PSME1 - PSME1

PSME1
Белок PSME1 PDB 1avo.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPSME1, IFI5111, PA28A, PA28alpha, REGalpha, HEL-S-129m, субъединица протеасомного активатора 1
Внешние идентификаторыOMIM: 600654 MGI: 1096367 ГомолоГен: 4560 Генные карты: PSME1
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человек)[1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение PSME1
Геномное расположение PSME1
Группа14q12Начинать24,136,163 бп[1]
Конец24,138,967 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PSME1 200814 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_176783
NM_001281528
NM_001281529
NM_006263

NM_011189

RefSeq (белок)

NP_001268457
NP_001268458
NP_006254
NP_788955

NP_035319

Расположение (UCSC)Chr 14: 24.14 - 24.14 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица 1 комплекса активатора протеасомы это белок что у людей кодируется PSME1 ген.[4][5]

Функция

Протеасома 26S представляет собой мультикаталитический протеиназный комплекс с высокоупорядоченной структурой, состоящей из 2 комплексов, ядра 20S и регулятора 19S. Ядро 20S состоит из 4 колец по 28 неидентичных субъединиц; 2 кольца состоят из 7 альфа-субъединиц и 2 кольца состоят из 7 бета-субъединиц. Регулятор 19S состоит из основания, которое содержит 6 субъединиц АТФазы и 2 субъединицы не АТФазы, и крышки, которая содержит до 10 субъединиц не АТФазы. Протеасомы в высокой концентрации распределяются по эукариотическим клеткам и расщепляют пептиды в АТФ / убиквитин-зависимом процессе нелизосомного пути. Важной функцией модифицированной протеасомы, иммунопротеасомы, является процессинг пептидов MHC класса I. Иммунопротеасома содержит альтернативный регулятор, называемый регулятором 11S или PA28, который заменяет регулятор 19S. Идентифицированы три субъединицы (альфа, бета и гамма) регулятора 11S. Этот ген кодирует альфа-субъединицу регулятора 11S, одну из двух субъединиц 11S, которая индуцируется гамма-интерфероном. Три альфа- и три бета-субъединицы объединяются, образуя гетерогексамерное кольцо. Идентифицированы два транскрипта, кодирующие разные изоформы.[5]

Взаимодействия

PSME1 был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000284916 GRCh38: Общий выпуск 89: ENSG00000092010, ENSG00000284916 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ Оноре Б., Лефферс Х., Мадсен П., Селис Дж. Э. (февраль 1994 г.). «Интерферон-гамма активирует уникальный набор белков в кератиноцитах человека. Молекулярное клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей белок IGUP I-5111, содержащий последовательность RGD». Eur J Biochem. 218 (2): 421–30. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18392.x. PMID  8269930.
  5. ^ а б «Ген Entrez: субъединица 1 активатора протеасомы PSME1 (просома, макропаин) (PA28 альфа)».
  6. ^ Wilkinson FL, Holaska JM, Zhang Z, Sharma A, Manilal S, Holt I, Stamm S, Wilson KL, Morris GE (июнь 2003 г.). «Emerin взаимодействует in vitro с фактором, связанным со сплайсингом, YT521-B». Евро. J. Biochem. 270 (11): 2459–66. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2003.03617.x. PMID  12755701.
  7. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
  8. ^ Ан К., Эрландер М., Летурк Д., Петерсон П.А., Фрю К., Ян Й. (июль 1996 г.). «Характеристика регулятора протеасомы РА28 in vivo». J. Biol. Chem. 271 (30): 18237–42. Дои:10.1074 / jbc.271.30.18237. PMID  8663520.

дальнейшее чтение