SARS (ген) - SARS (gene)
ОРВИ и цитоплазматическая серил-тРНК синтетаза человек ген и его закодированные фермент продукт соответственно.[5][6] ОРВИ принадлежит к семейство аминоацил тРНК класса II и встречается у всех людей; кодируемый им фермент серил-тРНК синтетаза участвует в трансляция белков и связан с несколькими бактериальными и дрожжевыми аналогами.[6]
Мутации в ОРВИ были связаны с несколькими состояниями, включая Синдром HUPRA.[7]
Открытие
С 1960-х годов серил-тРНК-синтетазы были описаны у различных видов эукариот как в биохимическом, так и в структурном анализе.[8][9] Только в 1997 году этот человеческий ОРВИ и его ферментный продукт были выделены и выражены в кишечная палочка командой из Европейской лаборатории молекулярной биологии во Франции.[5]
Расположение гена
Человек ОРВИ Ген расположен на плюсовой цепи хромосомы 1, от пары оснований 109 213 893 до пары оснований 109 238 182.[10]
Протеин
Серил-тРНК синтетаза состоит из 514 аминокислотных остатков и весит 58 777 Да.[11] Он существует как гомодимер из двух идентичных субъединиц, при этом молекула тРНК связывается через димер по сходству.[12] Он имеет два разных домена:
Функция и механизм
«SARS» и его ферментный продукт серил-тРНК-синтетаза участвуют в трансляции белка; в частности, серил-тРНК синтетаза катализирует перенос L-серина на тРНК (Ser).[13] Цитозольный фермент распознает родственные ему виды тРНК и связывается с высоким уровнем специфичности, обеспечивая точное взаимодействие между соответствующими кодонами и антикодонами на мРНК и тРНК во время трансляции белка.[5]
Мутации
Как и многие мутации, влияющие на трансляцию белков,[14] мутации в наборе генов SARS вызывают ряд заболеваний, таких как гиперурикемия, метаболический алкалоз, легочная гипертензия и прогрессирующая почечная недостаточность в младенчестве; Вместе эти состояния известны как синдром HUPRA.[7]
В этих случаях ген SARS (в частности, «SARS2») претерпевает миссенс-мутацию, которая приводит к полному отсутствию ацетилированной серил-тРНК синтетазы и сильно уменьшенному количеству неацетилированного фермента.[7] Это приводит к неэффективной или полной неспособности L-серина переноситься на родственную ему тРНК, что приводит к неполной трансляции и фолдингу белка. Воздействие, по-видимому, достигает фенотипической патологии только в определенных клетках с высоким расходом энергии, таких как почечные клетки и легочная ткань. Было высказано предположение, что остаточная активность гена SARS2 позволяет большинству других тканей избегать цитопатических симптомов, однако не может защитить клетки, требующие высокой энергии, от повреждения.[7]
Распространенность мутаций SARS, приводящих к синдрому HUPRA, невероятно редка, менее чем у 1 из 1000000 детей, рожденных с этим заболеванием.[15] Палестинская община в районе Большого Иерусалима, по-видимому, имеет гораздо более высокую частоту мутации, возможно, из-за общего предка.[7]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000031698 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068739 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c Винсент C, Tarbouriech N, Härtlein M (ноябрь 1997 г.). «Геномная организация, последовательность кДНК, бактериальная экспрессия и очистка человеческой серил-тРНК-синтазы». Европейский журнал биохимии / FEBS. 250 (1): 77–84. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1997.00077.x. PMID 9431993.
- ^ а б «Энтрез Ген: серил-тРНК синтетаза SARS».
- ^ а б c d е Белостоцкий Р., Бен-Шалом Е., Ринат С., Беккер-Коэн Р., Файнштейн С., Зелигсон С., Сегель Р., Эльпелег О., Нассар С., Фришберг Ю. (февраль 2011 г.). «Мутации в митохондриальной серил-тРНК-синтетазе вызывают гиперурикемию, легочную гипертензию, почечную недостаточность в младенчестве и алкалоз, синдром HUPRA». Американский журнал генетики человека. 88 (2): 193–200. Дои:10.1016 / j.ajhg.2010.12.010. ЧВК 3035710. PMID 21255763.
- ^ Le Meur MA, Gerlinger P, Clavert J, Ebel JP (ноябрь 1972 г.). «Очистка и свойства серил-тРНК синтетазы из печени курицы». Биохимия. 54 (11): 1391–7. Дои:10.1016 / S0300-9084 (72) 80080-4. PMID 4661528.
- ^ Мизутани Т., Нарихара Т., Хашимото А. (1984). «Очистка и свойства серил-тРНК синтетазы бычьей печени». Европейский журнал биохимии. 143 (1): 9–13. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1984.tb08331.x. PMID 6565588.
- ^ а б c UniProt: P49591
- ^ «ЮнитПрот»
- ^ Härtlein M, Cusack S (май 1995 г.). «Структура, функция и эволюция серил-тРНК синтетаз: значение для эволюции аминоацил-тРНК синтетаз и генетического кода». BMC Нефрология. 40 (5): 519–530. Bibcode:1995JMolE..40..519H. Дои:10.1007 / BF00166620. PMID 7540217. S2CID 20176737.
- ^ Rouge M (февраль 1969 г.). «Очистка и некоторые свойства серил-тРНК синтетазы печени крысы». Biochimica et Biophysica Acta. 171 (2): 342–51. Дои:10.1016/0005-2744(69)90167-3. PMID 5773438.
- ^ King MP, Koga Y, Davidson M, Schon EA (февраль 1992 г.). «Дефекты синтеза митохондриального белка и активности дыхательной цепи разделяются с мутацией тРНК (Leu (UUR)), связанной с митохондриальной миопатией, энцефалопатией, лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами». Молекулярная и клеточная биология. 12 (2): 480–90. Дои:10.1128 / mcb.12.2.480. ЧВК 364194. PMID 1732728.
- ^ "Орфа"
дальнейшее чтение
- Härtlein M, Cusack S (май 1995 г.). «Структура, функция и эволюция серил-тРНК синтетаз: значение для эволюции аминоацил-тРНК синтетаз и генетического кода». Журнал молекулярной эволюции. 40 (5): 519–30. Bibcode:1995JMolE..40..519H. Дои:10.1007 / BF00166620. PMID 7540217. S2CID 20176737.
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Хекл М., Буш К., Гросс Х. Дж. (Май 1998 г.). «Минимальные субстраты тРНК (Ser) и тРНК (Sec) для серил-тРНК синтетазы человека: вклад доменов тРНК в серилирование и третичную структуру». Письма FEBS. 427 (3): 315–9. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00435-9. PMID 9637248. S2CID 1897938.
- Шах З.Х., Тоомпуу М., Хаккинен Т., Ровио А.Т., ван Равенсвай С., Де Линхеер Е.М., Смит Р.Дж., Кремерс Ф.П., Кремерс С.В., Джейкобс Х.Т. (май 2001 г.). «Новый полиморфизм кодирующих областей в генах митохондриальной серил-тРНК синтетазы (SARSM) и миторибосомного белка S12 (RPMS12) в семьях аутосомно-доминантной глухоты DFNA4». Человеческая мутация. 17 (5): 433–4. Дои:10.1002 / humu.1123. PMID 11317363. S2CID 26793784.
- Шимада Н., Сузуки Т., Ватанабэ К. (декабрь 2001 г.). «Двойной режим распознавания двух изоакцепторных тРНК митохондриальной серил-тРНК синтетазой млекопитающих». Журнал биологической химии. 276 (50): 46770–8. Дои:10.1074 / jbc.M105150200. PMID 11577083.
- Риглер Р., Кронвалл Э., Хирш Р., Пахманн У., Захау Х. Г. (декабрь 1970 г.). «Взаимодействие серил-тРНК синтетазы с серин- и фенилаланин-специфической тРНК». Письма FEBS. 11 (5): 320–323. Дои:10.1016/0014-5793(70)80558-0. PMID 11945516. S2CID 32467286.
- Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.