NOD2 - Википедия - NOD2

NOD2
Идентификаторы
ПсевдонимыNOD2, ACUG, BLAU, CARD15, CD, CLR16.3, IBD1, NLRC2, NOD2B, PSORAS1, нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, содержащий 2, BLAUS, YAOS
Внешние идентификаторыOMIM: 605956 MGI: 2429397 ГомолоГен: 11156 Генные карты: NOD2
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение NOD2
Геномное расположение NOD2
Группа16q12.1Начинать50,693,588 бп[1]
Конец50,734,041 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NOD2 220066 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

64127

257632

Ансамбль

ENSG00000167207

ENSMUSG00000055994

UniProt

Q9HC29

Q8K3Z0

RefSeq (мРНК)

NM_001293557
NM_022162
NM_001370466

NM_145857

RefSeq (белок)

NP_001280486
NP_071445
NP_001357395

NP_665856

Расположение (UCSC)Chr 16: 50.69 - 50.73 МбChr 8: 88.65 - 88.69 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, содержащий белок 2 (NOD2), также известный как белок, содержащий домен рекрутирования каспазы 15 (CARD15) или же воспалительное заболевание кишечника белок 1 (IBD1), это белок что у людей кодируется NOD2 ген расположен на хромосома 16.[5][6] NOD2 играет важную роль в иммунная система. Он распознает бактериальные молекулы (пептидогликаны ) и стимулирует иммунную реакцию.[7]

NOD2 - это внутриклеточный рецептор распознавания образов, который по структуре похож на устойчивые белки растений и распознает молекулы, содержащие определенную структуру, называемую мурамиловый дипептид (MDP), который встречается в некоторых бактерии.[8]

Структура

Модель белка NOD2, состоящая из двух N-концевых CARD-доменов (красный), соединенных спиральным линкером (синий) с центральным доменом NOD (зеленый). На С-конце расположен LRR домен (голубой).[9]

В C-терминал часть белка содержит богатый лейцином повтор домен, который, как известно, играет роль во взаимодействиях белок-белок. Средняя часть белка характеризуется NOD домен участвует в самоолигомеризации белков. В N-концевой часть содержит два CARD домены известно, что играет роль в апоптоз и NF-κB пути активации.[10]

Функция

Этот ген является членом NOD1 /Апаф-1 семья (также известная как NOD-подобный рецептор семейство) и кодирует белок двумя домены набора caspase (КАРТОЧКИ) и одиннадцать богатые лейцином повторы (LRR). Белок в первую очередь экспрессируется в периферической крови. лейкоциты. Он играет роль в иммунном ответе, распознавая бактериальные молекулы, которые обладают мурамиловый дипептид (MDP) и активация NF-κB белок.[11]

Клиническое значение

Мутации в этом гене были связаны с болезнь Крона,[9] Синдром Блау, тяжелая легочная саркоидоз [12] и Болезнь трансплантат против хозяина.[13]

Ген NOD2 связан с воспалительными заболеваниями, такими как Воспалительное заболевание кишечника / Болезнь Крона и синдром Блау.[14][15]

Взаимодействия

NOD2 был показан взаимодействовать с NLRC4.[16][17]

Также было показано, что NOD2 связывается с MAVS в ответ на обработку оцРНК или вирусной РНК и активируют ответ IFN. Это первое сообщение о том, что NOD2 действует как рецептор распознавания образов для вирусов.[18]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167207 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055994 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Gilberts EC, Greenstein AJ, Katsel P, Harpaz N, Greenstein RJ (декабрь 1994 г.). «Молекулярные доказательства двух форм болезни Крона». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (26): 12721–4. Дои:10.1073 / пнас.91.26.12721. ЧВК  45511. PMID  7809109.
  6. ^ Hugot JP, Laurent-Puig P, Gower-Rousseau C, Olson JM, Lee JC, Beaugerie L, Naom I, Dupas JL, Van Gossum A, Orholm M, Bonaiti-Pellie C, Weissenbach J, Mathew CG, Lennard-Jones JE , Корто А., полковник Дж. Ф., Томас Дж. (Февраль 1996 г.). «Картирование локуса восприимчивости к болезни Крона на хромосоме 16». Природа. 379 (6568): 821–3. Дои:10.1038 / 379821a0. PMID  8587604. S2CID  4311407.
  7. ^ Махла Р.С., Редди М.С., Прасад Д.В., Кумар Х. (сентябрь 2013 г.). «Подслащенные PAMP: роль сахарных комплексов PAMP в врожденном иммунитете и биологии вакцины». Границы иммунологии. 4: 248. Дои:10.3389 / fimmu.2013.00248. ЧВК  3759294. PMID  24032031.
  8. ^ Куфер Т.А., Бэнкс диджей, Филпотт диджей (август 2006 г.). «Врожденное иммунное восприятие микробов белками Nod». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1072: 19–27. Дои:10.1196 / летопись.1326.020. PMID  17057187. S2CID  20217610.
  9. ^ а б Накагоме С., Мано С., Козловски Л., Буйницки Дж. М., Шибата Х, Фукумаки Ю., Кидд Дж. Р., Кидд К. К., Кавамура С., Оота Х (июнь 2012 г.). «Аллели риска болезни Крона в локусе NOD2 поддерживаются естественным отбором на постоянных вариациях». Молекулярная биология и эволюция. 29 (6): 1569–85. Дои:10.1093 / молбев / mss006. ЧВК  3697811. PMID  22319155.
  10. ^ Огура Ю., Инохара Н., Бенито А., Чен Ф. Ф., Ямаока С., Нуньес Г. (февраль 2001 г.). «Nod2, член семейства Nod1 / Apaf-1, который ограничен моноцитами и активирует NF-kappaB». Журнал биологической химии. 276 (7): 4812–8. Дои:10.1074 / jbc.M008072200. PMID  11087742.
  11. ^ «Ген Entrez: нуклеотид-связывающий домен олигомеризации NOD2, содержащий 2».
  12. ^ Сато Х., Уильямс Х.Р., Спаньоло П., Абдалла А., Ахмад Т., Орчард Т.Р., Копли С.Дж., Десаи С.Р., Уэллс АЮ, дю Буа, Уэльс, КИ (февраль 2010 г.). «Полиморфизм CARD15 / NOD2 связан с тяжелым легочным саркоидозом». Eur Respir J. 35 (2): 324–30. Дои:10.1183/09031936.00010209. PMID  19679608.
  13. ^ Чжао Х, Цзя М, Ван З, Ченг И, Ло З, Чен И, Сюй Х, Ян С., Тан И (июнь 2015 г.). «Связь между однонуклеотидным полиморфизмом NOD2 и острым заболеванием трансплантат против хозяина III-IV степени: метаанализ». Гематология. 20 (5): 254–62. Дои:10.1179 / 1607845414Y.0000000202. PMID  25248089. S2CID  206850232.
  14. ^ Radford-Smith G, Pandeya N (ноябрь 2006 г.). «Связь между генотипом NOD2 / CARD15 и фенотипом при болезни Крона - мы еще не достигли цели?». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 12 (44): 7097–103. Дои:10.3748 / wjg.v12.i44.7097. PMID  17131470.
  15. ^ Ким TH, Пейн Ю, Чжан X, Иванага Y, Дэви М.П., ​​Розенбаум Дж. Т., Инман Р. Д. (январь 2007 г.). «Измененный хозяин: взаимодействия патогенов, вызванные мутацией синдрома Блау NOD2». Rheumatology International. 27 (3): 257–62. Дои:10.1007 / s00296-006-0250-0. PMID  17096091. S2CID  23739992.
  16. ^ Дамиано Дж. С., Оливейра В., Валлийский К., Рид Дж. С. (июль 2004 г.). «Гетеротипические взаимодействия между доменами NACHT: значение для регуляции врожденных иммунных ответов». Биохимический журнал. 381 (Пт 1): 213–9. Дои:10.1042 / BJ20031506. ЧВК  1133779. PMID  15107016.
  17. ^ Damiano JS, Stehlik C, Pio F, Godzik A, Reed JC (июль 2001 г.). «CLAN, новый человеческий ген, подобный CED-4». Геномика. 75 (1–3): 77–83. Дои:10.1006 / geno.2001.6579. PMID  11472070.
  18. ^ Sabbah A, Chang TH, Harnack R, Frohlich V, Tominaga K, Dube PH, Xiang Y, Bose S (октябрь 2009 г.). «Активация противовирусных реакций врожденного иммунитета с помощью Nod2». Иммунология природы. 10 (10): 1073–80. Дои:10.1038 / ni.1782. ЧВК  2752345. PMID  19701189.

дальнейшее чтение

  • Punchard NA (октябрь 2001 г.). «Обзор: Nod2, причина или участник болезни Крона». Текущее мнение об исследуемых лекарствах. 2 (10): 1378–81. PMID  11890351.
  • Сатсанги Дж., Моркрофт Дж., Шах Н.Б., Ниммо Э. (февраль 2003 г.). «Генетика воспалительного заболевания кишечника: научные и клинические последствия». Лучшие практики и исследования. Клиническая гастроэнтерология. 17 (1): 3–18. Дои:10.1053 / bega.2002.0349. PMID  12617879.
  • Розенбаум Дж. Т., Планк С. Р., Дэйви М. П., Иванага Ю., Курц Д. Е., Мартин Т. М. (октябрь 2003 г.). «Одним кивком увеит вступает в новую эру». Американский журнал офтальмологии. 136 (4): 729–32. Дои:10.1016 / S0002-9394 (03) 00569-5. PMID  14516815.
  • Курокава Т., Кикучи Т., Охта К., Имаи Х., Йошимура Н. (октябрь 2003 г.). «Глазные проявления при синдроме Блау, связанные с мутацией CARD15 / Nod2». Офтальмология. 110 (10): 2040–4. Дои:10.1016 / S0161-6420 (03) 00717-6. PMID  14522785.
  • Girardin SE, Hugot JP, Sansonetti PJ (декабрь 2003 г.). «Уроки исследований Nod2: к связи между болезнью Крона и бактериальным зондированием». Тенденции в иммунологии. 24 (12): 652–8. Дои:10.1016 / j.it.2003.10.007. PMID  14644139.
  • Ньюман Б., Симинович К. (декабрь 2003 г.). «Воспалительное заболевание кишечника: болезнь Крона и успех генетики NODern». Клиническая и следственная медицина. 26 (6): 303–14. PMID  14690304.
  • Остенбруг Л.Е., ван Даллемен Х.М., Меерман Г.Дж., Янсен П.Л. (2003). «ВЗК и генетика: новые разработки». Скандинавский журнал гастроэнтерологии. Добавка. 38 (239): 63–8. Дои:10.1080/00855920310002717. PMID  14743885.
  • Камбе Н., Нисикомори Р., Канадзава Н. (август 2005 г.). «Рецептор распознавания цитозольных образов Nod2 и воспалительные гранулематозные расстройства». Журнал дерматологической науки. 39 (2): 71–80. Дои:10.1016 / j.jdermsci.2005.04.001. PMID  15927452.
  • Ньюман Б., Симинович К.А. (июль 2005 г.). «Последние достижения в генетике воспалительных заболеваний кишечника». Текущее мнение в гастроэнтерологии. 21 (4): 401–7. PMID  15930978.
  • Мартинон Ф., Чопп Дж. (Август 2005 г.). «NLR присоединяются к TLR как врожденные сенсоры патогенов». Тенденции в иммунологии. 26 (8): 447–54. Дои:10.1016 / j.it.2005.06.004. PMID  15967716.
  • Стробер В., Мюррей П.Дж., Китани А., Ватанабе Т. (январь 2006 г.). «Сигнальные пути и молекулярные взаимодействия NOD1 и NOD2». Обзоры природы. Иммунология. 6 (1): 9–20. Дои:10.1038 / nri1747. PMID  16493424. S2CID  33505741.
  • Кавано Дж. (Июнь 2006 г.). «NOD2: этнические и географические различия». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 12 (23): 3673–7. Дои:10.3748 / wjg.v12.i23.3673. ЧВК  4087459. PMID  16773683.
  • Hugot JP (август 2006 г.). «Мутации CARD15 / NOD2 при болезни Крона». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1072 (1): 9–18. Дои:10.1196 / летопись.1326.011. PMID  17057186. S2CID  24150549.
  • Vignal C, Singer E, Peyrin-Biroulet L, Desreumaux P, Chamaillard M (апрель 2007 г.). «Как мутации NOD2 предрасполагают к болезни Крона?». Микробы и инфекции / Institut Pasteur. 9 (5): 658–63. Дои:10.1016 / j.micinf.2007.01.016. PMID  17379562.
  • Quaglietta L, te Velde A, Staiano A, Troncone R, Hommes DW (май 2007 г.). «Функциональные последствия мутаций NOD2 / CARD15 при болезни Крона». Журнал детской гастроэнтерологии и питания. 44 (5): 529–39. Дои:10.1097 / MPG.0b013e31803815ee. PMID  17460484. S2CID  37476303.
  • ван дер Линде К., Бур П.П., Хаувинг-Дуистермаат Дж. Дж., Крузиус Б. Дж., Уилсон П. Дж., Койперс Е. Дж., де Рой Ф. В. (июнь 2007 г.) «Мутации CARD15 в голландских семейных и спорадических воспалительных заболеваниях кишечника и обзор европейских исследований». Европейский журнал гастроэнтерологии и гепатологии. 19 (6): 449–59. Дои:10.1097 / 01.meg.0000236887.44214.6a. PMID  17489054. S2CID  17766170.