Список сайтов разрезания рестрикционных ферментов: S - Википедия - List of restriction enzyme cutting sites: S

Легенда о азотистые основания
Код	Нуклеотид представлен
А	Аденин (А)
C	Цитозин (С)
грамм	Гуанин (ГРАММ)
Т	Тимин (Т)
N	A, C, G или T
M	А или С
р	A или G
W	А или Т
Y	C или T
S	C или G
K	G или T
ЧАС	A, C или T
B	C, G или T
V	A, C или G
D	A, G или T

Эта статья содержит список наиболее изученных рестрикционных ферментов, названия которых начинаются на S. В нем содержится около 130 ферментов. Приведена следующая информация:

Фермент: Принятое название молекула, согласно международно принятой номенклатура^[1]^[2], и библиографические ссылки. (Дальнейшее чтение: см. Раздел "Номенклатура "в статье"Фермент рестрикции ".)
Код PDB: Код, используемый для определения структуры белка в PDB база данных белковых структур. Трехмерная атомная структура белка предоставляет очень ценную информацию для понимания внутренних деталей механизма его действия.^[3]^[4].
Источник: Организм, который естественным образом производит фермент.
Последовательность распознавания: Последовательность ДНК, распознаваемая ферментом и с которой он специфически связывается.
Резать: Участок разреза и продукты ДНК разреза. В последовательность распознавания и место разрезания обычно совпадают, но иногда сайт разреза может находиться на расстоянии нескольких десятков нуклеотидов от сайта распознавания^[5]^[6].
Изошизомеры и неошизомеры: An изошизомер является фермент который распознает ту же последовательность, что и другой. А неошизомер представляет собой особый тип изошизомера, который распознает одну и ту же последовательность, но разрезает другим способом. Для каждого фермента указано не более 8-10 наиболее распространенных изошизомеров, но их может быть намного больше. Неошизомеры выделены жирным шрифтом зеленого цвета (например: BamHI). Когда "Нет на Дата", это означает, что на эту дату в базах данных не было зарегистрированных изошизомеров с четко определенным участком разрезания. Изошизомеры, указанные белым шрифтом и серым фоном, соответствуют ферментам, не указанным в текущих списках:

как в этом не перечисленном ферменте:

EcoR70I

Навигация по всему списку

Ферменты рестрикции

S

Фермент Код PDB Источник Последовательность распознавания Резать Изошизомеры

SacI ^[7] Streptomyces achromogenes 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG 5 '--- GAGCT C --- 3 '
3 '--- С TCGAG --- 5 '

SacII Streptomyces achromogenes 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 ' Cfr42I

SacNI Streptomyces achromogenes N-J-H 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG 5 '--- GRGCY C --- 3 '
3 '--- С YCGRG --- 5 '

SalI ^[7] Streptomyces albus 5 'GTCGAC
3 'CAGCTG 5 '--- G TCGAC --- 3 '
3 '--- CAGCT G --- 5 '

СалПИ Streptomyces albus 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 5 '--- CTGCA G --- 3 '
3 '--- G ACGTC --- 5 ' ApiI, BspMAI, CstI, Ecl37kI, Ecl2zI, Psp23I, PstI, Srl5DI, YenI

SanDI Streptomyces sp. 5 'GGGWCCC
3 'CCCWGGG 5 '--- GG GWCCC --- 3 '
3 '--- CCCWG GG --- 5 '

SapI Сахарополиспора sp. 5 'GCTCTTC
3 'CGAGAAG 5 '--- GCTCTTCN NNN --- 3 '
3 '--- CGAGAAGNNNN --- 5'

Сари Streptomyces aureomonopodiales 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA 5 '--- AGG CCT --- 3 '
3 '--- TCC GGA --- 5 ' AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, Sru30DI, SseBI, SteI, StuI

Сати Стафилококк arlettae RFL832 5 'GCNGC
3 'CGNCG 5 '--- GC NGC --- 3 '
3 '--- CGN CG --- 5 '

SauI Streptomyces aureofaciens IKA 18/4 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC 5 '--- CC TNAGG --- 3 '
3 '--- ГГАНТ CC --- 5 ' AocI, BliHKI, BspR7I, CvnI, Lmu60I, OxaNI, SauI, SshAI

Sau96I Золотистый стафилококк PS96 5 'GGNCC
3 'CCNGG 5 '--- G GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG G --- 5 ' AsuI, Bal228I, Bce22I, BsiZI, BspF4I, Cfr13I, Nsp7121I, UnbI

Sau3239I Streptomyces aureofaciens 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 5 '--- С TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT C --- 5 ' BspAAI, BstVI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sfr274I, SlaI, XpaI

Sau3AI 2REU Золотистый стафилококк 3А 5 'GATC
3 'CTAG 5' --- GATC --- 3 '
3 '--- CTAG --- 5' Bce243I, Bsp143I, BspJI, BstMBI, CviAI, Kzo9I, NdeII, Sth368I

SauBMKI Streptomyces aureofaciens БМ-К 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- GCC GGC --- 3 '
3 '--- CGG CCG --- 5 '

SauHPI Streptomyces aureofaciens R8 / 26 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- GCC GGC --- 3 '
3 '--- CGG CCG --- 5 '

SauLPI Streptomyces aureofaciens В-96 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- GCC GGC --- 3 '
3 '--- CGG CCG --- 5 '

SauLPII Streptomyces aureofaciens В-96 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 5 '--- С TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT C --- 5 ' BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sfr274I, SlaI, XpaI

SauMI Золотистый стафилококк M 5 'GATC
3 'CTAG 5' --- GATC --- 3 '
3 '--- CTAG --- 5' BscFI, BspAI, БстКТИ, Чай, HacI, MkrAI, RalF40I, SsiAI

Сауни Streptomyces aureofaciens NMU 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- GCC GGC --- 3 '
3 '--- CGG CCG --- 5 '

SauSI Streptomyces aureofaciens 16 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- GCC GGC --- 3 '
3 '--- CGG CCG --- 5 '

SbfI Streptomyces sp. BF-61 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC 5 '--- CCTGCA GG --- 3 '
3 '--- GG ACGTCC --- 5 '

Sbi68I Streptomyces bikiniensis JAM68 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 5 '--- С TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT C --- 5 ' BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XpaI

Sbo13I Шигелла бойди 13 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT 5 '--- TCG CGA --- 3 '
3 '--- AGC GCT --- 5 '

SbvI Streptococcus bovis II / 1 5 'GGCC
3 'CCGG 5 '--- GG CC --- 3 '
3 '--- CC GG --- 5 '

ScaI ^[7]

Streptomyces caespitosus

5 'АГТАКТ
3 'TCATGA

5 '--- AGT ДЕЙСТВИЕ --- 3 '
3 '--- TCA TGA --- 5 '

Acc113I, AssI,	BmcAI, Bpa34I,
DpaI, Eco255I, RflFII, ZrmI

Сцена III Saccharomyces cerevisiae 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- G CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC G --- 5 '

SchI Стафилококк cohnii Лки 19-320 5 'GAGTC
3 'CTCAG 5 '--- GAGTCN₄N --- 3'
3 '--- CTCAGN₄N --- 5'

ЩЗИ Streptomyces chusanensis ЗС-2 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

Наука Streptoverticillium cinnamoneum 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 5 '--- СТС GAG --- 3 '
3 '--- GAG CTC --- 5 ' BspAAI, BstVI, MlaAI, PaeR7I, SauLPII, SlaI, Sol10179I, XhoI

Наука Citri Spiroplasma ASP2 5 'GCGC
3 'CGCG 5 '--- G CGC --- 3 '
3 '--- CGC G --- 5 ' BspLAI, BstHHI, CFOI, FnuDIII, HhaI, Hin6I, HinP1I, HsoI, HspAI

ScrFI Streptococcus cremoris F 5 'CCNGG
3 'GGNCC 5 '--- CC NGG --- 3 '
3 '--- GGN CC --- 5 '

SdaI 2IXS Streptomyces diastaticus Кg7-324 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC 5 '--- CCTGCA GG --- 3 '
3 '--- GG ACGTCC --- 5 '

SdiI Streptomyces diastaticus 5 'GGCCN₅GGCC
3 'CCGGN₅CCGG 5 '--- GGCCNNNN NGGCC --- 3 '
3 '--- CCGGN NNNNCCGG --- 5 '

SduI Streptococcus durans RFL3 5 'ГДГЧК
3 'CHCGDG 5 '--- ГДГЧ C --- 3 '
3 '--- С HCGDG --- 5 ' AocII, BmyI, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, MhlI, NspII

SecI Synechocystis sp. 6701 5 'CCNNGG
3 'GGNNCC 5 '--- С CNNGG --- 3 '
3 '--- GGNNC C --- 5 '

SelI Synechococcus elongatus 5 футов CGCG
3 'GCGC 5' --- CGCG --- 3 '
3 '--- GCGC --- 5' AccII, Бш1236И, Bsp123I, Bsp50I, BstFNI, BstUI, BtkI, Csp68KVI

SenPT16I Сальмонелла энтеритидис PT16 5 'CGGCCG
3 'GCCGGC 5 '--- С GGCCG --- 3 '
3 '--- GCCGG C --- 5 ' AaaI, BseX3I, BstZI, EagI, EclXI, Eco52I, XmaIII

SenPT14bI Сальмонелла энтеритидис PT14b 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

SepI Эпидермальный стафилококк 5 'ATGCAT
3 'ТАКГА 5 '--- ATGCA Т --- 3 '
3 '--- т ACGTA --- 5 ' BfrBI, Csp68KIII, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SspD5II, Zsp2I

SexAI Streptomyces exfoliatus 5 'ACCWGGT
3 'TGGWCCA 5 '--- А CCWGGT --- 3 '
3 '--- TGGWCC А --- 5 '

SexBI Streptomyces exfoliatus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

SexCI Streptomyces exfoliatus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

SfaI Streptococcus faecalis зимогены 5 'GGCC
3 'CCGG 5 '--- GG CC --- 3 '
3 '--- CC GG --- 5 '

SfaNI Streptococcus faecalis ND547 5 'GCATC
3 'CGTAG 5 '--- GCATCN₄N NNNN --- 3 '
3 '--- CGTAGN₄NNNNN --- 5'

SfcI Streptococcus faecium 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC 5 '--- С TRYAG --- 3 '
3 '--- ГАЙРТ C --- 5 '

SfeI Streptococcus faecalis 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC 5 '--- С TRYAG --- 3 '
3 '--- ГАЙРТ C --- 5 '

SfiI 2F03 Streptomyces fimbriatus 5 'GGCCN₅GGCC
3 'CCGGN₅CCGG 5 '--- GGCCNNNN NGGCC --- 3 '
3 '--- CCGGN NNNNCCGG --- 5 '

SflI Streptoverticillium flavopersicum 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 5 '--- CTGCA G --- 3 '
3 '--- G ACGTC --- 5 ' ApiI, BspMAI, BsuBI, CfrA4I, Psp23I, PstI, Sag23I, Srl5DI, YenI

СФОИ Serratia fonticola 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG 5 '--- GGC GCC --- 3 '
3 '--- CCG CGG --- 5 '

Sfr274I Streptomyces fradiae 274 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 5 '--- С TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT C --- 5 ' AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sol10179I, StrI, TliI

Sfr303I Streptomyces fradiae 303 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

SfuI Streptomyces fulvissimus 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 5 '--- ТТ CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC TT --- 5 ' AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, Csp68KII, PlaII, Ssp1I, SviI

SgfI

Streptomyces griseoruber

5 'GCGATCGC
3 'CGCTAGCG

5 '--- GCGAT CGC --- 3 '
3 '--- CGC TAGCG --- 5 '

AsiSI,

RgaI, SfaAI

SgrAI 3DPG 3Н7Б 3N78 3МГГ 3МГ6 Streptomyces griseus 5 'CRCCGGYG
3 'GYGGCCRC 5 '--- CR CCGGYG --- 3 '
3 '--- GYGGCC RC --- 5 '

SgrBI Streptomyces griseus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

SimI Промежуточный стафилококк 6H 5 'GGGTC
3 'CCCAG 5 '--- GG GTC --- 3 '
3 '--- CCCAG --- 5'

SinI Сальмонелла младенческая 5 'GGWCC
3 'CCWGG 5 '--- G GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG G --- 5 ' Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHIII, Psp03I, ВпаК11БИ

SlaI Streptomyces lavendulae 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 5 '--- С TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT C --- 5 ' AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI

SleI Synechococcus leopoliensis 5 'CCWGG
3 'GGWCC 5' --- CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC --- 5' AeuI, Агли, Апаори, БспНИ, Bst2I, ЭкоРИИ, SniI, SslI, SspAI, Зани

Slu1777I Streptomyces lusitanus 1777 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- GCC GGC --- 3 '
3 '--- CGG CCG --- 5 '

SmaI Serratia marcescens Sb 5 'CCCGGG
3 'GGGCCC 5 '--- CCC ГГГ --- 3 '
3 '--- GGG CCC --- 5 ' Ахы, CfrJ4I, EaeAI, EclRI, Pac25I, PspAI, TspMI, XcyI, XmaI, XmaCI

SmiI Streptococcus milleri S 5 'ATTTAAAT
3 'ТАААТТТА 5 '--- ATTT AAAT --- 3 '
3 '--- ТААА TTTA --- 5 '

SmiMI Sphingobacterium mizutae M 5 'КАЙН₄РИТЭГ
3 'ГТРН₄YAC 5 '--- КЕЙНН NNRTG --- 3 '
3 '--- GTRNN NNYAC --- 5 '

SmlI Stenotrophomonas maltophilia 5 'CTYRAG
3 'ГАРРИТК 5 '--- С ТИРАГ --- 3 '
3 '--- ГАРРИТ C --- 5 '

SmuI Sphingobacterium multivorum RFL21 5 'CCCGC
3 'GGGCG 5 '--- CCCGCNNNN NN --- 3 '
3 '--- GGGCGNNNNNN --- 5'

SmuEI Streptococcus mutans E 5 'GGWCC
3 'CCWGG 5 '--- G GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG G --- 5 ' Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHIII, Psp03I, ВпаК11БИ

SnaBI Sphaerotilus natans 5 'ТАКГА
3 'ATGCAT 5 '--- TAC GTA --- 3 '
3 '--- ПТГ КОШКА --- 5 '

SniI Streptomyces niveus 5 'CCWGG
3 'GGWCC 5 '--- CC WGG --- 3 '
3 '--- GGW CC --- 5 ' ApaORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, MvaI, SspAI

SnoI Streptomyces novocastria 5 'GTGCAC
3 'CACGTG 5 '--- G TGCAC --- 3 '
3 '--- CACGT G --- 5 ' Alw44I, ApaLI, VneI

SolI Streptoverticillium olivoverticillatum 5 'GGATCC
3 'CCTAGG 5 '--- G GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG G --- 5 ' AccEBI, AliI, ApaCI, BamHI, Bce751I, CelI, OkrAI, SolI, SurI

Sol10179I Streptomyces olivochromogenes ST10179 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 5 '--- С TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT C --- 5 ' BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XpaI

SpaHI Synechococus parietina 5 'GCATGC
3 'CGTACG 5 '--- GCATG C --- 3 '
3 '--- С GTACG --- 5 '

SpeI Sphaerotilus natans 5 'ACTAGT
3 'ТГАТКА 5 '--- А CTAGT --- 3 '
3 '--- ТГАТК А --- 5 ' AhII, AclNI, BcuI

SphI ^[7] Streptomyces phaeochromogenes 5 'GCATGC
3 'CGTACG 5 '--- GCATG C --- 3 '
3 '--- С GTACG --- 5 '

SplI Spirulina platensis 5 'CGTACG
3 'GCATGC 5 '--- С GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG C --- 5 '

SpmI Sphingobacterium multivorum RFL21 5 'ATCGAT
3 'ТАГКТА 5 '--- В CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC ТА --- 5 ' BanIII, BbvAII, BdiI, BscI, Bsa29I, BspJI, ClaI, LcaI, PgaI, Ssp27144I

SpoI Сальмонелла потсдам 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT 5 '--- TCG CGA --- 3 '
3 '--- AGC GCT --- 5 '

SpuI Streptomyces pulveraceus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

SrfI Streptomyces sp. 5 'GCCCGGGC
3 'CGGGCCCG 5 '--- GCCC GGGC --- 3 '
3 '--- CGGG CCCG --- 5 '

SrlI Selenomonas ruminantium lactilytica 84 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- G CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC G --- 5 '

Srl5DI Selenomonas ruminantium 5 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 5 '--- CTGCA G --- 3 '
3 '--- G ACGTC --- 5 ' AliAJI, Asp713I, BspMAI, BsuBI, CfrA4I, Pfl21I, PstI, SflI, Srl5DI

Srl32DII Selenomonas ruminantium 32 5 'GAATTC
3 'CTTAAG 5 '--- G AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA G --- 5 '

Srl55DI Selenomonas ruminantium lactilytica 55 5 'GAATTC
3 'CTTAAG 5 '--- G AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA G --- 5 '

Srl56DI Selenomonas ruminantium 56 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC 5 '--- С TRYAG --- 3 '
3 '--- ГАЙРТ C --- 5 '

SruI Selenomonas ruminantium 18D 5 'TTTAAA
3 'AAATTT 5 '--- TTT AAA --- 3 '
3 '--- AAA ТТТ --- 5 ' AhaIII, DraI, PauAII

Sru4DI Selenomonas ruminantium 5 'АТТААТ
3 'ТААТТА 5 '--- В ТААТ --- 3 '
3 '--- ТААТ ТА --- 5 ' АсеИ, Асни, БпоАИ, ПшБИ, ВСПИ

Sru30DI Selenomonas ruminantium 30 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA 5 '--- AGG CCT --- 3 '
3 '--- TCC GGA --- 5 ' AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, SseBI, SteI, StuI

ССБИ Streptomyces чесотка 5 'AAGCTT
3 'TTCGAA 5 '--- А AGCTT --- 3 '
3 '--- TTCGA А --- 5 '

SscL1I Стафилококк sp. L1 5 'GANTC
3 'CTNAG 5 '--- G ANTC --- 3 '
3 '--- CTNA G --- 5 '

Sse9I Споросарцина sp. 9 5 'AATT
3 'ТТАА 5' --- AATT --- 3 '
3 '--- TTAA --- 5'

Sse232I Streptomyces sp. RH232 5 'CGCCGGCG
3 'GCGGCCGC 5 '--- CG CCGGCG --- 3 '
3 '--- GCGGCC GC --- 5 '

Sse1825I Streptomyces sp. 5 'GGGWCCC
3 'CCCWGGG 5 '--- GG GWCCC --- 3 '
3 '--- CCCWG GG --- 5 '

Sse8387I Streptomyces sp. 8387 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC 5 '--- CCTGCA GG --- 3 '
3 '--- GG ACGTCC --- 5 '

Sse8647I Streptomyces sp. 5 'AGGWCCT
3 'TCCWGGA 5 '--- AG GWCCT --- 3 '
3 '--- TCCWG GA --- 5 '

SseAI Streptomyces sp. 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG 5 '--- GG CGCC --- 3 '
3 '--- CCGC GG --- 5 '

SseBI Streptomyces sp. 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA 5 '--- AGG CCT --- 3 '
3 '--- TCC GGA --- 5 ' AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SteI, StuI

ШАЙ Сальмонелла шикмона 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC 5 '--- CC TNAGG --- 3 '
3 '--- ГГАНТ CC --- 5 ' AocI, BliHKI, BspR7I, CvnI, Lmu60I, OxaNI, SauI, SshAI

SsiI Стафилококк sciuri RFL1 5 'CCGC
3 'GGCG 5 '--- С CGC --- 3 '
3 '--- GGC G --- 5 ' AciI

SsiAI Стафилококк sp. А 5 'GATC
3 'CTAG 5' --- GATC --- 3 '
3 '--- CTAG --- 5' BscFI, BspAI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI

SsiBI Стафилококк sp. B 5 'GATC
3 'CTAG 5' --- GATC --- 3 '
3 '--- CTAG --- 5' BscFI, BspFI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI

SslI Streptococcus salivarius thermophilus 5 'CCWGG
3 'GGWCC 5 '--- CC WGG --- 3 '
3 '--- GGW CC --- 5 ' ApaORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, ЭкоРИИ, MvaI

SsoI Shigella sonnei 47 5 'GAATTC
3 'CTTAAG 5 '--- G AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA G --- 5 '

SsoII Shigella sonnei 47 5 'CCNGG
3 'GGNCC 5' --- CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC --- 5'

SspI Sphaerotilus sp. 5 'AATATT
3 'TTATAA 5 '--- AAT ATT --- 3 '
3 '--- ТТА TAA --- 5 '

Ssp1I Streptomyces sp. RFL1 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 5 '--- ТТ CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC TT --- 5 ' AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, MlaI, PlaII, SfuI, SspRFI, SviI

Ssp4800I

Streptomyces sp. BMTU 4800

5 'TGTACA
3 'ACATGT

5 '--- т GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG Т --- 5 '

AauI,	BsmRI,	Bsp1407I,
БсрГИ, БстАУИ, СспБИ

Ssp5230I Streptomyces sp. 5230 5 'GACGTC
3 'CTGCAG 5 '--- GACGT C --- 3 '
3 '--- С TGCAG --- 5 ' АатII, ЗРАИ

Ssp27144I Синехококк sp. 5 'ATCGAT
3 'ТАГКТА 5 '--- В CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC ТА --- 5 ' BanIII, BavCI, BbvAII, BscI, BspJI, BspOVII, BstNZ169I, ClaI, LcaI

SspAI Синехококк sp. 5 'CCWGG
3 'GGWCC 5' --- CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC --- 5' AeuI, AorI, Bse17I, БспНИ, Bst2I, ЭкоРИИ, SniI, SslI, SspAI, Зани

SspBI

Streptomyces sp.

5 'TGTACA
3 'ACATGT

5 '--- т GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG Т --- 5 '

AauI,	BsmRI,	Bsp1407I,
БсрГИ, БстАУИ, Ссп4800И

SspCI Streptomyces sp. 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- GCC GGC --- 3 '
3 '--- CGG CCG --- 5 '

SspD5I Стафилококк sp. D5 5 'GGTGA
3 'CCACT 5 '--- GGTGAN₇N --- 3'
3 '--- CCACTN₇N --- 5' AsuHPI, HphI

SspD5II Стафилококк sp. D5 5 'ATGCAT
3 'ТАКГА 5 '--- ATGCA Т --- 3 '
3 '--- т ACGTA --- 5 ' Csp68KIII, EcoT22I, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SepI, Zsp2I

SspRFI Синехококк sp. РФ-1 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 5 '--- ТТ CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC TT --- 5 ' AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, MlaI, PpaAI, SfuI, Ssp1I, SviI

ССРИ Staphylococcus saprophyticus B6 5 'GTTAAC
3 'CAATTG 5 '--- GTT AAC --- 3 '
3 '--- CAA ТТГ --- 5 '

SstI Streptomyces stanford 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG 5 '--- GAGCT C --- 3 '
3 '--- С TCGAG --- 5 '

SstII Streptomyces stanford 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

Sst12I Streptomyces sp. СТ-12 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 5 '--- CTGCA G --- 3 '
3 '--- G ACGTC --- 5 ' Asp713I, BloHII, BspMAI, BsuBI, CfuII, Psp23I, PstI, SflI, Srl5DI

SteI Streptomyces tendae 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA 5 '--- AGG CCT --- 3 '
3 '--- TCC GGA --- 5 ' AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SseBI, StuI

SthI Сальмонелла Томпсон YY356 5 'GGTACC
3 'CCATGG 5 '--- G GTACC --- 3 '
3 '--- CCATG G --- 5 ' Acc65I, AhaB8I, Asp718I, КПНИ,

Sth117I Термофильный стрептококк ST117 5 'CCWGG
3 'GGWCC 5 '--- CC WGG --- 3 '
3 '--- GGW CC --- 5 ' ApaORI, BseBI, BsiLI, BstNI, BstOI, Bst2UI, ЭкоРИИ, MvaI, SspAI

Sth132I Термофильный стрептококк 5 'CCCG
3 'GGGC 5 '--- CCCGNNNN NNNN --- 3 '
3 '--- GGGCNNNNNNNN --- 5'

Sth134I Термофильный стрептококк 134 5 'CCGG
3 'GGCC 5 '--- С CGG --- 3 '
3 '--- GGC C --- 5 '

Sth368I Термофильный стрептококк CNRZ368 5 'GATC
3 'CTAG 5' --- GATC --- 3 '
3 '--- CTAG --- 5' BscFI, BspFI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI

StrI Streptomyces thermodiastaticus 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 5 '--- С TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT C --- 5 ' AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI

StsI Streptococcus sanguis 54 5 'ГГАТГ
3 'CCTAC 5 '--- ГГАТГН₈NN NNNN --- 3 '
3 '--- CCTACN₈NNNNNN --- 5'

StuI ^[8] Streptomyces tubercidicus 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA 5 '--- AGG CCT --- 3 '
3 '--- TCC GGA --- 5 ' AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, SarI, Sru30DI, SseBI, SteI

StyI Сальмонелла тиф 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC 5 '--- С CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC C --- 5 '

StyD4I Сальмонелла тиф D4 5 'CCNGG
3 'GGNCC 5' --- CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC --- 5'

Суай Sulfolobus acidocaldarius 5 'GGCC
3 'CCGG 5 '--- GG CC --- 3 '
3 '--- CC GG --- 5 '

SuiI Sulfolobus islandicus REN2HI 5 'GCWGC
3 'CGWCG 5 '--- G CWGC --- 3 '
3 '--- CGWC G --- 5 ' AceI, ApeKI, Taq52I, TseI

SunI Synechococcus uniformis 5 'CGTACG
3 'GCATGC 5 '--- С GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG C --- 5 '

SurI Sporosarcina ureae 2 5 'GGATCC
3 'CCTAGG 5 '--- G GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG G --- 5 ' AccEBI, AliI, ApaCI, AsiI, BamHI, Bce751I, OkrAI, RspLKII, SolI

SviI Streptomyces violochromogenes 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 5 '--- ТТ CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC TT --- 5 ' AsuII, Bpu14I, Bsp119I, CbiI, MlaI, PpaAI, SfuI, Ssp1I

SwaI Staphylococcus warneri 5 'ATTTAAAT
3 'ТАААТТТА 5 '--- ATTT AAAT --- 3 '
3 '--- ТААА TTTA --- 5 '

Примечания

^ Смит Х.О., Натанс Д. (декабрь 1973 г.). «Письмо: Предлагаемая номенклатура для бактериальных систем модификации и рестрикции и их ферментов». J. Mol. Биол. 81 (3): 419–23. Дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.
^ Робертс Р.Дж., Белфорт М., Бестор Т., Бхагват А.С., Бикл Т.А., Битинаит Дж., Блюменталь Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К., Фирман К., Громова Е.С., Гампорт Р.И., Халфорд С.Е., Хаттман С., Хейтман Дж., Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh Э, Рао Д. Н., Райх Н., Репин В. Е., Селкер Э. С., Шоу П. К., Штейн Д. К., Стоддард Б. Л., Шибальский В., Траутнер Т. А., Ван Эттен Д. Л., Витор Д. М., Уилсон Г. Г., Сюй С.Ю. (апрель 2003 г.). «Номенклатура рестрикционных ферментов, ДНК-метилтрансфераз, самонаводящихся эндонуклеаз и их генов». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1805–12. Дои:10.1093 / nar / gkg274. ЧВК 152790. PMID 12654995.
^ Джереми МБ, Джон LT, Люберт S (2002). «3. Структура и функции белка». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN 0-7167-4684-0.
^ Анфинсен К. Б. (1973). «Принципы, регулирующие сворачивание белковых цепей». Наука. 181 (4096): 223–30. Дои:10.1126 / science.181.4096.223. PMID 4124164.
^ Кесслер C, Манта V (август 1990 г.). «Специфичность рестрикционных эндонуклеаз и модификации ДНК метилтрансфераз - обзор (издание 3)». Ген. 92 (1–2): 1–248. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-Б. PMID 2172084.
^ Pingoud A, Jeltsch A (сентябрь 2001 г.). «Структура и функция эндонуклеаз рестрикции II типа». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (18): 3705–27. Дои:10.1093 / nar / 29.18.3705. ЧВК 55916. PMID 11557805.
^ ^а ^б ^c ^d Монти Кригер; Мэтью П. Скотт; Matsudaira, Paul T .; Лодиш, Харви Ф .; Дарнелл, Джеймс Э .; Лоуренс Зипурски; Кайзер, Крис; Арнольд Берк (2004). Молекулярная клеточная биология (5-е изд.). Нью-Йорк: W.H. Фримен и компания. ISBN 0-7167-4366-3.
^ Шимоцу Х, Такахаши Х, Сайто Х (ноябрь 1980 г.). "Новая сайт-специфическая эндонуклеаза StuI от Streptomyces tubercidicus". Ген. 11 (3–4): 219–25. Дои:10.1016/0378-1119(80)90062-1. PMID 6260571.

[pmid4588280-1] Смит Х.О., Натанс Д. (декабрь 1973 г.). «Письмо: Предлагаемая номенклатура для бактериальных систем модификации и рестрикции и их ферментов». J. Mol. Биол. 81 (3): 419–23. Дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.

[pmid12654995-2] Робертс Р.Дж., Белфорт М., Бестор Т., Бхагват А.С., Бикл Т.А., Битинаит Дж., Блюменталь Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К., Фирман К., Громова Е.С., Гампорт Р.И., Халфорд С.Е., Хаттман С., Хейтман Дж., Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh Э, Рао Д. Н., Райх Н., Репин В. Е., Селкер Э. С., Шоу П. К., Штейн Д. К., Стоддард Б. Л., Шибальский В., Траутнер Т. А., Ван Эттен Д. Л., Витор Д. М., Уилсон Г. Г., Сюй С.Ю. (апрель 2003 г.). «Номенклатура рестрикционных ферментов, ДНК-метилтрансфераз, самонаводящихся эндонуклеаз и их генов». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1805–12. Дои:10.1093 / nar / gkg274. ЧВК 152790. PMID 12654995.

[3] Джереми МБ, Джон LT, Люберт S (2002). «3. Структура и функции белка». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN 0-7167-4684-0.

[4] Анфинсен К. Б. (1973). «Принципы, регулирующие сворачивание белковых цепей». Наука. 181 (4096): 223–30. Дои:10.1126 / science.181.4096.223. PMID 4124164.

[pmid2172084-5] Кесслер C, Манта V (август 1990 г.). «Специфичность рестрикционных эндонуклеаз и модификации ДНК метилтрансфераз - обзор (издание 3)». Ген. 92 (1–2): 1–248. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-Б. PMID 2172084.

[pmid11557805-6] Pingoud A, Jeltsch A (сентябрь 2001 г.). «Структура и функция эндонуклеаз рестрикции II типа». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (18): 3705–27. Дои:10.1093 / nar / 29.18.3705. ЧВК 55916. PMID 11557805.

[isbn0-7167-4366-3-7] а ^б ^c ^d Монти Кригер; Мэтью П. Скотт; Matsudaira, Paul T .; Лодиш, Харви Ф .; Дарнелл, Джеймс Э .; Лоуренс Зипурски; Кайзер, Крис; Арнольд Берк (2004). Молекулярная клеточная биология (5-е изд.). Нью-Йорк: W.H. Фримен и компания. ISBN 0-7167-4366-3.

[pmid6260571-8] Шимоцу Х, Такахаши Х, Сайто Х (ноябрь 1980 г.). "Новая сайт-специфическая эндонуклеаза StuI от Streptomyces tubercidicus". Ген. 11 (3–4): 219–25. Дои:10.1016/0378-1119(80)90062-1. PMID 6260571.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Система модификации ограничений: рестрикционный фермент
Основная концепция	Изошизомер Неошизомер Изокаудомер
Последовательность распознавания 4bp	Taqя Sau3А АлуЯ* ХэIII * ДпнII NlaIII HpaII
Последовательность распознавания 5bp	ЭкоRII Фокя
Последовательность распознавания 6bp	Ааая BglII POVII * ЭкоRV * ЭкоRI БамЗДРАВСТВУЙ ЗадняяIII Xbaя Xhoя Мешокя Тихоокеанское стандартное времяя Ндея
Последовательность распознавания 8bp	Нетя
Списки	А Ba – Bc Bd – Bp Bsa – Bso Bsp – Bss Bst – Bv CD E-F G-K L-N ИЛИ ЖЕ S Т-Я
* означает, что расщепление производит тупые концы