Фитореовирус - Википедия - Phytoreovirus
| Фитореовирус | |
|---|---|
 | |
| Крио-ЭМ белка капсид структура вирус рисового карлика (RDV) | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Duplornaviricota |
| Учебный класс: | Resentoviricetes |
| Заказ: | Reovirales |
| Семья: | Reoviridae |
| Подсемейство: | Sedoreovirinae |
| Род: | Фитореовирус |
| Типовой вид | |
| Вирус раневой опухоли | |
Фитореовирус это род вирусы, в семье Reoviridae, в подсемействе Sedoreovirinae. Они без турели реовирусы которые являются основными сельскохозяйственными патогенами, особенно в Азия.[1] Oryza sativa для РДВ и РГДВ, двудольные для WTV и цикадки служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роде три вида, включая типовой вид. Вирус раневой опухоли. Заболевания, связанные с этим родом, включают: WTV: галлы (опухоль). РДВ: карликовая (или каскадная) болезнь риса. РГДВ: карликовость, задержка роста и галлы.[2][3]
Классификация
Один член этой семьи, Вирус рисового карлика (RDV), был тщательно изучен электронная криомикроскопия и рентгеновская кристаллография. На основе этих анализов были получены атомные модели белков капсида и правдоподобная модель сборки капсида. Хотя структурные белки RDV не имеют сходства последовательностей с другими белками, их складками и общим капсид структура аналогична таковой у других Reoviridae.[1]
Фитореовирусы уникальны среди Reoviridae тем, что в каждом вирусе имеется 12 сегментов дцРНК. Как и все другие Reoviridae, они содержат собственные РНК-зависимые РНК-полимераза, что делает возможным эндогенный синтез вирусной мРНК внутри вируса. Хотя менее изучен, чем ортореовирус и орбивирус были предприняты значительные структурные и биохимические исследования для характеристики фитореовирусов, которые в целом инфицируют растения. Существует три признанных фитореовируса: вирус раневой опухоли (WTV), вирус рисового карлика (RDV) и вирус рисовой желчной карликовости (RGDV). Возможные дополнительные члены семейства включают вирус листовой энации табака (TLEF), вирус задержки роста риса и вирус сладкого картофеля (ICTV, VIDE). Существует также несколько изолятов RDV, все из которых имеют более 90% идентичности последовательностей. Из этих фитореовирусов RDV тщательно изучен и является наиболее охарактеризованным представителем. Большая часть наших знаний о сборке и структуре фитореовирусов основана на структурных данных, накопленных в исследованиях RDV.[1]
Таксономия
Группа: дцРНК
- Семья: Reoviridae
- Подсемейство: Sedoreovirinae
Структура
Вирусы Phytoreovirus не имеют оболочки, имеют форму икосаэдра и симметрию Т = 13, Т = 2. Диаметр около 70 нм. Геномы бывают линейными и сегментированными. Сегменты имеют размер от 1066 до 4423 пар оснований, в результате общая длина генома составляет около 26 килобайт. Геном кодирует 15 белков и имеет 4 открытые рамки считывания.[2]
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Фитореовирус | Икосаэдр | Т = 13, Т = 2 | Без оболочки | Линейный | Сегментированный |
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Вхождение в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция двухцепочечных РНК вирусов - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина за счет одностороннего вирусного движения без канальцев.Oryza sativa для rdv и rgdv и двудольные для wtv служат естественным хозяином. Вирус передается через переносчика (механическая инокуляция насекомыми растения цикадкой). Пути передачи бывают векторные и механические.[2]
| Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Фитореовирус | Oryza sativa; цикадки | Флоэма | Вирусное движение; механическая инокуляция | Смерть клетки | Цитоплазма | Цитоплазма | Цикадки |
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c Бейкер; и другие. (2008). «Структуры фитореовирусов». Сегментированные двухцепочечные РНК-вирусы: структура и молекулярная биология. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-21-9.
- ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
- ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 15 июн 2015.