EMI домен - EMI domain
| EMI домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | EMI | ||||||||
| Pfam | PF07546 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR011489 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии EMI домен, впервые названный в честь его присутствия в белки семьи ЭМИЛИН, небольшой цистеин -богатые белковый домен около 75 аминокислоты. Домен EMI чаще всего находится на N конечная из многоклеточный внеклеточный белки которые образуют или совместимы с мультимер формирование.[1] Он обнаруживается в ассоциации с другими доменами, такими как C1q, EGF-подобного типа ламинина, подобного коллагену, FN3, WAP, ZP или FAS1.[2] Было высказано предположение, что домен EMI может быть белок-белковое взаимодействие модуль, как домен EMI ЭМИЛИН-1 был найден взаимодействовать с областью C1q ЭМИЛИН-2.[1]
Домен EMI имеет шесть высококонсервативных цистеин остатки, которые, вероятно, образуют дисульфидные связи. Другими ключевыми особенностями домена EMI являются паттерн C-C-x-G- [WYFH], гидрофобный положение, непосредственно предшествующее первому цистеину (Cys1) домена и кластеру гидрофобных остатков между Cys3 и Cys4. Домен EMI может состоять из двух субдоменов: складывать второго, имеющего сходство с характеристикой C-терминального субмодуля EGF-подобные домены.[2]
Белки Известно, что домен EMI включает:
- Позвоночное животное Эмилиньш, внеклеточный матрикс гликопротеины.
- Мультимерины позвоночных, гликопротеины внеклеточного матрикса.
- Белки эму позвоночных, которые могут взаимодействовать с несколькими различными компонентами внеклеточного матрикса и служат для соединения и интегрировать функция нескольких партнеров молекулы.
- Позвоночное животное бета-IG-H3.
- Позвоночное животное остеобласт-специфический фактор 2 (OSF-2).
- Млекопитающее NEU1 / NG3 белки.
- Дрозофила срединный фасциклин.
- Caenorhabditis elegans цед-1, а трансмембранный рецептор это посредник ячейка поглощение трупа.
использованная литература
- ^ а б Долиана Р., Бот С., Боналдо П., Коломбатти А. (ноябрь 2000 г.). «EMI, новый богатый цистеином домен EMILIN и других внеклеточных белков, взаимодействует с доменами gC1q и участвует в мультимеризации». FEBS Lett. 484 (2): 164–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02140-2. PMID 11068053. S2CID 38531447.
- ^ а б Callebaut I, Mignotte V, Souchet M, Mornon JP (январь 2003 г.). «Домены EMI широко распространены и выявляют вероятные ортологи белка CED-1 Caenorhabditis elegans». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 300 (3): 619–23. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02904-2. PMID 12507493.