RFC2 - RFC2

RFC2
Идентификаторы
Псевдонимы	RFC2, RFC40, субъединица 2 фактора репликации C
Внешние идентификаторы	OMIM: 600404 MGI: 1341868 ГомолоГен: 6885 Генные карты: RFC2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	74,254,458 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание нуклеотидов; • Связывание ДНК; • GO: 0043142 активность одноцепочечной ДНК-геликазы; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ферментов; • Связывание АТФ; • Активность загрузчика зажимов ДНК;
Сотовый компонент	• Комплекс фактора репликации ДНК С; • Ctf18 RFC-подобный комплекс; • нуклеоплазма; • ядро клетки;
Биологический процесс	• эксцизионная репарация нуклеотидов, заполнение пробелов в ДНК; • безошибочный транслезионный синтез; • склонный к ошибкам транслезионный синтез; • Репликация ДНК; • положительная регуляция ДНК-направленной активности ДНК-полимеразы; • транслезионный синтез; • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов; • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК; • Ответ на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК; • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-очаг поражения; • Ремонт ДНК; • поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации; • ДНК-зависимая репликация ДНК; • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5982
	19718
	ENSG00000049541
	ENSMUSG00000023104
	P35250; Q75MT5
	Q9WUK4
	NM_001278791; NM_001278792; NM_001278793; NM_002914; NM_181471
	NM_020022
NP_001265720; NP_001265721; NP_001265722; NP_002905; NP_852136;
	NP_002905.2
	NP_064406
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 2 фактора репликации C это белок что у людей кодируется RFC2 ген.^[4]^[5]^[6]

Функция

Удлинение грунтованный Шаблоны ДНК от ДНК-полимераза дельта и эпсилон требует действия дополнительных белков, ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) и фактор репликации C (RFC). RFC, также называемый активатором 1, представляет собой белковый комплекс, состоящий из пяти отдельных субъединиц 145, 40, 38, 37 и 36,5 кДа. Этот ген кодирует субъединицу 40 кДа, которая, как было показано, отвечает за связывание АТФ. Делеция этого гена была связана с Синдром Вильямса. Альтернативно сращивание Были описаны варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.^[6]

Взаимодействия

RFC2 был показан взаимодействовать с участием BRD4,^[7] CHTF18,^[8]^[9] PCNA,^[10]^[11]^[12] RFC4^[10]^[13] и RFC5.^[10]^[13]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000049541 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Чен М., Пан З. К., Гурвиц Дж. (Апрель 1992 г.). «Последовательность и экспрессия в Escherichia coli субъединицы 40 кДа активатора 1 (фактор репликации C) клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (7): 2516–20. Bibcode:1992PNAS ... 89.2516C. Дои:10.1073 / пнас.89.7.2516. ЧВК 48692. PMID 1313560.
^ Окумура К., Ногами М., Тагучи Х., Дин Ф. Б., Чен М., Пан З. К., Гурвиц Дж., Ширатори А., Мураками Ю., Одзава К. (январь 1995 г.). «Присвоение генов субъединиц 36,5 кД (RFC5), 37 кД (RFC4), 38 кД (RFC3) и 40 кДа (RFC2) человеческого фактора репликации C полосам хромосом 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 и 7q11.23 ". Геномика. 25 (1): 274–8. Дои:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.
^ ^а ^б «Ген Entrez: фактор репликации RFC2 C (активатор 1) 2, 40 кДа».
^ Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6509–20. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002. ЧВК 135621. PMID 12192049.
^ Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10237–42. Bibcode:2003ПНАС..10010237Б. Дои:10.1073 / pnas.1434308100. ЧВК 193545. PMID 12930902.
^ Меркл С.Дж., Карниц Л.М., Генри-Санчес Д.Т., Чен Дж. (Август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид». Журнал биологической химии. 278 (32): 30051–6. Дои:10.1074 / jbc.M211591200. PMID 12766176.
^ ^а ^б ^c Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц фактора репликации C p40, p37 и p36 человека, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента». Журнал биологической химии. 272 (30): 18974–81. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.
^ Пан ZQ, Чен М., Гурвиц Дж. (Январь 1993 г.). «Субъединицы активатора 1 (фактор репликации C) выполняют множество функций, необходимых для ядерного антиген-зависимого синтеза ДНК пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (1): 6–10. Bibcode:1993ПНАС ... 90 .... 6П. Дои:10.1073 / пнас.90.1.6. ЧВК 45588. PMID 8093561.
^ Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
^ ^а ^б Цай Дж., Яо Н., Гиббс Е., Финкельштейн Дж., Филлипс Б., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Гидролиз АТФ, катализируемый человеческим фактором репликации C, требует участия нескольких субъединиц». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (20): 11607–12. Bibcode:1998PNAS ... 9511607C. Дои:10.1073 / pnas.95.20.11607. ЧВК 21688. PMID 9751713.

дальнейшее чтение

Пан ZQ, Чен М., Гурвиц Дж. (Январь 1993 г.). «Субъединицы активатора 1 (фактор репликации C) выполняют множество функций, необходимых для ядерного антиген-зависимого синтеза ДНК пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (1): 6–10. Bibcode:1993ПНАС ... 90 .... 6П. Дои:10.1073 / пнас.90.1.6. ЧВК 45588. PMID 8093561.
Peoples R, Perez-Jurado L, Wang YK, Kaplan P, Francke U (июнь 1996 г.). «Ген субъединицы 2 репликационного фактора C (RFC2) находится в пределах делеции 7q11.23 синдрома Вильямса». Американский журнал генетики человека. 58 (6): 1370–3. ЧВК 1915059. PMID 8651315.
Ульманн Ф., Цай Дж., Флорес-Розас Х., Дин Ф. Б., Финкельштейн Дж., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июнь 1996 г.). «Восстановление человеческого фактора репликации C из пяти субъединиц in vitro». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (13): 6521–6. Bibcode:1996PNAS ... 93.6521U. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6521. ЧВК 39056. PMID 8692848.
Осборн Л.Р., Мартиндейл Д., Шерер С.В., Ши Х.М., Хьюзенга Дж., Хенг Х.Х., Коста Т., Побер Б., Лью Л., Бринкман Дж., Ромменс Дж., Куп Б., Цуй Л.С. (сентябрь 1996 г.). «Идентификация генов из области размером 500 т.п.н. в 7q11.23, которая обычно удаляется у пациентов с синдромом Вильямса». Геномика. 36 (2): 328–36. Дои:10.1006 / geno.1996.0469. PMID 8812460.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (апрель 1997 г.). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с холоферментом РНК-полимеразы II». Молекулярная и клеточная биология. 17 (4): 1817–23. Дои:10.1128 / MCB.17.4.1817. ЧВК 232028. PMID 9121429.
Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц фактора репликации C p40, p37 и p36 человека, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента». Журнал биологической химии. 272 (30): 18974–81. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.
Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой АТФазной активностью». Журнал биологической химии. 273 (10): 5979–87. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738.
Чжан Г., Гиббс Э., Кельман З., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Март 1999 г.). «Исследования взаимодействий между фактором репликации С человека и ядерным антигеном пролиферирующих клеток человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (5): 1869–74. Bibcode:1999PNAS ... 96.1869Z. Дои:10.1073 / pnas.96.5.1869. ЧВК 26703. PMID 10051561.
Ван И, Кортез Д., Язди П., Нефф Н., Элледж С. Дж., Цинь Дж. (Апрель 2000 г.). «BASC, суперкомплекс белков, связанных с BRCA1, участвующих в распознавании и восстановлении аберрантных структур ДНК». Гены и развитие. 14 (8): 927–39. Дои:10.1101 / gad.14.8.927 (неактивно 12.10.2020). ЧВК 316544. PMID 10783165.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на октябрь 2020 г. (ссылка на сайт)
Мартиндейл Д.В., Уилсон, доктор медицины, Ван Д., Берк Р.Д., Чен Х, Дуронио В., Куп Б.Ф. (октябрь 2000 г.). «Сравнительный анализ геномной последовательности области синдрома Вильямса (LIMK1-RFC2) хромосомы 7q11.23 человека». Геном млекопитающих. 11 (10): 890–8. Дои:10.1007 / s003350010166. PMID 11003705. S2CID 8575994.
Гриффит Дж. Д., Линдси-Больц Л. А., Санкар А. (май 2002 г.). «Структуры человеческого Rad17-фактора репликации C и контрольных точек Rad 9-1-1, визуализированные с помощью глицеринового спрея / микроскопии низкого напряжения». Журнал биологической химии. 277 (18): 15233–6. Дои:10.1074 / jbc.C200129200. PMID 11907025.
Неборовска-Скорска М., Хосер Г., Косев П., Васик М.А., Скорски Т. (июнь 2002 г.). «Дополнительные функции антиапоптотического белка A1 и серин / треонинкиназы pim-1 в BCR / ABL-опосредованном лейкемогенезе». Кровь. 99 (12): 4531–9. Дои:10.1182 / кровь.V99.12.4531. PMID 12036885.
Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6509–20. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002. ЧВК 135621. PMID 12192049.
Меркл С.Дж., Карниц Л.М., Генри-Санчес Д.Т., Чен Дж. (Август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид». Журнал биологической химии. 278 (32): 30051–6. Дои:10.1074 / jbc.M211591200. PMID 12766176.
Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10237–42. Bibcode:2003ПНАС..10010237Б. Дои:10.1073 / pnas.1434308100. ЧВК 193545. PMID 12930902.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000049541 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1313560-4] Чен М., Пан З. К., Гурвиц Дж. (Апрель 1992 г.). «Последовательность и экспрессия в Escherichia coli субъединицы 40 кДа активатора 1 (фактор репликации C) клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (7): 2516–20. Bibcode:1992PNAS ... 89.2516C. Дои:10.1073 / пнас.89.7.2516. ЧВК 48692. PMID 1313560.

[pmid7774928-5] Окумура К., Ногами М., Тагучи Х., Дин Ф. Б., Чен М., Пан З. К., Гурвиц Дж., Ширатори А., Мураками Ю., Одзава К. (январь 1995 г.). «Присвоение генов субъединиц 36,5 кД (RFC5), 37 кД (RFC4), 38 кД (RFC3) и 40 кДа (RFC2) человеческого фактора репликации C полосам хромосом 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 и 7q11.23 ". Геномика. 25 (1): 274–8. Дои:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: фактор репликации RFC2 C (активатор 1) 2, 40 кДа».

[pmid12192049-7] Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6509–20. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002. ЧВК 135621. PMID 12192049.

[pmid12930902-8] Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10237–42. Bibcode:2003ПНАС..10010237Б. Дои:10.1073 / pnas.1434308100. ЧВК 193545. PMID 12930902.

[pmid12766176-9] Меркл С.Дж., Карниц Л.М., Генри-Санчес Д.Т., Чен Дж. (Август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид». Журнал биологической химии. 278 (32): 30051–6. Дои:10.1074 / jbc.M211591200. PMID 12766176.

[pmid9228079-10] а ^б ^c Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц фактора репликации C p40, p37 и p36 человека, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента». Журнал биологической химии. 272 (30): 18974–81. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.

[pmid8093561-11] Пан ZQ, Чен М., Гурвиц Дж. (Январь 1993 г.). «Субъединицы активатора 1 (фактор репликации C) выполняют множество функций, необходимых для ядерного антиген-зависимого синтеза ДНК пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (1): 6–10. Bibcode:1993ПНАС ... 90 .... 6П. Дои:10.1073 / пнас.90.1.6. ЧВК 45588. PMID 8093561.

[pmid12171929-12] Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.

[pmid9751713-13] а ^б Цай Дж., Яо Н., Гиббс Е., Финкельштейн Дж., Филлипс Б., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Гидролиз АТФ, катализируемый человеческим фактором репликации C, требует участия нескольких субъединиц». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (20): 11607–12. Bibcode:1998PNAS ... 9511607C. Дои:10.1073 / pnas.95.20.11607. ЧВК 21688. PMID 9751713.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]