Halorhodospira halophila - Halorhodospira halophila

Halorhodospira halophila
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Класс:
Гаммапротеобактерии
Порядок:
Chromatiales
Семья:
Ectothiorhodospiraceae
Род:
Halorhodospira
Виды:
H. halophila
Биномиальное имя
Halorhodospira halophila
(Раймонд и Систром 1969) Имхофф и Сюлинг 1997[1]

Halorhodospira halophila это вид Halorhodospira, который отличается своей способностью оптимально расти в среде с соленостью 15–20%. Раньше это называлось Ectothiorhodospira halophila. Это анаэробная палочковидная грамотрицательная бактерия. H. halophila имеет жгутик.

Общие особенности

H. halophila среди самых галофильный известные организмы. Это обязательно фотосинтетический и анаэробный пурпурная серная бактерия спиральной морфологии. H. halophila демонстрирует автотрофный рост в насыщенных концентрациях NaCl. H. halophila является грамотрицательной бактерией внутри гамма-подразделения филума Proteobacteria и, как известно, фототрофный (Класс: гаммапротеобактерии). H. halophila была первый фототрофный экстремальный галофил, геном которого секвенирован. Геном состоит из 2 678 452 п.н., кодирующих 2493 предсказанных гена, как было определено с помощью автоматической аннотации генома. На основе этого генома предсказано 2407 белков, и 1905 были назначены предполагаемые функции.[2]H. halophila производит органические растворенные вещества, такие как глицин, бетаин и эктоин, чтобы сбалансировать осмотическое давление. Каждая бактерия имеет жгутик.[3] Рост был продемонстрирован в гиперсоленых средах, таких как пруды-кристаллизаторы, которые имеют соленость 25% или выше.[4]

Метаболизм

H. halophila окисляет сульфид к сера, который откладывается вне клетки и далее окисляется до сульфат.

H. halophila содержит большое количество метаболических путей, таких как гликолиз, цитратный цикл и метаболизм аминокислот. Его способность к фотоавтотрофный рост в экстремальных условиях, и он отличается характерным для него метаболизмом серы. Протеом H. halophila очень кислая. Бактерия имеет низкое содержание калия в цитоплазме даже при выращивании в среде с высоким содержанием калия. KCl концентрации, как было установлено с помощью рентгеновского микроанализа и эмиссионной спектрометрии плазмы.[5] H. halophila не вызывает известных заболеваний.

Приложения

H. halophila может сыграть важную роль в производстве водорода, поскольку газообразный водород является побочным продуктом азотфиксация катализируется его нитрогеназой. H. halophila также служит для производства органических растворенных веществ, таких как глицин, бетаин, эктоин и трегалоза.

Фотоактивный желтый белок, PYP, датчик синего света от бактерии H. halophila.[6] Фотоактивные белки, такие как PYP, обычно считаются модельными системами для изучения формирования сигнального состояния белков.

использованная литература

  1. ^ Parte, A.C. «Халорходоспира». LPSN.
  2. ^ Challacombe, Жан Ф .; Маджид, София; Деоле, Ратнакар; Brettin, Thomas S .; Брюс, Дэвид; Делано, Сусана Ф .; Деттер, Джон С .; Gleasner, Cheryl D .; Han, Cliff S .; Мисра, Моника; Reitenga, Krista G .; Михайлова Наталья; Войке, Таня; Питлак, Сэм; Нолан, Мэтт; Земля, Мириам Л .; Сондерс, Элизабет; Тапиа, Роксана; Лапидус, Алла; Иванова Наталья; Хофф, Воутер Д. (2013). «Полная последовательность генома Halorhodospira halophila SL1». Стандарты геномных наук. 8 (2): 206–214. Дои:10.4056 / sigs.3677284. ЧВК  3746430. PMID  23991253.
  3. ^ «HAMAP: Halorhodospira halophila (штамм DSM 244 / SL1) (Ectothiorhodospira halophila (штамм DSM 244 / SL1)) полный протеом Сервер ExPASy Proteomics. Швейцарский институт биоинформатики[постоянная мертвая ссылка ] http://hamap.expasy.org/proteomes/HALHL.html
  4. ^ Antón, J; Росселло-Мора, Р. Родригес-Валера, Ф; Аманн, Р. (2000). «Чрезвычайно галофильные бактерии в прудах-кристаллизаторах из солнечных солончаков». Прикладная и экологическая микробиология. 66 (7): 3052–3057. Дои:10.1128 / aem.66.7.3052-3057.2000. ЧВК  92110. PMID  10877805.
  5. ^ Ратнакар; Challacombe, Жан; Raiford, Douglas W .; Хофф, Воутер Д. (2013). «Чрезвычайно галофильные Proteobacterium сочетают в себе высококислотный протеом с низким содержанием цитоплазматического калия». Журнал биологической химии. 288 (1): 581–588. Дои:10.1074 / jbc.M112.420505. ЧВК  3537055. PMID  23144460.
  6. ^ van Wilderen, LJ; ван дер Хорст, Массачусетс; van Stokkum, IH; Hellingwerf, KJ; van Grondelle, R; Грут, ML (2006). «Сверхбыстрая инфракрасная спектроскопия открывает ключевой шаг для успешного включения фотоактивного желтого белка в фотоцикл». Труды Национальной академии наук. 103 (41): 15050–15055. Bibcode:2006ПНАС..10315050В. Дои:10.1073 / pnas.0603476103. ЧВК  1940041. PMID  17015839.

внешние ссылки