Methylacidiphilum fumariolicum - Methylacidiphilum fumariolicum
| Methylacidiphilum fumariolicum | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Учебный класс: | Неклассифицированный |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | М. fumariolicum |
| Биномиальное имя | |
| Methylacidiphilum fumariolicum Х. Оп ден Камп и др., 2007 г. | |
| Тип штамма | |
| SolV | |
Methylacidiphilum fumariolicum является автотрофный бактерия, впервые описанная в 2007 г., растущая на вулканических лужах около Неаполь, Италия. Он растет в грязи на температуры от 50 ° C до 60 ° C и кислый pH 2–5. Он способен окислять метан газ.[1] Оно использует аммоний, нитрат или атмосферный азот как источник азота и фиксирует углекислый газ.[2]
Из-за наличия лантаноид зависимый метанолдегидрогеназа фермента его рост строго зависит от обилия редкоземельные металлы.[1]
Нет биотические взаимодействия между М. fumariolicum и другие организмы известны, вероятно, из-за экстремальных условий, в которых бактерии могут расти.
Биология
Геном
Геном М. fumariolicum составляет 2,36 Мбит / с размером с GC-контент 40,9% и 2283 гена, кодирующего белок.[3]
Метаболизм
Энергия получается метан окисление к метанол и ферментом метанолдегидрогеназа который строго зависит от использования редкоземельных металлов в качестве кофакторы. Обычно он использует лантан в качестве важного кофактора, но было показано, что его можно заменить другим лантаноиды Такие как церий, празеодим, или же неодим без негативных эффектов и с самарий, европий, или же гадолиний только замедляя скорость роста бактерий.[1]
Он использует Кальвин Бенсон цикл Бассема зафиксировать углекислый газ и использовать его как источник углерода. Фактически концентрации CO2 ниже 0,3% (об. / об.) препятствует любому росту М. fumariolicum.[4]
М. fumariolicum оказался более чувствительным к кислороду, чем большинство других протеобактериальный метанотрофы. Вероятно из-за того, что он использует нитрогеназа в течение азотфиксация который, как известно, чувствительный к кислороду.[5]
Рекомендации
- ^ а б c Pol, A., et al (2014). «Редкоземельные металлы необходимы для метанотрофной жизни в вулканических грязевых точках». Environ Microbiol. 16 (1): 255–264. Дои:10.1111/1462-2920.12249. PMID 24034209.
- ^ Хадем, А. и др. (2012). «Геномный и физиологический анализ хранения углерода в веррукомикробном метанотрофе» Ca. Метилацидифилум фумариоликум "СольВ". Передний микробиол. 3 (345): 345. Дои:10.3389 / fmicb.2012.00345. ЧВК 3460235. PMID 23060867.
- ^ Хадем, А. и др. (2012). "Проект последовательности генома обитающего на вулканах термоацидофильного метанотрофа Methylacidiphilum fumariolicum Strain SolV". J Бактериол. 194 (14): 3729–3730. Дои:10.1128 / JB.00501-12. ЧВК 3393509. PMID 22740660.
- ^ Khadem, A. et al (2011). «Автотрофная метанотрофия при Verrucomicrobia: Methylacidiphilum fumariolicumSolV использует цикл Кальвина-Бенсона-Бассама для фиксации диоксида углерода». J Бактериол. 193 (17): 4438–4446. Дои:10.1128 / JB.00407-11. ЧВК 3165502. PMID 21725016.
- ^ Khadem, A. et al (2010). «Фиксация азота веррукомикробным метанотрофом 'Methylacidiphilum fumariolicum' SolV». Микробиология. 156 (1): 1052–9. Дои:10.1099 / мик ..0.036061-0. PMID 20056702.