ANKS1A - ANKS1A

ANKS1A
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыANKS1A, ANKS1, анкириновый повтор и домен стерильного альфа-мотива, содержащий 1A
Внешние идентификаторыOMIM: 608994 MGI: 2446180 ГомолоГен: 9068 Генные карты: ANKS1A
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное местоположение для ANKS1A
Геномное местоположение для ANKS1A
Группа6п21.31Начинать34,889,255 бп[1]
Конец35,091,406 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ANKS1A 212747 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

23294

224650

Ансамбль

ENSG00000064999

ENSMUSG00000024219

UniProt

Q92625

P59672

RefSeq (мРНК)

NM_015245

NM_001286040
NM_001286041
NM_181413
NM_001374802

RefSeq (белок)

NP_056060

NP_001272969
NP_001272970
NP_852078

Расположение (UCSC)Chr 6: 34,89 - 35,09 МбChr 17: 27.91 - 28.06 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Анкириновый повтор и белок 1А, содержащий домен SAM (ANKS1A), также известный как ODIN, является белок что у людей кодируется ANKS1A ген на хромосома 6.[5][6]

Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток.[7] ODIN, как известно, регулирует рецептор эпидермального фактора роста (EGFR) и Рецептор EphA сигнальные пути.[8] Как Киназа семейства Src цель, ODIN участвовал в разработке рак.[9] В ANKS1A ген также содержит один из 27 SNP связано с повышенным риском ишемическая болезнь сердца.[10]

Структура

Ген

В ANKS1A ген находится на хромосоме 6 в полосе 6p21.31 и включает 29 экзоны.[6] Этот ген производит 2 изоформы через альтернативное сращивание.[11]

Протеин

ODIN является членом семейства анкириновых повторов и стерильных альфа-мотивов, содержащих домены (ANKS), и содержит 6 Анкирин повторяет, 1 фосфотирозинсвязывающий домен (PTD), и 2 тандемный стерильный альфа-мотив (SAM) домены.[11][12] Первый домен SAM связывается с доменом SAM EphA2 рецептор, принимая конформацию средней петли / конца спирали и может регулировать EphA2 эндоцитоз.[12][13]

Функция

ODIN широко экспрессируется в тканях, включая сердце, мозг, плацента, легкое, печень, скелетные мышцы, почка и поджелудочная железа.[14] ODIN был признан одним из тирозин фосфорилированные белки, индуцированные активацией фактор роста эпидермиса или же фактор роста тромбоцитов рецептор тирозинкиназы.[14] ODIN участвует в негативном регулировании EGFR сигнальный путь.[8] Сообщается, что уровень ODIN коррелирует со степенью увеличения EGF-индуцированного транспорта EGFR для рециклирования. эндосомы и вернуть обратно в поверхность клетки, предполагая роль в переработке EGFR.[15] Кроме того, ODIN служит ключевым адаптерным белком, регулирующим сигнальный путь рецептора EphA, который имеет решающее значение для регуляции EphA8 -опосредованный миграция клеток и рост нейритов.[16][17] Было продемонстрировано, что удаление фосфотирозин связывающий домен в ODIN приведет к незрелому развитию подкомиссуральный орган (SCO) с тяжелым средним мозгом гидроцефальный фенотип, что означает, что ODIN также играет роль в правильном развитии SCO и в эпендимные клетки в мозговой акведук.[18]

Клиническое значение

Как новая цель Киназы семейства SRC, которые участвуют в развитии некоторых колоректального рака, ODIN может участвовать в механизмах передачи сигналов раковых клеток.[19] В исследовании 64 колоректальный рак линии клеток тестировали на экспрессию Lck. Масс-спектрометрический анализ очищенных Lck белков впоследствии идентифицировал несколько белков, легко известных как субстраты киназы SFK, включая кортактин, Tom1L1 (SRCASM), GIT1, виментин и AFAP1L2 (XB130). Дополнительные белки, ранее описанные как субстраты других тирозинкиназы также были обнаружены, в том числе ODIN. ODIN был дополнительно проанализирован, и было обнаружено, что он содержит значительно меньше pY при ингибировании активности SFK в клетках SW620, что указывает на то, что он является ранее неизвестной мишенью SFK в клетках колоректальной карциномы.[19] Кроме того, было обнаружено, что ODIN регулирует COPII-опосредованный антероградный транспорт рецепторных тирозинкиназ, который является критическим механизмом в процессе опухолевого генеза.[20]

Клинический маркер

Мультилокусное исследование генетического риска, основанное на комбинации 27 места, включая ген ANKS1A, выявляли лиц с повышенным риском как инцидентов, так и повторных ишемическая болезнь сердца событиях, а также усиление клинической пользы от статины терапия. Исследование было основано на сообществе когортное исследование (исследование Malmo Diet and Cancer) и четыре дополнительных рандомизированных контролируемых исследования когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22).[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000064999 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024219 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси И., Охара О, Танака А., Котани Х., Миядзима Н., Номура Н. (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга». ДНК исследования. 3 (5): 321–9, 341–54. Дои:10.1093 / днарес / 3.5.321. PMID  9039502.
  6. ^ а б «Ген Entrez: анкириновый повтор ANKS1A и домен стерильного альфа-мотива, содержащий 1A».
  7. ^ «BioGPS - ваша система генного портала». biogps.org. Получено 2016-10-10.[постоянная мертвая ссылка ]
  8. ^ а б Кристиансен Т.З., Нильсен М.М., Благоев Б., Панди А., Манн М. (август 2004 г.). «Эмбриональные фибробласты мыши, полученные от мышей с дефицитом Odin, демонстрируют гиперпролииферативный фенотип». ДНК исследования. 11 (4): 285–92. PMID  15500253.
  9. ^ Эмадуддин М., Эдельманн М.Дж., Кесслер Б.М., Феллер С.М. (01.01.2008). «Odin (ANKS1A) является мишенью киназы семейства Src в клетках колоректального рака». Сотовая связь и сигнализация. 6: 7. Дои:10.1186 / 1478-811X-6-7. ЧВК  2584000. PMID  18844995.
  10. ^ а б Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ, Nordio F, Hyde CL, Cannon CP, Sacks FM, Poulter NR, Sever PS, Ridker PM, Braunwald E, Melander O, Kathiresan S, Sabatine MS (Июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза от терапии статинами: анализ испытаний первичной и вторичной профилактики». Ланцет. 385 (9984): 2264–71. Дои:10.1016 / S0140-6736 (14) 61730-X. ЧВК  4608367. PMID  25748612.
  11. ^ а б «ANKS1A - анкириновый повтор и белок 1A, содержащий домен SAM - Homo sapiens (человек) - ген и белок ANKS1A». www.uniprot.org. Получено 2016-10-10.
  12. ^ а б Mercurio FA, Marasco D, Pirone L, Pedone EM, Pellecchia M, Leone M (март 2012 г.). «Структура раствора первого Sam-домена Odin и исследования связывания с рецептором EphA2». Биохимия. 51 (10): 2136–45. Дои:10.1021 / bi300141h. ЧВК  3319784. PMID  22332920.
  13. ^ Mercurio FA, Di Natale C, Pirone L, Scognamiglio PL, Marasco D, Pedone EM, Saviano M, Leone M (июль 2015 г.). «Пептидные фрагменты Odin-Sam1: конформационный анализ и исследования взаимодействия с EphA2-Sam». ChemBioChem. 16 (11): 1629–36. Дои:10.1002 / cbic.201500197. PMID  26120079. S2CID  24673174.
  14. ^ а б Панди А., Благоев Б., Кратчмарова И., Фернандес М., Нильсен М., Кристиансен Т.З., Охара О., Подтелейников А.В., Рош С., Лодиш Х.Ф., Манн М. (ноябрь 2002 г.). «Клонирование новой молекулы, содержащей фосфотирозинсвязывающий домен, Odin, участвующего в передаче сигналов рецепторными тирозинкиназами». Онкоген. 21 (52): 8029–36. Дои:10.1038 / sj.onc.1205988. PMID  12439753.
  15. ^ Тонг Дж., Сидорский Ю., Сен-Жермен-младший, Тейлор П., Цао М.С., Моран М.Ф. (01.01.2013). «Один (ANKS1A) модулирует рециркуляцию и стабильность рецептора EGF». PLOS ONE. 8 (6): e64817. Bibcode:2013PLoSO ... 864817T. Дои:10.1371 / journal.pone.0064817. ЧВК  3692516. PMID  23825523.
  16. ^ Ким Дж, Ли Х, Ким Й, Ю С., Пак Э, Пак С. (апрель 2010 г.). «SAM-домены белков семейства Anks критически вовлечены в модуляцию деградации рецепторов EphA». Молекулярная и клеточная биология. 30 (7): 1582–92. Дои:10.1128 / MCB.01605-09. ЧВК  2838079. PMID  20100865.
  17. ^ Шин Дж, Гу Си, Парк Э, Парк С. (декабрь 2007 г.). «Идентификация белков, содержащих фосфотирозинсвязывающий домен, как новых нижестоящих мишеней сигнальной функции EphA8». Молекулярная и клеточная биология. 27 (23): 8113–26. Дои:10.1128 / MCB.00794-07. ЧВК  2169194. PMID  17875921.
  18. ^ Park S, Lee H, Park S (май 2015 г.). «Экспрессия in vivo мутанта Odin с удаленным PTB приводит к гидроцефалии». Молекулы и клетки. 38 (5): 426–31. Дои:10.14348 / molcells.2015.2288. ЧВК  4443284. PMID  26018557.
  19. ^ а б Эмадуддин М., Эдельманн М.Дж., Кесслер Б.М., Феллер С.М. (октябрь 2008 г.). «Odin (ANKS1A) является мишенью киназы семейства Src в клетках колоректального рака». Сотовая связь и сигнализация. 6: 7. Дои:10.1186 / 1478-811X-6-7. ЧВК  2584000. PMID  18844995.
  20. ^ Ли Х, Но Х, Мун Дж, Гу Си, Север С., Пак С. (сентябрь 2016 г.). «Anks1a регулирует COPII-опосредованный антероградный транспорт рецепторных тирозинкиназ, критических для онкогенеза». Nature Communications. 7: 12799. Bibcode:2016НатКо ... 712799L. Дои:10.1038 / ncomms12799. ЧВК  5027278. PMID  27619642.

внешняя ссылка

  • Человек ANKS1A расположение генома и ANKS1A страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q92625 (Повторение анкирина человека и белок 1А, содержащий домен SAM) на PDBe-KB.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P59672 (Анкириновый повтор мыши и белок 1А, содержащий домен SAM) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение