LDB3 - LDB3

LDB3
Белок LDB3 PDB 1rgw.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLDB3, CMD1C, CMPD3, CYPHER, LDB3Z1, LDB3Z4, LVNC3, MFM4, ORACLE, PDLIM6, ZASP, CMH24, связывание домена LIM 3
Внешние идентификаторыOMIM: 605906 MGI: 1344412 ГомолоГен: 134626 Генные карты: LDB3
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение LDB3
Геномное расположение LDB3
Группа10q23.2Начинать86,668,449 бп[1]
Конец86,736,068 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE LDB3 213717 в формате fs.png

PBB GE LDB3 216887 s в формате fs.png

PBB GE LDB3 213371 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

11155

24131

Ансамбль

ENSG00000122367

ENSMUSG00000021798

UniProt

O75112

Q9JKS4

RefSeq (мРНК)
RefSeq (белок)
Расположение (UCSC)Chr 10: 86.67 - 86.74 МбChr 14: 34,53 - 34,59 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Привязка домена LIM 3 (LDB3), также известный как Z-полоса, альтернативно склеенная PDZ-мотив (ЗАСП), это белок который у человека кодируется LDB3 ген.[5][6] ZASP принадлежит к подсемейству белков Enigma и стабилизирует саркомер (основные единицы мышц) во время сокращения, посредством взаимодействия с актин в сердечный и скелетные мышцы. Мутации в гене ZASP были связаны с несколькими мышечные заболевания.

Структура

ЗАСП - это PDZ домен -содержащий белок. Мотивы PDZ представляют собой модульные домены белок-белкового взаимодействия, состоящие из 80-120 аминокислотных остатков. Белки, содержащие домен PDZ, взаимодействуют друг с другом в цитоскелет сборки или с другими белками, участвующими в нацеливании и кластеризации мембранных белков. ЗАСП взаимодействует с альфа-актинин -2 через его N-концевой PDZ и с протеинкиназа C через его C-терминал LIM домены. Домен LIM - это цистеин -богатый мотив, состоящий из 50-60 аминокислот, содержащий два цинк-связывающих модуля. Этот белок также взаимодействует со всеми тремя членами миозенин семья.[5]

ZASP человека может существовать в клетках сердца и скелета в виде шести различных изоформ, основанных на альтернативном сплайсинге 16 экзонов.[7] Существует 2 короткие формы ZASP (Uniprot ID: O75112-6, 31,0 кДа, 283 аминокислоты;[8] и Uniprot ID: O75112-5, 35,6 кДа, 330 аминокислот);[9] и 4 длинные формы ZASP (Uniprot ID: O75112-4, 42,8 кДа, 398 аминокислот;[10] Uniprot ID: O75112-3, 50,6 кДа, 470 аминокислот;[11] Uniprot ID: O75112-2, 66,6 кДа, 617 аминокислот;[12] и Uniprot ID: O75112, 77,1 кДа, 727 аминокислот).[13][14] Все изоформы ZASP имеют N-концевой PDZ домен; внутренние консервативные последовательности, известные как ZASP-подобные мотивы (ZM); и четыре длинные изоформы имеют три C-терминал LIM домены.[7]

Функция

ZASP поддерживает структурную целостность саркомеров во время сокращения и, как было показано, участвует в протеинкиназа А сигнализация.[15] Также было показано, что ZASP активирует интегрины α5β1 вместе с белком. TLN1.[16]

Клиническое значение

Мутации в ZASP были связаны с миофибрилла миопатия,[17] дилатационная кардиомиопатия,[18][19][20] аритмогенная кардиомиопатия правого желудочка,[21] некомпактная кардиомиопатия,[20][22] и мышечная дистрофия.[17]

Взаимодействия

В PDZ домен ZASP связывает C-конец из альфа-актинин-2[23][24] и ZM связывают стержневой домен альфа-актинин-2.[25] В LIM домены было показано, что они взаимодействуют с протеинкиназа C.[24][26] Специфическая для сердца область ZASP, кодируемая экзоном 4, включает мотив ZP и связывает регуляторную субъединицу протеинкиназа А.[15]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000122367 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021798 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б "Ген Entrez: связывание домена LIM LDB3 3".
  6. ^ Faulkner G, Pallavicini A, Formentin E, Comelli A, Ievolella C, Trevisan S, Bortoletto G, Scannapieco P, Salamon M, Mouly V, Valle G, Lanfranchi G (июль 1999). «ZASP: новый белок с альтернативным сплайсингом с Z-полосой PDZ». J. Cell Biol. 146 (2): 465–75. Дои:10.1083 / jcb.146.2.465. ЧВК  3206570. PMID  10427098.
  7. ^ а б Шейх Ф., Банг М.Л., Ланге С., Чен Дж. (Ноябрь 2007 г.). ""Z "углубляется в роль Cypher в функции поперечно-полосатых мышц, передаче сигналов и болезнях человека". Тенденции в сердечно-сосудистой медицине. 17 (8): 258–62. Дои:10.1016 / j.tcm.2007.09.002. ЧВК  2134983. PMID  18021935.
  8. ^ "O75112-6".
  9. ^ "O75112-5".
  10. ^ "O75112-4".
  11. ^ «О75112-3».
  12. ^ "О75112-2".
  13. ^ "O75112".
  14. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
  15. ^ а б Лин Ц, Го Х, Ланге С., Лю Дж, Оуян К., Инь Икс, Цзян Л., Цай И, Му И, Шейх Ф, Йе С, Чен Дж, Ке И, Ченг Х (октябрь 2013 г.). «Cypher / ZASP - новый якорь для А-киназы». Журнал биологической химии. 288 (41): 29403–13. Дои:10.1074 / jbc.M113.470708. ЧВК  3795241. PMID  23996002.
  16. ^ Bouaouina M, Jani K, Long JY, Czerniecki S, Morse EM, Ellis SJ, Tanentzapf G, Schöck F, Calderwood DA (декабрь 2012 г.). «Zasp регулирует активацию интегрина». Журнал клеточной науки. 125 (Pt 23): 5647–57. Дои:10.1242 / jcs.103291. ЧВК  3575701. PMID  22992465.
  17. ^ а б Селцен Д., Энгель АГ (февраль 2005 г.). «Мутации в ZASP определяют новую форму мышечной дистрофии у людей». Анналы неврологии. 57 (2): 269–76. Дои:10.1002 / ana.20376. PMID  15668942. S2CID  25733755.
  18. ^ Ватта М., Мохапатра Б., Хименес С., Санчес Х, Фолкнер Дж., Перлес З, Синагра Дж, Лин Дж. Х., Ву TM, Чжоу К., Боулз К. Р., Ди Ленарда А., Шимменти Л., Фокс М., Криско М. А., Мерфи Р. Т., Маккенна У, Эллиотт П., Боулз Н. Э., Чен Дж., Валле Дж., Таубин Дж. А. (декабрь 2003 г.). «Мутации в Cypher / ZASP у пациентов с дилатационной кардиомиопатией и некомпактностью левого желудочка». Журнал Американского колледжа кардиологии. 42 (11): 2014–27. Дои:10.1016 / j.jacc.2003.10.021. PMID  14662268.
  19. ^ Аримура Т., Хаяси Т., Терада Х, Ли Си, Чжоу К., Такахаши М., Уэда К., Нучи Т., Хохда С., Шибутани М., Хиросе М., Чен Дж., Пак Джей Э., Ясунами М., Хаяси Х, Кимура А. (февраль 2004 г. ). «Мутация Cypher / ZASP, связанная с дилатационной кардиомиопатией, изменяет аффинность связывания с протеинкиназой C». Журнал биологической химии. 279 (8): 6746–52. Дои:10.1074 / jbc.M311849200. PMID  14660611.
  20. ^ а б Ватта М., Мохапатра Б., Хименес С., Санчес Х, Фолкнер Г., Перлес З, Синагра Дж, Лин Дж. Х., Ву TM, Чжоу К., Боулз К. Р., Ди Ленарда А., Шимменти Л., Фокс М., Криско М. А., Мерфи Р. Т., Маккенна У, Эллиотт П., Боулз Н. Э., Чен Дж., Валле Дж., Таубин Дж. А. (декабрь 2003 г.). «Мутации в Cypher / ZASP у пациентов с дилатационной кардиомиопатией и некомпактностью левого желудочка». Журнал Американского колледжа кардиологии. 42 (11): 2014–27. Дои:10.1016 / j.jacc.2003.10.021. PMID  14662268.
  21. ^ Лопес-Айяла Дж. М., Ортис-Дженга М, Гомес-Миланес I, Лопес-Куэнка Д., Руис-Эспехо Ф., Санчес-Муньос Дж. Дж., Олива-Сандовал М. Дж., Монсеррат Л., Химено Дж. Р. (июль 2014 г.). «Мутация в белке Cypher / ZASP Z-линии связана с аритмогенной кардиомиопатией правого желудочка». Клиническая генетика. 88 (2): 172–6. Дои:10.1111 / cge.12458. PMID  25041374. S2CID  21822009.
  22. ^ Xi Y, Ai T, De Lange E, Li Z, Wu G, Brunelli L, Kyle WB, Turker I, Cheng J, Ackerman MJ, Kimura A, Weiss JN, Qu Z, Kim JJ, Faulkner G, Vatta M (октябрь 2012). «Потеря функции hNav1.5 из-за мутации ZASP1, связанной с нарушениями внутрижелудочковой проводимости при некомпактности левого желудочка». Кровообращение: аритмия и электрофизиология. 5 (5): 1017–26. Дои:10.1161 / CIRCEP.111.969220. ЧВК  4331025. PMID  22929165.
  23. ^ Faulkner G, Pallavicini A, Formentin E, Comelli A, Ievolella C, Trevisan S, Bortoletto G, Scannapieco P, Salamon M, Mouly V, Valle G, Lanfranchi G (июль 1999 г.). «ZASP: новый белок с альтернативным сплайсингом с Z-полосой PDZ». Журнал клеточной биологии. 146 (2): 465–75. Дои:10.1083 / jcb.146.2.465. ЧВК  3206570. PMID  10427098.
  24. ^ а б Чжоу К., Руис-Лозано П., Мартоне М.Э., Чен Дж. (Июль 1999 г.). «Cypher, ограниченный поперечнополосатыми мышцами белок, содержащий PDZ и LIM домен, связывается с альфа-актинином-2 и протеинкиназой C». Журнал биологической химии. 274 (28): 19807–13. Дои:10.1074 / jbc.274.28.19807. PMID  10391924.
  25. ^ Клаавуниеми Т., Юленне Дж. (Май 2006 г.). «Фрагменты, содержащие внутренний ZM-мотив Zasp / Cypher, достаточны для совместной локализации с альфа-актинином - анализ мутаций пациента». Экспериментальные исследования клеток. 312 (8): 1299–311. Дои:10.1016 / j.yexcr.2005.12.036. PMID  16476425.
  26. ^ Курода С., Токунага С., Киёхара Ю., Хигучи О, Кониси Х., Мидзуно К., Гилл Г. Н., Киккава Ю. (декабрь 1996 г.). «Белково-белковое взаимодействие LIM-доменов цинкового пальца с протеинкиназой C». Журнал биологической химии. 271 (49): 31029–32. Дои:10.1074 / jbc.271.49.31029. PMID  8940095.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.