STXBP1 - STXBP1

STXBP1
Protein STXBP1 PDB 1dn1.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSTXBP1, MUNC18-1, NSEC1, P67, RBSEC1, UNC18, синтаксин-связывающий белок 1
Внешние идентификаторыOMIM: 602926 MGI: 107363 ГомолоГен: 2382 Генные карты: STXBP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Genomic location for STXBP1
Genomic location for STXBP1
Группа9q34.11Начинать127,579,370 бп[1]
Конец127,696,027 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE STXBP1 202260 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6812

20910

Ансамбль

ENSG00000136854

ENSMUSG00000026797

UniProt

P61764

O08599

RefSeq (мРНК)

NM_003165
NM_001032221

NM_001113569
NM_009295

RefSeq (белок)

NP_001107041
NP_033321

Расположение (UCSC)Chr 9: 127,58 - 127,7 МбChr 2: 32,79 - 32,85 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Синтаксин-связывающий белок 1 (также известен как Munc18-1 ) это белок что у людей кодируется STXBP1 ген.[5] Этот ген кодирует привязка синтаксина белок. Кодируемый белок, по-видимому, играет роль в высвобождении нейротрансмиттеры через регуляцию синтаксина, рецептора трансмембранного белка прикрепления. Мутации в этом гене были связаны с детская эпилептическая энцефалопатия-4.[6]

Структура

В STXBP1 ген расположен на q-плече хромосома 9 в позиции 34.11 и имеет 20 экзоны охватывающий 80 510 пар оснований.[6] Кодируемый белок представляет собой белок периферической мембраны расположен в цитозоль.[7][8] в сетчатка и мозжечок, альтернативно сращенный экспрессируется вариант транскрипта, содержащий дополнительный экзон и всего 603 аминокислоты.[9] Альтернативное сращивание может привести к изоформа с экзоном 19 и изоформой без.[10][11]

Функция

Кодируемый белок может участвовать в регуляции синаптический пузырек стыковка и слияние, возможно, через взаимодействие с GTP-связывающие белки. Это важно для нейротрансмиссия и связывает синтаксин, компонент механизма слияния синаптических пузырьков, вероятно, в соотношении 1: 1. Он может взаимодействовать с синтаксинами 1, 2 и 3, но не с синтаксином 4, и может играть роль в определении специфичности реакций внутриклеточного слияния.[7][8] Этот белок функционирует на поздней стадии процесса слияния внутриклеточных мембран экзоцитоз. Диссоциация этого белка от синтаксина определяет кинетика постфузионных событий.[12] Этот белок необходим для пресинпатической везикул релиз и быстро фосфорилированный к протеинкиназа C на нейронах деполяризация.[13] Белок участвует в секреторный путь между аппарат Гольджи и клеточная мембрана.[14][11]

Клиническое значение

Эпилептическая энцефалопатия

Мутации в STXBP1 причина Ранняя детская эпилептическая энцефалопатия 4 типа (EIEE4), тяжелая форма эпилепсия характеризуется частыми тоническими припадками или спазмами, начинающимися в младенчестве со специфическими ЭЭГ нахождение подавление-всплеск паттерны, характеризующиеся скачками высокого напряжения, чередующимися с почти плоскими фазами подавления. Пострадавшие люди неонатальный или младенческое начало припадки, глубокий умственная отсталость, и МРТ свидетельство мозга гипомиелинизация. Наследование EIEE4 есть аутосомно-доминантный.[7][8]

Этот ген был впервые обнаружен в 2008 году как причина Синдром Охтахара. С тех пор он стал одним из самых известных генов эпилептических энцефалопатий.[15]

Выражение

В меланоцитарные клетки STXBP1 экспрессия гена может быть регулируемый к MITF.[16]

В STXBP1 ген выражается в мозг и спинной мозг и высокообогащенный аксоны.[7][8] Экспрессия этого белка наиболее высока в сетчатке и мозжечке.[9][11]

Взаимодействия

Закодированный белок связывает SYTL4.[7][8] STXBP1 был показан взаимодействовать с STX2,[17][18] STX4[17][18] и STX1A.[18][19][20][21][22]

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P61765 (Крысиный синтаксин-связывающий белок 1) на PDBe-KB.

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136854 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026797 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Swanson DA, Steel JM, Valle D (март 1998 г.). «Идентификация и характеристика человеческого ортолога крысиного STXBP1, белка, участвующего в переносе везикул и высвобождении нейротрансмиттеров». Геномика. 48 (3): 373–6. Дои:10.1006 / geno.1997.5202. PMID  9545644.
  6. ^ а б «Ген Entrez: синтаксин-связывающий белок 1 STXBP1». Получено 2018-08-29. Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
  7. ^ а б c d е "STXBP1 - синтаксин-связывающий белок 1 - Homo sapiens (человек) - ген и белок STXBP1". www.uniprot.org. Получено 2018-08-29. Эта статья включает текст, доступный под CC BY 4.0 лицензия.
  8. ^ а б c d е «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК  5210571. PMID  27899622.
  9. ^ а б Swanson DA, Steel JM, Valle D (март 1998 г.). «Идентификация и характеристика человеческого ортолога крысиного STXBP1, белка, участвующего в переносе везикул и высвобождении нейротрансмиттеров». Геномика. 48 (3): 373–6. Дои:10.1006 / geno.1997.5202. PMID  9545644.
  10. ^ Hamdan FF, Piton A, Gauthier J, Lortie A, Dubeau F, Dobrzeniecka S, Spiegelman D, Noreau A, Pellerin S, Côté M, Henrion E, Fombonne E, Mottron L, Marineau C, Drapeau P, Lafrenière RG, Lacaille , Rouleau GA, Michaud JL (июнь 2009 г.). «Мутации de novo STXBP1 при умственной отсталости и несиндромной эпилепсии». Анналы неврологии. 65 (6): 748–53. Дои:10.1002 / ana.21625. PMID  19557857. S2CID  23892974.
  11. ^ а б c Интернет-Менделирующее наследование в человеке, OMIM®. Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. Номер MIM: {602926}: {22.04.2014}:. URL-адрес в Интернете: https://omim.org/
  12. ^ Фишер Р.Дж., Певснер Дж., Бургойн Р.Д. (февраль 2001 г.). «Контроль динамики пор слияния во время экзоцитоза по Munc18». Наука. 291 (5505): 875–8. Дои:10.1126 / science.291.5505.875. PMID  11157167. S2CID  27780447.
  13. ^ Wierda KD, Toonen RF, de Wit H, Brussaard AB, Verhage M (апрель 2007 г.). «Взаимозависимость PKC-зависимых и PKC-независимых путей пресинаптической пластичности». Нейрон. 54 (2): 275–90. Дои:10.1016 / j.neuron.2007.04.001. PMID  17442248. S2CID  15142600.
  14. ^ Певснер Дж., Хсу С.К., Шеллер Р.Х. (февраль 1994 г.). «n-Sec1: нейро-специфический синтаксин-связывающий белок». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (4): 1445–9. Дои:10.1073 / пнас.91.4.1445. ЧВК  43176. PMID  8108429.
  15. ^ STXBP1 - это то, что вам нужно знать в 2015 году
  16. ^ Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус К., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергстейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Исследования пигментных клеток и меланомы. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971. S2CID  24698373.
  17. ^ а б Шроу Т.Д., Лимоны П.П., Дин В.Л., Уайтхарт С.В. (август 2003 г.). «Роль белков Sec1 / Munc18 в экзоцитозе тромбоцитов». Биохимический журнал. 374 (Pt 1): 207–17. Дои:10.1042 / BJ20030610. ЧВК  1223584. PMID  12773094.
  18. ^ а б c Hata Y, Südhof TC (июнь 1995 г.). «Новая повсеместная форма Munc-18 взаимодействует с множеством синтаксинов. Использование дрожжевой двугибридной системы для изучения взаимодействий между белками, участвующими в мембранном движении». Журнал биологической химии. 270 (22): 13022–8. Дои:10.1074 / jbc.270.22.13022. PMID  7768895.
  19. ^ Бхаскар К., Шариф М.М., Шарма В.М., Шетти А.П., Рамамохан Ю., Пант Х.С., Раджу Т.Р., Шетти К.Т. (январь 2004 г.). «Совместная очистка и локализация Munc18-1 (p67) и Cdk5 с белками цитоскелета нейронов». Международная нейрохимия. 44 (1): 35–44. Дои:10.1016 / S0197-0186 (03) 00099-8. PMID  12963086. S2CID  23783141.
  20. ^ Дулубова И., Сугита С., Хилл С., Хосака М., Фернандес И., Зюдхоф ТК, Ризо Дж. (Август 1999 г.). «Конформационный переключатель синтаксина во время экзоцитоза: роль munc18». Журнал EMBO. 18 (16): 4372–82. Дои:10.1093 / emboj / 18.16.4372. ЧВК  1171512. PMID  10449403.
  21. ^ McMahon HT, Missler M, Li C, Südhof TC (октябрь 1995 г.). «Комплексины: цитозольные белки, регулирующие функцию рецептора SNAP». Клетка. 83 (1): 111–9. Дои:10.1016/0092-8674(95)90239-2. PMID  7553862. S2CID  675343.
  22. ^ Перес-Брангули Ф., Мухайсен А., Блази Дж. (Июнь 2002 г.). «Связывание Munc 18a с изоформами синтаксина 1A и 1B определяет его локализацию на плазматической мембране и блокирует сборку SNARE в трехгибридном системном анализе». Молекулярная и клеточная нейронауки. 20 (2): 169–80. Дои:10.1006 / mcne.2002.1122. PMID  12093152. S2CID  23927545.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.