Малые РНК, кодируемые вирусом Эпштейна-Барра - Epstein–Barr virus-encoded small RNAs

EBER1
EBER SScons.png
Консервированная вторичная структура EBER1.
Идентификаторы
СимволEBER1
РфамRF01789
Прочие данные
РНК типГен
Домен (ы)Вирус Эпштейна-Барра
PDB структурыPDBe

В Малые РНК, кодируемые вирусом Эпштейна-Барра (EBER) маленькие некодирующие РНК локализован в ядро человеческих клеток, инфицированных Вирус Эпштейна-Барра (EBV). Впервые обнаруженные в 1981 году, EBER являются наиболее распространенными РНК присутствует в инфицированных клетках.[1] EBER взаимодействуют с несколькими белками-хозяевами с образованием рибонуклеопротеин (РНП) комплексы. Хотя точная функция EBER остается неясной, роли в трансформация и онкогенез предлагаются.

Фон

EBER1 и EBER2 короткие, 167 и 172 нуклеотиды по длине соответственно, ядерно-обогащенные некодирующие РНК. Эти две РНК записано хозяином РНК-полимераза III в течение скрытая инфекция ВЭБ.[2][3]

EBER 1 и 2 могут быть удалены из вирусной геном без заметного фенотипический изменения, хотя это никогда не было обнаружено удаленными в природе.[2] Одна только экспрессия EBER может вызывать опухоли в мыши с тяжелым комбинированным иммунодефицитом.[4][5]

EBER1

EBER1 ассоциируется с человеческим рибосомный белок L22[6] и заставляет этот белок перемещаться из ядрышко к нуклеоплазма.[7] EBER1 также специфически взаимодействует как минимум с тремя хостами. hnRNPs (A1, A2 / B1 и D /AUF1 ).[8]

EBER2

Консенсусная вторичная структура для EBER2

Подобно EBER1, EBER2 очень высоко экспрессируется в латентно инфицированных клетках. В отличие от EBER1, последовательность EBER2 менее консервативна в родственных герпесвирусах (консервативность ~ 50%). Тем не менее вторичная структура EBER2 является высококонсервативный (см. рисунок 1). EBER2, как известно, связывает только клеточные белки (в частности, La домен ) на конечном участке повторяющегося уридины; однако считается, что другие особенности EBER2, особенно его два длинных и очень консервативных стебель-петли, также могут служить сайтами связывания для еще неизвестных белков.[9]

Рекомендации

  1. ^ Лернер MR, Эндрюс NC, Миллер G, Steitz JA (февраль 1981). «Две малые РНК, кодируемые вирусом Эпштейна-Барра и образующие комплекс с белком, осаждаются антителами пациентов с системной красной волчанкой». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 78 (2): 805–809. Дои:10.1073 / пнас.78.2.805. ЧВК  319891. PMID  6262773.
  2. ^ а б Конрад NK, Fok V, Cazalla D, Borah S, Steitz JA (2006). «Проблема вирусных snRNPs». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии. 71: 377–384. Дои:10.1101 / sqb.2006.71.057. PMID  17381320.
  3. ^ Мосс В.Н., Ли Н., Пимиента Дж., Стейтц Дж. А. (2014). «Семейства РНК в вирусе Эпштейна-Барра». РНК Биология. 11 (1): 10–17. Дои:10.4161 / rna.27488. ЧВК  3929418. PMID  24441309.
  4. ^ Комано Дж., Маруо С., Куродзуми К., Ода Т., Такада К. (декабрь 1999 г.). «Онкогенная роль РНК, кодируемых вирусом Эпштейна-Барра, в клеточной линии лимфомы Беркитта Akata». Журнал вирусологии. 73 (12): 9827–9831. ЧВК  113031. PMID  10559294.
  5. ^ Ямамото Н., Такидзава Т., Иванага И., Симидзу Н., Ямамото Н. (ноябрь 2000 г.). «Злокачественная трансформация клеточной линии B-лимфомы BJAB небольшими РНК, кодируемыми вирусом Эпштейна-Барра». Письма FEBS. 484 (2): 153–158. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02145-1. PMID  11068051.
  6. ^ Фок В., Миттон-Фрай Р.М., Греч А., Стейтц Дж. А. (май 2006 г.). «Множественные домены EBER 1, некодирующей РНК вируса Эпштейна-Барра, привлекают человеческий рибосомный белок L22». РНК. 12 (5): 872–882. Дои:10.1261 / rna.2339606. ЧВК  1440895. PMID  16556938.
  7. ^ Toczyski DP, Matera AG, Ward DC, Steitz JA (апрель 1994). «Малая РНК EBER1 вируса Эпштейна-Барра (EBV) связывает и перемещает рибосомный белок L22 в EBV-инфицированные B-лимфоциты человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (8): 3463–3467. Дои:10.1073 / пнас.91.8.3463. ЧВК  43597. PMID  8159770.
  8. ^ Ли Н., Пимиента Дж., Стейтц Дж. А. (ноябрь 2012 г.). «AUF1 / hnRNP D является новым белком-партнером некодирующей РНК EBER1 вируса Эпштейна-Барра». РНК. 18 (11): 2073–2082. Дои:10.1261 / rna.034900.112. ЧВК  3479396. PMID  23012480.
  9. ^ Мосс В.Н., Ли Н., Пимиента Дж., Стейтц Дж. А. (20 декабря 2013 г.). «Семейства РНК в вирусе Эпштейна-Барра». РНК Биология. 11 (1): 10–17. Дои:10.4161 / rna.27488. ЧВК  3929418. PMID  24441309.

внешняя ссылка