Список сайтов разрезания рестрикционных ферментов: S - Википедия - List of restriction enzyme cutting sites: S

Легенда о азотистые основания
КодНуклеотид представлен
ААденин (А)
CЦитозин (С)
граммГуанин (ГРАММ)
ТТимин (Т)
NA, C, G или T
MА или С
рA или G
WА или Т
YC или T
SC или G
KG или T
ЧАСA, C или T
BC, G или T
VA, C или G
DA, G или T


Эта статья содержит список наиболее изученных рестрикционных ферментов, названия которых начинаются на S. В нем содержится около 130 ферментов. Приведена следующая информация:

  • Фермент: Принятое название молекула, согласно международно принятой номенклатура[1][2], и библиографические ссылки. (Дальнейшее чтение: см. Раздел "Номенклатура "в статье"Фермент рестрикции ".)
  • Код PDB: Код, используемый для определения структуры белка в PDB база данных белковых структур. Трехмерная атомная структура белка предоставляет очень ценную информацию для понимания внутренних деталей механизма его действия.[3][4].
  • Источник: Организм, который естественным образом производит фермент.
  • Последовательность распознавания: Последовательность ДНК, распознаваемая ферментом и с которой он специфически связывается.
  • Резать: Участок разреза и продукты ДНК разреза. В последовательность распознавания и место разрезания обычно совпадают, но иногда сайт разреза может находиться на расстоянии нескольких десятков нуклеотидов от сайта распознавания[5][6].
  • Изошизомеры и неошизомеры: An изошизомер является фермент который распознает ту же последовательность, что и другой. А неошизомер представляет собой особый тип изошизомера, который распознает одну и ту же последовательность, но разрезает другим способом. Для каждого фермента указано не более 8-10 наиболее распространенных изошизомеров, но их может быть намного больше. Неошизомеры выделены жирным шрифтом зеленого цвета (например: BamHI). Когда "Нет на Дата", это означает, что на эту дату в базах данных не было зарегистрированных изошизомеров с четко определенным участком разрезания. Изошизомеры, указанные белым шрифтом и серым фоном, соответствуют ферментам, не указанным в текущих списках:
как в этом не перечисленном ферменте: EcoR70I 


Навигация по всему списку

Ферменты рестрикции

S

ФерментКод PDBИсточникПоследовательность распознаванияРезатьИзошизомеры
SacI [7]Streptomyces achromogenes 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG
5 '--- GAGCT   C --- 3 '
3 '--- С   TCGAG --- 5 '
SacIIStreptomyces achromogenes 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
Cfr42I
SacNIStreptomyces achromogenes N-J-H 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG
5 '--- GRGCY   C --- 3 '
3 '--- С   YCGRG --- 5 '
SalI [7]Streptomyces albus 5 'GTCGAC
3 'CAGCTG
5 '--- G   TCGAC --- 3 '
3 '--- CAGCT   G --- 5 '
СалПИStreptomyces albus 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- G   ACGTC --- 5 '
ApiI, BspMAI, CstI, Ecl37kI, Ecl2zI, Psp23I, PstI, Srl5DI, YenI
SanDIStreptomyces sp. 5 'GGGWCCC
3 'CCCWGGG
5 '--- GG   GWCCC --- 3 '
3 '--- CCCWG   GG --- 5 '
SapIСахарополиспора sp. 5 'GCTCTTC
3 'CGAGAAG
5 '--- GCTCTTCN   NNN --- 3 '
3 '--- CGAGAAGNNNN   --- 5'
СариStreptomyces aureomonopodiales 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, Sru30DI, SseBI, SteI, StuI
СатиСтафилококк arlettae RFL832 5 'GCNGC
3 'CGNCG
5 '--- GC   NGC --- 3 '
3 '--- CGN   CG --- 5 '
SauIStreptomyces aureofaciens IKA 18/4 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC
5 '--- CC   TNAGG --- 3 '
3 '--- ГГАНТ   CC --- 5 '
AocI, BliHKI, BspR7I, CvnI, Lmu60I, OxaNI, SauI, SshAI
Sau96IЗолотистый стафилококк PS96 5 'GGNCC
3 'CCNGG
5 '--- G   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 '
AsuI, Bal228I, Bce22I, BsiZI, BspF4I, Cfr13I, Nsp7121I, UnbI
Sau3239IStreptomyces aureofaciens 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, BstVI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sfr274I, SlaI, XpaI
Sau3AI2REUЗолотистый стафилококк 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
Bce243I, Bsp143I, BspJI, BstMBI, CviAI, Kzo9I, NdeII, Sth368I
SauBMKIStreptomyces aureofaciens БМ-К 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauHPIStreptomyces aureofaciens R8 / 26 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauLPIStreptomyces aureofaciens В-96 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauLPIIStreptomyces aureofaciens В-96 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sfr274I, SlaI, XpaI
SauMIЗолотистый стафилококк M 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspAI, БстКТИ, Чай, HacI, MkrAI, RalF40I, SsiAI
СауниStreptomyces aureofaciens NMU 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauSIStreptomyces aureofaciens 16 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SbfIStreptomyces sp. BF-61 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
Sbi68IStreptomyces bikiniensis JAM68 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XpaI
Sbo13IШигелла бойди 13 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT
5 '--- TCG   CGA --- 3 '
3 '--- AGC   GCT --- 5 '
SbvIStreptococcus bovis II / 1 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
ScaI [7]Streptomyces caespitosus 5 'АГТАКТ
3 'TCATGA
5 '--- AGT   ДЕЙСТВИЕ --- 3 '
3 '--- TCA   TGA --- 5 '
Acc113I, AssI, BmcAI, Bpa34I, 
DpaI, Eco255I, RflFII, ZrmI
Сцена IIISaccharomyces cerevisiae 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- G   CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC   G --- 5 '
SchIСтафилококк cohnii Лки 19-320 5 'GAGTC
3 'CTCAG
5 '--- GAGTCN4N   --- 3'
3 '--- CTCAGN4N   --- 5'
ЩЗИStreptomyces chusanensis ЗС-2 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
НаукаStreptoverticillium cinnamoneum 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- СТС   GAG --- 3 '
3 '--- GAG   CTC --- 5 '
BspAAI, BstVI, MlaAI, PaeR7I, SauLPII, SlaI, Sol10179I, XhoI
НаукаCitri Spiroplasma ASP2 5 'GCGC
3 'CGCG
5 '--- G   CGC --- 3 '
3 '--- CGC   G --- 5 '
BspLAI, BstHHI, CFOI, FnuDIII, HhaI, Hin6I, HinP1I, HsoI, HspAI
ScrFIStreptococcus cremoris F 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5 '--- CC   NGG --- 3 '
3 '--- GGN   CC --- 5 '
SdaI2IXSStreptomyces diastaticus Кg7-324 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
SdiIStreptomyces diastaticus 5 'GGCCN5GGCC
3 'CCGGN5CCGG
5 '--- GGCCNNNN   NGGCC --- 3 '
3 '--- CCGGN   NNNNCCGG --- 5 '
SduIStreptococcus durans RFL3 5 'ГДГЧК
3 'CHCGDG
5 '--- ГДГЧ   C --- 3 '
3 '--- С   HCGDG --- 5 '
AocII, BmyI, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, MhlI, NspII
SecISynechocystis sp. 6701 5 'CCNNGG
3 'GGNNCC
5 '--- С   CNNGG --- 3 '
3 '--- GGNNC   C --- 5 '
SelISynechococcus elongatus 5 футов CGCG
3 'GCGC
5' ---   CGCG --- 3 '
3 '--- GCGC   --- 5'
AccII, Бш1236И, Bsp123I, Bsp50I, BstFNI, BstUI, BtkI, Csp68KVI
SenPT16IСальмонелла энтеритидис PT16 5 'CGGCCG
3 'GCCGGC
5 '--- С   GGCCG --- 3 '
3 '--- GCCGG   C --- 5 '
AaaI, BseX3I, BstZI, EagI, EclXI, Eco52I, XmaIII
SenPT14bIСальмонелла энтеритидис PT14b 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SepIЭпидермальный стафилококк 5 'ATGCAT
3 'ТАКГА
5 '--- ATGCA   Т --- 3 '
3 '--- т   ACGTA --- 5 '
BfrBI, Csp68KIII, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SspD5II, Zsp2I
SexAIStreptomyces exfoliatus 5 'ACCWGGT
3 'TGGWCCA
5 '--- А   CCWGGT --- 3 '
3 '--- TGGWCC   А --- 5 '
SexBIStreptomyces exfoliatus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SexCIStreptomyces exfoliatus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SfaIStreptococcus faecalis зимогены 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
SfaNIStreptococcus faecalis ND547 5 'GCATC
3 'CGTAG
5 '--- GCATCN4N   NNNN --- 3 '
3 '--- CGTAGN4NNNNN   --- 5'
SfcIStreptococcus faecium 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- С   TRYAG --- 3 '
3 '--- ГАЙРТ   C --- 5 '
SfeIStreptococcus faecalis 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- С   TRYAG --- 3 '
3 '--- ГАЙРТ   C --- 5 '
SfiI2F03Streptomyces fimbriatus 5 'GGCCN5GGCC
3 'CCGGN5CCGG
5 '--- GGCCNNNN   NGGCC --- 3 '
3 '--- CCGGN   NNNNCCGG --- 5 '
SflIStreptoverticillium flavopersicum 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- G   ACGTC --- 5 '
ApiI, BspMAI, BsuBI, CfrA4I, Psp23I, PstI, Sag23I, Srl5DI, YenI
СФОИSerratia fonticola 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG
5 '--- GGC   GCC --- 3 '
3 '--- CCG   CGG --- 5 '
Sfr274IStreptomyces fradiae 274 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sol10179I, StrI, TliI
Sfr303IStreptomyces fradiae 303 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SfuIStreptomyces fulvissimus 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, Csp68KII, PlaII, Ssp1I, SviI
SgfIStreptomyces griseoruber 5 'GCGATCGC
3 'CGCTAGCG
5 '--- GCGAT   CGC --- 3 '
3 '--- CGC   TAGCG --- 5 '
AsiSI, RgaI, SfaAI 
SgrAI3DPG 3Н7Б 3N78 3МГГ 3МГ6Streptomyces griseus 5 'CRCCGGYG
3 'GYGGCCRC
5 '--- CR   CCGGYG --- 3 '
3 '--- GYGGCC   RC --- 5 '
SgrBIStreptomyces griseus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SimIПромежуточный стафилококк 6H 5 'GGGTC
3 'CCCAG
5 '--- GG   GTC --- 3 '
3 '--- CCCAG   --- 5'
SinIСальмонелла младенческая 5 'GGWCC
3 'CCWGG
5 '--- G   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 '
Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHIII, Psp03I, ВпаК11БИ
SlaIStreptomyces lavendulae 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI
SleISynechococcus leopoliensis 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5' ---   CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC   --- 5'
AeuI, Агли, Апаори, БспНИ, Bst2I, ЭкоРИИ, SniI, SslI, SspAI, Зани
Slu1777IStreptomyces lusitanus 1777 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SmaISerratia marcescens Sb 5 'CCCGGG
3 'GGGCCC
5 '--- CCC   ГГГ --- 3 '
3 '--- GGG   CCC --- 5 '
Ахы, CfrJ4I, EaeAI, EclRI, Pac25I, PspAI, TspMI, XcyI, XmaI, XmaCI
SmiIStreptococcus milleri S 5 'ATTTAAAT
3 'ТАААТТТА
5 '--- ATTT   AAAT --- 3 '
3 '--- ТААА   TTTA --- 5 '
SmiMISphingobacterium mizutae M 5 'КАЙН4РИТЭГ
3 'ГТРН4YAC
5 '--- КЕЙНН   NNRTG --- 3 '
3 '--- GTRNN   NNYAC --- 5 '
SmlIStenotrophomonas maltophilia 5 'CTYRAG
3 'ГАРРИТК
5 '--- С   ТИРАГ --- 3 '
3 '--- ГАРРИТ   C --- 5 '
SmuISphingobacterium multivorum RFL21 5 'CCCGC
3 'GGGCG
5 '--- CCCGCNNNN   NN --- 3 '
3 '--- GGGCGNNNNNN   --- 5'
SmuEIStreptococcus mutans E 5 'GGWCC
3 'CCWGG
5 '--- G   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 '
Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHIII, Psp03I, ВпаК11БИ
SnaBISphaerotilus natans 5 'ТАКГА
3 'ATGCAT
5 '--- TAC   GTA --- 3 '
3 '--- ПТГ   КОШКА --- 5 '
SniIStreptomyces niveus 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
ApaORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, MvaI, SspAI
SnoIStreptomyces novocastria 5 'GTGCAC
3 'CACGTG
5 '--- G   TGCAC --- 3 '
3 '--- CACGT   G --- 5 '
Alw44I, ApaLI, VneI
SolIStreptoverticillium olivoverticillatum 5 'GGATCC
3 'CCTAGG
5 '--- G   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 '
AccEBI, AliI, ApaCI, BamHI, Bce751I, CelI, OkrAI, SolI, SurI
Sol10179IStreptomyces olivochromogenes ST10179 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XpaI
SpaHISynechococus parietina 5 'GCATGC
3 'CGTACG
5 '--- GCATG   C --- 3 '
3 '--- С   GTACG --- 5 '
SpeISphaerotilus natans 5 'ACTAGT
3 'ТГАТКА
5 '--- А   CTAGT --- 3 '
3 '--- ТГАТК   А --- 5 '
AhII, AclNI, BcuI
SphI [7]Streptomyces phaeochromogenes 5 'GCATGC
3 'CGTACG
5 '--- GCATG   C --- 3 '
3 '--- С   GTACG --- 5 '
SplISpirulina platensis 5 'CGTACG
3 'GCATGC
5 '--- С   GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG   C --- 5 '
SpmISphingobacterium multivorum RFL21 5 'ATCGAT
3 'ТАГКТА
5 '--- В   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   ТА --- 5 '
BanIII, BbvAII, BdiI, BscI, Bsa29I, BspJI, ClaI, LcaI, PgaI, Ssp27144I
SpoIСальмонелла потсдам 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT
5 '--- TCG   CGA --- 3 '
3 '--- AGC   GCT --- 5 '
SpuIStreptomyces pulveraceus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SrfIStreptomyces sp. 5 'GCCCGGGC
3 'CGGGCCCG
5 '--- GCCC   GGGC --- 3 '
3 '--- CGGG   CCCG --- 5 '
SrlISelenomonas ruminantium lactilytica 84 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- G   CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC   G --- 5 '
Srl5DISelenomonas ruminantium 5 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- G   ACGTC --- 5 '
AliAJI, Asp713I, BspMAI, BsuBI, CfrA4I, Pfl21I, PstI, SflI, Srl5DI
Srl32DIISelenomonas ruminantium 32 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- G   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
Srl55DISelenomonas ruminantium lactilytica 55 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- G   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
Srl56DISelenomonas ruminantium 56 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- С   TRYAG --- 3 '
3 '--- ГАЙРТ   C --- 5 '
SruISelenomonas ruminantium 18D 5 'TTTAAA
3 'AAATTT
5 '--- TTT   AAA --- 3 '
3 '--- AAA   ТТТ --- 5 '
AhaIII, DraI, PauAII
Sru4DISelenomonas ruminantium 5 'АТТААТ
3 'ТААТТА
5 '--- В   ТААТ --- 3 '
3 '--- ТААТ   ТА --- 5 '
АсеИ, Асни, БпоАИ, ПшБИ, ВСПИ
Sru30DISelenomonas ruminantium 30 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, SseBI, SteI, StuI
ССБИStreptomyces чесотка 5 'AAGCTT
3 'TTCGAA
5 '--- А   AGCTT --- 3 '
3 '--- TTCGA   А --- 5 '
SscL1IСтафилококк sp. L1 5 'GANTC
3 'CTNAG
5 '--- G   ANTC --- 3 '
3 '--- CTNA   G --- 5 '
Sse9IСпоросарцина sp. 9 5 'AATT
3 'ТТАА
5' ---   AATT --- 3 '
3 '--- TTAA   --- 5'
Sse232IStreptomyces sp. RH232 5 'CGCCGGCG
3 'GCGGCCGC
5 '--- CG   CCGGCG --- 3 '
3 '--- GCGGCC   GC --- 5 '
Sse1825IStreptomyces sp. 5 'GGGWCCC
3 'CCCWGGG
5 '--- GG   GWCCC --- 3 '
3 '--- CCCWG   GG --- 5 '
Sse8387IStreptomyces sp. 8387 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
Sse8647IStreptomyces sp. 5 'AGGWCCT
3 'TCCWGGA
5 '--- AG   GWCCT --- 3 '
3 '--- TCCWG   GA --- 5 '
SseAIStreptomyces sp. 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG
5 '--- GG   CGCC --- 3 '
3 '--- CCGC   GG --- 5 '
SseBIStreptomyces sp. 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SteI, StuI
ШАЙСальмонелла шикмона 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC
5 '--- CC   TNAGG --- 3 '
3 '--- ГГАНТ   CC --- 5 '
AocI, BliHKI, BspR7I, CvnI, Lmu60I, OxaNI, SauI, SshAI
SsiIСтафилококк sciuri RFL1 5 'CCGC
3 'GGCG
5 '--- С   CGC --- 3 '
3 '--- GGC   G --- 5 '
AciI
SsiAIСтафилококк sp. А 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspAI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
SsiBIСтафилококк sp. B 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspFI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
SslIStreptococcus salivarius thermophilus 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
ApaORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, ЭкоРИИ, MvaI
SsoIShigella sonnei 47 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- G   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
SsoIIShigella sonnei 47 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5' ---   CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC   --- 5'
SspISphaerotilus sp. 5 'AATATT
3 'TTATAA
5 '--- AAT   ATT --- 3 '
3 '--- ТТА   TAA --- 5 '
Ssp1IStreptomyces sp. RFL1 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, MlaI, PlaII, SfuI, SspRFI, SviI
Ssp4800IStreptomyces sp. BMTU 4800 5 'TGTACA
3 'ACATGT
5 '--- т   GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG   Т --- 5 '
AauI, BsmRI, Bsp1407I,
БсрГИ, БстАУИ, СспБИ
Ssp5230IStreptomyces sp. 5230 5 'GACGTC
3 'CTGCAG
5 '--- GACGT   C --- 3 '
3 '--- С   TGCAG --- 5 '
АатII, ЗРАИ
Ssp27144IСинехококк sp. 5 'ATCGAT
3 'ТАГКТА
5 '--- В   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   ТА --- 5 '
BanIII, BavCI, BbvAII, BscI, BspJI, BspOVII, BstNZ169I, ClaI, LcaI
SspAIСинехококк sp. 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5' ---   CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC   --- 5'
AeuI, AorI, Bse17I, БспНИ, Bst2I, ЭкоРИИ, SniI, SslI, SspAI, Зани
SspBIStreptomyces sp. 5 'TGTACA
3 'ACATGT
5 '--- т   GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG   Т --- 5 '
AauI, BsmRI, Bsp1407I,
БсрГИ, БстАУИ, Ссп4800И
SspCIStreptomyces sp. 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SspD5IСтафилококк sp. D5 5 'GGTGA
3 'CCACT
5 '--- GGTGAN7N   --- 3'
3 '--- CCACTN7N   --- 5'
AsuHPI, HphI
SspD5IIСтафилококк sp. D5 5 'ATGCAT
3 'ТАКГА
5 '--- ATGCA   Т --- 3 '
3 '--- т   ACGTA --- 5 '
Csp68KIII, EcoT22I, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SepI, Zsp2I
SspRFIСинехококк sp. РФ-1 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, MlaI, PpaAI, SfuI, Ssp1I, SviI
ССРИStaphylococcus saprophyticus B6 5 'GTTAAC
3 'CAATTG
5 '--- GTT   AAC --- 3 '
3 '--- CAA   ТТГ --- 5 '
SstIStreptomyces stanford 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG
5 '--- GAGCT   C --- 3 '
3 '--- С   TCGAG --- 5 '
SstIIStreptomyces stanford 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
Sst12IStreptomyces sp. СТ-12 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- G   ACGTC --- 5 '
Asp713I, BloHII, BspMAI, BsuBI, CfuII, Psp23I, PstI, SflI, Srl5DI
SteIStreptomyces tendae 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SseBI, StuI
SthIСальмонелла Томпсон YY356 5 'GGTACC
3 'CCATGG
5 '--- G   GTACC --- 3 '
3 '--- CCATG   G --- 5 '
Acc65I, AhaB8I, Asp718I, КПНИ,
Sth117IТермофильный стрептококк ST117 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
ApaORI, BseBI, BsiLI, BstNI, BstOI, Bst2UI, ЭкоРИИ, MvaI, SspAI
Sth132IТермофильный стрептококк 5 'CCCG
3 'GGGC
5 '--- CCCGNNNN   NNNN --- 3 '
3 '--- GGGCNNNNNNNN   --- 5'
Sth134IТермофильный стрептококк 134 5 'CCGG
3 'GGCC
5 '--- С   CGG --- 3 '
3 '--- GGC   C --- 5 '
Sth368IТермофильный стрептококк CNRZ368 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspFI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
StrIStreptomyces thermodiastaticus 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI
StsIStreptococcus sanguis 54 5 'ГГАТГ
3 'CCTAC
5 '--- ГГАТГН8NN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCTACN8NNNNNN   --- 5'
StuI [8]Streptomyces tubercidicus 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, SarI, Sru30DI, SseBI, SteI
StyIСальмонелла тиф 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC
5 '--- С   CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC   C --- 5 '
StyD4IСальмонелла тиф D4 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5' ---   CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC   --- 5'
СуайSulfolobus acidocaldarius 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
SuiISulfolobus islandicus REN2HI 5 'GCWGC
3 'CGWCG
5 '--- G   CWGC --- 3 '
3 '--- CGWC   G --- 5 '
AceI, ApeKI, Taq52I, TseI
SunISynechococcus uniformis 5 'CGTACG
3 'GCATGC
5 '--- С   GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG   C --- 5 '
SurISporosarcina ureae 2 5 'GGATCC
3 'CCTAGG
5 '--- G   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 '
AccEBI, AliI, ApaCI, AsiI, BamHI, Bce751I, OkrAI, RspLKII, SolI
SviIStreptomyces violochromogenes 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
AsuII, Bpu14I, Bsp119I, CbiI, MlaI, PpaAI, SfuI, Ssp1I
SwaIStaphylococcus warneri 5 'ATTTAAAT
3 'ТАААТТТА
5 '--- ATTT   AAAT --- 3 '
3 '--- ТААА   TTTA --- 5 '

Примечания

  1. ^ Смит Х.О., Натанс Д. (декабрь 1973 г.). «Письмо: Предлагаемая номенклатура для бактериальных систем модификации и рестрикции и их ферментов». J. Mol. Биол. 81 (3): 419–23. Дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID  4588280.
  2. ^ Робертс Р.Дж., Белфорт М., Бестор Т., Бхагват А.С., Бикл Т.А., Битинаит Дж., Блюменталь Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К., Фирман К., Громова Е.С., Гампорт Р.И., Халфорд С.Е., Хаттман С., Хейтман Дж., Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh Э, Рао Д. Н., Райх Н., Репин В. Е., Селкер Э. С., Шоу П. К., Штейн Д. К., Стоддард Б. Л., Шибальский В., Траутнер Т. А., Ван Эттен Д. Л., Витор Д. М., Уилсон Г. Г., Сюй С.Ю. (апрель 2003 г.). «Номенклатура рестрикционных ферментов, ДНК-метилтрансфераз, самонаводящихся эндонуклеаз и их генов». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1805–12. Дои:10.1093 / nar / gkg274. ЧВК  152790. PMID  12654995.
  3. ^ Джереми МБ, Джон LT, Люберт S (2002). «3. Структура и функции белка». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN  0-7167-4684-0.
  4. ^ Анфинсен К. Б. (1973). «Принципы, регулирующие сворачивание белковых цепей». Наука. 181 (4096): 223–30. Дои:10.1126 / science.181.4096.223. PMID  4124164.
  5. ^ Кесслер C, Манта V (август 1990 г.). «Специфичность рестрикционных эндонуклеаз и модификации ДНК метилтрансфераз - обзор (издание 3)». Ген. 92 (1–2): 1–248. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-Б. PMID  2172084.
  6. ^ Pingoud A, Jeltsch A (сентябрь 2001 г.). «Структура и функция эндонуклеаз рестрикции II типа». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (18): 3705–27. Дои:10.1093 / nar / 29.18.3705. ЧВК  55916. PMID  11557805.
  7. ^ а б c d Монти Кригер; Мэтью П. Скотт; Matsudaira, Paul T .; Лодиш, Харви Ф .; Дарнелл, Джеймс Э .; Лоуренс Зипурски; Кайзер, Крис; Арнольд Берк (2004). Молекулярная клеточная биология (5-е изд.). Нью-Йорк: W.H. Фримен и компания. ISBN  0-7167-4366-3.
  8. ^ Шимоцу Х, Такахаши Х, Сайто Х (ноябрь 1980 г.). "Новая сайт-специфическая эндонуклеаза StuI от Streptomyces tubercidicus". Ген. 11 (3–4): 219–25. Дои:10.1016/0378-1119(80)90062-1. PMID  6260571.