Список сайтов разрезания рестрикционных ферментов: Bsa – Bso - Википедия - List of restriction enzyme cutting sites: Bsa–Bso

Основные статьи: Список сайтов разрезания рестрикционных ферментов и Фермент рестрикции
Легенда о азотистые основания
КодНуклеотид представлен
ААденин (А)
CЦитозин (С)
граммГуанин (ГРАММ)
ТТимин (Т)
NA, C, G или T
MА или С
рA или G
WА или Т
YC или T
SC или G
KG или T
ЧАСA, C или T
BC, G или T
VA, C или G
DA, G или T


Эта статья содержит список наиболее изученных рестрикционных ферментов, названия которых начинаются с Bsa до Bso включительно. Он содержит около 90 ферментов. Приведена следующая информация:

  • Фермент: Принятое название молекула, согласно международно принятой номенклатура[1][2], и библиографические ссылки. (Дальнейшее чтение: см. Раздел "Номенклатура "в статье"Фермент рестрикции ".)
  • Код PDB: Код, используемый для определения структуры белка в PDB база данных белковых структур. Трехмерная атомная структура белка предоставляет очень ценную информацию для понимания внутренних деталей механизма его действия.[3][4].
  • Источник: Организм, который естественным образом производит фермент.
  • Последовательность распознавания: Последовательность ДНК, распознаваемая ферментом и с которой он специфически связывается.
  • Резать: Участок разреза и продукты ДНК разреза. В последовательность распознавания и место разрезания обычно совпадают, но иногда сайт разреза может находиться на расстоянии нескольких десятков нуклеотидов от сайта распознавания[5][6].
  • Изошизомеры и неошизомеры: An изошизомер является фермент который распознает ту же последовательность, что и другой. А неошизомер представляет собой особый тип изошизомера, который распознает одну и ту же последовательность, но разрезает другим способом. Для каждого фермента указано не более 8-10 наиболее распространенных изошизомеров, но их может быть намного больше. Неошизомеры выделены жирным шрифтом зеленого цвета (например: BamHI). Когда "Нет на Дата", это означает, что на эту дату в базах данных не было зарегистрированных изошизомеров с четко определенным участком разрезания. Изошизомеры, указанные белым шрифтом и серым фоном, соответствуют ферментам, не указанным в текущих списках:
как в этом не перечисленном ферменте: EcoR70I 


Навигация по всему списку

Ферменты рестрикции

Bsa - Bso

ФерментКод PDBИсточникПоследовательность распознаванияРезатьИзошизомеры
BsaIBacillus stearothermophilus 20241 5 'GGTCTC
3 'CCAGAG 		5 '--- GGTCTCN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCAGAGNNNNN   --- 5' 		Bso31I, BspTNI, Eco31I
Bsa29IБациллы sp. 29 5 'ATCGAT
3 'ТАГКТА 		5 '--- В   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   ТА --- 5 ' 		AagI, BanIII, BavCI, BseCI, BspDI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI, BbvAII
BsaAIBacillus stearothermophilus G668 5 'ЯКГТР
3 'RTGCAY 		5 '--- YAC   GTR --- 3 '
3 '--- РИТЭГ   CAY --- 5 '
BsaBIBacillus stearothermophilus B674 5 'ГАТН4УВД
3 'CTAN4ТЕГ 		5 '--- ГАТНН   NNATC --- 3 '
3 '--- CTANN   NNTAG --- 5 '
BsaHI [7]Bacillus stearothermophilus CPW11 5 'GRCGYC
3 'CYGCRG 		5 '--- GR   CGYC --- 3 '
3 '--- CYGC   RG --- 5 ' 		AcyI, AhaII, AosII, AstWI, AsuIII, BbiII, BstACI, HgiI, PamII
BsaJIBacillus stearothermophilus J695 5 'CCNNGG
3 'GGNNCC 		5 '--- С   CNNGG --- 3 '
3 '--- GGNNC   C --- 5 '
BsaMIBacillus stearothermophilus M293 5 'GAATGC
3 'CTTACG 		5 '--- GAATGCN   --- 3'
3 '--- CTTAC   GN --- 5 ' 		Asp26HI, Asp35HI, Asp36HI, Asp50HI, BsaMI, BsmI, Mva1269I
BsaOIBacillus stearothermophilus О-122 5 'CGRYCG
3 'GCYRGC 		5 '--- CGRY   CG --- 3 '
3 '--- GC   YRGC --- 5 '
BsaWIBacillus stearothermophilus W1718 5 футов WCCGGW
3 'WGGCCW 		5 '--- Вт   CCGGW --- 3 '
3 '--- WGGCC   W --- 5 '
BsaXI [8]Bacillus stearothermophilus 25B 5 'ACN5CTCC
3 'ТГН5GAGG 		5 '--- ACN5CTCCN6NNNN   --- 3'
3 '--- TGN5ГАГГН6N   NNN --- 5 '
 BsmCI, BsmDI, BsmXI 
BscIБациллы sp. 5 'ATCGAT
3 'ТАГКТА 		5 '--- В   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   ТА --- 5 ' 		BanIII, BavCI, Bci29I, BdiI, Bli41I, BliAI, LplI, PgaI, SpmI
Bsc4IBacillus schlegelii 4 5 'CCN7GG
3 'GGN7CC 		5 '--- CCNNNNN   NNGG --- 3 '
3 '--- GGNN   NNNNNCC --- 5 '
Bsc91IБациллы sp. 5 'GAAGAC
3 'CTTCTG 		5 '--- GAAGACNN   NNNN --- 3 '
3 '--- CTTCTGNNNNNN   --- 5'
Bsc107IBacillus schlegelii 107 5 'CCN7GG
3 'GGN7CC 		5 '--- CCNNNNN   NNGG --- 3 '
3 '--- GGNN   NNNNNCC --- 5 '
BscAIBacillus schlegelii S3 5 'GCATC
3 'CGTAG 		5 '--- GCATCNNNN   NN --- 3 '
3 '--- CGTAGNNNNNN   --- 5'
BscBIБациллы sp. A11 5 'GGNNCC
3 'CCNNGG 		5 '--- GGN   NCC --- 3 '
3 '--- CCN   NGG --- 5 '
AspNI, BmiI, БспЛИ, НЛАИВ,
PspN4I
BscCIБациллы sp. 2G 5 'GAATGC
3 'CTTACG 		5 '--- GAATGCN   --- 3'
3 '--- CTTAC   GN --- 5 ' 		Asp26HI, Asp27HI, Asp35HI, Asp36HI, BsaMI, BscCI, PctI
BscFIБациллы sp. JY391 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		Bfi57I, Bsp143I, BspJI, BtkII, CviAI, Kzo9I, NlaII, SsiBI
Bse1IBacillus stearothermophilus 1 5 'ACTGG
3 'TGACC 		5 '--- ACTGGN   --- 3'
3 '--- TGAC   CN --- 5 '
Bse8IБациллы sp. 8 5 'ГАТН4УВД
3 'CTAN4ТЕГ 		5 '--- ГАТНН   NNATC --- 3 '
3 '--- CTANN   NNTAG --- 5 '
Bse15IБациллы sp. 15 5 'CYCGRG
3 'GRGCYC 		5 '--- С   YCGRG --- 3 '
3 '--- GRGCY   C --- 5 ' 		Ama87I, AvaI, BcoI, BsoBI, BstSI, Eco88I, NspSAI, OfoI
Bse16IБациллы sp. 16 5 'CCWGG
3 'GGWCC 		5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 ' 		AeuI, BseBI, BsiLI, BstNI, BstM6I, BthDI, BthEI, ЭкоРИИ, MvaI
Bse17IБациллы sp. 17 5 'CCWGG
3 'GGWCC 		5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 ' 		AeuI, BseBI, Bse16I, Bst2I, BstNI, Bst38I, Bst100I, Psp6I, PspGI
Bse21IБациллы sp. 21 год 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC 		5 '--- CC   TNAGG --- 3 '
3 '--- ГГАНТ   CC --- 5 ' 		AxyI, BliHKI, BspR7I, Bsu36I, Eco81I, MstII, OxaNI, SshAI
Bse24IБациллы sp. 24 5 'CCWGG
3 'GGWCC 		5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 ' 		AeuI, BseBI, Bse16I, Bst2I, BstNI, Bst38I, Bst100I, Psp6I, PspGI
Bse64IБациллы sp. 64 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 		5 '--- G   GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG   G --- 5 ' 		AspAI, Bse64I, BseT9I, BstPI, EcaI, Eci125I, EcoO65I, NspSAII
Bse118I [9]Бациллы sp. 118 5 'RCCGGY
3 'YGGCCR 		5 '--- R   CCGGY --- 3 '
3 '--- YGGCC   R --- 5 '
Bse634I1КНВБациллы sp. 634 5 'RCCGGY
3 'YGGCCR 		5 '--- R   CCGGY --- 3 '
3 '--- YGGCC   R --- 5 '
BseAI [10]Bacillus sphaericus 5 'TCCGGA
3 'AGGCCT 		5 '--- т   CCGGA --- 3 '
3 '--- AGGCC   Т --- 5 ' 		AccIII, Aor13HI, BlfI, BsiMI, Bsp13I, BspMII, CauB3I, Kpn2I
BseBI [11]Bacillus stearothermophilus 5 'CCWGG
3 'GGWCC 		5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 ' 		Аджни, AorI, Bse17I, Bst1I, BstOI, Bst2UI, ЭкоРИИ, MvaI, SleI, Зани
BseCI [12][13][14]Бациллы sp. 5 'ATCGAT
3 'ТАГКТА 		5 '--- В   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   ТА --- 5 ' 		AagI, BanIII, BavCI, Bsa29I, BspDI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI, LcaI
BseDIBacillus stearothermophilus RFL1434 5 'CCNNGG
3 'GGNNCC 		5 '--- С   CNNGG --- 3 '
3 '--- GGNNC   C --- 5 '
Bse3DIBacillus stearothermophilus 3D 5 'GCAATG
3 'CGTTAC 		5 '--- GCAATGNN   --- 3'
3 '--- CGTTAC   NN --- 5 '
BseGIBacillus stearothermophilus Против 34-031 5 'ГГАТГ
3 'CCTAC 		5 '--- GGATGNN   --- 3'
3 '--- CCTAC   NN --- 5 '
BseJIBacillus stearothermophilus Tsp5 5 'ГАТН4УВД
3 'CTAN4ТЕГ 		5 '--- ГАТНН   NNATC --- 3 '
3 '--- CTANN   NNTAG --- 5 '
БсеКИBacillus stearothermophilus Лa3-212 5 'GCAGC
3 'CGTCG 		5 '--- GCAGCN7N   NNNN --- 3 '
3 '--- CGTCGN7NNNNN   --- 5' 		AlwXI, BbvI, BseXI, Bsp423I, Bst12I, Bst71I, BstV1I
БселиBacillus stearothermophilus LK3-551 5 'CCN7GG
3 'GGN7CC 		5 '--- CCNNNNN   NNGG --- 3 '
3 '--- GGNN   NNNNNCC --- 5 '
BseMIBacillus stearothermophilus Остров 15-111 5 'GCAATG
3 'CGTTAC 		5 '--- GCAATGNN   --- 3'
3 '--- CGTTAC   NN --- 5 '
BseMII [15]Bacillus stearothermophilus Isl 15-111 5 'CTCAG
3 'GAGTC 		5 '--- CTCAGN7NNN   --- 3'
3 '--- GAGTCN7N   NN --- 5 '
БсениБациллы sp. N 5 'ACTGG
3 'TGACC 		5 '--- ACTGGN   --- 3'
3 '--- TGAC   CN --- 5 '
BsePIBacillus stearothermophilus P6 5 'GCGCGC
3 'CGCGCG 		5 '--- G   CGCGC --- 3 '
3 '--- CGCGC   G --- 5 '
BseQIБациллы sp. Q 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
BseRI [16]Бациллы sp. р 5 'ГАГГАГ
3 'CTCCTC 		5 '--- GAGGAGN7NNN   --- 3'
3 '--- CTCCTCN7N   NN --- 5 '
BseSI [17]Bacillus stearothermophilus Jo-553 5 'ГКГКМЦ
3 'CMCGKG 		5 '--- ГКГЦМ   C --- 3 '
3 '--- С   MCGKG --- 5 '
BseT9IБациллы sp. T9 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 		5 '--- G   GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG   G --- 5 ' 		AcrII, Bse64I, BstEII, BstT9I, EcaI, Eci125I, EcoO65I, NspSAII, PspEI
BseT10IБациллы sp. T10 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 		5 '--- G   GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG   G --- 5 ' 		AcrII, AspAI, BstEII, BstT10I, BstPI, EcoO128I, EcoO65I, PspEI
BseXIBacillus stearothermophilus Лa3-212 5 'GCAGC
3 'CGTCG 		5 '--- GCAGCN7N   NNNN --- 3 '
3 '--- CGTCGN7NNNNN   --- 5' 		AlwXI, BbvI, BseKI, Bsp423I, Bst12I, Bst71I, BstV1I
BseX3IBacillus stearothermophilus X3 5 'CGGCCG
3 'GCCGGC 		5 '--- С   GGCCG --- 3 '
3 '--- GCCGG   C --- 5 ' 		AaaI, BstZI, EagI, EclXI, Eco52I, SenPT16I, XmaIII
BseYIБациллы sp. 2521 5 'CCCAGC
3 'GGGTCG 		5 '--- С   CCAGC --- 3 '
3 '--- GGGTC   G --- 5 '
BseZIБациллы sp. Z 5 'CTCTTC
3 'ГАГААГ 		5 '--- CTCTTCN   NNN --- 3 '
3 '--- GAGAAGNNNN   --- 5'
BsgIBacillus sphaericus B922 5 'GTGCAG
3 'CACGTC 		5 '--- GTGCAGN12NNNN   --- 3'
3 '--- CACGTCN12NN   NN --- 5 '
BshIBacillus sphaericus 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
Бш45ИBacillus sphaericus 45 5 'GWGCWC
3 'CWCGWG 		5 '--- GWGCW   C --- 3 '
3 '--- С   WCGWG --- 5 '
Alw21I, AspHI, Bbv12I, BsiHKAI,
HgiAI, HpyF46II, MspV281I
Бш1236ИBacillus sphaericus RFL1236 5 футов CGCG
3 'GCGC 		5 '--- CG   CG --- 3 '
3 '--- GC   GC --- 5 ' 		AccII, BceBI, BspFNI, Bsp50I, Csp68KVI, FauBII, MvnI, SelI
Бш1285ИBacillus sphaericus RFL1285 5 'CGRYCG
3 'GCYRGC 		5 '--- CGRY   CG --- 3 '
3 '--- GC   YRGC --- 5 '
Bsh1365IBacillus sphaericus RFL1365 5 'ГАТН4УВД
3 'CTAN4ТЕГ 		5 '--- ГАТНН   NNATC --- 3 '
3 '--- CTANN   NNTAG --- 5 '
БшФИ [18]Bacillus sphaericus 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
БшГИBacillus sphaericus 5 'CCWGG
3 'GGWCC 		5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 ' 		AeuI, BseBI, Bse16I, Bst2I, BstNI, Bst38I, Bst100I, PspGI, SspAI
БшКИBacillus sphaericus 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- G   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AspS9I, Bac36I, BavAII, Bsp1894I, BspBII, CcuI, MaeK81II, Pde12I
БшНИBacillus sphaericus ТК-45 5 'GGYRCC
3 'CCRYGG 		5 '--- G   GYRCC --- 3 '
3 '--- CCRYG   G --- 5 ' 		BanI, BbvBI, BspT107I, Eco64I, HgiCI, HgiHI, MspB4I, PfaAI
БшТИBacillus sphaericus Jo22-024 5 'ACCGGT
3 'TGGCCA 		5 '--- А   CCGGT --- 3 '
3 '--- TGGCC   А --- 5 '
AgeI, AsiAI, AsiGI, CsiAI
CspAI, PinAI
BsiI [19][20]Bacillus sphaericus 5 'CACGAG
3 'GTGCTC 		5 '--- С   ACGAG --- 3 '
3 '--- GTGCT   C --- 5 '
BsiBI [21]Бациллы sp. 5 'ГАТН4УВД
3 'CTAN4ТЕГ 		5 '--- ГАТНН   NNATC --- 3 '
3 '--- CTANN   NNTAG --- 5 '
BsiCIБациллы sp. 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 		5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 ' 		AcpI, AsuII, Bpu14I, BspT104I, Csp45I, FspII, NspV, PpaAI, SfuI
BsiEI [22]Бациллы sp. 5 'CGRYCG
3 'GCYRGC 		5 '--- CGRY   CG --- 3 '
3 '--- GC   YRGC --- 5 '
BsiHKAI [23]Bacillus stearothermophilus 5 'GWGCWC
3 'CWCGWG 		5 '--- GWGCW   C --- 3 '
3 '--- С   WCGWG --- 5 '
Alw21I, AspHI, Bbv12I, Bsh45I,
 Бсм6И, HgiAI, MspV281I
BsiHKCIБациллы sp. HKC 5 'CYCGRG
3 'GRGCYC 		5 '--- С   YCGRG --- 3 '
3 '--- GRGCY   C --- 5 ' 		AquI, BcoI, Bse15I, BspLU4I, Eco88I, Nli3877I, PlaAI, PunAI
BsiKI [24]Бациллы sp. 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 		5 '--- G   GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG   G --- 5 '
BsiLIБациллы sp. 5 'CCWGG
3 'GGWCC 		5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 ' 		AglI, BseBI, Bse17I, Bst2I, BstNI, Bst38I, Bst100I, ЭкоРИИ, MvaI
BsiMIБациллы sp. 5 'TCCGGA
3 'AGGCCT 		5 '--- т   CCGGA --- 3 '
3 '--- AGGCC   Т --- 5 ' 		AccIII, BbvAIII, BlfI, Bsp13I, BspMII, Bsu23I, Kpn2I, PinBII
BsiQIБациллы sp. 5 'ТГАТКА
3 'ACTAGT 		5 '--- т   GATCA --- 3 '
3 '--- ACTAG   Т --- 5 '
AbaI, BclI, BspXII,
BstT7I, FbaI, Ksp22I, ParI 
BsiSI [25]Бациллы sp. 5 'CCGG
3 'GGCC 		5 '--- С   CGG --- 3 '
3 '--- GGC   C --- 5 '
BsiWIБациллы sp. 5 'CGTACG
3 'GCATGC 		5 '--- С   GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG   C --- 5 '
BsiXIБациллы sp. Икс 5 'ATCGAT
3 'ТАГКТА 		5 '--- В   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   ТА --- 5 ' 		BscI, BsiXI, Bsp106I, BspDI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI, Rme21I
BsiYI [26]Бациллы sp. 5 'CCN7GG
3 'GGN7CC 		5 '--- CCNNNNN   NNGG --- 3 '
3 '--- GGNN   NNNNNCC --- 5 '
BsiZIБациллы sp. 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- G   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AspS9I, Bac36I, BavAII, BshKI, BspBII, CcuI, MaeK81II, Pde12I
BslIБациллы sp. 5 'CCN7GG
3 'GGN7CC 		5 '--- CCNNNNN   NNGG --- 3 '
3 '--- GGNN   NNNNNCC --- 5 '
BslFIBacillus stearothermophilus FI 5 'GGGAC
3 'CCCTG 		5 '--- GGGACN8NN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCCTGN8NNNNNN   --- 5'
BsmIBacillus stearothermophilus NUB 5 'GAATGC
3 'CTTACG 		5 '--- GAATGCN   --- 3'
3 '--- CTTAC   GN --- 5 ' 		Asp26HI, Asp36HI, Asp40HI, BmaHI, BscCI, Mva1269I, PctI
BsmAIBacillus stearothermophilus A664 5 'GTCTC
3 'CAGAG 		5 '--- GTCTCN   NNNN --- 3 '
3 '--- CAGAGNNNNN   --- 5'
Alw26I, BcoDI, BscQII, BsoMAI,
BstMAI
BsmBIBacillus stearothermophilus B61 5 'CGTCTC
3 'GCAGAG 		5 '--- CGTCTCN   NNNN --- 3 '
3 '--- GCAGAGNNNNN   --- 5'
BsmFIBacillus stearothermophilus F 5 'GGGAC
3 'CCCTG 		5 '--- GGGACN8NN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCCTGN8NNNNNN   --- 5'
BsmSIBacillus stearothermophilus CP114 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC 		5 '--- С   CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC   C --- 5 '
Bso31IBacillus stearothermophilus E31 5 'GGTCTC
3 'CCAGAG 		5 '--- GGTCTCN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCAGAGNNNNN   --- 5'
BsoBI1DC1Bacillus stearothermophilus JN2091 5 'CYCGRG
3 'GRGCYC 		5 '--- С   YCGRG --- 3 '
3 '--- GRGCY   C --- 5 ' 		AquI, BcoI, BsiHKCI, BspLU4I, Eco88I, Nli3877I, PlaAI, PunAI
BsoCIBacillus stearothermophilus AU891 5 'ГДГЧК
3 'CHCGDG 		5 '--- ГДГЧ   C --- 3 '
3 '--- С   HCGDG --- 5 ' 		AocII, BmyI, Bsp1286I, BspLS2I, MhlI, NspII, SduI
BsoFIBacillus stearothermophilus F66 5 'GCNGC
3 'CGNCG 		5 '--- GC   NGC --- 3 '
3 '--- CGN   CG --- 5 '
BsoMAIBacillus stearothermophilus MA 5 'GTCTC
3 'CAGAG 		5 '--- GTCTCN   NNNN --- 3 '
3 '--- CAGAGNNNNN   --- 5'
Alw26I, BcoDI, BscQII, BsmAI,
BstMAI
Этот список неполный; вы можете помочь добавление недостающих предметов с надежные источники.

Примечания

  1. ^ Смит Х.О., Натанс Д. (декабрь 1973 г.). «Письмо: Предлагаемая номенклатура для бактериальных систем модификации и рестрикции и их ферментов». J. Mol. Биол. 81 (3): 419–23. Дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID  4588280.
  2. ^ Робертс Р.Дж., Белфорт М., Бестор Т., Бхагват А.С., Бикл Т.А., Битинаит Дж., Блюменталь Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К., Фирман К., Громова Е.С., Гампорт Р.И., Халфорд С.Е., Хаттман С., Хейтман Дж., Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh Э, Рао Д. Н., Райх Н., Репин В. Е., Селкер Э. С., Шоу П. К., Штейн Д. К., Стоддард Б. Л., Шибальский В., Траутнер Т. А., Ван Эттен Д. Л., Витор Д. М., Уилсон Г. Г., Сюй С.Ю. (апрель 2003 г.). «Номенклатура рестрикционных ферментов, ДНК-метилтрансфераз, самонаводящихся эндонуклеаз и их генов». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1805–12. Дои:10.1093 / nar / gkg274. ЧВК  152790. PMID  12654995.
  3. ^ Джереми МБ, Джон LT, Люберт S (2002). «3. Структура и функции белка». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN  0-7167-4684-0.
  4. ^ Анфинсен К. Б. (1973). «Принципы, регулирующие сворачивание белковых цепей». Наука. 181 (4096): 223–30. Дои:10.1126 / science.181.4096.223. PMID  4124164.
  5. ^ Кесслер C, Манта V (август 1990 г.). «Специфичность рестрикционных эндонуклеаз и модификации ДНК метилтрансфераз - обзор (издание 3)». Ген. 92 (1–2): 1–248. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-Б. PMID  2172084.
  6. ^ Pingoud A, Jeltsch A (сентябрь 2001 г.). «Структура и функция эндонуклеаз рестрикции II типа». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (18): 3705–27. Дои:10.1093 / nar / 29.18.3705. ЧВК  55916. PMID  11557805.
  7. ^ Нили Р.К., Робертс Р.Дж. (май 2008 г.). «Система рестрикции-модификации BsaHI: клонирование, секвенирование и анализ консервативных мотивов». БМК Мол Биол. 9: 48. Дои:10.1186/1471-2199-9-48. ЧВК  2413257. PMID  18479503.
  8. ^ Тенгс Т., ЛаФрамбуаз Т., Ден Р.Б., Хейс Д.Н., Чжан Дж., Деброй С., Джентльмен Р.С., О'Нил К., Биррен Б., Мейерсон М. (август 2004 г.). «Геномные представления с использованием конкатенированных фрагментов расщепления рестрикционной эндонуклеазой типа IIB». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (15): e121. Дои:10.1093 / нар / gnh120. ЧВК  516078. PMID  15329383.
  9. ^ Репин В.Е., Бабкин И.В., Терещенко Т.А. (апрель 1993 г.). «Bse118 I - новый изошизомер эндонуклеазы рестрикции Cfr10 I, выделенный из термофильной бактерии. Bacillus coagulans". Биоорг Хим (на русском). 19 (4): 406–9. PMID  8494562.
  10. ^ Танос Д., Скарпелис Дж., Папаматеакис Дж., Буриотис В. (ноябрь 1989 г.). «Выделение и идентификация эндонуклеазы рестрикции BseAI». Нуклеиновые кислоты Res. 17 (21): 8881. Дои:10.1093 / nar / 17.21.8881. ЧВК  335073. PMID  2587237.
  11. ^ Рина М., Цигос И., Карагуни А., Пагомену М., Буриотис В. (сентябрь 1991 г.). «Выделение и идентификация эндонуклеазы рестрикции BseBI». Нуклеиновые кислоты Res. 19 (17): 4776. Дои:10.1093 / nar / 19.17.4776. ЧВК  328730. PMID  1653952.
  12. ^ Рина М, Буриотис V (октябрь 1993 г.). "Клонирование, очистка и характеристика ДНК-метилтрансферазы BseCI из Bacillus stearothermophilus". Ген. 133 (1): 91–4. Дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90229-В. PMID  8224900.
  13. ^ Рина М, Маркаки М, Буриотис В (декабрь 1994). «Последовательность клонированного гена bseCIM: M.BseCI обнаруживает высокую гомологию с M.BanIII». Ген. 150 (1): 71–3. Дои:10.1016/0378-1119(94)90860-5. PMID  7959066.
  14. ^ Рина М., Диалектакис Д., Кларк Д., Пагомену М., Буриотис В. (апрель 1992 г.). «Выделение и идентификация эндонуклеазы рестрикции BseCI». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (7): 1807. Дои:10.1093 / nar / 20.7.1807. ЧВК  312279. PMID  1579477.
  15. ^ Юренайте-Урбанавичене С., Казлаускене Р., Урбелите В., Манелиене З., Петрусите М., Лубис А., Янулайтис А. (февраль 2001 г.). «Характеристика BseMII, системы рестрикции-модификации нового типа IV, которая распознает пентануклеотидную последовательность 5'-CTCAG (N) (10/8)». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (4): 895–903. Дои:10.1093 / nar / 29.4.895. ЧВК  29615. PMID  11160921.
  16. ^ Муштак Р., Наим С., Сохаил А., Риазуддин С. (июль 1993 г.). "BseRI - новая эндонуклеаза рестрикции из Бациллы вид, который распознает последовательность 5 '... GAGGAG ... 3'". Нуклеиновые кислоты Res. 21 (15): 3585. Дои:10.1093 / nar / 21.15.3585. ЧВК  331471. PMID  8346041.
  17. ^ Степонавичене Д., Манелиене З., Петрусите М., Янулайтис А. (июль 1999 г.). "BseSI, эндонуклеаза рестрикции из Bacillus stearothermophilus Jo 10-553, которая распознает новую гексануклеотидную последовательность 5'-G (G / T) GC (A / C) C-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 27 (13): 2644–5. Дои:10.1093 / nar / 27.13.2644. ЧВК  148472. PMID  10373580.
  18. ^ Влатакис Г., Кларк Д., Буриотис В. (ноябрь 1989 г.). «Выделение и идентификация рестрикционной эндонуклеазы BshFI». Нуклеиновые кислоты Res. 17 (21): 8882. Дои:10.1093 / nar / 17.21.8882. ЧВК  335074. PMID  2587238.
  19. ^ Дегтярев С.К., Речкунова Н.И., Колыхалов А.А., Дедков В.С., Жилкин П.А. (октябрь 1990 г.). «Эндонуклеазы рестрикции II-Q - новый класс ферментов типа II». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (19): 5807–10. Дои:10.1093 / nar / 18.19.5807. ЧВК  332318. PMID  2216771.
  20. ^ Дегтярева СХ; Колыхалов А.А.; Речкунова Н.И.; Дедков В.С.; Жилкин П.А. (январь – февраль 1990 г.). «BsiI - новая необычная эндонуклеаза рестрикции». Мол Биол (Моск) (на русском). 24 (1): 244–7. PMID  2348824.
  21. ^ Мок Ю.К., Кларк Д.Р., Кам К.М., Шоу П.К. (ноябрь 1990 г.). «Эндонуклеаза рестрикции из термофильных видов бактерий. II. Выделение и характеристика BsiBI». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (22): 6740. Дои:10.1093 / nar / 18.22.6740. ЧВК  332681. PMID  2251161.
  22. ^ Мок Ю.К., Кларк Д.Р., Кам К.М., Шоу П.К. (август 1990 г.). «Эндонуклеаза рестрикции из термофильных видов бактерий I. Выделение и характеристика BsiEI». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (16): 4954. Дои:10.1093 / nar / 18.16.4954. ЧВК  332016. PMID  2168545.
  23. ^ Ли К.Ф., Ши С.Д., Кам К.М., Шоу П.К. (февраль 1992 г.). «Эндонуклеаза рестрикции из термофильных бактерий вида III. Выделение и характеристика BsiHKAI». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (4): 921. Дои:10.1093 / nar / 20.4.921. ЧВК  312048. PMID  1542588.
  24. ^ Рина М., Кларк Д., Буриотис В. (март 1990 г.). «Выделение и идентификация эндонуклеазы рестрикции BsiKI». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (6): 1655. Дои:10.1093 / nar / 18.6.1655. ЧВК  330561. PMID  2326209.
  25. ^ Рина М, Буриотис V (март 1990 г.). «Выделение и идентификация эндонуклеазы рестрикции BsiSI». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (6): 1654. Дои:10.1093 / nar / 18.6.1654. ЧВК  330560. PMID  1691485.
  26. ^ Мок Ю.К., Кларк Д.Р., Кам К.М., Шоу П.К. (май 1991 г.). «BsiY I, новая термофильная эндонуклеаза рестрикции, которая распознает 5 'CCNNNNNNNGG 3' и открытие ошибочно секвенированного сайта в pACYC177». Нуклеиновые кислоты Res. 19 (9): 2321–3. Дои:10.1093 / nar / 19.9.2321. ЧВК  329437. PMID  2041772.