Кандидат в разделение SR1 и код грацилибактерий - Википедия - Candidate division SR1 and gracilibacteria code

В кандидат деления SR1 и код gracilibacteria (таблица перевода 25) используется в двух группах (пока) необработанных бактерии найдены в морской и пресной воде, а также в кишечнике и ротовой полости млекопитающих.[1] Отличие от стандартного и бактериального кода состоит в том, что UGA представляет собой дополнительный кодон глицина и не кодирует терминатор.[2]

Код

   AA = FFLLSSSSYY ** CCGWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVVAAAADDEEGGGG
Начинается = --- M ------------------------------- M ------------- --M ------------
 Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Базы: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (T) или урацил (U).

Аминокислоты: Аланин (Ала, А), Аргинин (Arg, R), Аспарагин (Asn, N), Аспарагиновая кислота (Asp, D), Цистеин (Cys, C), Глютаминовая кислота (Клей), Глутамин (Gln, Q), Глицин (Gly, G), Гистидин (Его, H), Изолейцин (Иль, я), Лейцин (Leu, L), Лизин (Лис, К), Метионин (Met, M), Фенилаланин (Phe, F), Пролин (Pro, P), Серин (Сер, S), Треонин (Thr, T), Триптофан (Трп, Вт), Тирозин (Tyr, Y) и Валин (Вал, В).

Отличие от стандартного кода

Кодон ДНККодон РНКЭтот код (25)Стандартный код (1)
TGAUGAГли (G)СТОП = Тер (*)

Кодоны инициации

  • AUG, GUG, UUG

Систематический диапазон

Смотрите также

Рекомендации

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.[3]

  1. ^ Дэвис, Джеймс П .; Юссеф, Ноха Х .; Эльшахед, Мостафа С. (июнь 2009 г.). «Оценка разнообразия, численности и экологического распределения членов подразделения-кандидата SR1 выявляет высокий уровень филогенетического разнообразия, но ограниченное морфотипическое разнообразие». Прикладная и экологическая микробиология. 75 (12): 4139–4148. Дои:10.1128 / AEM.00137-09. ISSN  1098-5336. ЧВК  2698373. PMID  19395567.
  2. ^ Дж. Х. Кэмпбелл; О'П. Донохью; А. Г. Кэмпбелл; П. Швентек; А. Щирба; Т. Войке; Д. Зёлль; М. Подар (2 апреля 2013 г.). «UGA является дополнительным кодоном глицина в некультивируемых бактериях SR1 из микробиоты человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (14): 5540–5. Дои:10.1073 / пнас.1303090110. ЧВК  3619370. PMID  23509275.
  3. ^ Эльзановский А, Остелл Дж, Лейпе Д., Сусов В. "Генетические коды". Браузер таксономии. Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США. Получено 19 марта 2016.

внешняя ссылка