Лимфоцистивирус - Lymphocystivirus

Лимфоцистивирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Вариднавирия
Королевство:Bamfordvirae
Тип:Nucleocytoviricota
Учебный класс:Megaviricetes
Заказ:Pimascovirales
Семья:Iridoviridae
Подсемейство:Alphairidovirinae
Род:Лимфоцистивирус
Типовой вид
Вирус лимфоцистоза 1

Лимфоцистивирус это род вирусы, в семье Iridoviridae.[1] Рыбы служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роду три вида, включая типовой вид Вирус лимфоцистоза 1.[1] Заболевания, связанные с этим родом, включают опухолевидные образования на коже.[1][2]

Хосты

Лимфоцистивирус один из шести роды из вирусы в вирусной семье Iridoviridae, и один из трех родов этого семейства, которые заражают костистость Рыбы, вместе с Мегалоцивирус и Ранавирус.[3] Лимфоцистивирусы заражают более 140 пресная вода и морской разновидность,[4] охватывает не менее 42 принимающих семей по всему миру,[5] вызывая хроническое, самоограничивающееся клиническое заболевание, лимфоцист. В то время как лимфоцистис не вызывает таких массовых смертей, как мегалоцивирусы и ранавирусы, у рыб с лимфоцистом наблюдаются явно видимые папилломоподобные поражения кожи, что существенно снижает их коммерческую ценность.[6][7] В настоящее время вакцины против вирусов лимфоцисты отсутствуют.[6]

Таксономия

Группа: dsDNA

[1]

Геном LCDV

Лимфоцистивирусы - это вирусы группы I с дцДНК. геном. Геном LCDV-1 составляет приблизительно 102,7 пар пар оснований (т.п.н.) в длину, с потенциальным потенциалом 195 пар оснований. открытые рамки для чтения (ORF) и кодирует два ДНК-зависимых РНК-полимераза подразделения, а ДНК-метилтрансфераза, а ДНК-полимераза, гуанозинтрифосфатфосфогидролаза (GTPase ), а геликаза, протеинкиназы, рибонуклеозиддифосфатредуктаза и протеины с цинковыми пальцами, среди прочего.[8] Геном LCDV-2 похож на геном LCDV-1, но немного меньше, примерно 98 пар пар оснований (kbp) в длину.[9]

Структура

Вирусы в роду Лимфоцистивирус огибают, имеют икосаэдрическую и многогранную геометрии и симметрию T = 189-217. Диаметр около 120-350 нм. Геномы линейны, около 100 килобайт.[1][2]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
ЛимфоцистивирусМногогранникТ = 189-217ЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Лимфоцистивирусы прикрепляются к клетке-хозяину и проникают через рецептор-опосредованного эндоцитоза похож на другие иридовирусы.[10] Вирусные частицы не имеют покрытия и перемещаются в ядро ячейки, где Репликация ДНК начинается с вирусной кодировки ДНК-полимераза.[11] Затем вирусная ДНК перемещается в цитоплазму для второго этапа репликации ДНК, что приводит к образованию ДНК. конкатемеры.[11] Конкатамерная вирусная ДНК впоследствии упаковывается через головной механизм в вирионы.[12] Геном вируса лимфоцист по кругу с окончательно повторяющаяся ДНК.[11] Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Рыба служит естественным хозяином.[1][2]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ЛимфоцистивирусРыбыНиктоЭндоцитоз клеточных рецепторовЛизис; подающий надеждыЯдроЦитоплазмаНеизвестный

Патогенез

Лимфоцистоз - хроническое заболевание, которое редко приводит к смерти.[4] Инфекция вызывает трансформацию и гипертрофию (примерно в 1000 раз) клеток дермы с образованием явно видимых лимфоцистных узелков, а также трансформацию и гипертрофию клеток соединительной ткани различных внутренних органов.[4] Фибробласты и остеобласты специально нацелены вирусом.[13] Вирусы Lymphocystis нелегко выращивать в культура клеток,[4] наложение ограничений на in vitro эксперименты по молекулярному патогенезу.

Диагностическая патология

Поскольку вирусы лимфоцистиса нелегко выращивать в культуре клеток,[4] диагноз основан на клинические признаки, грубая патология, гистопатология, серология, и / или полимеразной цепной реакции (ПЦР) на основе молекулярный анализы.

Макропатология

Патология лимфоцистоза состоит из папилломоподобных повреждений кожи, состоящих из сильно гипертрофированных инфицированных клеток-хозяев, встроенных во внеклеточный матрикс, иногда называемых опухолевыми клетками лимфоцистиса, которые явно проявляются в виде белых пятен на коже и плавниках инфицированной рыбы.[14] В некоторых случаях эти поражения разрастаются в виде эпителиальных опухолей.[15]

Гистопатология

В недавнем сравнении гистопатологии лимфоцисты четырех неродственных морских видов, поражения постоянно связаны с лимфоцистом, включая гипертрофированный клетки с неправильными ядрами, базофильный цитоплазматический органы включения это положительно окрашено через Реакция Фельгена и Манна и Периодическая кислота-Шифф (PAS) -положительный гиалиновые капсулы.[5] Гиалиновые капсулы возникают из внеклеточного матрикса, продуцируемого инфицированными клетками,[13] и состоят из сульфатных и карбоксилированных гликопротеинов (кислых мукополисахаридов).[13] Напротив, форма тела включения, распределение вирусных частиц в цитоплазме и общий вид узелков лимфоцистоза варьировались в зависимости от вида.[5] Виды, исследованные в этом исследовании, включали пуховика с белыми пятнами (Arothron hispidus ), японский морской окунь (Lateolabrax japonicus ), камбала оливковая (Паралихтис оливковый ) и «жгучая рыба» или черный морской окунь Шлегеля (Себастес Щегели ) [5]

Серология

Было разработано несколько серологических тестов для выявления инфекций LCDV, включая: проточной цитометрии,[16] иммуноблот,[16][17] и иммунофлуоресценция.[16] Однако молекулярные анализы на основе ПЦР более практичны для большинства приложений.[6]

Электронная микроскопия

Просвечивающая электронная микроскопия (ТЕМ) инфицированных клеток выявляет частицы цитоплазматического вируса, обычно размером 198-227 нм в диаметре.[4] (в некоторых случаях до 380 нм)[4][13] и электронно-плотные вещества в перинуклеарное пространство.[5]

Молекулярная патология

Опубликованные праймеры и протокол ПЦР доступны для амплификации части MCP LCDV-1.[6] Когда диагностический анализ ПЦР сочетается с слот-блот, диагностика чувствительность увеличивается, что облегчает диагностику бессимптомных инфекций LCDV-1.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж "Iridoviridae". Отчет ICTV Online (10).
  2. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  3. ^ Whittington, RJ; Becker, JA; Деннис, ММ (2010). «Иридовирусные инфекции у рыб - критический обзор с акцентом на ранавирусы». Журнал болезней рыб. 33 (2): 95–122. Дои:10.1111 / j.1365-2761.2009.01110.x. PMID  20050967.
  4. ^ а б c d е ж грамм Essbauer, S; Ане, В. (2001). «Вирусы низших позвоночных». Журнал ветеринарной медицины B, Инфекционные болезни и ветеринарное здравоохранение. 48 (6): 403–475. Дои:10.1046 / j.1439-0450.2001.00473.x. ЧВК  7159363. PMID  11550762.
  5. ^ а б c d е Шэн, X; Син, Дж; Жан, З; Ван, Y (2007). «Сравнительные исследования гистопатологических особенностей лимфоцистоза у четырех видов морских рыб». Журнал рыбных наук Китая (5).
  6. ^ а б c d е Кано, я; Ферро, П; Алонсо, MC; Бергманн, С.М. Ромер-Обердорфер, А; Гарсия-Росадо, Э; Кастро, Д; Боррего, Дж. Дж. (2006). «Разработка молекулярных методов обнаружения вируса лимфоцистоза у различных видов морских рыб». Журнал прикладной микробиологии. 102 (1): 32–40. Дои:10.1111 / j.1365-2672.2006.03066.x. PMID  17184317.
  7. ^ Hossain, M; Ким, SR; О, MJ (2007). "Лимфоцистоз у камбалы оливковой, Паралихтис оливковый". Университетский журнал зоологии, Университет Раджшахи. 26: 59–62. Дои:10.3329 / ujzru.v26i0.700.
  8. ^ Тидона, Калифорния; Дараи, Г. (1997). «Полная последовательность ДНК LCDV». Вирусология. 230 (2): 207–216. Дои:10.1006 / viro.1997.8456. PMID  9143276.
  9. ^ vanRegenmortel, MHV; Fauquet, CM; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б. Эстес, МК; Лимон, SM; Манилов, Дж; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Pringle, CR; Викнер, РБ (2000). Таксономия вирусов, седьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов. Журнал болезней рыб.
  10. ^ Eaton HE, Ring BA, Brunetti CR (2010). «Геномное разнообразие и филогенетические отношения в семье. Iridoviridae." Вирусы. 2:1458-1475. http://www.mdpi.com/1999-4915/2/7/1458/pdf
  11. ^ а б c Гурха, Р. (1982). «Репликация ДНК вируса лягушки 3 происходит в два этапа». Журнал вирусологии. 43 (2): 519–28. ЧВК  256155. PMID  7109033.
  12. ^ Чинчар В.Г., Эссбауэр С., Хе Дж. Г., Хаятт А, Миядзаки Т., Селиги В., Уильямс Т. (2005). "Семья Iridoviridae 145-162. В Fauquet CM, Mayo MA, Maniloff J, Desselburger U, Ball LA (ред.). Таксономия вирусов, Восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Academic Press, Сан-Диего, США.
  13. ^ а б c d Essbauer, S; Fischer, U; Бергманн, S; Ане, В. (2004). "Исследования ORF 167L вируса лимфоцистоза (Iridoviridae)". Гены вирусов. 28 (1): 19–39. Дои:10.1023 / B: VIRU.0000012261.96217.fe. PMID  14739649.
  14. ^ Харикришнан, Р. Ким, MC; Kim, JS; Баласундарам, С; Хео, MS (2010). «Иммунное усиление химиотерапевтических средств на вирусе лимфоцистоза (LDV), инфицированном Paralichthys olivaceous». Иммунология рыб и моллюсков. 29 (5): 862–867. Дои:10.1016 / j.fsi.2010.07.032. PMID  20688171.
  15. ^ Самалекос, CP (1986). «Анализ структуры вирионов болезни лимфоцистоза рыб из опухолей кожи плевронект». Архив вирусологии. 91 (1–2): 1–10. Дои:10.1007 / bf01316723. PMID  3753198.
  16. ^ а б c Гарсия-Росадо, Э; Кастро, Д; Кано, я; Перес-Прието, С.И. Borrego, JJ; Боррего, Дж. Дж. (2002). «Серологические методы обнаружения вируса лимфоцистоза у рыб». Водные живые ресурсы. 15 (3): 179–185. Дои:10.1016 / s0990-7440 (02) 01174-9.
  17. ^ Кано, я; Алонсо, MC; Гарсия-Росадо, Э; Родригес Сен-Жан, S; Кастро, Д; Боррего, Дж. Дж. (2006). "Обнаружение вируса болезни лимфоцистоза (LCDV) в бессимптомном культивировании морского леща свиноголового (Спартус аурата, L) методом иммуноблоттинга ». Ветеринарная микробиология. 113 (1–2): 137–141. Дои:10.1016 / j.vetmic.2005.10.024. PMID  16298500.

внешняя ссылка