Правило пяти Липински - Википедия - Lipinskis rule of five
Правило пяти липинского, также известный как Правило пяти Pfizer или просто правило пяти (RO5), это практическое правило оценить склонность к наркотикам или определить, если химическое соединение с определенным фармакологический или же биологическая активность имеет химические свойства и физические свойства это сделало бы это вероятным перорально активный препарат у человека. Правило сформулировано Кристофер А. Липински в 1997 г. на основании наблюдения, что большинство пероральных препаратов относительно небольшие и умеренно липофильный молекулы.[1][2]
Правило описывает молекулярные свойства важно для наркотиков фармакокинетика в организме человека, в том числе их поглощение, распределение, метаболизм, и выделение ("ADME "). Однако это правило не предсказывает, является ли соединение фармакологически активным.
Это правило важно помнить во время открытие лекарств когда фармакологически активный ведущая структура оптимизируется поэтапно для повышения активности и селективности соединения, а также для сохранения физико-химических свойств лекарственного средства, как описано в правиле Липинского.[3] Лекарственные препараты-кандидаты, соответствующие RO5, как правило, имеют более низкий коэффициент отсева во время клинические испытания и, следовательно, имеют больше шансов выйти на рынок.[2][4]
Компоненты правила
Правило Липинского гласит, что, как правило, перорально активный препарат имеет не более одного нарушения следующих критериев:[5]
- Не более 5 водородная связь доноры (общее количество азот –водород и кислород –Водород облигации )
- Не более 10 водородная связь акцепторы (все азот или же кислород атомы )
- А молекулярная масса менее 500 дальтон
- An коэффициент распределения октанол-вода[6] (бревно п), не превышающее 5
Обратите внимание, что все числа кратны пяти, что является источником названия правила. эмпирические правила, Такие как Правила Болдуина для закрытия кольца существует множество исключений.
Варианты
В попытке улучшить предсказания склонность к наркотикам, правила породили множество расширений, например фильтр Ghose:[7]
- Коэффициент распределения бревно п в диапазоне от -0,4 до +5,6
- Молярная рефракция от 40 до 130
- Молекулярная масса от 180 до 480
- Число атомов от 20 до 70 (включая доноры водородной связи [например, OH и NH] и акцепторы водородной связи [например, Ns и Os])
Правило Вебера дополнительно ставит под сомнение предельное значение молекулярной массы 500. В площадь полярной поверхности и было обнаружено, что количество вращающихся связей позволяет лучше различать соединения, которые являются перорально активными, и те, которые не подходят для большого набора данных соединений у крысы.[8] В частности, соединения, отвечающие только двум критериям:
- 10 или менее вращающихся связок и
- Площадь полярной поверхности не более 140 Å.2
прогнозируется хорошая биодоступность при приеме внутрь.[8]
Свинцовый
Во время открытия лекарств липофильность и молекулярная масса часто увеличиваются, чтобы улучшить сродство и селективность кандидата в лекарство. Следовательно, во время оптимизации попаданий и лидов часто бывает трудно поддерживать схожесть с лекарственным средством (то есть соответствие RO5). Поэтому было предложено, чтобы члены библиотеки скрининга при обнаружении попаданий должны быть смещены в сторону более низкой молекулярной массы и липофильности, чтобы химикам-медикам было легче доставлять оптимизированные кандидаты для разработки лекарств, которые также подобны лекарствам. Следовательно, правило пяти было распространено на правило трех (RO3) для определения свинцовый соединения.[9]
Соединение, соответствующее правилу трех, определяется как соединение, которое имеет:
- октанол-вода Коэффициент распределения бревно п не более 3
- молекулярная масса менее 300 дальтон
- не более 3 водородная связь доноры
- не более 3 водородная связь акцепторы
- не более 3-х вращающихся связок
Смотрите также
- Система классификации биофармацевтики
- Химическая структура
- Chemicalize.org § Список свойств на основе предсказанной структуры
- Обнаружение потенциальных клиентов на основе фрагментов
- QSAR
Рекомендации
- ^ Липински К.А., Ломбардо Ф., Домини Б.В., Фини П.Дж. (март 2001 г.). «Экспериментальные и вычислительные подходы к оценке растворимости и проницаемости в условиях открытия и разработки лекарств». Adv. Препарат Делив. Rev. 46 (1–3): 3–26. Дои:10.1016 / S0169-409X (00) 00129-0. PMID 11259830.
- ^ а б Липинский С.А. (декабрь 2004 г.). «Соединения, подобные свинцу и наркотикам: революция по правилу пяти». Открытие лекарств сегодня: технологии. 1 (4): 337–341. Дои:10.1016 / j.ddtec.2004.11.007. PMID 24981612.
- ^ Опреа Т.И., Дэвис А.М., Тиг С.Дж., Лисон П.Д. (2001). «Есть ли разница между свинцом и наркотиками? Историческая перспектива». J Chem Inf Comput Sci. 41 (5): 1308–15. Дои:10.1021 / ci010366a. PMID 11604031.
- ^ Leeson PD, Springthorpe B (ноябрь 2007 г.). «Влияние концепций, подобных лекарствам, на принятие решений в медицинской химии». Nat Rev Drug Discov. 6 (11): 881–90. Дои:10.1038 / nrd2445. PMID 17971784.
- ^ Липински, Калифорния; Lombardo, F; Dominy, BW; Фини, П.Дж. (март 2001 г.). «Экспериментальные и вычислительные подходы к оценке растворимости и проницаемости в условиях открытия и разработки лекарств». Расширенные обзоры доставки лекарств. 46 (1–3): 3–26. Дои:10.1016 / S0169-409X (00) 00129-0. PMID 11259830.
- ^ Лео А., Хэнш С., Элкинс Д. (1971). «Коэффициенты разделения и их использование». Chem Rev. 71 (6): 525–616. Дои:10.1021 / cr60274a001.
- ^ Гхош А.К., Вишванадан В.Н., Вендолоски Дж.Дж. (январь 1999 г.). «Основанный на знаниях подход к разработке библиотек комбинаторной или медицинской химии для открытия лекарств. 1. Качественная и количественная характеристика известных баз данных лекарств». J Comb Chem. 1 (1): 55–68. Дои:10.1021 / cc9800071. PMID 10746014.
- ^ а б Вебер Д.Ф., Джонсон С.Р., Ченг Х.Й., Смит Б.Р., Уорд К.В., Коппле К.Д. (июнь 2002 г.). «Молекулярные свойства, которые влияют на пероральную биодоступность кандидатов в лекарства». J. Med. Chem. 45 (12): 2615–23. CiteSeerX 10.1.1.606.5270. Дои:10.1021 / jm020017n. PMID 12036371.
- ^ Конгрив М., Карр Р., Мюррей С., Джоти Х. (октябрь 2003 г.). «Правило трех» для обнаружения потенциальных клиентов на основе фрагментов? ». Drug Discov. Сегодня. 8 (19): 876–7. Дои:10.1016 / S1359-6446 (03) 02831-9. PMID 14554012.
внешняя ссылка
- Интерактивный калькулятор правила пяти
- Бесплатные онлайн-расчеты донора / акцептора водородной связи, массы и logP с помощью ChemAxon Плагины Marvin и Calculator - требуется Java
- Расчет лекарственного сходства - требуется Java