TFEB - TFEB

TFEB
Идентификаторы
ПсевдонимыTFEB, ALPHABHLHE35, TCFEB, фактор транскрипции EB
Внешние идентификаторыOMIM: 600744 MGI: 103270 ГомолоГен: 5182 Генные карты: TFEB
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение TFEB
Геномное расположение TFEB
Группа6п21.1Начните41,683,978 бп[1]
Конец41,736,259 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TFEB 221866 at fs.png

PBB GE TFEB 50221 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7942

21425

Ансамбль

ENSG00000112561

ENSMUSG00000023990

UniProt

P19484

Q9R210

RefSeq (мРНК)

NM_001167827
NM_001271943
NM_001271944
NM_001271945
NM_007162

NM_001161722
NM_001161723
NM_011549

RefSeq (белок)

NP_001161299
NP_001258872
NP_001258873
NP_001258874
NP_009093

NP_001155194
NP_001155195
NP_035679

Расположение (UCSC)Chr 6: 41,68 - 41,74 МбChr 17: 47.74 - 47.79 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции EB это белок что у людей кодируется TFEB ген.[5][6]

Функция

TFEB - главный ген для лизосомный биогенез.[7] Он кодирует фактор транскрипции координирует экспрессию лизосомальных гидролаз, мембранных белков и генов, участвующих в аутофагия.[7][8] При истощении питательных веществ и в ненормальных лизосомных условиях хранения, таких как лизосомные болезни накопления TFEB перемещается из цитоплазмы в ядро, что приводит к активации его генов-мишеней.[7][8] Сверхэкспрессия TFEB в культивируемых клетках индуцирует лизосомный биогенез, экзоцитоз и аутофагию. [7][8][9]

При бактериальной инфекции никотиновая кислота аденин динуклеотид фосфат (NAADP) индукция лизосомального Ca2+ отток и активация TFEB приводит к усилению экспрессии воспалительный цитокины.[10] Опосредованная вирусами сверхэкспрессия TFEB в клеточных и мышиных моделях лизосомных нарушений накопления и общих нейродегенеративных заболеваний, таких как Хантингтон, Паркинсон и Альцгеймера болезни, приводящие к внутриклеточной очистке от накапливающихся молекул и спасению фенотипов болезни.[7][9][11][12][13] TFEB активируется PGC1-альфа и способствует снижению htt агрегация и нейротоксичность в мышиной модели Болезнь Хантингтона.[14]Сверхэкспрессия TFEB была обнаружена у пациентов с почечно-клеточным раком и раком поджелудочной железы и, как было показано, способствует онкогенезу за счет индукции различных онкогенных сигналов.[15][16][17]

Ядерная локализация и активность TFEB ингибируется фосфорилированием серина посредством mTORC1 и киназа 2, регулируемая внеклеточными сигналами (ERK2 ). [8][18][19][20]Фосфорилирование TFEB mTORC1 происходит на лизосомной поверхности, причем оба из них локализуются там за счет взаимодействия с Rag GTPases. Затем фосфорилированный TFEB удерживается в цитозоле за счет взаимодействия с 14-3-3 белков.[19][21][20] Эти киназы настроены на уровни внеклеточных питательных веществ, предполагая координацию в регуляции аутофагии и лизосомного биогенеза и партнерство двух отдельных клеточных органелл.[8] Истощение питательных веществ вызывает дефосфорилирование TFEB и последующую ядерную транслокацию через фосфатазу кальциневрин. [22]Ядерный экспорт TFEB опосредуется CRM1 и зависит от фосфорилирования.[23][24] TFEB также является мишенью протеинкиназы. АКТ / ПКБ.[25] АКТ / ПКБ фосфорилирует TFEB по серину 467 и ингибирует ядерную транслокацию TFEB.[25] Фармакологическое ингибирование АКТ / ПКБ активирует TFEB, способствует биогенезу лизосом и аутофагии, а также облегчает невропатологию в моделях ювенильных мышей. Болезнь Баттена и Синдром Санфилиппо тип Б.[25][26]TFEB активируется в Trex1 -дефицитные клетки за счет ингибирования mTORC1 активность, что приводит к расширению лизосомального компартмента.[27]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112561 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023990 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Carr CS, Sharp PA (август 1990 г.). «Белок спираль-петля-спираль, связанный с белками, связывающими иммуноглобулин Е-бокса». Молекулярная и клеточная биология. 10 (8): 4384–8. Дои:10.1128 / mcb.10.8.4384. ЧВК  360994. PMID  2115126.
  6. ^ «Ген Entrez: фактор транскрипции TFEB EB».
  7. ^ а б c d е Sardiello M, Palmieri M, di Ronza A, Medina DL, Valenza M, Gennarino VA, Di Malta C, Donaudy F, Embrione V, Polishchuk RS, Banfi S, Parenti G, Cattaneo E, Ballabio A (июль 2009 г.). «Генная сеть, регулирующая биогенез и функцию лизосом». Наука. 325 (5939): 473–7. Bibcode:2009Наука ... 325..473С. Дои:10.1126 / science.1174447. PMID  19556463. S2CID  20353685.
  8. ^ а б c d е Сеттембре С., Ди Мальта С., Полито В.А., Гарсия Аренсибиа М., Ветрини Ф., Эрдин С., Эрдин С.У., Хюнх Т., Медина Д., Колелла П., Сардиелло М., Рубинштейн округ Колумбия, Баллабио А. (июнь 2011 г.). «TFEB связывает аутофагию с лизосомным биогенезом». Наука. 332 (6036): 1429–33. Bibcode:2011Научный ... 332.1429S. Дои:10.1126 / science.1204592. ЧВК  3638014. PMID  21617040.
  9. ^ а б Medina DL, Fraldi A, Bouche V, Annunziata F, Mansueto G, Spampanato C, Puri C, Pignata A, Martina JA, Sardiello M, Palmieri M, Polishchuk R, Puertollano R, Ballabio A (сентябрь 2011 г.). «Активация транскрипции лизосомального экзоцитоза способствует клеточному очищению». Клетка развития. 21 (3): 421–30. Дои:10.1016 / j.devcel.2011.07.016. ЧВК  3173716. PMID  21889421.
  10. ^ Се Н, Чжан Л., Гао В., Хуан С., Цзоу Б. (2020). «Метаболизм НАД +: патофизиологические механизмы и терапевтический потенциал». ПЕРЕДАЧА СИГНАЛА И ЦЕЛЕВАЯ ТЕРАПИЯ. 5 (1): 227. Дои:10.1038 / s41392-020-00311-7. ЧВК  7539288. PMID  33028824.
  11. ^ Settembre C, De Cegli R, Mansueto G, Saha PK, Vetrini F, Visvikis O, Huynh T, Carissimo A, Palmer D, Klisch TJ, Wollenberg AC, Di Bernardo D, Chan L, Irazoqui JE, Ballabio A (июнь 2013 г.) . «TFEB контролирует клеточный метаболизм липидов посредством петли ауторегуляции, вызванной голоданием». Природа клеточной биологии. 15 (6): 647–58. Дои:10.1038 / ncb2718. ЧВК  3699877. PMID  23604321.
  12. ^ Polito VA, Li H, Martini-Stoica H, Wang B, Yang L, Xu Y, Swartzlander DB, Palmieri M, di Ronza A, Lee VM, Sardiello M, Ballabio A, Zheng H (сентябрь 2014 г.). «Селективный клиренс аберрантных белков тау и устранение нейротоксичности с помощью фактора транскрипции EB». EMBO Молекулярная медицина. 6 (9): 1142–60. Дои:10.15252 / emmm.201303671. ЧВК  4197862. PMID  25069841.
  13. ^ Decressac M, Mattsson B, Weikop P, Lundblad M, Jakobsson J, Björklund A (май 2013 г.). «TFEB-опосредованная аутофагия спасает дофаминовые нейроны среднего мозга от токсичности α-синуклеина». Proc Natl Acad Sci USA. 110 (19): 1817–26. Bibcode:2013PNAS..110E1817D. Дои:10.1073 / pnas.1305623110. ЧВК  3651458. PMID  23610405.
  14. ^ Цунэми Т., Эш Т.Д., Моррисон Б.Е., Сориано К.Р., Ау Дж., Роке Р.А., Лазаровски Е.Р., Дамиан В.А., Маслия Е., Ла Спада АР (июль 2012 г.). «PGC-1α снимает протеотоксичность при болезни Хантингтона, предотвращая окислительный стресс и способствуя функции TFEB». Научная трансляционная медицина. 4 (142): 142ra97. Дои:10.1126 / scitranslmed.3003799. ЧВК  4096245. PMID  22786682.
  15. ^ Ди Мальта К., Сицилиано Д., Кальканьи А., Монфрегола Дж., Пунци С., Пасторе Н., Истес А. Н., Дэвис О., Де Чегли Р., Зампелли А., Ди Джованнантонио Л. Г., Нуско Е, Платт Н., Гуида А., Огмундсдоттир М. Х., Ланфранконе Л. , Перера Р.М., Зонку Р., Пеличчи П.Г., Сеттембре С., Баллабио А. (июнь 2017 г.). «Активация транскрипции RagD GTPase контролирует mTORC1 и способствует росту рака». Наука. 356 (6343): 1188–1192. Дои:10.1126 / science.aag2553. ЧВК  5730647. PMID  28619945.
  16. ^ Calcagnì A, Kors L, Verschuren E, De Cegli R, Zampelli N, Nusco E, Confalonieri S, Bertalot G, Pece S, Settembre C, Malouf GG, Leemans JC, de Heer E, Salvatore M, Peters DJ, Di Fiore PP , Ballabio A (сентябрь 2016 г.). «Моделирование почечно-клеточной карциномы TFE у мышей показывает критическую роль передачи сигналов WNT». eLife. 5. Дои:10.7554 / eLife.17047. ЧВК  5036965. PMID  27668431.
  17. ^ Перера Р.М., Стойкова С., Николай Б.Н., Росс К.Н., Фитамант Дж., Бухали М., Ленгранд Дж., Дешпанде В., Селиг М.К., Феррон С.Р., Сеттлман Дж., Стефанопулос Г., Дайсон Н.Дж., Зонку Р., Рамасвами С., Хаас В., Бардизи Н. (Август 2015 г.). «Транскрипционный контроль функции аутофагии и лизосом управляет метаболизмом рака поджелудочной железы». Природа. 524 (7565): 361–5. Bibcode:2015Натура.524..361П. Дои:10.1038 / природа14587. ЧВК  5086585. PMID  26168401.
  18. ^ Сеттембре С., Зонку Р., Медина Д.Л., Ветрини Ф., Эрдин С., Эрдин С., Хюин Т., Феррон М., Карсенти Дж., Веллард М.С., Факкинетти В., Сабатини Д.М., Баллабио А. (март 2012 г.). «Механизм передачи сигналов от лизосомы к ядру определяет и регулирует лизосомы через mTOR и TFEB». EMBO Журнал. 31 (5): 1095–108. Дои:10.1038 / emboj.2012.32. ЧВК  3298007. PMID  22343943.
  19. ^ а б Мартина Дж. А., Чен Ю., Гучек М., Пуэртоллано Р. (июнь 2012 г.). «MTORC1 функционирует как транскрипционный регулятор аутофагии, предотвращая ядерный транспорт TFEB». Аутофагия. 8 (6): 903–14. Дои:10.4161 / авто.19653. ЧВК  3427256. PMID  22576015.
  20. ^ а б Рочняк-Фергюсон А., Пети К.С., Фрёлих Ф., Циан С., Ки Дж., Ангарола Б., Вальтер Т.С., Фергюсон С.М. (июнь 2012 г.). «Фактор транскрипции TFEB связывает передачу сигналов mTORC1 с транскрипционным контролем гомеостаза лизосом». Научная сигнализация. 5 (228): ra42. Дои:10.1126 / scisignal.2002790. ЧВК  3437338. PMID  22692423.
  21. ^ Мартина Дж. А., Пуэртоллано Р. (июнь 2013 г.). «RRAG GTPases связывают доступность питательных веществ с экспрессией генов, аутофагией и лизосомным биогенезом». Аутофагия. 9 (6): 928–30. Дои:10.4161 / авто.24371. ЧВК  3672304. PMID  23524842.
  22. ^ Медина Д.Л., Ди Паола С., Пелусо I, Армани А., Де Стефани Д., Вендитти Р., Монтефуско С., Скотто-Розато А., Прециозо С., Форрестер А., Сеттембре С., Ван В., Гао К., Сюй Х, Сандри М., Риццуто Р., Де Маттеис М.А., Баллабио А (март 2015 г.). «Передача сигналов лизосомального кальция регулирует аутофагию через кальциневрин и TFEB». Природа клеточной биологии. 17 (3): 288–99. Дои:10.1038 / ncb3114. ЧВК  4801004. PMID  25720963.
  23. ^ Наполитано Дж., Эспозито А., Чой Х, Матарезе М, Бенедетти В., Ди Мальта С., Монфрегола Дж., Медина Д. Л., Липпинкотт-Шварц Дж., Баллабио А. (август 2018 г.). «mTOR-зависимое фосфорилирование контролирует ядерный экспорт TFEB». Nature Communications. 9 (1): 3312. Bibcode:2018НатКо ... 9.3312N. Дои:10.1038 / s41467-018-05862-6. ЧВК  6098152. PMID  30120233.
  24. ^ Ли Л., Фридрихсен Х. Дж., Эндрюс С., Пикауд С., Волпон Л., Нгеоу К., Берридж Г., Фишер Р., Борден К.Л.Б., Филиппакопулос П., Годинг С.Р. (июль 2018 г.). «Сигнал ядерного экспорта TFEB объединяет поступление аминокислот и доступность глюкозы». Nature Communications. 9 (1): 2685. Bibcode:2018НатКо ... 9.2685L. Дои:10.1038 / s41467-018-04849-7. ЧВК  6041281. PMID  29992949.
  25. ^ а б c Пальмиери М., Пал Р., Нельвагал Х. Р., Лотфи П., Стиннетт Г. Р., Сеймур М. Л., Чаудхури А., Баджадж Л., Бондар В. В., Бремнер Л., Салим У., Це Д. Ю., Санагасетти Д., Ву С. М., Нилсон-младший, Перейра Ф. А., Паутлер Р. Г. , Родни Г.Г., Купер Д.Д., Сардиелло М. (февраль 2017 г.). «mTORC1-независимая активация TFEB посредством ингибирования Akt способствует очищению клеток при нейродегенеративных заболеваниях накопления». Nature Communications. 8: 14338. Bibcode:2017НатКо ... 814338P. Дои:10.1038 / ncomms14338. ЧВК  5303831. PMID  28165011.
  26. ^ Lotfi P, Tse DY, Di Ronza A, Seymour ML, Martano G, Cooper JD, Pereira FA, Passafaro M, Wu SM, Sardiello M (июль 2018 г.). «Трегалоза снижает дегенерацию сетчатки, нейровоспаление и нагрузку на накопление, вызванную дефицитом лизосомальной гидролазы». Аутофагия. 14 (8): 1419–1434. Дои:10.1080/15548627.2018.1474313. ЧВК  6103706. PMID  29916295.
  27. ^ Хасан М., Коч Дж., Рахеджа Д., Паттнаик А.К., Бругаролас Дж., Дозморов И., Левин Б., Вейкленд Е.К., Ли-Кирш М.А., Ян Н. (январь 2013 г.). «Trex1 регулирует лизосомный биогенез и интерферон-независимую активацию противовирусных генов». Иммунология природы. 14 (1): 61–71. Дои:10.1038 / ni.2475. ЧВК  3522772. PMID  23160154.

дальнейшее чтение