

RefSeq (белок)

NP_001317398
NP_009194
NP_955474
NP_955476

NP_067513

Расположение (UCSC)Chr 19: 18.9 - 18.92 МбChr 8: 70.3 - 70.31 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Коутомер субъединица эпсилон это белок что у людей кодируется СПРАВИТЬСЯ ген.[5][6]

Функция

Продукт этого гена представляет собой эпсилон-субъединицу белкового комплекса катомера. Коутомер представляет собой цитозольный белковый комплекс, который связывается с мотивами дилизина и обратимо связывается с везикулами Гольджи, не покрытыми клатрином. Он необходим для отпочкования от мембран Гольджи и важен для ретроградного транспорта Гольджи в ER белков, меченных дилизином. Коутомерный комплекс состоит, по меньшей мере, из альфа, бета, бета ', гамма, дельта, эпсилон и дзета субъединиц. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.[6]

Взаимодействия

COPE (ген) показал взаимодействовать с COPA.[7][8][9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105669 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055681 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Шима Д. Т., Весы С. Дж., Крейс Т. Е., Пепперкок Р. (ноябрь 1999 г.). «Сегрегация COPI-богатых и антероградных грузов богатых доменов в эндоплазматическом ретикулуме транспортных комплексов Гольджи». Curr. Биол. 9 (15): 821–4. Дои:10.1016 / S0960-9822 (99) 80365-0. PMID  10469566. S2CID  16182290.
  6. ^ а б «Ген Entrez: комплекс белка-катомера COPE, эпсилон-субъединица».
  7. ^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
  8. ^ Eugster A, Frigerio G, Dale M, Duden R (август 2000 г.). «Домены COP I, необходимые для целостности коатомера и новые взаимодействия с ARF и ARF-GAP». EMBO J. 19 (15): 3905–17. Дои:10.1093 / emboj / 19.15.3905. ЧВК  306616. PMID  10921873.
  9. ^ Faulstich D, Auerbach S, Orci L, Ravazzola M, Wegchingel S, Lottspeich F, Stenbeck G, Harter C, Wieland FT, Tschochner H (октябрь 1996). «Архитектура катомера: молекулярная характеристика дельта-COP и белковых взаимодействий в комплексе». J. Cell Biol. 135 (1): 53–61. Дои:10.1083 / jcb.135.1.53. ЧВК  2121028. PMID  8858162.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение