PPIE (ген) - PPIE (gene)
Пептидилпролилизомераза E (циклофилин E), также известный как PPIE, является фермент который у человека кодируется PPIE ген на хромосоме 1. Как член семейства пептидил-пролил цис-транс-изомераз (PPIase), этот белок катализирует цис-транс изомеризация имидного пролина пептидные связи, что позволяет облегчить сворачивание или восстановление белков.[5] Кроме того, PPIE участвует во многих биологических процессах, в том числе митохондриальных. метаболизм, апоптоз, и воспаление, а также сопутствующие заболевания и состояния, такие как ишемическое реперфузионное повреждение, СПИД, грипп, и рак.[6][7][8]
Структура
Как и другие циклофилины, PPIE образует β-цилиндрическую структуру с гидрофобным ядром. Этот β-бочонок состоит из восьми антипараллельных β-нитей и ограничен двумя α-спиралями вверху и внизу. Кроме того, β-витки и петли в прядях способствуют гибкости ствола. В частности, PPIE содержит два РНК-связывающих домена на N-конце и домен PPIase длиной 165 оснований на C-конце. Домен PPIase гомологичен PPIA и может связываться и ингибироваться CsA.[8]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является членом пептидилпролилцис-транс-изомеразы (PPIase ) семья. PPIases катализируют цис-транс-изомеризация из пролин имидные пептидные связи в олигопептиды и ускорить складывание белков.[5] Как правило, PPIases обнаруживаются у всех эубактерий и эукариот, а также у некоторых архебактерий и, следовательно, очень консервативны.[6][9] Семейство PPIase делится на три структурно различных подсемейства: циклофилин (CyP), FK506-связывающий белок (FKBP ), и парвулин (Пвн).[6][8] Как циклофилин PPI связывает циклоспорин А (CsA) и может быть обнаружен внутри клетки или секретируется клеткой.[7] У эукариот циклофилины повсеместно локализуются во многих типах клеток и тканей.[7][8] Помимо активности PPIase и белков-шаперонов, циклофилины участвуют в митохондриальном метаболизме, апоптозе, иммунологическом ответе, воспалении, росте и пролиферации клеток.[6][7][8] PPIE, в частности, также проявляет РНК-связывающую активность.[5]
Клиническое значение
Из-за близкой гомологии в домене PPIase между PPIE и PPIA, PPIE также может участвовать в процессе репликации ВИЧ.[8] Более того, PPIE помогает предотвратить инфекции путем вирус гриппа А.[10] Как циклофилин, PPIE также связывает иммунодепрессивное лекарство CsA с образованием комплекса CsA-циклофилин, который затем нацеливается на кальциневрин, чтобы ингибировать сигнальный путь для активации Т-клеток.[7]
В сердечных миогенных клетках циклофилины активируются тепловым шоком и гипоксией-реоксигенацией, а также образуют комплекс с белками теплового шока. Таким образом, циклофилины могут выполнять функцию кардиопротекции во время ишемического реперфузионного повреждения.
В настоящее время экспрессия циклофилина сильно коррелирует с патогенезом рака, но конкретные механизмы еще предстоит выяснить.[7]
Взаимодействия
PPIE (ген) показал взаимодействовать с CsA и MLL.[7][11]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000084072 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000028651 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c «Ген Entrez: PPID пептидилпролилизомераза E (циклофилин E)».
- ^ а б c d Казуи Т., Иноуэ Н., Ямада О., Комацу С. (январь 1992 г.). «Избирательная церебральная перфузия при операции по поводу аневризмы дуги аорты: переоценка». Летопись торакальной хирургии. 53 (1): 109–14. Дои:10.1016 / 0003-4975 (92) 90767-х. PMID 1530810.
- ^ а б c d е ж грамм Яо Ц., Ли М., Ян Х, Чай Х, Фишер В., Чен С. (март 2005 г.). «Роль циклофилинов в раке и других системах органов». Всемирный журнал хирургии. 29 (3): 276–80. Дои:10.1007 / s00268-004-7812-7. PMID 15706440.
- ^ а б c d е ж Ван Т., Юнь Ч., Гу Си, Чанг В. Р., Лян округ Колумбия (август 2005 г.). «1.88 Кристаллическая структура домена C hCyP33: новый домен пептидил-пролил цис-транс-изомеразы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 333 (3): 845–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.06.006. PMID 15963461.
- ^ Hoffmann H, Schiene-Fischer C (июль 2014 г.). «Функциональные аспекты внеклеточных циклофилинов». Биологическая химия. 395 (7–8): 721–35. Дои:10.1515 / hsz-2014-0125. PMID 24713575.
- ^ Ван З., Лю X, Чжао З., Сюй Ц., Чжан К., Чэнь Ц., Сунь Л., Гао Г.Ф., Е Икс, Лю В. (2011). «Циклофилин E действует как негативный регулятор репликации вируса гриппа, нарушая образование вирусного рибонуклеопротеинового комплекса». PLOS ONE. 6 (8): e22625. Дои:10.1371 / journal.pone.0022625. ЧВК 3160840. PMID 21887220.
- ^ Ярмарка К., Андерсон М., Буланова Е., Ми Х, Тропшуг М., Диас М. О. (май 2001 г.). «Белковые взаимодействия пальцев MLL PHD модулируют регуляцию гена-мишени MLL в клетках человека». Молекулярная и клеточная биология. 21 (10): 3589–97. Дои:10.1128 / MCB.21.10.3589-3597.2001. ЧВК 100280. PMID 11313484.
дальнейшее чтение
- Mi H, Kops O, Zimmermann E, Jäschke A, Tropschug M (декабрь 1996 г.). «Ядерный РНК-связывающий циклофилин в человеческих Т-клетках». Письма FEBS. 398 (2–3): 201–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (96) 01248-3. PMID 8977107.
- Ярмарка К., Андерсон М., Буланова Е., Ми Х, Тропшуг М., Диас М. О. (май 2001 г.). «Белковые взаимодействия пальцев MLL PHD модулируют регуляцию гена-мишени MLL в клетках человека». Молекулярная и клеточная биология. 21 (10): 3589–97. Дои:10.1128 / MCB.21.10.3589-3597.2001. ЧВК 100280. PMID 11313484.
- Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК 1370266. PMID 11991638.
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514.
- Дэвис Т.Л., Уокер-младший, Кампанья-Слейтер V и др. (2010). «Структурная и биохимическая характеристика семейства пептидил-пролилизомераз циклофилина человека». PLoS Biol. 8 (7): e1000439. Дои:10.1371 / journal.pbio.1000439. ЧВК 2911226. PMID 20676357.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
