GvpA - Википедия - GvpA
gvpA белок синтеза газовых пузырьков GvpA | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Организм | |||||||
Символ | gvpA | ||||||
Entrez | 1446785 | ||||||
RefSeq (Prot) | NP_045970.1 | ||||||
UniProt | P08958 | ||||||
Прочие данные | |||||||
Хромосома | Геном: 0,02 - 0,02 Мб | ||||||
|
GvpA | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | GvpA | ||||||||
Pfam | PF00741 | ||||||||
ИнтерПро | IPR000638 | ||||||||
PROSITE | PDOC00207 | ||||||||
|
GvpA это газовый пузырек структурный белок найдено в разных тип из бактерии и археи например в Halobacterium salinarum или же Haloferax mediterranei. Газовые пузырьки мелкие, полые, наполненные газом белковые структуры найдено в нескольких цианобактериальный и архебактериальные микроорганизмы.[1] Они позволяют позиционировать бактерии на подходящей глубине для рост.
GvpA связывается с GvpC для создания газовых пузырьков, полых белковых структур, которые используются планктонный организмов для выполнения вертикальной миграции. GvpA составляет большую часть структуры, так называемых «ребер», жестких β-листы, тогда как GvpC стабилизирует везикулу от коллапса путем сшивания, как α-спирали.[2][3][4]
Последовательность
В последовательность GVPa очень хорошо консервированный. GvpJ и gvpM, два белки закодирован в кластере гены необходим для синтеза газовых пузырьков в архебактерии Halobacterium salinarium и Halobacterium mediterranei (Haloferax mediterranei), были обнаружены [5] быть эволюционно связанные с GVPa. Точная функция этих двух белки неизвестно, хотя они могут быть важны для определения форма определение газовых пузырьков. В N-концевой домен из Афанизоменон flos-aquae белок gvpA / J также связан с GVPa.
Структура
GvpA из Halobacterium salinarum представляет собой гидрофобный мономер длиной 8 кДа из 76 аминокислот.[3]
Газовые везикулы представляют собой полые цилиндрические трубки, закрытые полыми коническими крышками с каждого конца. И конические торцевые крышки, и центральные цилиндр состоят из 4-5 нм широкие ребра, идущие под прямым углом к длинной оси конструкции. Газ пузырьки по-видимому, состоят из двух разных белковых компонентов, GVPa и GVPc. GVPa, небольшой белок около 70 аминокислота остатков, является основным компонентом газовых везикул и формирует основное ядро структура.
Рекомендации
- ^ Уолсби А.Е., Хейс П.К. (декабрь 1989 г.). «Белки газовых везикул». Biochem. J. 264 (2): 313–22. Дои:10.1042 / bj2640313. ЧВК 1133585. PMID 2513809.
- ^ Энглерт С., Пфайфер Ф. (май 1993 г.). «Анализ экспрессии гена газовых везикул в Haloferax mediterranei показывает, что GvpA и GvpC являются структурными белками газовых везикул». J. Biol. Chem. 268 (13): 9329–36. PMID 7683649.
- ^ а б UniProt, UniProt GvpA из halobacterium salinarum.
- ^ Уолсби А.Е. (март 1994 г.). «Газовые пузырьки». Microbiol. Rev. 58 (1): 94–144. Дои:10.1128 / ммбр.58.1.94-144.1994. ЧВК 372955. PMID 8177173.
- ^ Джонс Дж. Г., Молодой округ Колумбия, DasSarma S (июнь 1991 г.). «Структура и организация кластера генов газовых везикул на плазмиде Halobacterium halobium pNRC100». Ген. 102 (1): 117–22. Дои:10.1016 / 0378-1119 (91) 90549-Q. PMID 1864501.