NLRX1 - NLRX1

NLRX1
3un9 ctermhex.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNLRX1, CLR11.3, DLNB26, NOD26, NOD5, NOD9, член семейства NLR X1
Внешние идентификаторыOMIM: 611947 MGI: 2429611 ГомолоГен: 11623 Генные карты: NLRX1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение NLRX1
Геномное расположение NLRX1
Группа11q23.3Начинать119,166,568 бп[1]
Конец119,184,016 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001282143
NM_001282144
NM_001282358
NM_024618
NM_170722

NM_001163742
NM_001163743
NM_178420

RefSeq (белок)

NP_001269072
NP_001269073
NP_001269287
NP_078894

NP_001157214
NP_001157215
NP_848507

Расположение (UCSC)Chr 11: 119.17 - 119.18 МбChr 9: 44,25 - 44,27 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

NLRX1 или же Член семьи NLR X1, Короче для нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, богатый лейцином повтор, содержащий X1 это белок что у людей кодируется NLRX1 ген.[5][6] Он также известен как NOD-подобный рецептор X1, Семейство NLR, X1, NOD5, NOD9 и CLR11.3 и является членом NOD-подобный рецептор семья рецепторы распознавания образов.

Функция

NLRX1 - это внутриклеточный белок, который играет роль в иммунная система. Предполагается, что NLRX1 влияет на врожденный иммунитет к вирусы путем вмешательства в митохондриальный противовирусный сигнальный белок (MAVS ) / ген I, индуцируемый ретиноевой кислотой (RIG-I ) митохондриальный противовирусный путь.,[7] хотя недавно это было подвергнуто сомнению.[8][9]

NLRX1 также играет роль в иммунитете хозяина во время бактериальных инфекций, таких как Хламидия трахоматис и Helicobacter pylori, регулируя бактериальную нагрузку и воспаление в мононуклеарных фагоцитах. Механизмы, лежащие в основе модуляции NLRX1, недостаточно хорошо охарактеризованы, однако прогнозы компьютерного моделирования предполагают, что уровни NLRX1 могут контролироваться цепями отрицательной обратной связи, индуцированными рано после заражения.[10][11][12]

Структура

NLRX1 имеет уникальную структуру белка, состоящую из 3 белковые домены: an N-концевой эффекторный домен, содержащий сигнал локализации митохондрий; центральный NACHT домен; а C-терминал богатый лейцином повтор (LRR) домен.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000160703 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032109 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ "Entrez Gene: член семьи NLR X1".
  6. ^ Инохара Н., Нуньес Г. (май 2003 г.). «NODs: внутриклеточные белки, участвующие в воспалении и апоптозе». Обзоры природы. Иммунология. 3 (5): 371–82. Дои:10.1038 / nri1086. PMID  12766759. S2CID  8088987.
  7. ^ О'Нил, Лос-Анджелес (апрель 2008 г.). «Врожденный иммунитет: подавление антивирусной передачи сигналов с помощью NLRX1». Текущая биология. 18 (7): R302-4. Дои:10.1016 / j.cub.2008.02.021. PMID  18397740. S2CID  18188728.
  8. ^ Ребсамен М., Васкес Дж., Тардивел А., Гуарда Дж., Карран Дж., Чопп Дж. (Август 2011 г.). «Дефицит NLRX1 / NOD5 не влияет на передачу сигналов MAVS». Гибель клеток и дифференциация. 18 (8): 1387. Дои:10.1038 / cdd.2011.64. ЧВК  3172102. PMID  21617692.
  9. ^ Соарес Ф., Таттоли I, Вортцман М.Э., Арно Д., Филпотт Д.Д., Жирардин С.Е. (2013). «NLRX1 не ингибирует MAVS-зависимую противовирусную передачу сигналов». Врожденный иммунитет. 19 (4): 438–48. Дои:10.1177/1753425912467383. PMID  23212541. S2CID  20642957.
  10. ^ Кастаньо-Родригес Н., Каакуш Н.О., Го К.Л., Фок К.М., Митчелл Х.М. (01.01.2014). «Путь передачи сигналов NOD-подобного рецептора при инфекции Helicobacter pylori и родственном раке желудка: исследование случай-контроль и анализ экспрессии генов». PLOS ONE. 9 (6): e98899. Дои:10.1371 / journal.pone.0098899. ЧВК  4047072. PMID  24901306.
  11. ^ Филипсон К.В., Бассаганья-Риера Дж., Виладомиу М., Кронштайнер Б., Абеди В., Хупс С., Михалак П., Канг Л., Жирардин С. Е., Хонтесиллас Р. (01.01.2015). «Моделирование регуляторных механизмов, с помощью которых NLRX1 модулирует врожденные иммунные ответы на инфекцию Helicobacter pylori». PLOS ONE. 10 (9): e0137839. Дои:10.1371 / journal.pone.0137839. ЧВК  4569576. PMID  26367386.
  12. ^ Абдул-Сатер А.А., Саид-Садье Н., Лам В.М., Сингх Б., Петтенгилл М.А., Соарес Ф., Таттоли И., Липински С., Жирардин С.Е., Розенстиль П., Оджиус Д.М. (декабрь 2010 г.). «Повышение производства активных форм кислорода и хламидийной инфекции митохондриальным Nod-подобным членом семейства NLRX1». Журнал биологической химии. 285 (53): 41637–45. Дои:10.1074 / jbc.M110.137885. ЧВК  3009891. PMID  20959452.
  13. ^ Мейлан Э., Чопп Дж. (Март 2008 г.). "NLRX1: друг или враг?". EMBO отчеты. 9 (3): 243–5. Дои:10.1038 / embor.2008.23. ЧВК  2267384. PMID  18311173.

дальнейшее чтение