Mesoniviridae - Mesoniviridae
Альфамезонивирус | |
---|---|
Электронная микрофотография из отрицательно окрашенный NDiV вирионы | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Учебный класс: | Pisoniviricetes |
Заказ: | Нидовиралес |
Подотряд: | Mesnidovirineae |
Семья: | Mesoniviridae |
Подсемейство: | Hexponivirinae |
Род: | Альфамезонивирус |
Подроды и виды | |
Mesoniviridae представляет собой семейство одноцепочечных РНК-вирусов с положительным смыслом. Семейство названо в честь размера геномов по сравнению с другими нидовирусами, с Мезо исходящий из Греческий слово мезо, что означает средний, и ni сокращение от нидо.[1] Комары - это естественный резервуар всех известных вирусов этого семейства.[2][3]
Классификация
Mesoniviridae является членом ордена Нидовиралес, порядок + ssRNA вирусов с животными-хозяевами. В семье всего одно подсемейство, Hexponivirinae, который содержит только один род, Альфамезонивирус. Всего насчитывается 8 подродов и 10 видов. Альфамезонивирус.[4]
- Заказ Нидовиралес
- Семья Mesoniviridae
- Подсемейство Hexponivirinae
- Семья Mesoniviridae
Открытие и филогенетический анализ четырех дополнительных мезонивирусов в 2013 году, названных вирусом Hana, вирусом Méno, вирусом Nsé и вирусом Moumo, показал, что они представляют по крайней мере три новых вида мезонивирусов.[5] Кроме того, в 2014 году в Австралии, Индонезии и Таиланде были обнаружены четыре потенциально новых вида: вирус Казуарина, вирус Каранг Сари, вирус Бонтаг Бару и вирус Кампхенг Пхет, соответственно.[3][6] По состоянию на февраль 2015 года эти открытия еще не ратифицированы Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV).
Структура и геном
Члены этого семейства имеют оболочку, сферическую форму и диаметр 60–80 нм с булавовидными шипами на поверхности. Существует восемь основных структурных белков, включая белок нуклеокапсида (массой 25 кДа), четыре дифференциально гликозилированные формы мембранного белка (20, 19, 18 и 17 кДа) и белок-шип (S) (77 кДа), который является расщепляется с образованием двух субъединиц S-белка (23 и 57 кДа).[5][7]
Геномы представляют собой линейные, полицистронные, одноцепочечные РНК с положительным смыслом и имеют длину около 20 000 нуклеотидов с 3 ' поли (А) хвост и семь основных открытые рамки для чтения (ORF). Две перекрывающиеся ORF находятся на 5'-конце, кодируют основные неструктурные белки и выражаются как гибридный белок к рибосомальный сдвиг рамки. ORF 1a и 1b содержат шесть репликаза домены, а также 3'-5 ' экзорибонуклеаза (ExoN), который контролирует точность репликации РНК, и 2'-O-метилтрансфераза, оба из которых обнаружены в более крупных нидовирусах. ORF 1b также кодирует N7-метилтрансферазу.[2][7]
История
Это семейство относительно новое, его обнаружили только в 2011 году. Первый вирус, получивший название Нам Динь вирус, был найден во вьетнамской провинции Нам Địнх.[2] Второй вирус, названный Кавалли вирус, затем был найден в Берег Слоновой Кости.[7] Позже выяснилось, что эти два вируса принадлежат к одному виду. Третий представитель этого первого вида, названный Вирус Дак Нонг, позже был найден в Culex tritaeniorhynchus населения во Вьетнаме.[8] В 2013 году еще четыре мезонивируса были обнаружены в популяциях комаров, все в Кот-д'Ивуаре,[5] а в 2014 г. в популяциях комаров в Австралии были обнаружены четыре мезонивируса,[6] Индонезия и Таиланд.[3]
Рекомендации
- ^ Lauber, C .; Ziebuhr, J .; Junglen, S .; Drosten, C .; Zirkel, F .; Nga, P.T .; Morita, K .; Snijder, E.J .; Горбаленя, А. Е. (2012). «Mesoniviridae: предлагаемое новое семейство в отряде Nidovirales, образованное одним видом вирусов, переносимых комарами». Архив вирусологии. 157 (8): 1623–1628. Дои:10.1007 / s00705-012-1295-х. ЧВК 3407358. PMID 22527862.
- ^ а б c Nga, P.T .; Parquet Mdel, M. D. C .; Lauber, C .; Parida, M .; Набешима, Т .; Ю, Ф .; Thuy, N.T .; Inoue, S .; Ито, Т .; Окамото, К .; Ichinose, A .; Snijder, E.J .; Morita, K .; Горбаленя, А. Э. (2011). Барик, Ральф С. (ред.). «Открытие первого нидовируса насекомых, отсутствующего эволюционного звена в возникновении геномов крупнейших РНК-вирусов». PLoS Патогены. 7 (9): e1002215. Дои:10.1371 / journal.ppat.1002215. ЧВК 3169540. PMID 21931546.
- ^ а б c Василакис, Н; Гусман, H; Ферт, C; Forrester, N.L .; Widen, S.G .; Wood, T. G .; Росси, С. Л .; Ghedin, E; Попов, В; Blasdell, K. R .; Уокер, П. Дж .; Теш, Р. Б. (2014). «Мезонивирусы - это вирусы, специфичные для комаров, с обширным географическим распространением и диапазоном хозяев». Журнал вирусологии. 11: 97. Дои:10.1186 / 1743-422X-11-97. ЧВК 4038087. PMID 24884700.
- ^ «Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)».
- ^ а б c Zirkel, F .; Roth, H .; Kurth, A .; Drosten, C .; Ziebuhr, J .; Джанглен, С. (2013). «Идентификация и характеристика генетически дивергентных членов недавно созданного семейства Mesoniviridae». Журнал вирусологии. 87 (11): 6346–6358. Дои:10.1128 / JVI.00416-13. ЧВК 3648093. PMID 23536661.
- ^ а б Warrilow, D; Уоттерсон, Д; Холл, Р. А .; Дэвис, С. С .; Weir, R; Куруц, N; Уилан, П; Allcock, R; Холл-Менделин, S; O'Brien, C.A .; Хобсон-Петерс, Дж (2014). «Новый вид мезонивируса из Северной территории, Австралия». PLoS ONE. 9 (3): e91103. Bibcode:2014PLoSO ... 991103W. Дои:10.1371 / journal.pone.0091103. ЧВК 3966781. PMID 24670468.
- ^ а б c Zirkel, F .; Kurth, A .; Quan, P. -L .; Briese, T .; Ellerbrok, H .; Pauli, G .; Leendertz, F. H .; Липкин, В. И .; Ziebuhr, J .; Drosten, C .; Джанглен, С. (2011). «Нидовирус насекомых, появляющийся из первичных тропических лесов». мБио. 2 (3): e00077 – e00011. Дои:10.1128 / mBio.00077-11. ЧВК 3111606. PMID 21673192.
- ^ Kuwata, R .; Satho, T .; Isawa, H .; Yen, N.T .; Фонг, Т. В .; Nga, P.T .; Курашиге, Т .; Hiramatsu, Y .; Fukumitsu, Y .; Хосино, К .; Сасаки, Т .; Кобаяши, М .; Mizutani, T .; Савабе, К. (2013). «Характеристика вируса Дак Нонг, нидовируса насекомых, выделенного от комаров Culex во Вьетнаме». Архив вирусологии. 158 (11): 2273–2284. Дои:10.1007 / s00705-013-1741-4. ЧВК 7087109. PMID 23728735.