Натрономонады - Википедия - Natronomonas

Натрономонады
Научная классификация
Домен:
Археи
Королевство:
Euryarchaeota
Тип:
Euryarchaeota
Учебный класс:
Галобактерии
Заказ:
Галобактерии
Семья:
Галобактерии
Род:
Натрономонады

Камекура и другие. 1997[нужна цитата ]
Разновидность
  • N. moolapensis Burns et al. 2010 г.
  • N. pharaonis (Солиман и Трупер, 1983) Камекура и др. 1997 г. (тип sp.)

В таксономия, Натрономонады это род из Галобактерии.[1]

Описание и значение

Натрономонас фараонис является аэробный, чрезвычайно галогеналкалифильный Археон который оптимально растет через 3,5 млн хлорид натрия и в pH 8.5, но чувствителен к высоким магний концентрации.

Структура генома

В геном из Натрономонас фараонис состоит из трех круговых репликонов, хромосома который имеет длину 2,595,221 п.н., типичную галоархейную плазмиду размером 131 т.п.н. и уникальную многокопийную плазмиду размером 23 т.п.н. Его хромосома имеет высокое содержание G + C (63,4%). Кроме того, высокая доля кислых аминокислот (в среднем 19,3%) содержится в белках N. pharaonis что приводит к низким изоэлектрическим точкам (средний pI 4,6). Это считается одной из адаптивных особенностей галоархей, которые, как известно, применяют стратегию солености (высокие внутренние концентрации соли), чтобы выжить в своей гиперсоленой среде (Falb et al.). Кроме того, примечательно, что, поскольку у архея отсутствует генетическое кодирование ключевых ферментов гликолитических путей, он не способен к утилизации сахара.

Структура клетки и метаболизм

Натрономонады, как и другие представители Halobacteriaceae, обладает определенными физиологическими характеристиками, поскольку для роста ему необходимы не только высокие концентрации NaCl, но также высокие значения pH и низкие концентрации Mg2 +. Обычно в качестве источника углерода используются аминокислоты, но серия исследований показала, что археи обладают высокой степенью самообеспеченности питанием. Кроме того, в отличие от других алкалифилов, которые используют натрий Na + вместо протонов H + в качестве связующего иона между дыхательной цепью и АТФ-синтазой, Натрономонады использует протоны как ион связи.

Археоны растут в сильно щелочных условиях с pH около 11, что приводит к снижению уровня аммиака в дополнение к низкой доступности ионов металлов. Анализ генома показывает, что в процессе метаболизма азота у архей есть три механизма, которые поставляют аммиак, который затем ассимилируется в глутамат: прямое поглощение аммиака, поглощение нитрата и последующее восстановление до аммиака, а также поглощение мочевины, которая расщепляется уреаза для выделения аммиака. Зеленые стрелки на рисунке представляют собой переносчики аммиака из экзогенного источника азота (AmtB ), нитратов (NarK) и мочевины (UrtA-E), а синие стрелки представляют собой ферменты для восстановления нитрата (NarB + Nir A) и гидролиза мочевины (UreA-G). Другие сокращения: GlnA + GltB = глутамат; 2-OG = оксоглутарат; fdx = ферредоксин.

Вероятно, что Натрономонады в качестве донора электронов для всех трех восстановительных превращений использует ферредоксин, а не НАДН. Это очевидно из наличия консервативных ферредоксин-связывающих остатков в белке NirA N. pharaonis и ферредоксиновой зависимости нитрат- и нитритредуктаз в галофильных Haloferax mediterranei.

Экология

Штаммы N. pharaonis были впервые выделены из сильно засоленных содовые озера в Египте и Кении, где значение pH составляет около 11.

Рекомендации

  1. ^ Увидеть NCBI веб-страница о Natronomonas. Данные извлечены из "Ресурсы таксономии NCBI". Национальный центр биотехнологической информации. Получено 2007-03-19.

дальнейшее чтение

Научные журналы

Научные книги

Научные базы данных

внешняя ссылка