GvpA - Википедия - GvpA

gvpA белок синтеза газовых пузырьков GvpA
Идентификаторы
ОрганизмHalobacterium salinarum
NRC-1
СимволgvpA
Entrez1446785
RefSeq (Prot)NP_045970.1
UniProtP08958
Прочие данные
ХромосомаГеном: 0,02 - 0,02 Мб
GvpA
Идентификаторы
СимволGvpA
PfamPF00741
ИнтерПроIPR000638
PROSITEPDOC00207

GvpA это газовый пузырек структурный белок найдено в разных тип из бактерии и археи например в Halobacterium salinarum или же Haloferax mediterranei. Газовые пузырьки мелкие, полые, наполненные газом белковые структуры найдено в нескольких цианобактериальный и архебактериальные микроорганизмы.[1] Они позволяют позиционировать бактерии на подходящей глубине для рост.

GvpA связывается с GvpC для создания газовых пузырьков, полых белковых структур, которые используются планктонный организмов для выполнения вертикальной миграции. GvpA составляет большую часть структуры, так называемых «ребер», жестких β-листы, тогда как GvpC стабилизирует везикулу от коллапса путем сшивания, как α-спирали.[2][3][4]

Последовательность

В последовательность GVPa очень хорошо консервированный. GvpJ и gvpM, два белки закодирован в кластере гены необходим для синтеза газовых пузырьков в архебактерии Halobacterium salinarium и Halobacterium mediterranei (Haloferax mediterranei), были обнаружены [5] быть эволюционно связанные с GVPa. Точная функция этих двух белки неизвестно, хотя они могут быть важны для определения форма определение газовых пузырьков. В N-концевой домен из Афанизоменон flos-aquae белок gvpA / J также связан с GVPa.

Структура

GvpA из Halobacterium salinarum представляет собой гидрофобный мономер длиной 8 кДа из 76 аминокислот.[3]

Газовые везикулы представляют собой полые цилиндрические трубки, закрытые полыми коническими крышками с каждого конца. И конические торцевые крышки, и центральные цилиндр состоят из 4-5 нм широкие ребра, идущие под прямым углом к ​​длинной оси конструкции. Газ пузырьки по-видимому, состоят из двух разных белковых компонентов, GVPa и GVPc. GVPa, небольшой белок около 70 аминокислота остатков, является основным компонентом газовых везикул и формирует основное ядро структура.

Рекомендации

  1. ^ Уолсби А.Е., Хейс П.К. (декабрь 1989 г.). «Белки газовых везикул». Biochem. J. 264 (2): 313–22. Дои:10.1042 / bj2640313. ЧВК  1133585. PMID  2513809.
  2. ^ Энглерт С., Пфайфер Ф. (май 1993 г.). «Анализ экспрессии гена газовых везикул в Haloferax mediterranei показывает, что GvpA и GvpC являются структурными белками газовых везикул». J. Biol. Chem. 268 (13): 9329–36. PMID  7683649.
  3. ^ а б UniProt, UniProt GvpA из halobacterium salinarum.
  4. ^ Уолсби А.Е. (март 1994 г.). «Газовые пузырьки». Microbiol. Rev. 58 (1): 94–144. Дои:10.1128 / ммбр.58.1.94-144.1994. ЧВК  372955. PMID  8177173.
  5. ^ Джонс Дж. Г., Молодой округ Колумбия, DasSarma S (июнь 1991 г.). «Структура и организация кластера генов газовых везикул на плазмиде Halobacterium halobium pNRC100». Ген. 102 (1): 117–22. Дои:10.1016 / 0378-1119 (91) 90549-Q. PMID  1864501.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR000638