NLRP1 - NLRP1

NLRP1
PDB 1pn5 EBI.jpg
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNLRP1, CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L / S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, семейство NLR, домен пирина, содержащий 1, домен пирина семейства NLR, содержащий 1, MSPC, AIADK, JRRP
Внешние идентификаторыOMIM: 606636 MGI: 3582959 ГомолоГен: 19080 Генные карты: NLRP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение NLRP1
Геномное расположение NLRP1
Группа17p13.2Начните5,499,427 бп[1]
Конец5,619,424 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NLRP1 210113 s в формате fs.png

PBB GE NLRP1 211824 x at fs.png

PBB GE NLRP1 211822 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_033007
NM_001033053
NM_014922
NM_033004
NM_033006

NM_001039680
NM_001040696
NM_001162414

RefSeq (белок)

NP_001028225
NP_055737
NP_127497
NP_127499
NP_127500

NP_001035786
NP_001155886

Расположение (UCSC)Chr 17: 5.5 - 5.62 МбChr 11: 71.15 - 71.23 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

NLRP1 кодирует NACHT, LRR, FIIND, домен CARD и белок 1, содержащий домены PYD в людях.[5][6][7] NLRP1 был первым белок показано, чтобы сформировать воспаление.[8] NLRP1 экспрессируется множеством ячейка типы, которые преимущественно кроветворный. Выражение также наблюдается в структурах железистого эпителия, включая выстилку тонкий кишечник, желудок.[9] Полиморфизм NLRP1 связан с кожными внекишечными проявлениями при БК.[9] Его самая высокая экспрессия была обнаружена в коже человека, в псориаз и при витилиго. Полиморфизмы NLRP1 были обнаружены в Красная волчанка и диабет 1 типа.[10] Было обнаружено, что варианты мышиного NLRP1 активируются при N-концевом расщеплении протеаза в сибирская язва летальный фактор.[8]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства Ced-4 апоптоз белки. Члены Ced-семьи содержат домен найма caspase (CARD) и, как известно, являются ключевыми посредниками запрограммированная гибель клеток. Закодированный белок содержит отдельный N-концевой пириноподобный мотив, который, возможно, участвует в белок-белковые взаимодействия. Белок NLRP1 сильно взаимодействует с каспаза 2 и слабо с каспаза 9. Чрезмерное выражение этого ген было показано, что он вызывает апоптоз в клетках. Множественный альтернативно сращенный варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы, были обнаружены для этого гена, но биологическая достоверность некоторых вариантов не была определена.[7]

Механизм активации

NLRP1 активирует антибактериальный иммунная реакция. Антибактериальный иммунная реакция компенсирует потерю MAP киназа ответ. Люди продуцируют NLRP1, но человеческий NLRP1 не активируется летальным фактором.[8] NLRP1 может быть активирован протеолитическим расщеплением, что приводит к удалению аутоингибиторного PYD и высвобождению домена CARD, ответственного за рекрутинг и активацию прокаспазы-1 в активной форме каспазы-1.[8] Но механизм активации человеческого NLRP1 и функция в иммунитет непонятно.[8]

Взаимодействия

NLRP1 был показан взаимодействовать с участием каспаза 9[11][12] и APAF1.[11]

Варианты NLRP1 у мышей

У мышей есть три паралога Nlrp1 ген (Nlrp1a, b, c). Nlrp1c это псевдоген.[13] NLRP1B мыши не активируется механизмом рецептор-лиганд. Варианты NLRP1B от некоторых инбредных линий мышей, BALB / c и 129, могут активироваться летальным фактором (LF). протеаза. Смертельный фактор протеаза производится и секретируется бацилла сибирской язвы, агент сибирская язва.[14] Вместе с защитным антигеном (PA) LF образует двусторонний токсин, Lethal Toxin. Роль ПА - формировать перемещение канал, который доставляет LF в клетку-хозяин цитозоль, где LF играют роль в иммунном ответе, расщепляя и инактивируя киназы MAP.[15][16] LF также непосредственно расщепляет NLRP1B проксимальнее его N-конец, это необходимо и достаточно для NLRP1B воспаление формирование и активация CASP1.[17] Активация NLRP1B-зависимого воспаление ответы проявляются в защите хозяина с помощью такого механизма, как IL-1β и нейтрофилы.[18][19] NLRP1B может функционировать как датчик бактериальный протеазы, иммунные ответы специфически активируются вирулентность факторы.[20][21]

Неясно, какие стимулы могут активировать NLRP1A, другой известный функциональный паралог NLRP1 мыши. Исследование выявило мышь, несущую миссенс-прирост функции. мутация в NLRP1A (Q593P), который активен воспаление ответы. Механизм дикого типа Активация NLRP1A неясна.[22]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000091592 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070390 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Торп К.Л., Абдулла С., Кауфман Дж., Троусдейл Дж., Бек С. (октябрь 1996 г.). «Филогения и структура гена RING3». Иммуногенетика. 44 (5): 391–6. Дои:10.1007 / BF02602785. PMID  8781126. S2CID  44613743.
  6. ^ Tschopp J, Martinon F, Burns K (февраль 2003 г.). «NALP: новое семейство белков, участвующих в воспалении». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 4 (2): 95–104. Дои:10.1038 / nrm1019. PMID  12563287. S2CID  31417018.
  7. ^ а б «Ген Entrez: семейство NLRP1 NLR, пириновый домен, содержащий 1».
  8. ^ а б c d е Чаваррия-Смит Дж., Митчелл П.С., Хо А.М., Догерти, доктор медицины, Вэнс Р.Э. (декабрь 2016 г.). «Функциональные и эволюционные анализы идентифицируют протеолиз как общий механизм активации инфламмасомы NLRP1». Патогены PLOS. 12 (12): e1006052. Дои:10.1371 / journal.ppat.1006052. ЧВК  5142783. PMID  27926929. CC-BY icon.svg Материал был скопирован из этого источника, который доступен под Международная лицензия Creative Commons Attribution 4.0.
  9. ^ а б Kummer JA, Broekhuizen R, Everett H, Agostini L., Kuijk L, Martinon F, et al. (Май 2007 г.). «Компоненты инфламмасомы NALP 1 и 3 демонстрируют различные, но отдельные профили экспрессии в тканях человека, предполагая сайт-специфическую роль в воспалительной реакции». Журнал гистохимии и цитохимии. 55 (5): 443–52. Дои:10.1369 / jhc.6A7101.2006. PMID  17164409.
  10. ^ Грандеманж С., Санчес Э., Луи-Планс П., Тран Мау-Тем Ф., Бессис Д., Кубес С. и др. (Июль 2017 г.). «Новый аутовоспалительный и аутоиммунный синдром, связанный с мутациями NLRP1: NAIAD (NLRP1-ассоциированное аутоиммунное воспаление с артритом и дискератозом)». Анналы ревматических болезней. 76 (7): 1191–1198. Дои:10.1136 / annrheumdis-2016-210021. PMID  27965258. S2CID  206852426.
  11. ^ а б Chu ZL, Pio F, Xie Z, Welsh K, Krajewska M, Krajewski S, Godzik A, Reed JC (март 2001 г.). «Новый энхансер апоптосомы Apaf1, участвующий в цитохром c-зависимой активации каспазы и апоптозе». Журнал биологической химии. 276 (12): 9239–45. Дои:10.1074 / jbc.M006309200. PMID  11113115.
  12. ^ Hlaing T, Guo RF, Dilley KA, Loussia JM, Morrish TA, Shi MM, Vincenz C, Ward PA (март 2001 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика DEFCAP-L и -S, двух изоформ нового члена семейства белков апоптоза Ced-4 млекопитающих». Журнал биологической химии. 276 (12): 9230–8. Дои:10.1074 / jbc.M009853200. PMID  11076957.
  13. ^ Sastalla I, Crown D, Masters SL, McKenzie A, Leppla SH, Moayeri M (март 2013 г.). «Транскрипционный анализ трех паралогов Nlrp1 у мышей». BMC Genomics. 14 (1): 188. Дои:10.1186/1471-2164-14-188. ЧВК  3641005. PMID  23506131.
  14. ^ Бойден Э.Д., Дитрих В.Ф. (февраль 2006 г.). «Nalp1b контролирует чувствительность макрофагов мыши к летальному токсину сибирской язвы». Природа Генетика. 38 (2): 240–4. Дои:10,1038 / ng1724. PMID  16429160. S2CID  23316987.
  15. ^ Turk BE (март 2007 г.). «Манипулирование сигнальными путями хозяина токсинами сибирской язвы». Биохимический журнал. 402 (3): 405–17. Дои:10.1042 / BJ20061891. PMID  17313374.
  16. ^ Моайери М., Леппла С.Х. (декабрь 2009 г.). «Клеточные и системные эффекты летального токсина сибирской язвы и токсина отека». Молекулярные аспекты медицины. 30 (6): 439–55. Дои:10.1016 / j.mam.2009.07.003. ЧВК  2784088. PMID  19638283.
  17. ^ Чаваррия-Смит Дж., Вэнс Р. Э. (2013). «Прямое протеолитическое расщепление NLRP1B необходимо и достаточно для активации инфламмасом летальным фактором сибирской язвы». Патогены PLOS. 9 (6): e1003452. Дои:10.1371 / journal.ppat.1003452. ЧВК  3688554. PMID  23818853.
  18. ^ Терра Дж. К., Кот СК, Франция Б., Дженкинс А. Л., Бозуэ Дж. А., Велкос С. Л., Левин С. М., Брэдли К. А. (январь 2010 г.). «Передний край: устойчивость к инфекции Bacillus anthracis, опосредованной летальным токсин-чувствительным аллелем Nalp1b / Nlrp1b». Журнал иммунологии. 184 (1): 17–20. Дои:10.4049 / jimmunol.0903114. ЧВК  2811128. PMID  19949100.
  19. ^ Моайери М., Краун Д., Ньюман З.Л., Окугава С., Экхаус М., Катайссон С., Лю С., Састалла И., Леппла С.Х. (декабрь 2010 г.). «Датчик инфламмасомы Nlrp1b-зависимая резистентность к сибирской язве опосредована каспазой-1, передачей сигналов IL-1 и привлечением нейтрофилов». Патогены PLOS. 6 (12): e1001222. Дои:10.1371 / journal.ppat.1001222. ЧВК  3000361. PMID  21170303.
  20. ^ de Zoete MR, Bouwman LI, Keestra AM, van Putten JP (март 2011 г.). «Расщепление и активация Toll-подобного рецептора микробными протеазами». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (12): 4968–73. Дои:10.1073 / pnas.1018135108. ЧВК  3064367. PMID  21383168.
  21. ^ Sarris PF, Duxbury Z, Huh SU, Ma Y, Segonzac C, Sklenar J, Derbyshire P, Cevik V, Rallapalli G, Saucet SB, Wirthmueller L, Menke FL, Sohn KH, Jones JD (май 2015 г.). «Иммунный рецептор растений выявляет эффекторы патогенов, которые нацелены на факторы транскрипции WRKY». Ячейка. 161 (5): 1089–1100. Дои:10.1016 / j.cell.2015.04.024. PMID  26000484.
  22. ^ Мастерс С.Л., Герлик М., Меткалф Д., Престон С., Пеллегрини М., О'Доннелл Дж. А. и др. (Декабрь 2012 г.). «Активация инфламмасомы NLRP1 вызывает пироптоз гемопоэтических клеток-предшественников». Иммунитет. 37 (6): 1009–23. Дои:10.1016 / j.immuni.2012.08.027. ЧВК  4275304. PMID  23219391.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9C000 (Белок 1, содержащий домены NACHT, LRR и PYD) на PDBe-KB.