STARD13 - STARD13
Связанный со StAR белок домена переноса липидов 13 (STARD13), также известный как удаленный в раке печени белок 2 (DLC-2), представляет собой белок что у людей кодируется STARD13 ген и член семейства белков DLC.[5][6]
Функция и структура
STARD13 служит белком, активирующим ГТФазу Rho (GAP), типом белка, который регулирует членов Семейство Rho GTPases.[7] Выборочно активирует RhoA и CDC42 и подавляет рост клеток, подавляя актин сборка напряженного волокна.[7]
Белок состоит из N-концевого стерильный альфа-мотив (SAM) домен,[8] богатый серином домен, RhoGAP домен и на С-конце домен переноса липидов, связанный со StAR (НАЧНИТЕ ).
Распределение тканей и патология
Частично белок был идентифицирован по его дифференциальной экспрессии в раки. Низкий уровень STARD13 наблюдался у менее дифференцированных гепатоцеллюлярная карцинома ткань с более высокой экспрессией RhoA. Небольшое исследование на пациентах показывает, что отсутствие STARD13 в гепатоцеллюлярной карциноме коррелирует с более высокими уровнями RhoA и более низким уровнем RhoA. прогноз чем пациенты с карциномами, которые были STARD13-положительными.[9]
Модельные организмы
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Гомозигота жизнеспособность | Нормальный |
| Плодородие | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Беспокойство | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Горячая тарелка | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Температура тела | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология | Аномальный[10] |
| Лимфоциты периферической крови | Нормальный |
| Микроядерный тест | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Гистопатология кожи | Нормальный |
| Гистопатология мозга | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный[11] |
| Citrobacter инфекционное заболевание | Аномальный[12] |
| Все тесты и анализы от[13][14] |
Модельные организмы были использованы при изучении функции STARD13. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Звездный13tm1a (КОМП) Wtsi[15][16] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[17][18][19]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[13][20] Было проведено 24 испытания на мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось. Женские гомозиготные мутанты имели повышенную чувствительность к Citrobacter инфекция и показала уменьшенное гематокрит и гемоглобин содержание.[13]
Другое исследование мышей, лишенных STARD13, показало, что он может способствовать кровеносный сосуд формирование (ангиогенез ), особенно опухолевые клетки.[21] Стимуляция ангиогенеза с потерей STARD13 происходит за счет действия RhoA.[21]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133121 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016128 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Диван Ф.Дж., Ромменс Дж.М., Нойхаузен С.Л., Беланжер С., Дюмон М, Абель К., Белл Р., Берри С., Богден Р., Кэннон-Олбрайт Л., Фарид Л., Фрай К., Хаттье Т, Янеки Т., Цзян П., Керер Р., Леблан Дж. Ф., МакАртур-Моррисон Дж., Мени Д., Мики Й., Пэн Й., Самсон С., Шредер М., Снайдер С. К., Симард Дж. (Август 1996 г.). «Создание интегрированной транскрипционной карты региона BRCA2 на хромосоме 13q12-q13». Геномика. 36 (1): 86–99. Дои:10.1006 / geno.1996.0428. PMID 8812419.
- ^ "Entrez Gene: STARD13 START домен, содержащий 13".
- ^ а б Чинг Ю.П., Вонг С.М., Чан С.Ф., Люнг Т.Х., Нг округ Колумбия, Джин Д.Й., Нг И.О. (март 2003 г.). «Делированный при раке печени (DLC) 2 кодирует белок RhoGAP с функцией подавления роста и недоэкспрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме». Журнал биологической химии. 278 (12): 10824–30. Дои:10.1074 / jbc.M208310200. PMID 12531887.
- ^ Ли, Хунъянь; Фунг, Кинг-Люн; Цзинь, Донг-Ян; Чанг, Стивен С. М .; Чинг, Ик-Пан; Нг, Ирен Ой-лин; Сзе, Конг-Хунг; Ko, Ben C.B .; Сунь, Хунчжэ (01.06.2007). «Структура раствора, динамика и связывание липидов стерильного домена альфа-мотива с делецией при раке печени 2». Белки. 67 (4): 1154–1166. Дои:10.1002 / prot.21361. ISSN 1097-0134. PMID 17380510.
- ^ Сяожун Л., Вэй В., Лиюань К., Кайян Ю. (2008). «Недостаточная экспрессия делеции при раке печени 2 (DLC2) связана со сверхэкспрессией RhoA и плохим прогнозом при гепатоцеллюлярной карциноме». BMC Рак. 8: 205. Дои:10.1186/1471-2407-8-205. ЧВК 2496915. PMID 18651974.
- ^ «Гематологические данные для Stard13». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Сальмонелла данные о заражении для Stard13 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Citrobacter данные о заражении для Stard13 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
- ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
- ^ а б Лин И, Чен Н.Т., Ши Ю.П., Ляо Ю.К., Сюэ Л., Ло Ш. (май 2010 г.). «DLC2 модулирует ангиогенные ответы в эндотелиальных клетках сосудов, регулируя прикрепление и миграцию клеток». Онкоген. 29 (20): 3010–6. Дои:10.1038 / onc.2010.54. ЧВК 2874629. PMID 20208559.
дальнейшее чтение
- Чинг Ю.П., Вонг С.М., Чан С.Ф., Люнг Т.Х., Нг округ Колумбия, Джин Д.Й., Нг И.О. (март 2003 г.). «Делеция при раке печени (DLC) 2 кодирует белок RhoGAP с функцией подавления роста и недоэкспрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме». Журнал биологической химии. 278 (12): 10824–30. Дои:10.1074 / jbc.M208310200. PMID 12531887.
- Day CL, Puthalakath H, Skea G, Strasser A, Barsukov I, Lian LY, Huang DC, Hinds MG (февраль 2004 г.). «Локализация легких цепей 1 и 2 динеина и их проапоптотических лигандов». Биохимический журнал. 377 (Pt 3): 597–605. Дои:10.1042 / BJ20031251. ЧВК 1223895. PMID 14561217.
- Нагараджа GM, Кандпал Р.П. (январь 2004 г.). «Кодируемый хромосомой 13q12 белок, активирующий Rho GTPase, подавляет рост клеток карциномы молочной железы, и двухгибридный дрожжевой скрининг показывает его взаимодействие с несколькими белками». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 313 (3): 654–65. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.001. PMID 14697242.
- Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Гройзело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК 442148. PMID 15231748.
- Леунг TH, Чинг Ю.П., Ям Дж.В., Вонг С.М., Яу ТО, Джин Д.Й., Нг И.О. (октябрь 2005 г.). «Удаленный при раке печени 2 (DLC2) подавляет трансформацию клеток посредством ингибирования активности RhoA». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (42): 15207–12. Дои:10.1073 / pnas.0504501102. ЧВК 1250229. PMID 16217026.
PDB галерея | |
|---|---|
|
