RFC5 - RFC5

RFC5
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1LFS
Идентификаторы
Псевдонимы	RFC5, RFC36, субъединица 5 фактора репликации C
Внешние идентификаторы	OMIM: 600407 MGI: 1919401 ГомолоГен: 6730 Генные карты: RFC5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	118,033,130 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание нуклеотидов; • Связывание ДНК; • GO: 0043142 активность одноцепочечной ДНК-геликазы; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание АТФ; • связывание ферментов; • Активность загрузчика зажимов ДНК;
Сотовый компонент	• Комплекс фактора репликации ДНК С; • Ctf18 RFC-подобный комплекс; • нуклеоплазма; • ядро клетки;
Биологический процесс	• эксцизионная репарация нуклеотидов, заполнение пробелов в ДНК; • безошибочный транслезионный синтез; • склонный к ошибкам транслезионный синтез; • положительная регуляция ДНК-направленной активности ДНК-полимеразы; • транслезионный синтез; • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов; • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК; • Ответ на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК; • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-очаг поражения; • Репликация ДНК; • Ремонт ДНК; • поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации; • ДНК-зависимая репликация ДНК; • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5985
	72151
	ENSG00000111445
	ENSMUSG00000029363
	P40937
	Q9D0F6
NM_001130112; NM_001130113; NM_001206801; NM_007370; NM_181578;
	NM_001346815
	NM_028128
NP_001123584; NP_001123585; NP_001193730; NP_001333744; NP_031396;
	NP_853556
	NP_082404
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 5 фактора репликации C это белок что у людей кодируется RFC5 ген.^[4]^[5]

Функция

Удлинение грунтованный Шаблоны ДНК от ДНК-полимераза дельта и ДНК-полимераза эпсилон требует дополнительных белков ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) и фактор репликации C (RFC). RFC, также называемый активатором 1, представляет собой белковый комплекс, состоящий из пяти отдельных субъединиц 140, 40, 38, 37 и 36 кДа. Этот ген кодирует субъединицу 36 кДа. Эта субъединица может взаимодействовать с C-терминал область PCNA. Он образует сердцевинный комплекс с субъединицами 38 и 40 кДа. Базовый комплекс обладает ДНК-зависимая АТФаза активность, которая, как было обнаружено, стимулируется PCNA в системе in vitro. Альтернативно сращивание Сообщалось о вариантах транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[5]

Взаимодействия

RFC5 был показан взаимодействовать с участием:

BRD4,^[6]
CHTF18,^[7]
PCNA,^[8]^[9]^[10]
RFC2,^[8]^[11] и
RFC4.^[8]^[11]^[12]^[13]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111445 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Окумура К., Ногами М., Тагучи Х., Дин Ф. Б., Чен М., Пан З. К., Гурвиц Дж., Ширатори А., Мураками Ю., Одзава К. (январь 1995 г.). «Присвоение генов субъединиц 36,5 кД (RFC5), 37 кД (RFC4), 38 кД (RFC3) и 40 кДа (RFC2) человеческого фактора репликации C полосам хромосом 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 и 7q11.23 ". Геномика. 25 (1): 274–8. Дои:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.
^ ^а ^б «Ген Entrez: фактор репликации RFC5 C (активатор 1) 5, 36,5 кДа».
^ Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6509–20. Дои:10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002. ЧВК 135621. PMID 12192049.
^ Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10237–42. Дои:10.1073 / pnas.1434308100. ЧВК 193545. PMID 12930902.
^ ^а ^б ^c Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц фактора репликации C p40, p37 и p36 человека, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента». Журнал биологической химии. 272 (30): 18974–81. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.
^ Мосси Р., Йонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин С.Х., Хюбшер Ю. (январь 1997 г.). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующих клеток». Журнал биологической химии. 272 (3): 1769–76. Дои:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.
^ Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
^ ^а ^б Цай Дж., Яо Н., Гиббс Е., Финкельштейн Дж., Филлипс Б., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Гидролиз АТФ, катализируемый человеческим фактором репликации C, требует участия нескольких субъединиц». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (20): 11607–12. Дои:10.1073 / pnas.95.20.11607. ЧВК 21688. PMID 9751713.
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой АТФазной активностью». Журнал биологической химии. 273 (10): 5979–87. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738.

дальнейшее чтение

О'Доннелл М., Онраст Р., Дин Ф. Б., Чен М., Гурвиц Дж. (Январь 1993 г.). «Гомология дополнительных белков репликативных полимераз - E. coli для человека». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (1): 1–3. Дои:10.1093 / nar / 21.1.1. ЧВК 309057. PMID 8441605.
Ульманн Ф., Цай Дж., Флорес-Розас Х., Дин Ф. Б., Финкельштейн Дж., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июнь 1996 г.). «Восстановление человеческого фактора репликации C из пяти субъединиц in vitro». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (13): 6521–6. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6521. ЧВК 39056. PMID 8692848.
Мосси Р., Йонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин С.Х., Хюбшер Ю. (январь 1997 г.). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующих клеток». Журнал биологической химии. 272 (3): 1769–76. Дои:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (апрель 1997 г.). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с холоферментом РНК-полимеразы II». Молекулярная и клеточная биология. 17 (4): 1817–23. Дои:10.1128 / mcb.17.4.1817. ЧВК 232028. PMID 9121429.
Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц фактора репликации C p40, p37 и p36 человека, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента». Журнал биологической химии. 272 (30): 18974–81. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.
Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (декабрь 1997 г.). «Идентификация белков репликации ДНК и клеточного цикла, которые взаимодействуют с PCNA». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (24): 5041–6. Дои:10.1093 / nar / 25.24.5041. ЧВК 147130. PMID 9396813.
Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой АТФазной активностью» (PDF). Журнал биологической химии. 273 (10): 5979–87. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738. S2CID 17647091.
Цай Дж., Яо Н., Гиббс Е., Финкельштейн Дж., Филлипс Б., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Гидролиз АТФ, катализируемый человеческим фактором репликации C, требует участия нескольких субъединиц». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (20): 11607–12. Дои:10.1073 / pnas.95.20.11607. ЧВК 21688. PMID 9751713.
Чжан Г., Гиббс Э., Кельман З., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Март 1999 г.). «Исследования взаимодействий между фактором репликации С человека и ядерным антигеном пролиферирующих клеток человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (5): 1869–74. Дои:10.1073 / pnas.96.5.1869. ЧВК 26703. PMID 10051561.
Линдси-Больц Л.А., Бермудес В.П., Гурвиц Дж., Санкар А. (сентябрь 2001 г.). «Очистка и характеристика радиокомплексов контрольной точки повреждения ДНК человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (20): 11236–41. Дои:10.1073 / pnas.201373498. ЧВК 58713. PMID 11572977.
Гриффит Дж. Д., Линдси-Больц Л. А., Санкар А. (май 2002 г.). «Структуры человеческого Rad17-фактора репликации C и контрольных точек Rad 9-1-1, визуализированные с помощью глицеринового спрея / микроскопии низкого напряжения». Журнал биологической химии. 277 (18): 15233–6. Дои:10.1074 / jbc.C200129200. PMID 11907025.
Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6509–20. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002. ЧВК 135621. PMID 12192049.
Венцловас К., Колвин М.Э., Телен депутат (октябрь 2002 г.). «Основанный на молекулярном моделировании анализ взаимодействий в RFC-зависимом процессе зажима». Белковая наука. 11 (10): 2403–16. Дои:10.1110 / пс. 0214302. ЧВК 2373712. PMID 12237462.
Меркл С.Дж., Карниц Л.М., Генри-Санчес Д.Т., Чен Дж. (Август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид». Журнал биологической химии. 278 (32): 30051–6. Дои:10.1074 / jbc.M211591200. PMID 12766176.
Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10237–42. Дои:10.1073 / pnas.1434308100. ЧВК 193545. PMID 12930902.
Цзоу Л., Лю Д., Элледж С.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Репликационный белок А-опосредованный рекрутинг и активация комплексов Rad17». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (24): 13827–32. Дои:10.1073 / pnas.2336100100. ЧВК 283506. PMID 14605214.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111445 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid7774928-4] Окумура К., Ногами М., Тагучи Х., Дин Ф. Б., Чен М., Пан З. К., Гурвиц Дж., Ширатори А., Мураками Ю., Одзава К. (январь 1995 г.). «Присвоение генов субъединиц 36,5 кД (RFC5), 37 кД (RFC4), 38 кД (RFC3) и 40 кДа (RFC2) человеческого фактора репликации C полосам хромосом 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 и 7q11.23 ". Геномика. 25 (1): 274–8. Дои:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: фактор репликации RFC5 C (активатор 1) 5, 36,5 кДа».

[pmid12192049-6] Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6509–20. Дои:10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002. ЧВК 135621. PMID 12192049.

[pmid12930902-7] Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10237–42. Дои:10.1073 / pnas.1434308100. ЧВК 193545. PMID 12930902.

[pmid9228079-8] а ^б ^c Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц фактора репликации C p40, p37 и p36 человека, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента». Журнал биологической химии. 272 (30): 18974–81. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.

[pmid8999859-9] Мосси Р., Йонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин С.Х., Хюбшер Ю. (январь 1997 г.). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующих клеток». Журнал биологической химии. 272 (3): 1769–76. Дои:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.

[pmid12171929-10] Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.

[pmid9751713-11] а ^б Цай Дж., Яо Н., Гиббс Е., Финкельштейн Дж., Филлипс Б., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Гидролиз АТФ, катализируемый человеческим фактором репликации C, требует участия нескольких субъединиц». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (20): 11607–12. Дои:10.1073 / pnas.95.20.11607. ЧВК 21688. PMID 9751713.

[pmid16189514-12] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid9488738-13] Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой АТФазной активностью». Журнал биологической химии. 273 (10): 5979–87. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]