Ранавирус - Ranavirus
Ранавирус | |
---|---|
Просвечивающая электронная микрофотография ранавирусов (темных шестиугольников), собирающихся на границе ячейки и покидающих ячейку посредством процесса, называемого "подающий надежды ". | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Вариднавирия |
Королевство: | Bamfordvirae |
Тип: | Nucleocytoviricota |
Учебный класс: | Megaviricetes |
Заказ: | Pimascovirales |
Семья: | Iridoviridae |
Подсемейство: | Alphairidovirinae |
Род: | Ранавирус |
Типовой вид | |
Вирус лягушки 3 |
Ранавирус это род вирусы, в семье Iridoviridae.[1] Есть еще пять роды из вирусы в семье Iridoviridae, но Ранавирус - единственный, который включает вирусы, инфекционные для амфибий и рептилий. Кроме того, это один из трех родов этого семейства, которые инфицируют костистость Рыбы, вместе с Лимфоцистивирус и Мегалоцивирус.[2] Семья Iridoviridae одна из пяти семей нуклеоцитоплазматические большие ДНК-вирусы.
Экологическое воздействие
Ранавирусы, как и мегалоцивирусы, являются возникающий группа близкородственных дцДНК вирусы, вызывающие системные инфекции у большого разнообразия диких и разводимых пресноводных и морских рыб. Как и в случае с мегалоцивирусами, Ранавирус поэтому вспышки имеют большое экономическое значение в аквакультура, в качестве эпизоотии может привести к умеренной потере рыбы или массовой гибели разводимых рыб. Однако, в отличие от мегалоцитивирусов, Ранавирус инфекции у земноводных были вовлечены в качестве фактора, способствующего глобальному сокращению популяций амфибий.[3][4] Воздействие ранавирусов на популяции амфибий сравнивали с воздействием Читрид грибок Batrachochytrium dendrobatidis, возбудитель хитридиомикоз.[5][6][7] Считается, что в Великобритании серьезность вспышек заболеваний увеличилась из-за изменения климата.[8]
Этимология
Рана происходит из латинский для "лягушки",[9] отражая первую изоляцию Ранавирус в 1960-х от северной леопардовой лягушки (Lithobates pipiens ).[10][11][12]
Эволюция
Ранавирусы, по-видимому, произошли от вируса рыб, который впоследствии заразил амфибий и рептилий.[13]
Хосты
Ануранские хосты
- Деревянные лягушки (Lithobates sylvaticus)
- Американская лягушка-бык (Lithobates catesbieanus)
- Пиккер лягушка
Хосты Urodelan
Рептилии-хозяева
- Зеленые питоны (Chondropython viridis )[14]
- Бирманские звездчатые черепахи (Geochelone platynota )
- Леопардовая черепаха (Geochelone pardalis )[15]
- Суслики черепахи (Гофер полифем )
- Горная ящерица (Lacerta monticola )[16]
- Восточные коробчатые черепахи (Террапен каролина каролина )[17]
- Коробчатые черепахи Флориды (Террапен каролина баури )
- Западные декоративные коробчатые черепахи (Террапен орната )[18]
- Шпороногие черепахи (Testudo Graeca )[19]
- Черепахи Германа (Testudo Hermanni )
- Египетские черепахи (Testudo kleinmanni )
- Русские черепахи (Testudo horsfieldii )
- Маргинальные черепахи (Testudo marginata )
- Красноухие слайдеры (Trachemys scripta elegans )[18]
- Обычные щелкающие черепахи (Челидра серпентина )[20]
- Китайские черепахи софтшелл (Пелодискус китайский )[21]
- Геккон с плоским хвостом (Uroplatus fimbriatus )[22]
- Ящерица Восточного Забора (Sceloporus undulatus ) [23]
Таксономия
Группа: dsDNA
Семья Iridoviridae делится на шесть родов, которые включают Хлоридовирус, Иридовирус, Лимфоцистивирус, Мегалоцивирус, и Ранавирус.[1] Род Ранавирус состоит из 6 признанных вирусные виды, 3 из которых, как известно, заражают земноводных (Вирус амбистомы тигринум (Квадроцикл), Боле иридовирус (BIV), и вирус лягушки 3 ).[24]
Структура
Ранавирусы большие икосаэдр ДНК-вирусы размером примерно 150 нм в диаметре с большой одиночной линейной дцДНК геном примерно 105 кб[25] который кодирует около 100 генных продуктов.[26] Основная структурная составляющая белок капсид это основной капсидный белок (MCP).
Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Ранавирус | Многогранник | Т = 133 или 147 | Линейный | Одночастный |
Репликация
Репликация ранавирусов хорошо изучена с помощью типовой вид для рода - вирус лягушки 3 (FV3).[24][25] Репликация FV3 происходит при температуре от 12 до 32 градусов Цельсия.[26] Ранавирусы проникают в клетку-хозяина рецептор-опосредованного эндоцитоза.[27] Вирусные частицы не имеют покрытия и впоследствии перемещаются в ядро клетки, где вирусный Репликация ДНК начинается с вирусной кодировки ДНК-полимераза.[28] Затем вирусная ДНК покидает ядро клетки и начинает второй этап репликации ДНК в цитоплазме, в конечном итоге формируя ДНК. конкатемеры.[28] Затем вирусная ДНК упаковывается через головной механизм в инфекционные вирионы.[24] В ранавирус геном, как и другие иридовирусные геномы, циркулярно переставленный и экспонаты окончательно повторяющаяся ДНК.[28]
Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ранавирус | Лягушки; змеи | Никто | Эндоцитоз клеточных рецепторов | Лизис; подающий надежды | Ядро | Цитоплазма | Контакт |
Передача инфекции
Считается, что передача ранавирусов происходит несколькими путями, включая зараженную почву, прямой контакт, воздействие через воду и проглатывание инфицированных тканей во время хищничество, некрофагия или же каннибализм.[11] Ранавирусы относительно стабильны в водной среде, сохраняясь вне организма хозяина несколько недель или дольше.[11]
Эпизоология
События массовой гибели земноводных из-за Ранавирус были зарегистрированы в Азии, Европе, Северной Америке и Южной Америке.[11] Ранавирусы были выделены из диких популяций амфибий в Австралии, но не были связаны с массовой смертностью на этом континенте.[11][29][30]
Патогенез
Синтез вирусных белков начинается в течение нескольких часов после проникновения вируса.[26] с некроз или же апоптоз происходит уже через несколько часов после заражения.[25][31]
Макропатология
Грубые поражения, связанные с Ранавирус Инфекция включает эритему, генерализованный отек, кровоизлияние, отек конечностей, а также опухание и рыхлость печени.[11]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c "Iridoviridae". Отчет ICTV Online (10).
- ^ Whittington, RJ; Becker, JA; Деннис, ММ (2010). «Иридовирусные инфекции у рыб - критический обзор с акцентом на ранавирусы». Журнал болезней рыб. 33 (2): 95–122. Дои:10.1111 / j.1365-2761.2009.01110.x. PMID 20050967.
- ^ Учитель, А.Г.Ф .; Каннингем, А. А .; Гарнер, Т. У. Дж. (10 июня 2010 г.). «Оценка долгосрочного воздействия ранавирусной инфекции на популяции диких лягушек: влияние ранавируса на популяции диких лягушек». Сохранение животных. 13 (5): 514–522. Дои:10.1111 / j.1469-1795.2010.00373.x.
- ^ Прайс, Стивен Дж .; Гарнер, Трентон У.Дж .; Николс, Ричард А .; Баллу, Франсуа; Эйрес, Сезар; Мора-Кабельо де Альба, Ампаро; Босх, Хайме (ноябрь 2014 г.). «Коллапс сообществ амфибий из-за занесенного ранавируса». Текущая биология. 24 (21): 2586–2591. Дои:10.1016 / j.cub.2014.09.028. PMID 25438946.
- ^ Янкович, Джеймс К; Мао, Цзинхэ; Чинчар, В. Григорий; Вятт, Кристофер; Дело, Стивен Т; Кумар, Судхир; Валенте, Гразиела; Субраманиан, Санкар; Дэвидсон, Элизабет В; Коллинз, Джеймс П.; Джейкобс, Бертрам L (2003). «Геномная последовательность ранавируса (семейство Iridoviridae), связанного со смертностью саламандр в Северной Америке». Вирусология. 316 (1): 90–103. Дои:10.1016 / j.virol.2003.08.001. PMID 14599794.
- ^ Бруннер, Джесси Л .; Schock, Danna M .; Дэвидсон, Элизабет В .; Коллинз, Джеймс П. (2004). «Внутривидовые водоемы: сложная история жизни и устойчивость смертельного ранавируса». Экология. 85 (2): 560. Дои:10.1890/02-0374.
- ^ Пирман, Питер Б .; Гарнер, Трентон В. Дж. (2005). «Восприимчивость итальянских популяций ловких лягушек к появляющемуся штамму ранавируса параллельна генетическому разнообразию популяции». Письма об экологии. 8 (4): 401. Дои:10.1111 / j.1461-0248.2005.00735.x.
- ^ Прайс, Стивен Дж .; Люнг, Уильям Т. М .; Оуэн, Кристофер Дж .; Пушендорф, Роберт; Сержант Крис; Каннингем, Эндрю А .; Баллу, Франсуа; Гарнер, Трентон В. Дж .; Николс, Ричард А. (9 мая 2019 г.). «Влияние исторического и прогнозируемого изменения климата на диапазон и последствия возникающей болезни диких животных». Биология глобальных изменений. 25 (8): 2648–2660. Дои:10.1111 / gcb.14651. HDL:10026.1/13802. ISSN 1354-1013.
- ^ Харпер, Дуглас. "лягушка". Интернет-словарь этимологии.
- ^ Granoff, A; Пришел, ЧП; Рафферти, KA (1965). «Выделение и свойства вирусов из Rana pipiens: их возможное родство с почечной аденокарциномой леопардовой лягушки». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 126 (1): 237–255. Bibcode:1965НЯСА.126..237Г. Дои:10.1111 / j.1749-6632.1965.tb14278.x. PMID 5220161.
- ^ а б c d е ж Грей, MJ; Miller, DL; Ховерман, Дж. Т. (2009). «Экология и патология ранавирусов амфибий». Болезни водных организмов. 87 (3): 243–266. Дои:10.3354 / dao02138. PMID 20099417.
- ^ Рафферти, KA (1965). «Культивирование ассоциированных с включением вирусов из лягушек-опухолей Лакке». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 126 (1): 3–21. Bibcode:1965НЯСА.126 .... 3Р. Дои:10.1111 / j.1749-6632.1965.tb14266.x. PMID 5220167.
- ^ Янкович, JK; Бремонт, М; Touchman, JW; Джейкобс, Б.Л. (2010). "Свидетельства множественных недавних смен видов хозяев среди ранавирусов (семейства Iridoviridae)". J Virol. 84 (6): 2636–2647. Дои:10.1128 / JVI.01991-09. ЧВК 2826071. PMID 20042506.
- ^ Первое обнаружение ранавируса у зеленых питонов (Chondropython viridis); Уильямсон; Coupar; Миддлтон; Хенгстбергер; Гулд; Селлек; Мудрый; Каттенбельт; Каннингем; Ли (2002). «Первая идентификация ранавируса у зеленых питонов (Chondropython viridis)». Журнал болезней дикой природы. 38 (2): 239–52. Дои:10.7589/0090-3558-38.2.239. PMID 12038121.
- ^ Бенетка В. (2007). "Первое сообщение об иридовирусе (род Ранавирус) инфекция у леопардовой черепахи (Geochelone pardalis pardalis)" (PDF). Vet Med Австрия. 94: 243–248.
- ^ Де Матос, А. П .; Caeiro, M. F .; Папп, Т; Matos, B.A .; Correia, A.C .; Маршанг, Р. Э. (2011). "Новые вирусы из Lacerta monticola (Серра-да-Эштрела, Португалия): дополнительные доказательства новой группы нуклео-цитоплазматических больших дезоксирибовирусов (NCLDV) ». Микроскопия и микроанализ. 17 (1): 101–8. Bibcode:2011MiMic..17..101A. Дои:10.1017 / S143192761009433X. PMID 21138619.
- ^ Мао, Дж; Хедрик, RP; Чинчар, В.Г. (1997). «Молекулярная характеристика, анализ последовательности и таксономическое положение вновь выделенных иридовирусов рыб». Вирусология. 229 (1): 212–220. Дои:10.1006 / viro.1996.8435. PMID 9123863.
- ^ а б Johnson, A.J .; Pessier, A. P .; Якобсон, Э. Р. (2007). "Экспериментальная передача и индукция ранавирусной болезни у западных декоративных коробчатых черепах (Terrapene ornata ornata) и красноухие ползунки (Trachemys scripta elegans)". Ветеринарная патология. 44 (3): 285–97. Дои:10.1354 / вп.44-3-285. PMID 17491069.
- ^ Blahak S., Uhlenbrok C. "Ранавирусные инфекции у европейских наземных черепах в Германии". Материалы 1-й Международной конференции по медицине рептилий и амфибий; Мюнхен, Германия. 4–7 марта 2010 г .; стр. 17–23
- ^ McKenzie, C.M .; Piczak, M.L .; Snyman, H.N .; Joseph, T .; Theijin, C .; Chow-Fraser, P .; Жардин, К. М. (2019). «Первый отчет о смертности от ранавируса у обыкновенной щелкающей черепахи Chelydra serpentina» (PDF). Болезни водных организмов (132): 221–227. Дои:10.3354 / dao03324.
- ^ Чен, З. X .; Zheng, J.C .; Цзян, Ю. Л. (1999). «Новый иридовирус, выделенный из мягкой черепахи». Вирусные исследования. 63 (1–2): 147–51. Дои:10.1016 / S0168-1702 (99) 00069-6. PMID 10509727.
- ^ Marschang, R.E .; Браун, S; Бехер, П. (2005). «Изоляция ранавируса от геккона (Uroplatus fimbriatus)". Журнал медицины зоопарков и дикой природы. 36 (2): 295–300. Дои:10.1638/04-008.1. JSTOR 20096453. PMID 17323572.
- ^ Goodman, R .; Харгадон, К; Картер, Э. (2018). «Обнаружение ранавируса у восточных ящериц и коробчатых черепах в Центральной Вирджинии». Северо-восточный натуралист. 25 (3): 391–398. Дои:10.1656/045.025.0306.
- ^ а б c Чинчар В.Г., Эссбауэр С., Хе Дж. Г., Хаятт А, Миядзаки Т., Селиги В., Уильямс Т. (2005). "Семья Iridoviridae"pp. 145–162 в Fauquet CM, Mayo MA, Maniloff J, Desselburger U, Ball LA (ред.). Таксономия вирусов, Восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Academic Press, Сан-Диего, США.
- ^ а б c Уильямс Т., Барбоса-Соломье В., Чинчар Г.Д. (2005). «Десятилетие достижений в исследовании иридовирусов» 173-148. В Мараморош К., Шаткин А. (ред.). Достижения в вирусных исследованиях, Vol. 65 Academic Press, Нью-Йорк, США.
- ^ а б c Чинчар, В.Г. (2002). «Ранавирусы (семейство Iridoviridae) появляющиеся хладнокровные убийцы ». Архив вирусологии. 147 (3): 447–470. Дои:10.1007 / s007050200000. PMID 11958449.
- ^ Eaton, Heather E .; Кольцо, Brooke A .; Брунетти, Крейг Р. (2010). «Геномное разнообразие и филогенетические отношения в семье. Iridoviridae". Вирусы. 2 (7): 1458–75. Дои:10.3390 / v2071458. ЧВК 3185713. PMID 21994690.
- ^ а б c Гурха, Р. (1982). «Репликация ДНК вируса лягушки 3 происходит в два этапа». Журнал вирусологии. 43 (2): 519–28. ЧВК 256155. PMID 7109033.
- ^ Speare, R; Смит, младший (1992). "Агент, похожий на иридовирус, выделен из декоративной роющей лягушки. Лимнодинастес орнатус в северной Австралии ". Болезни водных организмов. 14: 51–57. Дои:10.3354 / dao014051.
- ^ Каллен, BR; Оуэнс, Л. (2002). «Экспериментальная проблема и клинические случаи иридовируса Боле (BIV) у аборигенов Австралии». Болезни водных организмов. 49 (2): 83–92. Дои:10.3354 / dao049083. PMID 12078986.
- ^ Чинчар, В.Г .; Брайан, Л; Ван, Дж; Длинный, S; Чинчар, GD (2003). «Индукция апоптоза в клетках, инфицированных вирусом лягушки 3». Вирусология. 306 (2): 303–312. Дои:10.1016 / S0042-6822 (02) 00039-9. PMID 12642103.
внешняя ссылка
Данные, относящиеся к Список вирусов в Wikispecies
- Отчет ICTV Online (10-й): Iridoviridae
- Viralzone: Ранавирус
- Проект исследования ранавируса
- Вирусные болезни амфибий
- Больше информации о Ранавирус и другие патогены, поражающие популяции амфибий, в том числе Batrachochytrium dendrobatidis и Batrachochytrium salamandrivorans можно найти на веб-странице целевой группы по борьбе с болезнями амфибий и рептилий «Юго-восточные партнеры». [1]