Лактатдегидрогеназа А - Lactate dehydrogenase A

LDHA
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1I10, 4AJP, 4JNK, 4L4R, 4L4S, 4М49, 4OJN, 4OKN, 4QO7, 4QO8, 4QSM, 4QT0, 4R68, 4R69, 4RLS, 4ZVV
Идентификаторы
Псевдонимы	LDHA, GSD11, HEL-S-133P, LDH1, LDHM, PIG19, лактатдегидрогеназа A
Внешние идентификаторы	OMIM: 150000 MGI: 96759 ГомолоГен: 56495 Генные карты: LDHA
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	18,408,425 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	46,855,627 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• оксидоредуктазная активность, действующая на группу CH-OH доноров, NAD или NADP в качестве акцептора; • Привязка NAD; • активность лактатдегидрогеназы; • связывание киназы; • GO: 0001948 связывание с белками; • каталитическая активность; • идентичное связывание с белками; • оксидоредуктазная активность; • Активность L-лактатдегидрогеназы; • связывание кадгерина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • мембрана; • внеклеточная экзосома; • ядро клетки; • цитозоль;
Биологический процесс	• постэмбриональное развитие органов животных; • процесс обмена лактата; • ответ на гипоксию; • гликолитический процесс; • реакция на органическое циклическое соединение; • развитие черной субстанции; • реакция на питательные вещества; • метаболический процесс карбоновых кислот; • ответ на глюкозу; • Метаболический процесс НАД; • ответ на эстроген; • метаболический процесс пирувата; • положительная регуляция апоптотического процесса; • ответ на цАМФ; • окислительно-восстановительный процесс; • реакция на перекись водорода; • ответ на наркотик; • углеводный обмен;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3939
	16828
	ENSG00000134333; ENSG00000288299
	ENSMUSG00000063229
	P00338
	P06151
	NM_001135239; NM_001165414; NM_001165415; NM_001165416; NM_005566
	NM_001136069; NM_010699
	NP_001128711; NP_001158886; NP_001158887; NP_001158888; NP_005557
	NP_001129541; NP_034829
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Лактатдегидрогеназа А (LDHA) представляет собой фермент, который у человека кодируется LDHA ген.^[5] Это мономер Лактатдегидрогеназа b, который существует как тетрамер. Другая основная подгруппа - это лактатдегидрогеназа B (ЛДГБ).

Функция

Лактатдегидрогеназа А катализирует взаимное превращение пируват и я-лактат с сопутствующим взаимным превращением НАДН и НАД⁺. LDHA обнаружен в большинстве соматических тканей, но преимущественно в мышечной ткани и опухолях, и принадлежит к группе лактатдегидрогеназа семья. Давно известно, что многие виды рака человека имеют более высокие уровни LDHA по сравнению с нормальными тканями. Также было показано, что LDHA играет важную роль в развитии, инвазии и метастазировании злокачественных новообразований. Мутации в LDHA были связаны с физическими нагрузками. миоглобинурия.^[6]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.^{[§ 1]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{bSize}}} px | alt = Гликолиз и глюконеогенез редактировать ]]

Гликолиз и глюконеогенез редактировать

^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «ГликолизГлюконеогенез_WP534».

Модельные организмы

*Лдха* нокаутный фенотип мыши
Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Аномальный
Рецессивный смертельное исследование	Аномальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Аномальный^[7]
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Аномальный^[8]
Плазма иммуноглобулины	Нормальный
Гематология	Аномальный^[9]
Лимфоциты периферической крови	Нормальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Эпидермис хвоста цельный	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология головного мозга	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный^[10]
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный^[11]
Все тесты и анализы от^[12]^[13]

Модельные организмы были использованы при изучении функции LDHA. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Лдха^{tm1a (EUCOMM) Wtsi}^[14]^[15] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[16]^[17]^[18]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[12]^[19] Было проведено 27 испытаний на мутант мышей и пять значительных аномалий.^[12] Несколько гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши. Животные обоего пола имели аномальный химический состав плазмы, самцы также улучшились. толерантность к глюкозе и увеличился эритроцит ширина раздачи.^[12]

Ингибиторы LDHA

Было продемонстрировано, что следующие соединения подавлять фермент LDHA:

дальнейшее чтение

Миядзима Х., Симидзу Т., Канеко Э. (октябрь 1992 г.). «[Экспрессия гена при дефиците субъединицы лактатдегидрогеназы-А]». Риншо Синкэйгаку. 32 (10): 1087–92. PMID 1297552.
Судо К., Маэкава М., Сиоя М., Икеда К., Такахаши Н., Исогай И., Ли С.С., Канно Т., Мачида К., Торими Дж. (Сентябрь 1992 г.). «Молекулярный анализ генетической мутации в электрофоретическом варианте субъединицы A (M) лактатдегидрогеназы человека». Биохимия Интернэшнл. 27 (6): 1051–7. PMID 1445373.
Маэкава М., Судо К., Ли СС, Канно Т. (октябрь 1991 г.). «Анализ генетических мутаций при дефиците лактатдегидрогеназы-A (M) человека с использованием полиморфизма конформации ДНК в сочетании с полиакриламидным градиентным гелем и окрашиванием серебром». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 180 (2): 1083–90. Дои:10.1016 / S0006-291X (05) 81177-5. PMID 1953713.
Маэкава М., Судо К., Ли СС, Канно Т. (ноябрь 1991 г.). «Генотипический анализ семей с дефицитом лактатдегидрогеназы A (M) путем селективной амплификации ДНК». Генетика человека. 88 (1): 34–8. Дои:10.1007 / BF00204925. PMID 1959923. S2CID 19321774.
Scrable HJ, Johnson DK, Rinchik EM, Cavenee WK (март 1990 г.). «Локус, связанный с рабдомиосаркомой, и MYOD1 являются синтеническими, но отдельными локусами на коротком плече хромосомы 11 человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 87 (6): 2182–6. Bibcode:1990ПНАС ... 87.2182С. Дои:10.1073 / pnas.87.6.2182. ЧВК 53650. PMID 2315312.
Маэкава М., Судо К., Канно Т., Ли СС (апрель 1990 г.). «Молекулярная характеристика генетической мутации при дефиците лактатдегидрогеназы-A (M) человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях (Представлена рукопись). 168 (2): 677–82. Дои:10.1016 / 0006-291X (90) 92374-9. PMID 2334430.
Гости Ф, Марти М.С., Курвалин Дж. К., Маунори Р., Борненс М. (февраль 1987 г.). «Центросомные белки и лактатдегидрогеназа обладают общим эпитопом в линиях клеток человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 84 (4): 1000–4. Bibcode:1987PNAS ... 84.1000G. Дои:10.1073 / пнас.84.4.1000. ЧВК 304349. PMID 2434947.
Чунг Ф.З., Цудзибо Х., Бхаттачарья У., Шариф Ф.С., Ли С.С. (ноябрь 1985 г.). «Геномная организация гена лактатдегидрогеназы-А человека». Биохимический журнал. 231 (3): 537–41. Дои:10.1042 / bj2310537. ЧВК 1152784. PMID 3000353.
Цудзибо Х., Тиано Х. Ф., Ли СС (февраль 1985 г.). «Нуклеотидные последовательности кДНК и безинтронного псевдогена для изофермента лактатдегидрогеназы-А человека». Европейский журнал биохимии. 147 (1): 9–15. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1985.tb08711.x. PMID 3838278.
Гласс Р.Д., Дойл Д. (апрель 1972 г.). «Генетический контроль экспрессии лактатдегидрогеназы в тканях млекопитающих». Наука. 176 (4031): 180–1. Bibcode:1972Научный ... 176..180Г. Дои:10.1126 / science.176.4031.180. PMID 5014440. S2CID 20224553.
Маэкава М., Судо К., Кобаяси А., Сугияма Э., Ли СС, Канно Т. (апрель 1994). «Электрофоретический вариант быстрого типа лактатдегидрогеназы M (A) и сравнение с другими миссенс-мутациями в генах лактатдегидрогеназы M (A) и H (B)». Клиническая химия. 40 (4): 665–8. Дои:10.1093 / Clinchem / 40.4.665. PMID 7908613.
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Миядзима Х, Такахаши Й, Сузуки М, Симидзу Т., Канеко Э. (июль 1993 г.). «Молекулярная характеристика экспрессии генов при дефиците лактатдегидрогеназы-А человека». Неврология. 43 (7): 1414–9. Дои:10.1212 / wnl.43.7.1414. PMID 8327147. S2CID 41011165.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (ноябрь 1999 г.). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». Международный журнал рака. 83 (4): 456–64. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID 10508479.
Вила М.Р., Николас А., Мороте Дж, де I, Месегер А. (июль 2000 г.). «Повышенная экспрессия глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы в почечно-клеточной карциноме, выявленная с помощью основанной на РНК произвольно затравленной полимеразной цепной реакции». Рак. 89 (1): 152–64. Дои:10.1002 / 1097-0142 (20000701) 89: 1 <152 :: AID-CNCR20> 3.0.CO; 2-T. PMID 10897012.
Буте А, Альтмайер Р., Эри С., Тардье М. (декабрь 2000 г.). «Прямая роль gp120 / 41, экспрессируемого плазматической мембраной в токсичности для человеческих астроцитов, индуцированной ВИЧ-1-инфицированными макрофагами». СПИД. 14 (17): 2687–97. Дои:10.1097/00002030-200012010-00008. PMID 11125887. S2CID 12747999.
Прочтите JA, Winter VJ, Eszes CM, Sessions RB, Brady RL (май 2001 г.). «Структурные основы измененной активности M- и H-изоферментных форм человеческой лактатдегидрогеназы». Белки. 43 (2): 175–85. Дои:10.1002 / 1097-0134 (20010501) 43: 2 <175 :: AID-PROT1029> 3.0.CO; 2- #. PMID 11276087.
Сунг Дж. Х., Шин С. А., Пак Х. К., Монтеларо Р. К., Чонг Й. Х. (октябрь 2001 г.). «Защитный эффект глутатиона в индуцированной литическим пептидом 1 ВИЧ-1 гибели клеток в нейрональных клетках человека». Журнал нейровирологии. 7 (5): 454–65. Дои:10.1080/135502801753170318. PMID 11582518. S2CID 12958486.
Пиоли П.А., Гамильтон Б.Дж., Коннолли Д.Э., Брюер Г., Ригби В.Ф. (сентябрь 2002 г.). «Лактатдегидрогеназа - это белок, связывающий AU-элементы, который напрямую взаимодействует с AUF1». Журнал биологической химии. 277 (38): 35738–45. Дои:10.1074 / jbc.M204002200. PMID 12107167.

внешняя ссылка

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P00338 (Цепь A человеческой L-лактатдегидрогеназы) на PDBe-KB.

[WikiPathways-7] Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «ГликолизГлюконеогенез_WP534».

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000288299 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134333, ENSG00000288299 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063229 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid3000353-5] Чунг Ф.З., Цудзибо Х., Бхаттачарья У., Шариф Ф.С., Ли С.С. (ноябрь 1985 г.). «Геномная организация гена лактатдегидрогеназы-А человека». Биохимический журнал. 231 (3): 537–41. Дои:10.1042 / bj2310537. ЧВК 1152784. PMID 3000353.

[entrez-6] «Ген Entrez: лактатдегидрогеназа A LDHA».

[Glucose_tolerance_test-8] «Данные теста на толерантность к глюкозе для Ldha». Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[Clinical_chemistry-9] «Данные клинической химии для Ldha». Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[Haematology-10] «Гематологические данные для Ldha». Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[''Salmonella''_infection-11] "Сальмонелла данные о заражении Ldha ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[''Citrobacter''_infection-12] "Citrobacter данные о заражении Ldha ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.

[mgp_reference-13] а ^б ^c ^d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.

[14] Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.

[allele_ref-15] «Международный консорциум нокаут-мышей».

[mgi_allele_ref-16] "Информатика генома мыши".

[pmid21677750-17] Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.

[mouse_library-18] Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.

[mouse_for_all_reasons-19] Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.

[pmid21722353-20] ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (июнь 2011 г.). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.

[21] Miskimins WK, Ahn HJ, Kim JY, Ryu S, Jung YS, Choi JY (2014). «Синергетический противораковый эффект фенформина и оксамата». PLOS ONE. 9 (1): e85576. Bibcode:2014PLoSO ... 985576M. Дои:10.1371 / journal.pone.0085576. ЧВК 3897486. PMID 24465604.

[22] Лу Цюй, Чжан Л., Йи Дж.К., Гоу В.В., Ли В.Н. (февраль 2015 г.). «Метаболические последствия ингибирования LDHA эпигаллокатехин галлатом и оксаматом в раковых клетках поджелудочной железы MIA PaCa-2». Метаболомика. 11 (1): 71–80. Дои:10.1007 / s11306-014-0672-8. ЧВК 4523095. PMID 26246802.

[23] Бильярд Дж., Деннисон Дж. Б., Бриан Дж., Аннан Р. С., Чай Д., Колон М., Додсон К. С., Гилберт С. А., Грешок Дж., Джинг Дж., Лу Х., МакСерди-Фрид Дж. Д.Л., Скотт Г.Ф., Шоу А.Н., Уайтт Г.М., Вустер РФ, Даффи К.Дж. (сентябрь 2013 г.). «Хинолин-3-сульфонамиды ингибируют лактатдегидрогеназу А и обращают вспять аэробный гликолиз в раковых клетках». Рак и метаболизм. 1 (1): 19. Дои:10.1186/2049-3002-1-19. ЧВК 4178217. PMID 24280423.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[§ 1]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]