Руководство по фармакологии - Guide to Pharmacology

IUPHAR / BPS Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ
Содержание
Описание	Интернет-портал с открытым доступом к фармакологической информации обо всех мишенях рецептурных лекарств для людей
Типы данных; захвачен	Номенклатура мишеней, фармакологические данные, структуры лигандов
Организмы	Человек, Мышь, Крыса
Контакт
Исследовательский центр	Эдинбургский университет, Великобритания
Основное цитирование	Руководство IUPHAR / BPS по ФАРМАКОЛОГИИ на 2020 год: расширение содержания иммунофармакологии и введение Руководства IUPHAR / MMV по ФАРМАКОЛОГИИ МАЛЯРИИ
Доступ
Интернет сайт	www.guidetopharmacology.org
веб-сервис URL	www.guidetopharmacology.org/ webServices.jsp
Sparql конечная точка	rdf.guidetopharmacology.org/ sparql
Разное
Управление версиями	Контент обновляется примерно раз в квартал (например, в 2020.2 указывается [год]. [Номер выпуска])
Политика курирования	Руководство, внутри компании

В IUPHAR / BPS Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ является открытый доступ веб-сайт, служащий порталом для информации о биологических мишенях лицензионных препаратов и других малых молекул. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ (стандартное сокращение - GtoPdb) разработано как совместное предприятие Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии (IUPHAR) и Британское фармакологическое общество (БПС). Это заменяет и расширяет исходную базу данных IUPHAR 2009 г. (стандартное сокращение IUPHAR-DB). Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ направлено на предоставление краткого обзора всех фармакологических мишеней, доступного для всех членов научного и клинического сообществ и заинтересованной общественности, со ссылками на подробную информацию по выбранному набору мишеней. Представленная информация включает фармакологические данные, номенклатуру мишеней и генов, а также тщательно подобранную химическую информацию для лигандов. Включены обзоры и комментарии по каждому целевому семейству со ссылками на ключевые ссылки.

Предпосылки и развитие

Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ было первоначально размещено в Интернете в декабре 2011 года, а дополнительные материалы были выпущены в июле 2012 года. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ, поддерживаемое группой кураторов из Эдинбургского университета, разработано международной сетью участников, включая редакторов журнала в Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ. Как и в случае с исходной IUPHAR-DB, Комитет Международного союза фундаментальной и клинической фармакологии (IUPHAR) по номенклатуре рецепторов и классификации лекарственных средств (NC-IUPHAR) выступает в качестве научного консультативного и редакционного совета базы данных. Его сеть из более чем 500 специализированных консультантов (организованных в ~ 90 подкомитетов) делится своими знаниями и данными. Текущий ИП и обладатель гранта проекта GtoPdb - проф. Джейми А. Дэвис. Разработка и выпуск первой версии GtoPdb в 2012 году описывались в редакционной статье, опубликованной в Британский журнал фармакологии под названием «Путеводитель по Pharmacology.org - обновление».^[2] IUPHAR-DB больше не разрабатывается, и вся информация, содержащаяся на этом сайте, теперь доступна через Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ (ссылки IUPHAR-DB теперь должны быть перенаправлены).

Содержание и особенности

В настоящее время в Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ включены следующие целевые группы:

Каталитические рецепторы
Ферменты
G-белковые рецепторы
Ионные каналы
Киназы
Ядерные рецепторы
Транспортеры
Другие белковые мишени, включая белки, связывающие жирные кислоты, сигма рецепторы и рецепторы адипонектина

Информация для каждой целевой группы подразделяется на семьи на основе классификации, с отдельной страницей данных для каждой семьи. На каждой странице мишени организованы в списки таблиц, причем каждая таблица включает номенклатуру белков и генов для мишени со ссылками на базы данных номенклатуры генов и перечисляет выбранные лиганды с активностью в отношении мишени, включая агонисты, антагонисты, ингибиторы и радиолиганды. Приведены фармакологические данные и ссылки, и каждый лиганд связан гиперссылкой на страницу лигандов, отображающую номенклатуру и химическую структуру или пептидную последовательность, а также синонимы и соответствующие ссылки на базу данных. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ также включает список всех молекул лигандов, представленных на сайте, разделенных на категории, включая малые органические молекулы (включая молекулы млекопитающих). метаболиты, гормоны и нейротрансмиттеры ), синтетические органические молекулы, натуральные продукты, пептиды, неорганические молекулы и антитела. Полный список всех одобренных препаратов, представленный на сайте, также доступен через список лигандов. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ расширяется за счет включения клинической информации о мишенях и лигандах в дополнение к образовательным ресурсам. Функции поиска на веб-сайте включают возможности быстрого и расширенного поиска, а также поиск рецепторов и лигандов, включая поддержку структур лигандов с использованием химических структур. Другие функции включают в себя новости «Горячие темы» и недавний список сочетаний рецептор-лиганд.

Руководство ИЮФАР по ИММУНОФАРМАКОЛОГИИ

В период с ноября 2015 г. по октябрь 2018 г. Wellcome Trust поддержал проект по развитию Руководство ИЮФАР по ИММУНОФАРМАКОЛОГИИ (GtoImmuPdb), основанный на схеме GtoPdb. GtoImmuPdb - это ресурс с открытым доступом, который привносит иммунологическую перспективу в высококачественные, тщательно отобранные экспертами фармакологические данные, содержащиеся в существующем Руководстве IUPHAR / BPS по ФАРМАКОЛОГИИ. Белковые мишени и лиганды, относящиеся к иммунофармакологии, были помечены и внесены в GtoImmuPdb. Они также были связаны с новыми типами иммунологических данных, такими как иммунологические процессы, типы клеток и болезни. GtoImmuPdb предоставляет базу знаний, которая связывает иммунологию с фармакологией, принося дополнительную пользу и поддерживая исследования и разработку лекарств, направленных на модуляцию иммунных, воспалительных или инфекционных компонентов заболевания.^[3]

Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ

Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ включает в себя онлайн-версию базы данных открытого доступа Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ, ранее "Путеводитель по рецепторам и каналам"^[4] доступны в форматах HTML, PDF и в печатном виде. Резюме онлайн-базы данных в печатном виде публикуется как Краткое руководство по фармакологии 2017/2018 ^[5] в виде серии статей как двухгодичного приложения к Британский журнал фармакологии.

Ссылки на базу данных

Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ включает ссылки на другие релевантные ресурсы через целевые страницы и страницы-лиганды как на кратких, так и на подробных страницах просмотра. Многие из этих ресурсов поддерживают взаимные ссылки на соответствующие страницы Руководства по ФАРМАКОЛОГИИ.

Будущие направления

После финансирования со стороны Wellcome Trust, с 2012 по 2015 год Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ было расширено, чтобы включить в него биологические цели всех рецептурных препаратов и другие вероятные цели будущих низкомолекулярных препаратов. На страницах сводных представлений представлены обзоры ключевых характеристик широкого диапазона целей, а на страницах подробных представлений представлена более подробная информация о свойствах выбранного подмножества целей. По состоянию на январь 2018 г. Лекарства от малярии Venture поддерживает новое расширение для разработки Руководство по фармакологии малярии. Ядро GtoPdb продолжает поддерживаться Британское фармакологическое общество.

Смотрите также

внешняя ссылка

[1] Армстронг, JF; Faccenda, E; Harding, SD; Поусон, AJ; Саутан, К; Шарман, JL; Кампо, Б; Кавана, Д.Р .; Александр, SPH; Давенпорт, AP; Спеддинг, М; Дэвис, Джеймс (8 января 2020 г.). «Руководство IUPHAR / BPS по ФАРМАКОЛОГИИ на 2020 год: расширение содержания иммунофармакологии и представление Руководства IUPHAR / MMV по ФАРМАКОЛОГИИ МАЛЯРИИ». Исследования нуклеиновых кислот. 48 (D1): D1006 – D1021. Дои:10.1093 / нар / gkz951. ЧВК 7145572. PMID 31691834.

[pmid-2] Александр, С.П .; Benson, H.E .; Davenport, A .; Mathie, A .; McGrath, I.J .; Pawson, A.J .; Peters, J. A .; Sharman, J. L .; Спеддинг, М .; Хармар, А. Дж. (2012). «GuideToPharmacology.org - обновление». Британский журнал фармакологии. 167 (4): 697–698. Дои:10.1111 / j.1476-5381.2012.02141.x. ЧВК 3575771. PMID 23003568.

[3] Harding, SD; Faccenda, E; Саутан, С; Maffia, P; Дэвис, Дж. А. (декабрь 2018 г.). «Новое руководство по иммунофармакологии». Обзоры природы. Иммунология. 18 (12): 729. Дои:10.1038 / s41577-018-0079-2. PMID 30327546.

[4] Александр, ИП; Мэти, А; Петерс, Дж. А. (ноябрь 2011 г.). "Руководство по рецепторам и каналам (GRAC), 5-е издание". Британский журнал фармакологии. 164 Дополнение 1: S1–324. Дои:10.1111 / j.1476-5381.2011.01649_1.x. ЧВК 3315626. PMID 22040146.

[5] Александр, ИП; Келли, Э; Marrion, NV; Peters, JA; Faccenda, E; Harding, SD; Поусон, AJ; Шарман, JL; Саутан, К; Бунеман, ОП; Cidlowski, JA; Christopoulos, A; Давенпорт, AP; Fabbro, D; Спеддинг, М; Стриссниг, Дж; Дэвис, JA; CGTP, Соавторы. (Декабрь 2017 г.). «Краткое руководство по фармацевтике 2017/18: Обзор». Британский журнал фармакологии. 174 Приложение 1: S1 – S16. Дои:10.1111 / bph.13882. ЧВК 5650665. PMID 29055037.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]