Мотив лидерной РНК Lactis-leu-phe - Lactis-leu-phe leader RNA motif

Консенсусная вторичная структура лактис-leu / phe лидерные РНК. Этот рисунок взят из предыдущей публикации.[1]
Лидерная РНК leu / phe из Lactococcus lactis
Идентификаторы
Символleu-phe_leader
РфамRF01743
Прочие данные
РНК типЦис-рег; лидер;
Домен (ы)Бактерии;
ТАКSO: 0005836
PDB структурыPDBe

В leu / phe-лидерный мотив РНК (так же лактис-leu / phe-лидерный мотив) является сохраняющимся РНК структура идентифицирована биоинформатика.[1] Эти РНК функционируют как пептидные лидеры. Они содержат короткое открытая рамка чтения (ORF), который содержит много кодоны за лейцин или же фенилаланин. Обычно выражение нижестоящего гены подавляется. Однако, когда клеточные концентрации соответствующего аминокислота низкий, рибосома остановка приводит к альтернативной структуре, которая делает возможной экспрессию последующих генов.

Leu / phe лидеры этой структуры известны только у видов Lactococcus lactis, и по существу такой же, как ранее охарактеризованный лейцин лидер того же вида.[2] Дополнительный гомологи были обнаружены, что они содержат кодоны фенилаланина вместо кодонов лейцина и находятся выше генов, участвующих в синтезе фенилаланина вместо лейцина.

Рекомендации

  1. ^ а б Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Кок Дж. (Октябрь 1996 г.). «Индуцируемая экспрессия генов и гены, регулируемые окружающей средой в молочнокислых бактериях» (PDF). Антони ван Левенгук. 70 (2–4): 129–145. Дои:10.1007 / BF00395930. PMID  8879404.

внешняя ссылка