9 СЕНТЯБРЯ - SEPT9

СЕНТЯБРЬ9
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыСЕНТЯБРЬ9, AF17q25, MSF, MSF1, NAPB, PNUTL4, SINT1, SeptD1, септин 9, SEPT9
Внешние идентификаторыOMIM: 604061 MGI: 1858222 ГомолоГен: 90949 Генные карты: СЕНТЯБРЬ9
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение SEPTIN9
Геномное расположение SEPTIN9
Группа17q25.3Начните77,280,569 бп[1]
Конец77,500,596 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001113486
NM_001113487
NM_001113488
NM_017380

RefSeq (белок)

NP_001106958
NP_001106959
NP_001106960
NP_059076

Расположение (UCSC)Chr 17: 77,28 - 77,5 МбChr 11: 117,2 - 117,36 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Септин-9 это белок что у людей кодируется 9 СЕНТЯБРЯ ген.[5][6][7]

Взаимодействия

SEPT9 был показан взаимодействовать с участием 2 СЕНТЯБРЯ[8] и 7 СЕНТЯБРЯ.[8]

Функция

Вместе с AHNAK, eIF4E и S100A11, SEPT9, как было показано, важен для выпячивания ложных ножек, миграции опухолевых клеток и инвазии.[9]

Клиническое значение

Было показано, что область v2 промотора SEPT9 метилированный в колоректальный рак ткани по сравнению с нормальной слизистой оболочкой толстой кишки.[10] Используя высокочувствительные ПЦР-анализы в реальном времени, метилированный SEPT9 был обнаружен в крови пациентов с колоректальным раком. Этот альтернативный паттерн метилирования в образцах рака указывает на аберрантную активацию или репрессию гена по сравнению с образцами нормальной ткани.[11][12]

Тестирование для обнаружения метилированного SEPT9 не показано в качестве первого варианта скрининга на колоректальный рак.[13] Он похож по специфичности и чувствительности к гваяковый тест стула или фекальные иммунные тесты, и эти тесты следует использовать в первую очередь.[13] В случаях, когда врач настойчиво рекомендовал колоноскопия и пациент отказался от этого и других тестов, тогда этот тест имеет преимущества перед пациентами, которые вообще не проходят скрининг.[13]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ENSG00000184640 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000282302, ENSG00000184640 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059248 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Osaka M, Rowley JD, Zeleznik-Le NJ (май 1999 г.). «MSF (MLL-септин-подобное слияние), ген-партнер слияния MLL, при остром миелоидном лейкозе, связанном с терапией, с t (11; 17) (q23; q25)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (11): 6428–33. Дои:10.1073 / пнас.96.11.6428. ЧВК  26898. PMID  10339604.
  6. ^ Таки Т., Охниши Х., Шинохара К., Сако М., Бесшо Ф., Янагисава М., Хаяси Ю. (сентябрь 1999 г.). «AF17q25, предполагаемый ген семейства септинов, объединяет ген MLL при остром миелоидном лейкозе с t (11; 17) (q23; q25)». Исследования рака. 59 (17): 4261–5. PMID  10485469.
  7. ^ "Entrez Gene: SEPT9 септин 9".
  8. ^ а б Сурка MC, Цанг CW, Trimble WS (октябрь 2002 г.). «Септин млекопитающих MSF находится в микротрубочках и необходим для завершения цитокинеза». Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3532–45. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0042. ЧВК  129964. PMID  12388755.
  9. ^ Шанкар Дж., Мессенберг А., Чан Дж., Андерхилл TM, Фостер Л.Дж., Наби И.Р. (май 2010 г.). «Псевдоподиальная динамика актина контролирует эпителиально-мезенхимальный переход в метастатических раковых клетках». Исследования рака. 70 (9): 3780–90. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-4439. PMID  20388789.
  10. ^ http://www.transatlantic-symposium.de/content/_docs/doc1241003872263.pdf
  11. ^ Грюцманн Р., Мольнар Б., Пиларски К., Хаберманн Дж. К., Шлаг П. М., Сэгер HD, Мильке С., Штольц Т., Модель F, Роблик У. Дж., Брух Х. П., Кох Р., Либенберг В., Девос Т., Песня X, Дэй Р. Х, Следзевски А. З. , Lofton-Day C (2008). «Чувствительное обнаружение колоректального рака в периферической крови с помощью анализа метилирования ДНК септина 9». PLOS ONE. 3 (11): e3759. Дои:10.1371 / journal.pone.0003759. ЧВК  2582436. PMID  19018278.
  12. ^ deVos T, Tetzner R, Model F, Weiss G, Schuster M, Distler J, Steiger KV, Grützmann R, Pilarsky C, Habermann JK, Fleshner PR, Oubre BM, Day R, Sledziewski AZ, Lofton-Day C (июль 2009 г.) . «Циркуляция метилированной ДНК SEPT9 в плазме является биомаркером колоректального рака». Клиническая химия. 55 (7): 1337–46. Дои:10.1373 / Clinchem.2008.115808. PMID  19406918.
  13. ^ а б c Американское общество клинической патологии, «Пять вещей, которые должны задать вопросы врачам и пациентам», Мудрый выбор: инициатива Фонд ABIM, Американское общество клинической патологии, получено 1 августа, 2013, который цитирует

дальнейшее чтение