Geobacter Metallireducens - Geobacter metallireducens
Geobacter Metallireducens | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Учебный класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | G. Metallireducens |
Биномиальное имя | |
Geobacter Metallireducens Lovley et al. 1995 г. |
Geobacter Metallireducens это грамотрицательный металлорежущий протеобактерии.[1] Это строгий анаэроб, окисляющий несколько короткоцепочечных жирные кислоты, спирты, и моноароматический соединения с Fe (III) как единственный акцептор электронов.[2] Он также может использовать уран для его роста и преобразовать U (VI) в U (IV).[3]
Geobacter Metallireducens был обнаружен Дереком Ловли в UMass Amherst в 1993 г.[1] Это бактерии, восстанавливающие железо, и считалось, что этот микроб можно использовать для обработки промышленных участков, на которых образовались «комплексы цианид-металл», чтобы загрязнить участок.[4] Geobacter Metallireducens при необходимости становится подвижным, образуя жгутик, который перемещается, когда условия окружающей среды становятся неблагоприятными. [4]
Геном Geobacter Metallireducens имеет длина хромосомы 3 997 420 б.п. Оно имеет круговая бактериальная хромосома, что означает отсутствие свободных концов ДНК. По форме примерно как яйцо.[5] Geobacter Metallireducens также есть Содержимое GC 59,51%.[5] В плазмида имеет более низкий Содержимое GC, 52,48% и длиной 13 762 п.н. Плазмида кодирует стабилизирующий белок RelE / ParE, который позволяет Geobacter Metallireducens адаптироваться и процветать в различных и новых условиях окружающей среды.[6]
G. Metallireducens было продемонстрировано сокращение хлорамфеникол (CAP) для завершения дехлорирования продуктов в условиях чистой культуры. Исследования с использованием циклических вольтамперограммы и хроноамперометрия показали, что бактерии демонстрируют отрицательную корреляцию эффективности удаления CAP с начальными дозами CAP, показывая потенциальное применение организмом биоремедиация в средах, загрязненных антибиотиками.[7]
Рекомендации
- ^ а б Ловли Д.Р., Джованнони С.Дж., Белый округ Колумбия, Чампин Дж. Э., Филлипс Э. Дж., Горби Ю. А., Гудвин С. (1993). «Geobacter Metallireducens gen. Nov. Sp. Nov., Микроорганизм, способный сочетать полное окисление органических соединений с восстановлением железа и других металлов». Архив микробиологии. 159 (4): 336–344. Дои:10.1007 / BF00290916. PMID 8387263.
- ^ Tremblay PL, Aklujkar M, Leang C, Nevin KP, Lovley D (февраль 2012 г.). «Генетическая система для Geobacter Metallireducens: роль флагеллина и пилина в восстановлении оксида Fe (III)». Отчеты по экологической микробиологии. 4 (1): 82–88. Дои:10.1111 / j.1758-2229.2011.00305.x. PMID 23757233.
- ^ Корибаникс Н.М., Туорто С.Дж., Лопес-Чиаффарелли Н., МакГиннесс Л.Р., Хэггблом М.М., Уильямс К.Х., Лонг ЧП, Керкхоф Л.Дж. (2015). «Пространственное распределение дышащих ураном бета-протеобактерий на полевых исследованиях в Рифле, штат Колорадо». PLOS ONE. 10 (4): e0123378. Bibcode:2015PLoSO..1023378K. Дои:10.1371 / journal.pone.0123378. ЧВК 4395306. PMID 25874721.
- ^ а б Чайлдерс С.Е., Чиуфо С., Ловли Д.Р. (апрель 2002 г.). «Geobacter Metallireducens получает доступ к нерастворимому оксиду Fe (III) путем хемотаксиса». Природа. 416 (6882): 767–769. Bibcode:2002Натура 416..767С. Дои:10.1038 / 416767a. PMID 11961561.
- ^ а б Аклужкар М., Крушкал Дж., ДиБартоло Дж., Лапидус А., Лэнд М.Л., Ловли Д.Р. (май 2009 г.). «Последовательность генома Geobacter Metallireducens: особенности метаболизма, физиологии и регуляции, общие и отличные от Geobacter sulfatereducens». BMC Microbiology. 9: 109. Дои:10.1186/1471-2180-9-109. ЧВК 2700814. PMID 19473543.
- ^ Анантараман В., Аравинд Л. (2003). «Новые связи в прокариотической сети токсин-антитоксин: связь с эукариотической системой распада РНК, опосредованной нонсенсом». Геномная биология. 4 (12): R81. Дои:10.1186 / gb-2003-4-12-r81. ЧВК 329420. PMID 14659018.
- ^ Xu, H., Xiao, L., Zheng, S. et al. «Восстановительное разложение хлорамфеникола с помощью Geobacter Metallireducens». Sci. China Technol. Sci. 62, 1688–1694 (2019). Дои:10.1007 / s11431-018-9415-2
дальнейшее чтение
- Эйкхофф М., Биргель Д., Талбот Х.М., Пекманн Дж., Капплер А. (2013). «Бактериогопаноидный инвентарь Geobacter surreducens и Geobacter Metallireducens». Органическая геохимия. 58: 107–114. Дои:10.1016 / j.orggeochem.2013.02.013. ISSN 0146-6380.
- Schleinitz KM, Schmeling S, Jehmlich N, von Bergen M, Harms H, Kleinsteuber S, Vogt C, Fuchs G (июнь 2009 г.). «Разложение фенола в строго анаэробной железоредуцирующей бактерии Geobacter Metallireducens GS-15». Прикладная и экологическая микробиология. 75 (12): 3912–3919. Дои:10.1128 / AEM.01525-08. ЧВК 2698347. PMID 19376902.
- Zhang T, Tremblay PL, Chaurasia AK, Smith JA, Bain TS, Lovley DR (22 мая 2014 г.). «Идентификация генов, специально необходимых для анаэробного метаболизма бензола у Geobacter Metallireducens». Границы микробиологии. 5: 245. Дои:10.3389 / fmicb.2014.00245. ЧВК 4033198. PMID 24904558.